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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1b1a | ||||||
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タイトル | GLUTAMATE MUTASE (B12-BINDING SUBUNIT), NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||
要素 | GLUTAMATE MUTASE | ||||||
キーワード | ISOMERASE (異性化酵素) / GLUTAMATE MUTASE / B12-BINDING SUBUNIT | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 メチルアスパラギン酸ムターゼ / anaerobic glutamate catabolic process / methylaspartate mutase activity / glutamate catabolic process via L-citramalate / cobalamin binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Clostridium cochlearium (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISTANCE GEOMETRY, SIMULATED ANNEALING, ENERGY MINIMIZATION | ||||||
データ登録者 | Hoffmann, B. / Konrat, R. / Bothe, H. / Buckel, W. / Kraeutler, B. | ||||||
引用 | ジャーナル: Eur.J.Biochem. / 年: 1999 タイトル: Structure and dynamics of the B12-binding subunit of glutamate mutase from Clostridium cochlearium. 著者: Hoffmann, B. / Konrat, R. / Bothe, H. / Buckel, W. / Krautler, B. #1: ジャーナル: Fems Microbiol.Lett. / 年: 1994 タイトル: Cloning, Sequencing and Expression in Escherichia Coli of the Gene Encoding Component S of the Coenzyme B12-Dependent Glutamate Mutase from Clostridium Cochlearium 著者: Zelder, O. / Beatrix, B. / Buckel, W. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1b1a.cif.gz | 52.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1b1a.ent.gz | 38.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1b1a.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b1/1b1a ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b1/1b1a | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14830.046 Da / 分子数: 1 / 断片: B12-BINDING SUBUNIT / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Clostridium cochlearium (バクテリア) 解説: DSM 1285 / 遺伝子: GLMS / プラスミド: POZ3 / 遺伝子 (発現宿主): GLMS / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): MC4100 参照: UniProt: P80078, メチルアスパラギン酸ムターゼ |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: MEAN STRUCTURE |
-試料調製
詳細 | 内容: 10% H2O/90% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 10mM K2HPO4/KH2PO4 / pH: 7.4 / 圧: ATMOSPHERIC atm / 温度: 299 K |
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITYPLUS / 製造業者: Varian / モデル: UNITYPLUS / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DISTANCE GEOMETRY, SIMULATED ANNEALING, ENERGY MINIMIZATION ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: MINIMIZED AVERAGE / 計算したコンフォーマーの数: 15 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |