分子量: 6729.044 Da / 分子数: 1 / 断片: RBS AND START SITE FOR PHAGE GA REPLICASE GENE / 変異: A5U, A6U / 由来タイプ: 合成 詳細: IN VITRO SYNTHESIS FROM DNA TEMPLATE USING T7 RNA POLYMERASE. HAIRPIN CORRESPONDS TO NT -16 - +5 OF PHAGE GA REPLICASE AND THE YEAST PRE-MRNA BRANCHPOINT HELIX
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
2D/3D NOESY
1
2
1
COSY
1
3
1
HETCOR
NMR実験の詳細
Text: FURTHER DETAILS OF DATA ACQUISITION AND STRUCTURE CALCULATION CAN BE FOUND IN THE METHODS SECTION OF THE MANUSCRIPT LISTED ABOVE. MODELS 1-6 ARE MINIMIZED STRUCTURES CALCULATED WITHOUT BASE ...Text: FURTHER DETAILS OF DATA ACQUISITION AND STRUCTURE CALCULATION CAN BE FOUND IN THE METHODS SECTION OF THE MANUSCRIPT LISTED ABOVE. MODELS 1-6 ARE MINIMIZED STRUCTURES CALCULATED WITHOUT BASE PAIR CONSTRAINTS FOR A6, A7, AND U16. MODELS 7-12 ARE MINIMIZED STRUCTURES CALCULATED USING A6-U16 BASE PAIR CONSTRAINTS AND AN A7 N1H-U16 O2 HYDROGEN BOND.
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試料調製
詳細
内容: 10% H2O/90% D2O, 100% D2O
試料状態
イオン強度: 20 mM / pH: 6.8 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K
結晶化
*PLUS
手法: その他 / 詳細: NMR
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker AMX500 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX500 / 磁場強度: 500 MHz
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
X-PLOR
3.1
モデル構築
X-PLOR
3.1
精密化
X-PLOR
3.1
位相決定
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR
3.1
BRUNGER
精密化
Felix
950
構造決定
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE.
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION 計算したコンフォーマーの数: 75 / 登録したコンフォーマーの数: 12