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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1dcj | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF YHHP, A NOVEL ESCHERICHIA COLI PROTEIN IMPLICATED IN THE CELL DIVISION | ||||||
![]() | YHHP PROTEIN | ||||||
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機能・相同性 | ![]() sulfur carrier activity / tRNA wobble position uridine thiolation / Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process / ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Katoh, E. / Hatta, T. / Shindo, H. / Mizuno, T. / Yamazaki, T. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: High precision NMR structure of YhhP, a novel Escherichia coli protein implicated in cell division. 著者: Katoh, E. / Hatta, T. / Shindo, H. / Ishii, Y. / Yamada, H. / Mizuno, T. / Yamazaki, T. #1: ![]() タイトル: The yhhP Gene Encoding a Small Ubiquitous Protein is Fundamental for Normal Cell Growth of Escherichia Coli 著者: Yamashino, T. / Isomura, M. / Ueguchi, C. / Mizuno, T. #2: ![]() タイトル: Characterization of the yhhP Gene Whose Deficiency Results in a Non-Divided Filamentous Cell Morphology in Escherichia coli 著者: Ishii, Y. / Yamada, H. / Yamazaki, T. / Katoh, E. / Mizuno, T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 491.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 412 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9105.547 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化![]() | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル![]() |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: HYBRID DISTANCE GEOMETRY-SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURES ARE BASED ON A TOTAL OF 1655 RESTRAINTS, 1390 ARE NOE-DERIVED DISTANCE CONSTRAINTS, 211 DIHEDRAL ANGLE RESTRAINTS, 54 DISTANCE RESTRAINTS FROM HYDROGEN BONDS. | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |