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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1brg | ||||||
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タイトル | CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF PHE->LEU SUBSTITUTION IN THE HYDROPHOBIC CORE OF BARNASE | ||||||
![]() | BARNASE | ||||||
![]() | ENDONUCLEASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / RNA endonuclease activity / RNA binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Chen, Y.W. / Fersht, A.R. / Henrick, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystallographic analysis of Phe-->Leu substitution in the hydrophobic core of barnase. 著者: Chen, Y.W. / Fersht, A.R. / Henrick, K. #1: ![]() タイトル: Contribution of Hydrophobic Interactions to Protein Stability 著者: Kellis Junior, J.T. / Nyberg, K. / Sali, D. / Fersht, A.R. #2: ![]() タイトル: Molecular Structures of a New Family of Ribonucleases 著者: Mauguen, Y. / Hartley, R.W. / Dodson, E.J. / Dodson, G.G. / Bricogne, G. / Chothia, C. / Jack, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 79.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 59.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 434.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 454.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 19 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 26.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12165.499 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P00648, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ #2: 化合物 | ChemComp-ZN / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.24 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.01 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Mauguen, Y., (1982) Nature, 297, 162. | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 6 Å / Num. obs: 15097 / % possible obs: 94 % / 冗長度: 1.5 % / Num. measured all: 26504 / Rmerge(I) obs: 0.08 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 2.26 Å / % possible obs: 77.1 % / 冗長度: 1.4 % / Rmerge(I) obs: 0.053 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→6 Å / σ(F): 3 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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