分子量: 7483.630 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: THE PROTEIN STUDIED EXCLUDES THE PRECURSOR SIGNAL SEQUENCE. THIS IS THE NATIVE FORM OF THE PROTEIN AFTER CELL PROCESSING. 由来: (組換発現) Shigella flexneri (フレクスナー赤痢菌) 解説: MER GENES LOCATED ON TRANSPOSON TN21 / 細胞内の位置: PERIPLASM / 遺伝子: MERP / プラスミド: PSSS / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 遺伝子 (発現宿主): MERP / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: P04129
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
HMQC-NOESY
1
2
1
HMQC-TOCSY
1
3
1
HNCA
1
4
1
HN(CO)CA
1
5
1
CBCA(CO)NH
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試料調製
試料状態
pH: 6.5 / 温度: 300 K
結晶化
*PLUS
手法: other / 詳細: NMR
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker DMX500
Bruker
DMX500
500
1
Bruker DMX600
Bruker
DMX600
600
2
Bruker DMX750
Bruker
DMX750
750
3
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
X-PLOR
3.1
モデル構築
X-PLOR
3.1
精密化
X-PLOR
3.1
位相決定
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR
3.1
BRUNGER
精密化
X-PLOR
構造決定
精密化
手法: DISTANCE GEOMETRY SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. IN SUMMARY, INITIAL CALCULATIONS WERE STARTED FROM A LINEAR POLYPEPTIDE TEMPLATE WITH RANDOM BACKBONE ANGLES. AN ITERATIVE ...詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. IN SUMMARY, INITIAL CALCULATIONS WERE STARTED FROM A LINEAR POLYPEPTIDE TEMPLATE WITH RANDOM BACKBONE ANGLES. AN ITERATIVE REFINEMENT WAS EMPLOYED USING ADDITIONAL RESTRAINTS AS THE QUALITY OF THE STRUCTURES IMPROVED AND AMBIGUITIES IN THE DATA WERE RESOLVED.
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 80 / 登録したコンフォーマーの数: 20