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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1b4c | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF RAT APO-S100B USING DIPOLAR COUPLINGS | ||||||
![]() | PROTEIN (S-100 PROTEIN, BETA CHAIN) | ||||||
![]() | METAL BINDING PROTEIN / S100BETA / S100B / DIPOLAR COUPLINGS / EF-HAND / S100 PROTEIN / CALCIUM- BINDING PROTEIN / FOUR-HELIX BUNDLE / THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE / SOLUTION STRUCTURE | ||||||
機能・相同性 | ![]() TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation / TRAF6 mediated NF-kB activation / Advanced glycosylation endproduct receptor signaling / negative regulation of skeletal muscle cell differentiation / adaptive thermogenesis / sympathetic neuron projection extension / positive regulation of myelination / RAGE receptor binding / response to methylmercury / astrocyte differentiation ...TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation / TRAF6 mediated NF-kB activation / Advanced glycosylation endproduct receptor signaling / negative regulation of skeletal muscle cell differentiation / adaptive thermogenesis / sympathetic neuron projection extension / positive regulation of myelination / RAGE receptor binding / response to methylmercury / astrocyte differentiation / S100 protein binding / neuron projection extension / response to anesthetic / regulation of neuronal synaptic plasticity / positive regulation of synaptic transmission / response to glucocorticoid / ruffle / positive regulation of neuron differentiation / tau protein binding / long-term synaptic potentiation / memory / calcium-dependent protein binding / regulation of cell shape / response to ethanol / cellular response to hypoxia / learning or memory / positive regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / cell adhesion / ciliary basal body / positive regulation of apoptotic process / signaling receptor binding / neuronal cell body / positive regulation of cell population proliferation / calcium ion binding / perinuclear region of cytoplasm / protein homodimerization activity / extracellular space / extracellular region / zinc ion binding / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / SEE MAIN REFERENCE | ||||||
![]() | Weber, D.J. / Drohat, A.C. / Tjandra, N. / Baldisseri, D.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The use of dipolar couplings for determining the solution structure of rat apo-S100B(betabeta). 著者: Drohat, A.C. / Tjandra, N. / Baldisseri, D.M. / Weber, D.J. #1: ![]() タイトル: Solution Structure of Rat Apo-S100B(beta beta) as Determined by NMR Spectroscopy 著者: Drohat, A.C. / Amburgey, J.C. / Abildgaard, F. / Starich, M.R. / Baldisseri, D.M. / Weber, D.J. #2: ![]() タイトル: ==1==H, ==13==C and ==15==N NMR Assignments and Solution Secondary Structure of Rat Apo-S100Beta 著者: Amburgey, J.C. / Abildgaard, F. / Starich, M.R. / Shah, S. / Hilt, D.C. / Weber, D.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 993.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 347 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 608 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 62.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 97.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10758.048 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: S100B IS A HOMODIMER OF S100BETA SUBUNITS / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: SEE MAIN REFERENCE |
NMR実験の詳細 | Text: SEE MAIN REFERENCE |
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試料調製
試料状態 | イオン強度: 25mM / pH: 6.5 / 圧: 1 atm / 温度: 310 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 600.13 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: SEE MAIN REFERENCE / ソフトェア番号: 1 / 詳細: SEE MAIN REFERENCE | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: SEE MAIN REFERENCE / 計算したコンフォーマーの数: 21 / 登録したコンフォーマーの数: 21 |