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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | GABA-DGABAB-Gi-complex | |||||||||
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![]() | GPCR / DGABAB / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | ![]() negative regulation of synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane / olfactory behavior / G protein-coupled GABA receptor activity / G protein-coupled receptor heterodimeric complex / gamma-aminobutyric acid signaling pathway / adenylate cyclase inhibitor activity / positive regulation of protein localization to cell cortex / Adenylate cyclase inhibitory pathway / T cell migration / D2 dopamine receptor binding ...negative regulation of synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane / olfactory behavior / G protein-coupled GABA receptor activity / G protein-coupled receptor heterodimeric complex / gamma-aminobutyric acid signaling pathway / adenylate cyclase inhibitor activity / positive regulation of protein localization to cell cortex / Adenylate cyclase inhibitory pathway / T cell migration / D2 dopamine receptor binding / response to prostaglandin E / adenylate cyclase regulator activity / G protein-coupled serotonin receptor binding / adenylate cyclase-inhibiting serotonin receptor signaling pathway / cellular response to forskolin / regulation of mitotic spindle organization / Regulation of insulin secretion / positive regulation of cholesterol biosynthetic process / negative regulation of insulin secretion / cellular response to mechanical stimulus / G protein-coupled receptor binding / response to peptide hormone / adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway / adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway / G-protein beta/gamma-subunit complex binding / centriolar satellite / Olfactory Signaling Pathway / Activation of the phototransduction cascade / G beta:gamma signalling through PLC beta / Presynaptic function of Kainate receptors / Thromboxane signalling through TP receptor / G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway / G-protein activation / Activation of G protein gated Potassium channels / Inhibition of voltage gated Ca2+ channels via Gbeta/gamma subunits / Prostacyclin signalling through prostacyclin receptor / G beta:gamma signalling through CDC42 / Glucagon signaling in metabolic regulation / G beta:gamma signalling through BTK / Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1) / ADP signalling through P2Y purinoceptor 12 / photoreceptor disc membrane / Sensory perception of sweet, bitter, and umami (glutamate) taste / Glucagon-type ligand receptors / Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion / Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins / GDP binding / Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion / G alpha (z) signalling events / cellular response to catecholamine stimulus / ADP signalling through P2Y purinoceptor 1 / ADORA2B mediated anti-inflammatory cytokines production / G beta:gamma signalling through PI3Kgamma / Cooperation of PDCL (PhLP1) and TRiC/CCT in G-protein beta folding / adenylate cyclase-activating dopamine receptor signaling pathway / GPER1 signaling / Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade / cellular response to prostaglandin E stimulus / G-protein beta-subunit binding / heterotrimeric G-protein complex / G alpha (12/13) signalling events / sensory perception of taste / extracellular vesicle / signaling receptor complex adaptor activity / Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs) / retina development in camera-type eye / G protein activity / GTPase binding / Ca2+ pathway / fibroblast proliferation / midbody / High laminar flow shear stress activates signaling by PIEZO1 and PECAM1:CDH5:KDR in endothelial cells / cell cortex / G alpha (i) signalling events / G alpha (s) signalling events / phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / G alpha (q) signalling events / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / Ras protein signal transduction / Extra-nuclear estrogen signaling / cell population proliferation / ciliary basal body / G protein-coupled receptor signaling pathway / lysosomal membrane / cell division / GTPase activity / synapse / centrosome / GTP binding / protein-containing complex binding / nucleolus / magnesium ion binding / Golgi apparatus / signal transduction / extracellular exosome / nucleoplasm / membrane / plasma membrane / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.06 Å | |||||||||
![]() | shen CS / liu JF | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis of GABAB receptor activation during evolution 著者: shen CS / liu JF | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 117 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 21.3 KB 21.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 14.6 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 14.2 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 125 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 7.1 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 98.3 MB 98.3 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 968 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 967.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 24.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 9jr0MC ![]() 9jqxC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.93 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_61745_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_61745_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : DGABAB-Gi
全体 | 名称: DGABAB-Gi |
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要素 |
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-超分子 #1: DGABAB-Gi
超分子 | 名称: DGABAB-Gi / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#5 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: Metabotropic GABA-B receptor subtype 1
分子 | 名称: Metabotropic GABA-B receptor subtype 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 88.52825 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: GVAGRPDELH IGGIFPIAGK GGWQGGQACM PATRLALDDV NKQPNLLPGF KLILHSNDSE CEPGLGASVM YNLLYNKPQK LMLLAGCST VCTTVAEAAK MWNLIVLCYG ASSPALSDRK RFPTLFRTHP SATVHNPTRI KLMKKFGWSR VAILQQAEEV F ISTVEDLE ...文字列: GVAGRPDELH IGGIFPIAGK GGWQGGQACM PATRLALDDV NKQPNLLPGF KLILHSNDSE CEPGLGASVM YNLLYNKPQK LMLLAGCST VCTTVAEAAK MWNLIVLCYG ASSPALSDRK RFPTLFRTHP SATVHNPTRI KLMKKFGWSR VAILQQAEEV F ISTVEDLE NRCMEAGVEI VTRQSFLSDP TDAVRNLRRQ DARIIVGLFY VVAARRVLCE MYKQQLYGRA HVWFFIGWYE DN WYEVNLK AEGITCTVEQ MRIAAEGHLT TEALMWNQNN QTTISGMTAE EFRHRLNQAL IEEGYDINHD RYPEGYQEAP LAY DAVWSV ALAFNKTMER LTTGKKSLRD FTYTDKEIAD EIYAAMNSTQ FLGVSGVVAF SSQGDRIALT QIEQMIDGKY EKLG YYDTQ LDNLSWLNTE QWIGGKVPQD RTIVTHVLRT VSLPLFVCMC TISSCGIFVA FALIIFNIWN KHRRVIQSSH PVCNT IMLF GVIICLISVI LLGIDGRFVS PEEYPKICQA RAWLLSTGFT LAYGAMFSKV WRVHRFTTKA KTDPKKKVEP WKLYTM VSG LLSIDLVILL SWQIFDPLQR YLETFPLEDP VSTTDDIKIR PELEHCESQR NSMWLGLVYG FKGLILVFGL FLAYETR SI KVKQINDSRY VGMSIYNVVV LCLITAPVGM VIASQQDASF AFVALAVIFC CFLSMLLIFV PKVIEVIRHP KDKAESKY N PDSAISKEDE ERYQKLVTEN EQLQRLITQK EEKIRVLRQR LVERGDAKGT ELEVLFQGP UniProtKB: Metabotropic GABA-B receptor subtype 1 |
-分子 #2: Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2
分子 | 名称: Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 87.493703 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: RTAKRSDVYI AGFFPYGDGV ENSYTGRGVM PSVKLALGHV NEHGKILANY RLHMWWNDTQ CNAAVGVKSF FDMMHSGPNK VMLFGAACT HVTDPIAKAS KHWHLTQLSY ADTHPMFTKD AFPNFFRVVP SENAFNAPRL ALLKEFNWTR VGTVYQNEPR Y SLPHNHMV ...文字列: RTAKRSDVYI AGFFPYGDGV ENSYTGRGVM PSVKLALGHV NEHGKILANY RLHMWWNDTQ CNAAVGVKSF FDMMHSGPNK VMLFGAACT HVTDPIAKAS KHWHLTQLSY ADTHPMFTKD AFPNFFRVVP SENAFNAPRL ALLKEFNWTR VGTVYQNEPR Y SLPHNHMV ADLDAMEVEV VETQSFVNDV AESLKKLREK DVRIILGNFN EHFARKAFCE AYKLDMYGRA YQWLIMATYS TD WWNVTQD SECSVEEIAT ALEGAILVDL LPLSTSGDIT VAGITADEYL VEYDRLRGTE YSRFHGYTYD GIWAAALAIQ YVA EKREDL LTHFDYRVKD WESVFLEALR NTSFEGVTGP VRFYNNERKA NILINQFQLG QMEKIGEYHS QKSHLDLSLG KPVK WVGKT PPKDRTLIYI EHSQVNPTIY IVSASASVIG VIIATVFLAF NIKYRNQRYI KMSSPHLNNL IIVGCMITYL SIIFL GLDT TLSSVAAFPY ICTARAWILM AGFSLSFGAM FSKTWRVHSI FTDLKLNKKV IKDYQLFMVV GVLLAIDIAI ITTWQI ADP FYRETKQLEP LHHENIDDVL VIPENEYCQS EHMTIFVSII YAYKGLLLVF GAFLAWETRH VSIPALNDSK HIGFSVY NV FITCLAGAAI SLVLSDRKDL VFVLLSFFII FCTTATLCLV FVPKLVELKR NPQGVVDKRV RATLRPMSKN GRRDSSVC E LEQRLRDVKN TNCRFRKALM EKENELQALI RKLGPEARKW IDGVTC UniProtKB: Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 |
-分子 #3: Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1
分子 | 名称: Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO EC番号: 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 40.414047 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MGCTLSAEDK AAVERSKMID RNLREDGEKA AREVKLLLLG AGESGKNTIV KQMKIIHEAG YSEEECKQYK AVVYSNTIQS IIAIIRAMG RLKIDFGDSA RADDARQLFV LAGAAEEGFM TAELAGVIKR LWKDSGVQAC FNRSREYQLN DSAAYYLNDL D RIAQPNYI ...文字列: MGCTLSAEDK AAVERSKMID RNLREDGEKA AREVKLLLLG AGESGKNTIV KQMKIIHEAG YSEEECKQYK AVVYSNTIQS IIAIIRAMG RLKIDFGDSA RADDARQLFV LAGAAEEGFM TAELAGVIKR LWKDSGVQAC FNRSREYQLN DSAAYYLNDL D RIAQPNYI PTQQDVLRTR VKTTGIVETH FTFKDLHFKM FDVGAQRSER KKWIHCFEGV TAIIFCVALS DYDLVLAEDE EM NRMHASM KLFDSICNNK WFTDTSIILF LNKKDLFEEK IKKSPLTICY PEYAGSNTYE EAAAYIQCQF EDLNKRKDTK EIY THFTCS TDTKNVQFVF DAVTDVIIKN NLKDCGLF UniProtKB: Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 |
-分子 #4: Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1
分子 | 名称: Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 39.418086 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MHHHHHHLEV LFQGPGSSGS ELDQLRQEAE QLKNQIRDAR KACADATLSQ ITNNIDPVGR IQMRTRRTLR GHLAKIYAMH WGTDSRLLV SASQDGKLII WDSYTTNKVH AIPLRSSWVM TCAYAPSGNY VACGGLDNIC SIYNLKTREG NVRVSRELAG H TGYLSCCR ...文字列: MHHHHHHLEV LFQGPGSSGS ELDQLRQEAE QLKNQIRDAR KACADATLSQ ITNNIDPVGR IQMRTRRTLR GHLAKIYAMH WGTDSRLLV SASQDGKLII WDSYTTNKVH AIPLRSSWVM TCAYAPSGNY VACGGLDNIC SIYNLKTREG NVRVSRELAG H TGYLSCCR FLDDNQIVTS SGDTTCALWD IETGQQTTTF TGHTGDVMSL SLAPDTRLFV SGACDASAKL WDVREGMCRQ TF TGHESDI NAICFFPNGN AFATGSDDAT CRLFDLRADQ ELMTYSHDNI ICGITSVSFS KSGRLLLAGY DDFNCNVWDA LKA DRAGVL AGHDNRVSCL GVTDDGMAVA TGSWDSFLKI WN UniProtKB: Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 |
-分子 #5: Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2
分子 | 名称: Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 7.861143 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MASNNTASIA QARKLVEQLK MEANIDRIKV SKAAADLMAY CEAHAKEDPL LTPVPASENP FREKKFFCAI L UniProtKB: Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 |
-分子 #6: GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID
分子 | 名称: GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID / タイプ: ligand / ID: 6 / コピー数: 1 / 式: ABU |
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分子量 | 理論値: 103.12 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-ABU: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | 3D array |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI POLARA 300 |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 7.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company |