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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1d96 | ||||||||||||||||||
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タイトル | MOLECULAR STRUCTURE OF R(GCG)D(TATACGC): A DNA-RNA HYBRID HELIX JOINED TO DOUBLE HELICAL DNA | ||||||||||||||||||
![]() | DNA/RNA (5'-R(*![]() DNA-RNA HYBRID / A-DNA/RNA / DOUBLE HELIX | 機能・相同性 | DNA/RNA hybrid | ![]() 手法 | ![]() ![]() Wang, A.H.-J. / Fujii, S. / Van Boom, J.H. / Van Der Marel, G.A. / Van Boeckel, S.A.A. / Rich, A. | ![]() ![]() タイトル: Molecular structure of r(GCG)d(TATACGC): a DNA--RNA hybrid helix joined to double helical DNA. 著者: Wang, A.H. / Fujii, S. / van Boom, J.H. / van der Marel, G.A. / van Boeckel, S.A. / Rich, A. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 20.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 11.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA/RNAハイブリッド | 分子量: 3093.005 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.1 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.42 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法 / pH: 6 / 詳細: pH 6.00, VAPOR DIFFUSION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS pH: 6 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 273 K |
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検出器 | タイプ: NICOLET / 検出器: DIFFRACTOMETER |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2 Å / Num. all: 3798 / Num. obs: 2521 / Observed criterion σ(I): 1.5 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Observed criterion σ(I): 1.5 |
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解析
ソフトウェア | 名称: NUCLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 最高解像度: 2 Å / σ(I): 1.5 /
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Refine Biso | クラス: ALL ATOMS / 詳細: TR / Treatment: isotropic | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2 Å
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精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.16 / 最高解像度: 2 Å / Num. reflection obs: 2521 / σ(I): 1.5 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |