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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aia | ||||||
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タイトル | STRUCTURAL BASIS FOR THE CATALYTIC ACTIVITY OF ASPARTATE AMINOTRANSFERASE K258H LACKING THE PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE BINDING LYSINE RESIDUE | ||||||
![]() | ASPARTATE AMINOTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE(AMINOTRANSFERASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() L-phenylalanine biosynthetic process from chorismate via phenylpyruvate / L-tyrosine-2-oxoglutarate transaminase activity / L-phenylalanine biosynthetic process / aspartate transaminase / L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase activity / pyridoxal phosphate binding / protein homodimerization activity / identical protein binding / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Jaeger, J. / Jansonius, J.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for the catalytic activity of aspartate aminotransferase K258H lacking the pyridoxal 5'-phosphate-binding lysine residue. 著者: Malashkevich, V.N. / Jager, J. / Ziak, M. / Sauder, U. / Gehring, H. / Christen, P. / Jansonius, J.N. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 161.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 127.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 138 / 2: CIS PROLINE - PRO A 195 3: ARG B 29 - PRO B 30 OMEGA = 216.42 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 4: CIS PROLINE - PRO B 138 / 5: CIS PROLINE - PRO B 195 | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.99999, -0.00064, -0.00015), ベクター: 詳細 | THE ASYMMETRIC UNIT CONTAINS A DIMER OF ASPARTATE AMINOTRANSFERASE. | |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 43628.180 Da / 分子数: 2 / 変異: K246H / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | 配列の詳細 | THE RESIDUE NUMBERING USED IN THIS ENTRY CONFORMS TO THE AMINO ACID SEQUENCE OF THE CHICKEN ...THE RESIDUE NUMBERING USED IN THIS ENTRY CONFORMS TO THE AMINO ACID SEQUENCE OF THE CHICKEN CYTOSOLIC ISOENZYME. HENCE, THE RESIDUE NUMBERING STARTS WITH MET 5 AND RESIDUES 127, 128, 130, 131, 132, 153, 232 AND 406 OF BOTH CHAINS HAVE NOT BEEN INCLUDED. | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.13 Å3/Da / 溶媒含有率: 60.66 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.5 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. all: 89322 / Num. obs: 49125 / % possible obs: 90.1 % / Rmerge(I) obs: 0.061 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→10 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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