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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bwt | ||||||||||||||||||
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タイトル | NMR SOLUTION STRUCTURE OF [D(GCGAATCGC)2] | ||||||||||||||||||
要素 | DNA (5'-D(*キーワード | DNA / ECORI RECOGNITION SITE | 機能・相同性 | DNA | 機能・相同性情報 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | データ登録者 | Aramini, J.M. / Mujeeb, A. / Germann, M.W. | 引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 1998 | タイトル: NMR solution structures of [d(GCGAAT-3'-3'-alphaT-5'-5'-CGC)2] and its unmodified control. 著者: Aramini, J.M. / Mujeeb, A. / Germann, M.W. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bwt.cif.gz | 20.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bwt.ent.gz | 13.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bwt.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1bwt_validation.pdf.gz | 235.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1bwt_full_validation.pdf.gz | 235.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1bwt_validation.xml.gz | 1.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1bwt_validation.cif.gz | 1.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bw/1bwt ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bw/1bwt | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3045.005 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: MEAN STRUCTURE. THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING DISTANCE AND TORSION ANGLE RESTRAINTS OBTAINED FROM HOMONUCLEAR NOESY (125, 250 MS MIXING TIMES) AND DQF- COSY EXPERIMENTS. |
-試料調製
試料状態 | イオン強度: 50 mM NACL, 10 mM NAPHOSPHATE, 0.1 mM EDTA pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 303 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX600 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX600 / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | 計算したコンフォーマーの数: 9 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |