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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1an7 | ||||||
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タイトル | RIBOSOMAL PROTEIN S8 FROM THERMUS THERMOPHILUS | ||||||
![]() | RIBOSOMAL PROTEIN S8 | ||||||
![]() | RIBOSOMAL PROTEIN / RRNA-PROTEIN BINDING / PROTEIN-PROTEIN BINDING / THERMUS THERMOPHILUS | ||||||
機能・相同性 | ![]() cytosolic small ribosomal subunit / rRNA binding / structural constituent of ribosome / translation 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Nevskaya, N. / Nikonov, S. / Al-Karadaghi, S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of ribosomal protein S8 from Thermus thermophilus reveals a high degree of structural conservation of a specific RNA binding site. 著者: Nevskaya, N. / Tishchenko, S. / Nikulin, A. / al-Karadaghi, S. / Liljas, A. / Ehresmann, B. / Ehresmann, C. / Garber, M. / Nikonov, S. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary Crystallographic Analysis of Ribosomal Protein S8 from Thermus Thermophilus 著者: Tishchenko, S.V. / Vysotskaya, V.S. / Fomenkova, N.P. / Nikonov, S.V. / Ehresmann, B. / Garber, M.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 64.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 49.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.8928, 0.0842, -0.4425), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15624.214 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: VK1 / 細胞株: BL21 / 遺伝子: RPS8 / プラスミド: PET-TTHS8 / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.21 Å3/Da / 溶媒含有率: 60 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6 / 詳細: pH 6.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 24 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: Tishchenko, S.V., (1997) Proteins: Struct.,Funct., Genet., 27, 309. | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 300 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1996年2月10日 |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.9→20 Å / Num. obs: 8932 / % possible obs: 94.5 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.6 % / Biso Wilson estimate: 33.6 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.051 |
反射 シェル | 解像度: 2.9→2.95 Å / 冗長度: 3.2 % / Rmerge(I) obs: 0.019 / % possible all: 93.6 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 37 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→8 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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