+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1c0b | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | BOVINE PANCREATIC RIBONUCLEASE A DESICCATED FOR 2.5 DAYS | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE A | ||||||
![]() | HYDROLASE / HYDROLASE (PHOSPHORIC DIESTER / RNA) / DESICCATED / DRY / DEHYDRATED | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic ribonuclease / ribonuclease A activity / RNA nuclease activity / nucleic acid binding / lyase activity / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bell, J.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: X-ray crystal structures of a severely desiccated protein 著者: Bell, J.A. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 32.5 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 24.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 429.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 447.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||||
単位格子 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14062.729 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
---|---|
#2: 化合物 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶化 | 温度: 295 K / 手法: small tubes / pH: 4.5 詳細: 58% methanol (v/v), pH 4.5, SMALL TUBES, temperature 295K |
---|
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: PRINCETON 2K / 検出器: CCD / 日付: 1996年9月25日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.918 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→99 Å / Num. all: 5880 / Num. obs: 5532 / % possible obs: 91 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 6.5 % / Biso Wilson estimate: 38.7 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.06 / Net I/σ(I): 33.2 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→2.1 Å / Num. unique all: 1229 / % possible all: 80 |
反射 | *PLUS 最低解像度: 9999 Å / Num. measured all: 38053 / Rmerge(I) obs: 0.06 |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 1.9→20 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(I): 1 / 立体化学のターゲット値: Protgeo 詳細: Final five cycles of refinement included all observed data
| ||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→20 Å
| ||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / バージョン: 5E / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / 最低解像度: 20 Å / % reflection Rfree: 10 % | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
|