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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ars | ||||||
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タイトル | X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDY OF PYRIDOXAL 5'-PHOSPHATE-TYPE ASPARTATE AMINOTRANSFERASES FROM ESCHERICHIA COLI IN OPEN AND CLOSED FORM | ||||||
![]() | ASPARTATE AMINOTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE(AMINOTRANSFERASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() L-phenylalanine biosynthetic process / L-phenylalanine biosynthetic process from chorismate via phenylpyruvate / L-tyrosine-2-oxoglutarate transaminase activity / aspartate catabolic process / aspartate transaminase / L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase activity / pyridoxal phosphate binding / protein homodimerization activity / identical protein binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Okamoto, A. / Higuchi, T. / Hirotsu, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: X-ray crystallographic study of pyridoxal 5'-phosphate-type aspartate aminotransferases from Escherichia coli in open and closed form. 著者: Okamoto, A. / Higuchi, T. / Hirotsu, K. / Kuramitsu, S. / Kagamiyama, H. #1: ![]() 年: 1991 タイトル: Three-Dimensional Structure of Aspartate Aminotransferase from Escherichia Coli 著者: Okamoto, A. / Hirotsu, K. / Higuchi, T. / Kuramitsu, S. / Kagamiyama, H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 87.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 69.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 388.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 403.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 138 / 2: CIS PROLINE - PRO 195 3: RESIDUE PLP 413 IS A PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE, AND AS A COFACTOR, MAKES A SCHIFF BASE WITH LYS 258. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 43619.215 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-PLP / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.08 Å3/Da / 溶媒含有率: 60.07 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 最高解像度: 1.8 Å / σ(F): 4 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 6 Å / Rfactor obs: 0.213 / Rfactor Rwork: 0.213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_deg / Dev ideal: 3.3 |