- PDB-1af1: THE SOLUTION NMR STRUCTURE OF AN R-STYRENE OXIDE ADDUCT AT THE N2... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 1af1
タイトル
THE SOLUTION NMR STRUCTURE OF AN R-STYRENE OXIDE ADDUCT AT THE N2 POSITION OF GUANINE OF AN 11 BASE-PAIR OLIGONUCLEOTIDE SEQUENCE CODING FOR AMINO ACIDS 11-13 OF THE PRODUCT OF THE N-RAS PROTOONCOGENE, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
要素
DNA (5'-D(*CP*AP*CP*CP*AP*CP*CP*TP*GP*CP*C)-3')
DNA (5'-D(*GP*GP*CP*AP*GP*GSRP*TP*GP*GP*TP*G)-3')
キーワード
DNA / DNA DUPLEX / HUMAN N-RAS GENE / CODON 12 SEQUENCE / R-STYRENE OXIDE / MINOR GROOVE ADDUCT / DEOXYRIBONUCLEIC ACID
タイプ: Bruker AMX500 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX500 / 磁場強度: 500 MHz
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
X-PLOR
3.1
モデル構築
X-PLOR
3.1
精密化
X-PLOR
3.1
位相決定
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR
3.1
BRUNGER
精密化
Felix
構造決定
X-PLOR
構造決定
MARDIGRAS
構造決定
CORMA
構造決定
精密化
手法: NOE-RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS, SIMULATED ANNEALING ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE.
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: THIS STRUCTURE PROVIDED THE BEST-FIT FOR THE NOE DATA BASED ON THE RELAXATION MATRIX ANALYSIS USING CORMA. 計算したコンフォーマーの数: 1 / 登録したコンフォーマーの数: 1