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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1by0 | ||||||
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タイトル | N-TERMINAL LEUCINE-REPEAT REGION OF HEPATITIS DELTA ANTIGEN | ||||||
要素 | PROTEIN (HEPATITIS DELTA ANTIGEN) | ||||||
キーワード | RNA BINDING PROTEIN / HEPATITIS DELTA ANTIGEN / HELIX / SOLUTION STRUCTURE / RNA BINDING | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 virion component / viral penetration into host nucleus / host cell / symbiont entry into host cell / host cell nucleus / RNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Cheng, J.W. / Lin, I.J. / Lou, Y.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proteins / 年: 1999 タイトル: Solution structure and RNA-binding activity of the N-terminal leucine-repeat region of hepatitis delta antigen 著者: Lin, I.J. / Lou, Y.C. / Pai, M.T. / Wu, H.N. / Cheng, J.W. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1by0.cif.gz | 227.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1by0.ent.gz | 193.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1by0.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1by0_validation.pdf.gz | 340.9 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1by0_full_validation.pdf.gz | 476 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1by0_validation.xml.gz | 16.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1by0_validation.cif.gz | 25.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/by/1by0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/by/1by0 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3475.154 Da / 分子数: 1 / 断片: RESIDUES 24-50 / 由来タイプ: 合成 詳細: THE PROTEIN WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED FROM THE HEPATITIS D VIRUS 参照: UniProt: P25989 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: DISTANCE RESTRAINTS WERE REQUIRED FROM NOES ASSIGNED IN A 2D NOESY SPECTRUM WITH 75 MS MIXING TIME. |
-試料調製
試料状態 | pH: 6.8 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX600 / 製造業者: Bruker / モデル: DMX600 / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST TOTAL ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |