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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1d9h | ||||||||||||||||||
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タイトル | Structural origins of the exonuclease resistance of a zwitterionic RNA | ||||||||||||||||||
![]() | DNA/RNA (5'-D(*![]() DNA / RNA / EXONUCLEASE RESISTANCE / A-DNA | 機能・相同性 | DNA/RNA hybrid | ![]() 手法 | ![]() ![]() Teplova, M. / Wallace, S.T. / Tereshko, V. / Minasov, G. / Simons, A.M. / Cook, P.D. / Manoharan, M. / Egli, M. | ![]() ![]() タイトル: Structural origins of the exonuclease resistance of a zwitterionic RNA 著者: Teplova, M. / Wallace, S.T. / Tereshko, V. / Minasov, G. / Symons, A.M. / Cook, P.D. / Manoharan, M. / Egli, M. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 23.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 15 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 378.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 378.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA/RNAハイブリッド | 分子量: 3104.073 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.88 Å3/Da / 溶媒含有率: 34.61 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: MPD, POTASSIUN CACODYLATE, KCL, SPERMINE, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 120 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.6→30 Å / Num. all: 6444 / Num. obs: 6444 / % possible obs: 94.8 % / Rmerge(I) obs: 0.086 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.6 Å |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.6→8 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.6 Å / 最低解像度: 8 Å / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |