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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1al1 | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF ALPHA1: IMPLICATIONS FOR PROTEIN DESIGN | ||||||
要素 | ALPHA HELIX PEPTIDE: ELLKKLLEELKG | ||||||
キーワード | SYNTHETIC PROTEIN MODEL | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.7 Å | ||||||
データ登録者 | Hill, C.P. / Anderson, D.H. / Wesson, L. / Degrado, W.F. / Eisenberg, D. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 1990 タイトル: Crystal structure of alpha 1: implications for protein design. 著者: Hill, C.P. / Anderson, D.H. / Wesson, L. / DeGrado, W.F. / Eisenberg, D. #1: ジャーナル: Proteins / 年: 1986 タイトル: The Design, Synthesis, and Crystallization of an Alpha-Helical Peptide 著者: Eisenberg, D. / Wilcox, W. / Eshita, S.M. / Pryciak, P.M. / Ho, S.P. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1al1.cif.gz | 9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1al1.ent.gz | 7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1al1.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1al1_validation.pdf.gz | 401.9 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1al1_full_validation.pdf.gz | 402.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1al1_validation.xml.gz | 2.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1al1_validation.cif.gz | 2.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/al/1al1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/al/1al1 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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2 |
| x 6||||||||
単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1441.775 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: The peptide was chemically synthesized |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.5 Å3/Da / 溶媒含有率: 64.91 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 30 ℃ / pH: 3.24 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.7→10 Å / Rfactor all: 0.255 / Rfactor obs: 0.211 / Data cutoff high absF: 2 | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||
精密化 | *PLUS σ(F): 2 / Rfactor all: 0.255 / Rfactor obs: 0.211 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 25 Å2 |