PDB-1ad7: NMR STRUCTURE OF METAL-FREE CONANTOKIN G, 1 STRUCTURE

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 1ad7

タイトル

NMR STRUCTURE OF METAL-FREE CONANTOKIN G, 1 STRUCTURE

要素

CONANTOXIN G

キーワード

GAMMA-CARBOXYGLUTAMIC ACID / CONANTOKIN G / CONOTOXIN

機能・相同性

Conantokin, conserved site / Conantokin family signature. / host cell postsynaptic membrane / ion channel regulator activity / toxin activity / extracellular region / metal ion binding / Conantokin-G

機能・相同性情報

生物種

Conus geographus (アンボイナ)

手法

溶液NMR / DG

データ登録者

Rigby, A.C. / Baleja, J.D. / Furie, B.C. / Furie, B.

引用

ジャーナル: Biochemistry / 年: 1997
タイトル: Three-dimensional structure of a gamma-carboxyglutamic acid-containing conotoxin, conantokin G, from the marine snail Conus geographus: the metal-free conformer.
著者: Rigby, A.C. / Baleja, J.D. / Furie, B.C. / Furie, B.

履歴

登録	1997年2月21日	処理サイト: BNL
改定 1.0	1997年8月20日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2008年3月24日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.3	2015年10月21日	Group: Source and taxonomy
改定 1.4	2024年6月5日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_nmr_software / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.process_site / _pdbx_nmr_software.name / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	1ad7.cif.gz	13.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb1ad7.ent.gz	8.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	1ad7.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ad/1ad7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ad/1ad7	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	6g4x-d 2wna-d 1p83-d 2lsa-d 2mhw-d 333d-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: CONANTOXIN G

2.27 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

NMR アンサンブル

	データ	基準
コンフォーマー数 (登録 / 計算)	1 / 20	LOWEST ENERGY
代表モデル

#1: タンパク質・ペプチド	CONANTOXIN G 分子量: 2265.196 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: C-TERMINAL AMIDE, SYNTHETIC PEPTIDE / 由来: (合成) Conus geographus (アンボイナ) / 参照: UniProt: P07231

-
実験

実験

手法: 溶液NMR

NMR実験

Conditions-ID	Experiment-ID	Solution-ID	タイプ
1	1	1	TOCSY
1	2	1	NOESY

-
試料調製

試料状態	pH: 5.6 / 温度: 298 K
結晶化	*PLUS 手法: other / 詳細: NMR

-
NMR測定

NMRスペクトロメーター	タイプ: Bruker AMX / 製造業者: Bruker / モデル: AMX / 磁場強度: 500 MHz

-
解析

NMR software

名称	開発者	分類
DGII	HAVEL	精密化
Insight II		構造決定

精密化

手法: DG / ソフトェア番号: 1

NMRアンサンブル

コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 1

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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