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- EMDB-53347: Structure of the 50S ribosomal subunit from the antibiotic-produc... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-53347
タイトルStructure of the 50S ribosomal subunit from the antibiotic-producing bacterium Streptomyces fradiae
マップデータ
試料
  • 複合体: Streptomyces fradiae ribosome
    • タンパク質・ペプチド: x 28種
    • RNA: x 2種
キーワードStreptomyces / ribosome / 50S / ribosome-targeting antibiotics
機能・相同性
機能・相同性情報


large ribosomal subunit / transferase activity / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding ...large ribosomal subunit / transferase activity / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / : / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site ...Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / : / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / : / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / : / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L32p, bacterial type / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L18, bacterial-type / : / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / : / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L35 superfamily / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / Ribosomal protein L33 / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein L30, bacterial-type / L28p-like / Ribosomal protein L16 / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20, C-terminal / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 superfamily / : / Large ribosomal subunit protein uL24, C-terminal domain / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L17 superfamily / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L24 / Ribosomal L32p protein family / Ribosomal protein L21 / Ribosomal protein L32p / Ribosomal protein L21-like / L21-like superfamily / Ribosomal prokaryotic L21 protein / Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type / Ribosomal protein L15, bacterial-type / 50S ribosomal protein uL4 / Ribosomal protein L13, bacterial-type / Ribosomal protein L23/L25, conserved site / Ribosomal protein L23 signature. / Ribosomal protein L30, conserved site / Ribosomal protein L30 signature. / Ribosomal protein L5, conserved site
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Large ribosomal subunit protein uL29 ...Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein bL9 / Large ribosomal subunit protein bL25
類似検索 - 構成要素
生物種Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.13 Å
データ登録者Ekemezie CL / Melnikov SV
資金援助 英国, 2件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MR/N013840/1 英国
Royal SocietyRGS/R2/202003 英国
引用ジャーナル: Cell Rep / 年: 2025
タイトル: Extensive natural variation in bacterial ribosomal drug-binding sites.
著者: Chinenye L Ekemezie / Lewis I Chan / Charlotte R Brown / Karla Helena-Bueno / Tom A Williams / Sergey V Melnikov /
要旨: Ribosomes from certain bacteria possess divergent drug-binding sites compared to those of Escherichia coli, leading to natural evasion or hypersensitivity to antibiotics. However, in the absence of ...Ribosomes from certain bacteria possess divergent drug-binding sites compared to those of Escherichia coli, leading to natural evasion or hypersensitivity to antibiotics. However, in the absence of systematic studies, it is unknown whether this divergence is rare or common among bacterial species. Here, we address this by reconstructing the evolutionary history of drug-binding residues in bacterial ribosomes. We find that many rRNA residues that are currently viewed as bacterial-specific features of ribosomal drug-binding sites are in fact conserved only in a subset of bacteria. Conversely, species with divergent drug-binding sites are widespread in nature, arising from ancient rRNA polymorphisms at the direct ribosome-drug interface. Using a few bacterial species harboring divergent drug-binding sites, we identify their intrinsic resistance to corresponding ribosome-targeting antibiotics. Overall, we reveal the extensive lineage-specific diversity of ribosomal drug-binding sites, offering a resource for developing more targeted antibiotics and enabling personalized drug selection for specific pathogens.
履歴
登録2025年4月7日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年5月14日-
マップ公開2025年5月14日-
更新2025年11月26日-
現状2025年11月26日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_53347.png

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_53347.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

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その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.93 Å/pix.
x 512 pix.
= 478.208 Å		0.93 Å/pix.
x 512 pix.
= 478.208 Å		0.93 Å/pix.
x 512 pix.
= 478.208 Å

表面

投影像

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断面 (1/2)

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ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.934 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0769
最小 - 最大-0.1749859 - 0.44742438
平均 (標準偏差)-0.000068282825 (±0.018293345)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 478.208 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_53347_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_53347_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Streptomyces fradiae ribosome

全体名称: Streptomyces fradiae ribosome
要素
  • 複合体: Streptomyces fradiae ribosome
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL16
    • RNA: 5S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL2
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL3
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL4
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL5
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL6
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL9
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL13
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL14
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL18
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL15
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL19
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL20
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL21
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL22
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL23
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL24
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL25
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL27
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL28
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL29
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL30
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL32
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL33
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL34
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL35
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL36
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL17
    • RNA: 23S rRNA

+
超分子 #1: Streptomyces fradiae ribosome

超分子名称: Streptomyces fradiae ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#30
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 2.5 MDa

+
分子 #1: Large ribosomal subunit protein uL16

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 15.829605 KDa
配列文字列:
MLIPRRVKHR KQHHPKRSGM SKGGTQVAFG EYGIQALTPA YVTNRQIEAA RIAMTRHIKR GGKVWINIYP DRPLTKKPAE TRMGSGKGS PEWWVANVKP GRVMFELSYP NEKIAREALT RAAHKLPMKC RIVRREAGEA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #3: Large ribosomal subunit protein uL2

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 30.492934 KDa
配列文字列: MGIRKYKPTT PGRRGSSVAD FVEITRSTPE KSLVRPLHSK GGRNNTGRVT VRHQGGGHKR AYRVIDFRRH DKDGVPAKVA HIEYDPNRT ARIALLHYAD GEKRYIIAPR GLSQGDRIEN GPGADIKPGN NLALRNIPVG TTIHAIELRP GGGAKFARSA G ASVQLLAK ...文字列:
MGIRKYKPTT PGRRGSSVAD FVEITRSTPE KSLVRPLHSK GGRNNTGRVT VRHQGGGHKR AYRVIDFRRH DKDGVPAKVA HIEYDPNRT ARIALLHYAD GEKRYIIAPR GLSQGDRIEN GPGADIKPGN NLALRNIPVG TTIHAIELRP GGGAKFARSA G ASVQLLAK EGSMAHLRMP SGEIRLVDVR CRATIGEVGN AEQSNINWGK AGRKRWLGVR PTVRGVAMNP VDHPHGGGEG KT SGGRHPV SPWGQKEGRT RSPKKASNKY IVRRRKTNKK R

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #4: Large ribosomal subunit protein uL3

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 22.682186 KDa
配列文字列: MAKNIKGVLG EKLGMTQVWD ENNRVVPVTV VKAGPCVVTQ VRSNDTDGYE SVQIAFGEID PRKVNKPLKG HFAKADVTPR RHLVEIRTA DASEYTLGQE ITAAVFEAGV KVDVTGKSKG KGFAGVMKRH NFRGLGAGHG TQRKHRSPGS IGGCATPGRV F KGLRMAGR ...文字列:
MAKNIKGVLG EKLGMTQVWD ENNRVVPVTV VKAGPCVVTQ VRSNDTDGYE SVQIAFGEID PRKVNKPLKG HFAKADVTPR RHLVEIRTA DASEYTLGQE ITAAVFEAGV KVDVTGKSKG KGFAGVMKRH NFRGLGAGHG TQRKHRSPGS IGGCATPGRV F KGLRMAGR MGNERVTTQN LTVHAVDAEK GLLLIKGAVP GPNGGLVLVR TAAKGA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #5: Large ribosomal subunit protein uL4

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 23.112234 KDa
配列文字列: MSTIDILSPA GDKAGTVELP SEIFDAKTSV PLIHQVVVAQ LAAARQGTHK TKTRGEVRGG GKKPYRQKGT GRARQGSTRA PQFAGGGVV HGPVPRDYSQ RTPKKMKAAA LRGALSDRAR HSRIHVVTGV VEGEISTKAA KTLFGKISER KNLLLVVERS D EAAWLSAR ...文字列:
MSTIDILSPA GDKAGTVELP SEIFDAKTSV PLIHQVVVAQ LAAARQGTHK TKTRGEVRGG GKKPYRQKGT GRARQGSTRA PQFAGGGVV HGPVPRDYSQ RTPKKMKAAA LRGALSDRAR HSRIHVVTGV VEGEISTKAA KTLFGKISER KNLLLVVERS D EAAWLSAR NLPQVHILEP GQLNTYDVLV SDDVVFTKAA FESFVSGPQT AETEGSDA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #6: Large ribosomal subunit protein uL5

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 20.97108 KDa
配列文字列:
MATTTTPRLK TKYREEIVGK LRDEFSYENV MQVPGLVKIV VNMGVGDAAR DSKLIEGAIR DLTTITGQKP AVTKARKSIA QFKLREGQP IGAHVTLRGD RMWEFLDRTL SLALPRIRDF RGLSPKQFDG RGNYTFGLTE QVMFHEIDQD KIDRVRGMDI T VVTTATND DEGRALLRHL GFPFKEN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #7: Large ribosomal subunit protein uL6

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 19.174201 KDa
配列文字列:
MSRIGKLPIT VPAGVDVTID GRTVEVKGPK GTLTHTVAAP IEIVKGEDGV LNVTRPNDER QNKALHGLSR TLVANMITGV TQGYTKALE ISGVGYRVAA KGSNLEFQLG YSHPILVEAP EGISFKVESP TKFSVEGIDK QKVGEVAANI RKLRKPDPYK A KGVKYAGE VIRRKVGKAG K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #8: Large ribosomal subunit protein bL9

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 15.794217 KDa
配列文字列:
MKIILTHEVS GLGAAGDVVD VKDGYARNYL VPRGFAIRWT KGGEKDVAQI RRARKIHEIA TIEQANQIKA QLESVKVRLA VRSGDAGRL FGSVTPADIA SAIKSAGGPE VDKRRVELGS PIKTLGSHQV SVRLHPEVAA KLGVEVVAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9

+
分子 #9: Large ribosomal subunit protein uL13

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 16.301764 KDa
配列文字列:
MRTYSPKPGD VTRQWHVIDA QDVVLGRLAT TAATLLRGKH KPIYAPHVDA GDFVIIINAD KVHLSGNKRT QKMAYRHSGY PGGLRSVRY DDLLANNPEK AVEKAVKGML PKNSLGRQML SKLKVYAGEN HPHAAQQPVP FEITQVAQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #10: Large ribosomal subunit protein uL14

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 13.426666 KDa
配列文字列:
MIQQESRLRV ADNTGAKEIL CIRVLGGSGR RYAGIGDVIV ATVKDAIPGG NVKKGDVVKA VIVRTVKERR RQDGSYIRFD ENAAVILKN DGDPRGTRIF GPVGRELREK KFMKIISLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #11: Large ribosomal subunit protein uL18

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 13.341402 KDa
配列文字列:
MAYGVKIAKG KAYKGAALKR RHIRIRKKVS GTAERPRLVV TRSNRGITAQ VIDDIAGHTV ASASTLDASI RGGEGDKSAK AQQVGKLVA ERAKAAGVEA VVFDRGGNRY AGRIAALADA AREAGLKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #12: Large ribosomal subunit protein uL15

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 16.01954 KDa
配列文字列:
MAENNPLKIH NLRPAPGAKT AKTRVGRGEA SKGKTAGRGT KGTKARYQVP ERFEGGQMPL HMRLPKLKGF KNPFKTEYQV VNLDKLASL YPEGGEVTVA DLVAKGAVRK NQLVKVLGQG EVSVALQVTV DAVSGSAKEK ITAAGGSVTE LV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #13: Large ribosomal subunit protein bL19

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 13.173204 KDa
配列文字列:
MSHVLDAVNA ASLRSDVPAF RPGDTVNVHV RVIEGNRSRI QQFKGVVIRR QGSGVSETFT VRKVSFSVGV ERTFPVHSPI FEKIELVTR GDVRRAKLYY LRELRGKAAK IKEKREN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #14: Large ribosomal subunit protein bL20

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 14.460655 KDa
配列文字列:
MARVKRAVNA HKKRRAILEQ ASGYRGQRSR LYRKAKEQVT HSLVYNYNDR KKRKGDFRQL WIQRINAAAR ANGITYNRFI QGLKAANVE VDRKILAELA VNDANAFAAL VEVAQKALPS DVNAPKAAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #15: Large ribosomal subunit protein bL21

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 11.600355 KDa
配列文字列:
MYAIVRSGGR QHKVAVGDIV EVDKISTAKV GDTVELSTLL VVDGDAVTSD PWVLAGIKVQ AEVVDHHKGA KIDILRYKNK TGYRRRQGH RQQYTAIKVT AIPTAAK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #16: Large ribosomal subunit protein uL22

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 12.846766 KDa
配列文字列:
MEARAQARYI RVTPMKARRV VDLIRGMDAT EAQAVLRFAP QAASVPVKKV LDSAIANAAH NYDHTDASSL FISEAFVDEG PTLKRFRPR AQGRAYRIRK RTSHITVVVS SKEGTR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #17: Large ribosomal subunit protein uL23

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 11.849599 KDa
配列文字列:
MSEAVVTSKT FTDPRDILVK PVVSEKSYAL LDENKYTFVV DPRANKTQIK QAVEAVFSVK VTGVNTINRQ GKRKRTRTGY GKRANTKRA IVTLAEGNRI DIFGGPTA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #18: Large ribosomal subunit protein uL24

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 11.709555 KDa
配列文字列:
MKIKKGDLVQ VITGKDKGKQ GKVIAAFPRE DRVLVEGVNR VKKHTKANQP GRASQAGGIV TVEAPIHVSN VQLVVEKDGN KVVTRVGYR FDENGNKIRV AKRTGEDI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #19: Large ribosomal subunit protein bL25

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 20.475338 KDa
配列文字列: MSEVKITAET RSEFGKGAAR RIRRENKVPG VLYGHGTDPV HLTLPGHDLM MALKTSNVLL SLDLDGKTEL AIPKAVQRDP LKGFLEHVD LLLVKRGEQV NVEIPVVTEG ELAPGGNLLE HVLNALPVEA EATHIPESLS VSVAGLEAGA SVLAKDIALP K GVSLAVEA ...文字列:
MSEVKITAET RSEFGKGAAR RIRRENKVPG VLYGHGTDPV HLTLPGHDLM MALKTSNVLL SLDLDGKTEL AIPKAVQRDP LKGFLEHVD LLLVKRGEQV NVEIPVVTEG ELAPGGNLLE HVLNALPVEA EATHIPESLS VSVAGLEAGA SVLAKDIALP K GVSLAVEA DTVVLQVLAA QAEEPAEGAE SAESAEA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #20: Large ribosomal subunit protein bL27

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 8.844027 KDa
配列文字列:
MAHKKGASST RNGRDSNAQR LGVKRFGGQV VNAGEILVRQ RGTHFHPGAG VGRGGDDTLF ALQAGSVQFG TFRGRKVVNI VPVA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #21: Large ribosomal subunit protein bL28

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 6.734838 KDa
配列文字列:
MAANCDVCGK GPGFGNNISH SHRRTSRRWN PNIQRVRAVV GRTPKRLNVC TSCIKAGKVS R

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #22: Large ribosomal subunit protein uL29

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 8.417594 KDa
配列文字列:
MSAGTKASEL RELSNEELVG KLREAKEELF NLRFQAATGQ LENHGRLKAV RKDIARIYTL MRERELGIET VESA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #23: Large ribosomal subunit protein uL30

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 6.932001 KDa
配列文字列:
MARLKITQTK SYIGSKQNHR DTLRSLGLKG INTQVVKEDR PEFRGMVHTV RHLVTVEEVD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #24: Large ribosomal subunit protein bL32

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 6.566715 KDa
配列文字列:
MAVPKRKMSR SNTRHRRSQW KAAVPTLVSC ERCQEPKQQH IACPSCGTYN KRQVLAV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #25: Large ribosomal subunit protein bL33

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 6.423511 KDa
配列文字列:
MAATDVRPKI TLACVECKER NYITKKNRRN NPDRLEMKKH CPRCNAHTAH RETR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33

+
分子 #26: Large ribosomal subunit protein bL34

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 5.313309 KDa
配列文字列:
MSKRTFQPNN RRRAKTHGFR LRMRTRAGRA ILATRRSKGR ARLSA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #27: Large ribosomal subunit protein bL35

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 7.103505 KDa
配列文字列:
MPKNKTHSGA KKRFKITGSG KVLRERAGKR HLLEHKSSKL TRRLTGNAEM APGDSAKIKK MLGI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #28: Large ribosomal subunit protein bL36

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 4.403474 KDa
配列文字列:
MKVKPSVKKI CDKCKVIRRH GRVMVICDNL RHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36

+
分子 #29: Large ribosomal subunit protein bL17

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 17.701307 KDa
配列文字列:
MPKPAKGARL GGSAAHEKLL LANLAKSLFE HGRITTTEAK ARRLRPVAER LITKAKKGDI HNRRLVLQTI TDKGIVHTLF TEIAPRYAE RPGGYTRITK IGNRRGDNAP MAVIELVEGE IAKKATVAEA EAATKRAVKE ADEAAASEAP AEDTAEAPAE E KKEA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #2: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 37.883551 KDa
配列文字列:
UUCGGUGGUC AUAGCGUUAG GGAAACGCCC GGUUACAUUC CGAACCCGGA AGCUAAGCCU UUCAGCGCCG AUGGUACUGC AGGGGGGAC CCUGUGGGAG AGUAGGACGC CGCCGAAC

GENBANK: GENBANK: CP023696.1

+
分子 #30: 23S rRNA

分子名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 30 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Streptomyces fradiae ATCC 10745 = DSM 40063 (バクテリア)
分子量理論値: 1.0122666249999999 MDa
配列文字列: GGCCAAGUUU AUAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACC AGGAACCGAU GAAGGACGUG GGAGGCCGCG AUAGGCCCCG GGGAGCUGU CAACCGAGCU UUGAUCCGGG GGUGUCCGAA UGGGGAAACC CGGCAGUCGU CAUGGGCUGU CACCCACUGC U GAACACAU ...文字列:
GGCCAAGUUU AUAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACC AGGAACCGAU GAAGGACGUG GGAGGCCGCG AUAGGCCCCG GGGAGCUGU CAACCGAGCU UUGAUCCGGG GGUGUCCGAA UGGGGAAACC CGGCAGUCGU CAUGGGCUGU CACCCACUGC U GAACACAU AGGCAGUGUG GAGGGAACGA GGGGAAGUGA AACAUCUCAG UACCCUCAGG AAGAGAAAAC AACCGUGAUU CC GGGAGUA GUGGCGAGCG AAACCGGAUG AGGCCAAACC GUAUGCGUGU GAUACCCGGC AGGGGUUGCG CAUGCGGGGU UGU GGGAUC UCUCUUUCAC GGUCUGCCGG CCGUGAGACG AGUCAGAAAC CGUUGAUGUA GGCGAAGGAC AUGCGAAAGG UCCG GCGUA GAGGGUAAGA CCCCCGUAGC UGAAACAUUG ACGGCUCGUU UGAGAGACAC CCAAGUAGCA CGGGGCCCGA GAAAU CCCG UGUGAAUCUG GCGGGACCAC CCGCUAAGCC UAAAUAUUCC CUGGUGACCG AUAGCGGAUA GUACCGUGAG GGAAUG GUG AAAAGUACCG CGGGAGCGGA GUGAAAUAGU ACCUGAAACC GUGUGCCUAC AAGCCGUGGG AGCGUCGGAC AUGCUUU GC AUGUCUCGUG ACUGCGUGCC UUUUGAAGAA UGAGCCUGCG AGUUUGCGGU GCGUUGCGAG GUUAACCCGU GUGGGGAA G CCGUAGCGAA AGCGAGUCCG AAUAGGGCGA UCGAGUAGCG CGCUCAAGAC CCGAAGCGGA GUGAUCUAGC CAUGGGCAG GUUGAAGCGG AGGUAAGACU UCGUGGAGGA CCGAACCCAC CAGGGUUGAA AACCUGGGGG AUGACCUGUG GUUAGGGGUG AAAGGCCAA UCAAACUCCG UGAUAGCUGG UUCUCCCCGA AAUGCAUUUA GGUGCAGCGU CGUGUGUUUC UUGCCGGAGG U AGAGCACU GGAUAGGCGA UGGGCCCUAC CGGGUUACUG ACCUUAGCCA AACUCCGAAU GCCGGUAAGU GAGAGCGCGG CA GUGAGAC UGUGGGGGAU AAGCUCCAUG GUCGAGAGGG AAACAGCCCA GAGCAUCGAC UAAGGCCCCU AAGCGUACGC UAA GUGGGA AAGGAUGUGG AGUCGCAGAG ACAACCAGGA GGUUGGCUUA GAAGCAGCCA CCCUUGAAAG AGUGCGUAAU AGCU CACUG GUCAAGUGAU UCCGCGCCGA CAAUGUAGCG GGGCUCAAGC GUACCGCCGA AGUCGUGUCA UUGCAGCAUA AGCCC CAAC GGGUGCUGUG AUGGGUAGGG GAGCGUCGUG UGCCGGGUGA AGCAGCCGCG GAAGCGAGUU GUGGACGGUU CACGAG UGA GAAUGCAGGC AUGAGUAGCG AUACACACGU GAGAAACGUG UGCGCCGAUU GACUAAGGGU UCCUGGGUCA AGCUGAU CU GCCCAGGGUA AGUCGGGACC UAAGGCGAGG CCGACAGGCG UAGUCGAUGG ACAACCGGUU GAUAUUCCGG UACCCGCU U UGAAGCGCCA GCGCUGAACC CAGCGAUGCU AAGCCCGUGA AACCGCCGUG UGCGUCUUCG GACAAGCACG GAGUGGUGG AGCCGGUGGC CCAGACUGGU AGUAGGUGAG CGAUGGGGUG ACGCAGGAAG GUAGUCCAGC CCGGGCGGUG GUUGUCCCGG GGUAAGGGU GUAGGCCGUG UGGUAGGCAA AUCCGUCACA CGUUAAGGCU GAGACCUGAU GCCGAGCCGA UUGUGGUGAA G UGGAUGAU CCUAUGCUGU CGAGAAAAGC CUCUAGCGAG UUUCAUGGCG GCCCGUACCC UAAACCGACU CAGGUGGUCA GG UAGAGAA UACCGAGGCG UUCGGGUGAA CUAUGGUUAA GGAACUCGGC AAAAUGCCCC CGUAACUUCG GGAGAAGGGG GGC CACUUC UGGUGAUCAC UCUUGCAGUG UGAGCUGGGG GUGGCCGCAG AGACCAGCGA GAAGCGACUG UUUACUAAAA ACAC AGGUC CGUGCGAAGC CGUAAGGCGA UGUAUACGGA CUGACGCCUG CCCGGUGCUG GAACGUUAAG GGGACCGGUU AGCUU GGAU UCGUCCGGGC GAAGCUGAGA ACUUAAGCGC CAGUAAACGG CGGUGGUAAC UAUAACCAUC CUAAGGUAGC GAAAUU CCU UGUCGGGUAA GUUCCGACCU GCACGAAUGG CGUAACGACU UCUCGACUGU CUCAACCAUA GGCCCGGUGA AAUUGCA CU ACGAGUAAAG AUGCUCGUUU CGCGCAGCAG GACGGAAAGA CCCCGGGACC UUUACUACAG UUUGAUAUUG GUGUUCGG U UCGGCUUGUG UAGGAUAGGU GGGAGACUGU GAAACUGUGA CGCCAGUCAU GGUGGAGUCG UCGUUGAAAU ACCACUCUG GUCGUGCUGG AUGUCUAACC UGGGUCCGUG AUCCGGAUCA GGGACAGUGU CUGAUGGGUA GUUUAACUGG GGCGGUUGCC UCCUAAAGG GUAACGGAGG CGCCCAAAGG UUCCCUCAGC CUGGUUGGCA AUCAGGUGUU GAGUGUAAGU GCACAAGGGA G CUUGACUG UGAGACCGAC GGGUCGAGCA GGGACGAAAG UCGGGACUAG UGAUCCGGCG GUGGCUUGUG GAAGCGCCGU CG CUCAACG GAUAAAAGGU ACCCCGGGGA UAACAGGCUG AUCUUCCCCA AGAGUCCAUA UCGACGGGAU GGUUUGGCAC CUC GAUGUC GGCUCGUCGC AUCCUGGGGC UGGAGUCGGU CCCAAGGGUU GGGCUGUUCG CCCAUUAAAG CGGUACGCGA GCUG GGUUU AGAACGUCGU GAGACAGUUC GGUCCCUAUC CGCUGCGCGC GCAGGAACAU UGAGAAGGGC UGUCCCUAGU ACGAG AGGA CCGGGACGGA CGAACCUCUG GUGUGCCAGU UGUUCUGCCA AGGGCAUGGC UGGUUGGCUA CGUUCGGGAG GGAUAA CCG CUGAAAGCAU CUAAGCGGGA AGCCUGCUUC GAGAUGAGUG UUCCCACCUC CUUGAGAGGG UAAGGCUCCC AGUAGAC GA CUGGGUUGAU AGGCCGGAUA UGGAAGCCCA GUGAUGGGUG GAGUUGACCG GUACUAAUAG GCCGAGGGCU UGUCCUC

GENBANK: GENBANK: CP023696.1

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度式名称
50.0 mMTris-HCltris(hydroxymethyl)aminomethane-hydrochloric
20.0 mMMgCH3C002Magnesium acetate
50.0 mMKClPotassium Chloride
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 60 sec. / 前処理 - 雰囲気: OTHER / 前処理 - 気圧: 0.026000000000000002 kPa
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS GLACIOS
温度最高: 77.0 K
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k)
撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 4219 / 平均露光時間: 7.94 sec. / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 50.0 µm / 照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.6 µm / 倍率（公称値）: 150000
試料ステージホルダー冷却材: NITROGEN

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 966178
CTF補正ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6) / タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / アルゴリズム: FOURIER SPACE / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.13 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6) / 使用した粒子像数: 250126
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6)
最終 3次元分類クラス数: 50 / 平均メンバー数/クラス: 5791 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 4.6)
詳細: The number of particles used for the final 2D classification is 289,553. The average particle in 50 classes is ~5,791.
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

初期モデルChain - Source name: AlphaFold / Chain - Initial model type: in silico model
精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-9qt5:
Structure of the 50S ribosomal subunit from the antibiotic-producing bacterium Streptomyces fradiae

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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