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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cew | ||||||
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タイトル | THE 2.0 ANGSTROMS X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF CHICKEN EGG WHITE CYSTATIN AND ITS POSSIBLE MODE OF INTERACTION WITH CYSTEINE PROTEINASES | ||||||
![]() | CYSTATIN | ||||||
![]() | PROTEINASE INHIBITOR(CYSTEINE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() cysteine-type endopeptidase inhibitor activity / vesicle / extracellular space / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Bode, W. / Musil, D. / Huber, R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The 2.0 A X-ray crystal structure of chicken egg white cystatin and its possible mode of interaction with cysteine proteinases. 著者: Bode, W. / Engh, R. / Musil, D. / Thiele, U. / Huber, R. / Karshikov, A. / Brzin, J. / Kos, J. / Turk, V. #1: ![]() タイトル: Conformational Variability of Chicken Cystatin: Comparison of Structures Determined by X-Ray Diffraction and NMR-Spectroscopy 著者: Engh, R.A. / Dieckmann, T. / Bode, W. / Auerswald, E.A. / Turk, V. / Huber, R. / Oschkinat, H. #2: ![]() タイトル: The Structures of Native Phosphorylated Chicken Cystatin and of a Recombinant Unphosphorylated Variant in Solution 著者: Dieckmann, T. / Mitschang, L. / Hofmann, M. / Kos, J. / Turk, V. / Auerswald, E.A. / Jaenicke, R. / Oschkinat, H. #3: ![]() タイトル: The Cystatins: Protein Inhibitors of Cysteine Proteinases 著者: Turk, V. / Bode, W. #4: ![]() タイトル: Mechanism of Interaction of Cysteine Proteinases and Their Protein Inhibitors as Compared to the Serine Proteinase-Inhibitor Interaction 著者: Bode, W. / Engh, R. / Musil, D. / Laber, B. / Stubbs, M. / Huber, R. / Turk, V. #5: ![]() タイトル: Mechanism of Inhibition of Papain by Chicken Egg White Cystatin: Inhibition Constants of N-Terminally Truncated Forms and Cyanogen Bromide Fragments of the Inhibitor 著者: Machleidt, W. / Thiele, U. / Laber, B. / Assfalg-Machleidt, I. / Esterl, A. / Wiegand, G. / Kos, J. / Turk, V. / Bode, W. #6: ![]() タイトル: The Cysteine Proteinase Inhibitor Chicken Cystatin is a Phophoprotein 著者: Laber, B. / Krieglstein, K. / Henschen, A. / Kos, J. / Turk, V. / Huber, R. / Bode, W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 25.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 367.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 374.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: GLU I 88 - MET I 89 OMEGA =121.89 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12204.868 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.37 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.17 % | ||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 8.2 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Num. obs: 6715 / % possible obs: 75 % / Rmerge(I) obs: 0.105 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 2.2 Å / % possible obs: 30 % |
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解析
ソフトウェア | 名称: EREF / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.198 / 最高解像度: 2 Å | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: EREF / 分類: refinement | ||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 6 Å / Num. reflection obs: 6181 / Rfactor obs: 0.198 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 20 Å2 | ||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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