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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1b3i | ||||||
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タイトル | NMR SOLUTION STRUCTURE OF PLASTOCYANIN FROM THE PHOTOSYNTHETIC PROKARYOTE, PROCHLOROTHRIX HOLLANDICA (MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE) | ||||||
![]() | PROTEIN (PLASTOCYANIN) | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT / TYPE I COPPER PROTEIN / PHOTOSYNTHESIS | ||||||
機能・相同性 | ![]() electron transporter, transferring electrons from cytochrome b6/f complex of photosystem II activity / plasma membrane-derived thylakoid membrane / copper ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Babu, C.R. / Volkman, B.F. / Bullerjahn, G.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: NMR solution structure of plastocyanin from the photosynthetic prokaryote, Prochlorothrix hollandica. 著者: Babu, C.R. / Volkman, B.F. / Bullerjahn, G.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 40.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 27.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 294.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 294.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10148.560 Da / 分子数: 1 / 変異: T2S / 由来タイプ: 組換発現 詳細: T2S MUTATION INTRODUCED TO CLONE IN EXPRESSION VECTOR 由来: (組換発現) ![]() 解説: INCLUSION BODIES WERE REFOLDED IN-VITRO / 細胞内の位置: THYLAKOID LUMEN / 遺伝子: PETE / プラスミド: PVAPC10 細胞内の位置 (発現宿主): CYTOPLASM - INCLUSION BODIES 遺伝子 (発現宿主): PETE / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-CU1 / |
配列の詳細 | T2S - INTRODUCED |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE. THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TWO- DIMENCIONAL NMR SPECTROSCOPY. WATER SUPPRESSION WAS ACHIEVED WITH A WATERGATE SEQ. WITH A 3-9-19 SELECTIVE INVERSION. |
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試料調製
詳細 | 内容: 90% WATER/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 20mM POTASSIUM PHOSPHATE / pH: 7.0 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX750 / 製造業者: Bruker / モデル: DMX750 / 磁場強度: 750 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS ARE IN THE SUBMITTED FILE AND IN THE JRNL CITATION ABOVE. THE RESTRAINTS ARE IN THE FILES WITH THE 19 CONFORMERS. | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST TARGET FUNCTION 計算したコンフォーマーの数: 40 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |