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- EMDB-52877: Closed state with NUQM and without flavoprotein (classification s... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-52877
タイトルClosed state with NUQM and without flavoprotein (classification state 2) of Pichia pastoris mitochondrial complex I in cMSP26 nanodiscs
マップデータConsensus refinement map postprocessed with RELION and used for model building and model refinement
試料
  • 複合体: Pichia Pastoris (Komagataella phaffi) mitochondrial complex I (NADH:ubiquinone oxidoreductase)
    • タンパク質・ペプチド: x 42種
  • リガンド: x 9種
キーワードNADH:ubiquinone oxidoreductase nanodisc membrane protein complex / MEMBRANE PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


carbon-nitrogen ligase activity, with glutamine as amido-N-donor / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / NADH dehydrogenase complex / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / NADH dehydrogenase activity / acyl binding / ubiquinone binding / electron transport coupled proton transport / acyl carrier activity / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) ...carbon-nitrogen ligase activity, with glutamine as amido-N-donor / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / NADH dehydrogenase complex / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / NADH dehydrogenase activity / acyl binding / ubiquinone binding / electron transport coupled proton transport / acyl carrier activity / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / respiratory chain complex I / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / aerobic respiration / respiratory electron transport chain / electron transport chain / mitochondrial membrane / mitochondrial intermembrane space / NAD binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / oxidoreductase activity / mitochondrial inner membrane / protein-containing complex binding / mitochondrion / metal ion binding / membrane
類似検索 - 分子機能
Uncharacterised protein YqeY/Aim41 / YqeY/Aim41, N-terminal domain / Yqey-like protein / Aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B-like / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), 21kDa subunit, fungi / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, C-terminal, fungi / NADH-ubiquinone oxidoreductase 9.5kDa subunit / C-terminal of NADH-ubiquinone oxidoreductase 21 kDa subunit / : ...Uncharacterised protein YqeY/Aim41 / YqeY/Aim41, N-terminal domain / Yqey-like protein / Aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B-like / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), 21kDa subunit, fungi / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, C-terminal, fungi / NADH-ubiquinone oxidoreductase 9.5kDa subunit / C-terminal of NADH-ubiquinone oxidoreductase 21 kDa subunit / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, N-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / GRIM-19 / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / : / NADH-quinone oxidoreductase subunit 3, ferredoxin-like domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2. / NADH dehydrogenase, subunit C / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature. / Complex 1 LYR protein domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase / Complex 1 protein (LYR family) / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1. / : / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit / NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit / NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, TM / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 1. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 2. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H / NADH dehydrogenase / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / NAD-dependent epimerase/dehydratase / NAD dependent epimerase/dehydratase family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding / His(Cys)3-ligated-type [4Fe-4S] domain profile. / Molybdopterin oxidoreductase, 4Fe-4S domain / Prokaryotic molybdopterin oxidoreductases 4Fe-4S domain profile. / NADH:ubiquinone oxidoreductase-like, 20kDa subunit / NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / Molybdopterin oxidoreductase / Molybdopterin oxidoreductase / Coiled coil-helix-coiled coil-helix (CHCH) domain profile.
類似検索 - ドメイン・相同性
Subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / Altered inheritance of mitochondria protein 41, mitochondrial / Uncharacterized protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase 78 kDa subunit, mitochondrial / NUCM (49 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUEM (39 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUFM (B13) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUGM (30 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUIM (TYKY) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUJM (B14.7) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) ...Subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / Altered inheritance of mitochondria protein 41, mitochondrial / Uncharacterized protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase 78 kDa subunit, mitochondrial / NUCM (49 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUEM (39 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUFM (B13) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUGM (30 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUIM (TYKY) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUJM (B14.7) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / BA75_00622T0 / NULM (ND4L) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUMM (13 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NADH-ubiquinone oxidoreductase / NUXM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / BA75_00589T0 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NIAM (ASHI) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NIDM (PDSW) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / BA75_05084T0 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NI8M (B8) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NI9M (B9) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NB2M (B12) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / BA75_04796T0 / NB5M (B15) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit / NESM (ESSS) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / Acyl carrier protein / Acyl carrier protein / NUSM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUTM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) / NUUM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
類似検索 - 構成要素
生物種Komagataella pastoris (菌類)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.9 Å
データ登録者Grba DN / Hirst J
資金援助 英国, 1件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MC_UU_00015/2 英国
引用ジャーナル: Sci Adv / 年: 2025
タイトル: Global conformations of complex I are distinguished by the binding of a unique interdomain bridging subunit.
著者: Chris Seunggyu Lee / Daniel N Grba / John J Wright / Bozhidar S Ivanov / Judy Hirst /
要旨: Complex I (CI; NADH ubiquinone oxidoreductase) is central to energy generation and metabolic homeostasis in mammalian cells but contributes to adverse outcome pathways under challenging conditions. ...Complex I (CI; NADH ubiquinone oxidoreductase) is central to energy generation and metabolic homeostasis in mammalian cells but contributes to adverse outcome pathways under challenging conditions. During ischemia, mammalian CI transitions from a turnover-ready, structurally "closed" state toward a dormant "open" state that prevents it from functioning in reverse during reperfusion to produce reactive oxygen species. Unfortunately, simpler, genetically tractable CI models do not recapitulate the same regulatory behavior, compromising mechanistic studies. Here, we report the structure of isolated CI from the yeast (-CI) and identify distinct closed and open states that resemble those of mammalian CI. Notably, a hitherto-unknown protein (NUQM) completes an interdomain bridge in only the closed state, implying that NUQM stabilizes it by restricting the conformational changes of opening. The direct correlation of NUQM binding with closed/open status in -CI provides opportunities for investigating regulatory mechanisms relevant to reversible catalysis and ischemia-reperfusion injury.
履歴
登録2025年2月21日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年10月15日-
マップ公開2025年10月15日-
更新2025年10月15日-
現状2025年10月15日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_52877.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_52877.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 600.7 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Consensus refinement map postprocessed with RELION and used for model building and model refinement
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.93 Å/pix.
x 540 pix.
= 501.66 Å		0.93 Å/pix.
x 540 pix.
= 501.66 Å		0.93 Å/pix.
x 540 pix.
= 501.66 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.929 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0127
最小 - 最大-0.036482405 - 0.078555554
平均 (標準偏差)-0.000092214854 (±0.0032555202)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ540540540
Spacing540540540
セルA=B=C: 501.66 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_52877_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Half map 2

ファイルemd_52877_half_map_1.map
注釈Half map 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Half map 1

ファイルemd_52877_half_map_2.map
注釈Half map 1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Pichia Pastoris (Komagataella phaffi) mitochondrial complex I (NA...

全体名称: Pichia Pastoris (Komagataella phaffi) mitochondrial complex I (NADH:ubiquinone oxidoreductase)
要素
  • 複合体: Pichia Pastoris (Komagataella phaffi) mitochondrial complex I (NADH:ubiquinone oxidoreductase)
    • タンパク質・ペプチド: Altered inheritance of mitochondria protein 41, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: BA75_00622T0
    • タンパク質・ペプチド: NUGM (30 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NUCM (49 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NUAM (75 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NUIM (TYKY) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NULM (ND4L) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: NUXM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NUEM (39 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NUMM (13 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NI8M (B8) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: NUFM (B13) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: BA75_04796T0
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase
    • タンパク質・ペプチド: NUJM (B14.7) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NI9M (B9) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: BA75_00589T0
    • タンパク質・ペプチド: Pichia pastoris NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit NEBM
    • タンパク質・ペプチド: BA75_05084T0
    • タンパク質・ペプチド: NUTM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NESM (ESSS) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NUSM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NUUM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: Subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NB2M (B12) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NIAM (ASHI) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NB5M (B15) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NIDM (PDSW) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit
  • リガンド: DIUNDECYL PHOSPHATIDYL CHOLINE
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: POTASSIUM ION
  • リガンド: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate

+
超分子 #1: Pichia Pastoris (Komagataella phaffi) mitochondrial complex I (NA...

超分子名称: Pichia Pastoris (Komagataella phaffi) mitochondrial complex I (NADH:ubiquinone oxidoreductase)
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#42
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 850 KDa

+
分子 #1: Altered inheritance of mitochondria protein 41, mitochondrial

分子名称: Altered inheritance of mitochondria protein 41, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 22.019129 KDa
配列文字列: MFTLAARRLA IRLPRVRFGS SSAYDEALAT IRNDLKLNFR FKADVLEKNV IRSILAETKN LEIDNKDKDL DEFKLYDLLS KMIKQRQDS AAIYLKEGSP DRFRQTGWNE LREVDYITKY LEALPVASAE EIEAKVEPIV QSVLEEEGEL KSPKEIFSRI P WKVVNQDW ...文字列:
MFTLAARRLA IRLPRVRFGS SSAYDEALAT IRNDLKLNFR FKADVLEKNV IRSILAETKN LEIDNKDKDL DEFKLYDLLS KMIKQRQDS AAIYLKEGSP DRFRQTGWNE LREVDYITKY LEALPVASAE EIEAKVEPIV QSVLEEEGEL KSPKEIFSRI P WKVVNQDW QASEGAVKNT VLRLYNLYKT DA

UniProtKB: Altered inheritance of mitochondria protein 41, mitochondrial

+
分子 #2: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 16.019821 KDa
配列文字列:
(FME)LQDLFNNYV ILVGILGLIF LGVNYFIVES PRMDENNGNI SDYIEKSGPF ECGFSSFEQS HNPIPIAFIL VALLFL PFD LEVSSMLPYI VSIYSVGIYG LIIFILFLLI LIVGFIYEFN TKSLSITTIL HKKNKALVKN LY

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

+
分子 #3: BA75_00622T0

分子名称: BA75_00622T0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 23.353986 KDa
配列文字列: MFVPCRTQIS RSLAHSVRYA SKQVATSHSY SSDLPTDIPV LSKRPHTNLL DYTFTTFDKM KNWARKSSFW PMTFGLACCA VEMMHVSAP RYDQDRLGII FRASPRQSDI MIVAGTVTNK MAPALRQVYD QMPYPRWVIS MGSCANGGGY YHYSYSVVRG V DRIVPVDI ...文字列:
MFVPCRTQIS RSLAHSVRYA SKQVATSHSY SSDLPTDIPV LSKRPHTNLL DYTFTTFDKM KNWARKSSFW PMTFGLACCA VEMMHVSAP RYDQDRLGII FRASPRQSDI MIVAGTVTNK MAPALRQVYD QMPYPRWVIS MGSCANGGGY YHYSYSVVRG V DRIVPVDI YVPGCPPTSE ALMYGVFQLQ KKMMDGQTHR MWYRSY

UniProtKB: BA75_00622T0

+
分子 #4: NUGM (30 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreduc...

分子名称: NUGM (30 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 33.18368 KDa
配列文字列: MIAARSIQRA IGTKPLAVRA VVLTTNSFRG FSKSSMSRKA DEEPLPVLRD LPRPEYGELH APVYNPAEKY KEQIEELHKF GRYIMGCLP KFVQQFSVWK DELVIYVAPS ALTQVATFLK DHTSAQFKAC MDVTAADYPT RTNRFDVVYN LLSVRHNSRI R IKTYASEV ...文字列:
MIAARSIQRA IGTKPLAVRA VVLTTNSFRG FSKSSMSRKA DEEPLPVLRD LPRPEYGELH APVYNPAEKY KEQIEELHKF GRYIMGCLP KFVQQFSVWK DELVIYVAPS ALTQVATFLK DHTSAQFKAC MDVTAADYPT RTNRFDVVYN LLSVRHNSRI R IKTYASEV SPVPSVVPLF QGANWFERET YDLFGIFFEG HPDLRRIMTD YGFQGHPLRK DFPTTGYTEV RYDAEKRRVV YE PLELTQA WRNFTVGSSV WEQVGDGKDF TPESFKLPTP APDPEPEADK KK

UniProtKB: NUGM (30 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #5: NUCM (49 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreduc...

分子名称: NUCM (49 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 54.962457 KDa
配列文字列: MFARLHAKRG WKSLARARVG SRFLSNSSIA RAAQTKDNND FYDVKTKKND FFPVQVDGIE SSLGKYEEFA KDAHEWESWN LQNEDHPEY PVKRTKIRHF TLNFGPQHPA AHGVLRLILE LHGEEILRSD PHVGLLH(2MR)GT EKLIESKTYM QALPYFD RL ...文字列:
MFARLHAKRG WKSLARARVG SRFLSNSSIA RAAQTKDNND FYDVKTKKND FFPVQVDGIE SSLGKYEEFA KDAHEWESWN LQNEDHPEY PVKRTKIRHF TLNFGPQHPA AHGVLRLILE LHGEEILRSD PHVGLLH(2MR)GT EKLIESKTYM QALPYFD RL DYVSMMTNEQ VFSLAVEKLL NLEVPERGQY IRTLFGEITR VLNHLMSVLS HAMDVGALTP FLWGFEEREK LMEFYERV S GARLHSAYVR PGGVSQDLPA GLLDDIYMWA TQFGDRLDET EELLTDSRIW KQRTIGIGEV TAEDALNYGL SGVMLRGSG VPFDIRKSQP YDAYDKVDFD IAVGTKGDCY DRYLIRMTEF RQSLRIIEQC CNQMPPGPVK VEDFKVAPPP RALMKEDMEA LIHHFLLYT KGYAVPAGET YTAIEAPKGE MAVYVVSDGS ERPYRCKIRA PGFAHLGAFD HIARGHFLPD AVAIIGTMDL V FGEVDR

UniProtKB: NUCM (49 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #6: NUAM (75 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreduc...

分子名称: NUAM (75 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 79.646414 KDa
配列文字列: MLSVKRSISR IPTARLFSTT RRQLKEVELT VDGVKVSIEA GSSIIQAAEK AGVTIPRYCY HEKLAVAGNC RMCLVEIERS PKLAASCAM PVQNGMSVLT NTPKIKKARE GVTEMLLENH PLDCPVCDQG GECDLQEQSL RYGSDRGRFH EIVGKRAVEN K AIGPLIKT ...文字列:
MLSVKRSISR IPTARLFSTT RRQLKEVELT VDGVKVSIEA GSSIIQAAEK AGVTIPRYCY HEKLAVAGNC RMCLVEIERS PKLAASCAM PVQNGMSVLT NTPKIKKARE GVTEMLLENH PLDCPVCDQG GECDLQEQSL RYGSDRGRFH EIVGKRAVEN K AIGPLIKT SMNRCIHCTR CVRFLNDVAG APEFGTAGRG NDMQIGTYVE RNVNSELSAN VIDLCPVGAL TSKPYAFRAR PW ELKRTET IDVHDALGSN VRVDTRGIEV MRVLPRLNDE INEEWISDKT RFACDGLKTQ RLTKPLIRQG NTFVDATWEE ALA TIAEGF QKVQPKENEI KAIVGSLTDL ESIVALKDLV NKLGSENVST DGDATTVPPA HGADFRSNYI FNSTIDNIEE ADQI LLVGT NPRHEAAVLN ARIRKVWLRS DLEVHHVGEE FDSTFELNHL GSDVNALAKA LTGEVGKKLS EASKPLIIIG SGVTE TQDA EAVYATVAKF VTSNANIVTP EWNGFNLLHR EASRVGALDV GFTTQSPEVA NTKAKFIYLL GADEIVNKDI PKDAFV VYQ GHHGDLGASF ADVILPGSAY TEKTATYVNT EGRVQSTRAA TNPPGVARED WMIIRALSEY LGATLPYDNL YEMRSRL AD VAPHLLRHEV VEPVSEGIAK VGFQSLVKPG IQSKGVLLKN PIENFYFTDV ISKSSPTMAK CVGSFGSKIE KIKDEKAN S YLSFA

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase 78 kDa subunit, mitochondrial

+
分子 #7: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 39.698844 KDa
配列文字列: (FME)LNNLFDFIE YIEYWLIIVA FVASVLIVVA YLTVAERKTM GYMQRRLGPN AVGYYGVLMA VADALKLLSK EIVLPH NGD IIYVMSGPLI SLFSVLLSWA VIPFGPGLSL LDSEYSIIYL LASGSIGVFG TVIVGWMSNS KYTVLATVRT TAQLISY EL ...文字列:
(FME)LNNLFDFIE YIEYWLIIVA FVASVLIVVA YLTVAERKTM GYMQRRLGPN AVGYYGVLMA VADALKLLSK EIVLPH NGD IIYVMSGPLI SLFSVLLSWA VIPFGPGLSL LDSEYSIIYL LASGSIGVFG TVIVGWMSNS KYTVLATVRT TAQLISY EL VLTTVVFIIA LIVSSLNINV IIESQYNIWY IIPFFPLCLI FFISALAETA RPPFDNVEAE SELVSGHMTE LSASPFVI F FLSEYCSMVL MSTLTAIFFF GGYLPFSNTI HHLILNLFDQ HSIYYFIIEG ILLSGYLAIK ANFFMFSFVW IRAAAPRLR YDLLILFCWY VLLPIVFAIV VFAPGILYCF DALPVII

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

+
分子 #8: NUIM (TYKY) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreducta...

分子名称: NUIM (TYKY) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 25.544215 KDa
配列文字列: MFRPLALKPS CRAINRIPVC RFSTGLIAQK PTLALTSGSI QGTHPEGFRL PRPKTWEESS ESALSKATKW YLLSEIFRGL YITLEMYFR APYTIYYPFE KGPVSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEERIDGS RRTYKYDIDM T KCIYCGYC ...文字列:
MFRPLALKPS CRAINRIPVC RFSTGLIAQK PTLALTSGSI QGTHPEGFRL PRPKTWEESS ESALSKATKW YLLSEIFRGL YITLEMYFR APYTIYYPFE KGPVSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEERIDGS RRTYKYDIDM T KCIYCGYC QESCPVDAIV ETPNVEYATE TREELLYNKE KLLANGDKWE QEIQYALDAD APYR

UniProtKB: NUIM (TYKY) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #9: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 18.564352 KDa
配列文字列:
(FME)NLEILDLSI LGFYSLISSN SFESIAILVA TIMPVITELW YNYSQLFALL YTLIYVGAVV ILFVFILSVI NEKEEY EYE YSGLFILILV LLLDDLDDNE SNDNDYNNVY ITDYADWFNN YNESDLSVIG NLLFTEYALL LLIISFILLM SIIGLIL IV KKD

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

+
分子 #10: NULM (ND4L) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreducta...

分子名称: NULM (ND4L) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 9.118741 KDa
配列文字列:
(FME)DLILLMLVA VGLNIIDIYI MIEILIMGCT VNTIYSASLD NDMIGLIYSL IQIIIAGVES AIGLSILVNY NRIRNS EEI ENE

UniProtKB: NULM (ND4L) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #11: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 72.43607 KDa
配列文字列: (FME)ILLCIFTPF LGSLISGFFG RYIGVNSSKW IVCLSIFVSV VSTYILFIDV IFNEIEYTYN IMNWLNVEYL VVDWSF TID KLSVSMLVPV VTVSFLVHLY SVSYMSHDPH QQRFFSYLSM FTFAMIVLVT GDNYLILFVG WEFIGVASYL LISFWFT RF ...文字列:
(FME)ILLCIFTPF LGSLISGFFG RYIGVNSSKW IVCLSIFVSV VSTYILFIDV IFNEIEYTYN IMNWLNVEYL VVDWSF TID KLSVSMLVPV VTVSFLVHLY SVSYMSHDPH QQRFFSYLSM FTFAMIVLVT GDNYLILFVG WEFIGVASYL LISFWFT RF NAVKSGLSAL LINRFGDALL VLGLSYLVLV TGSVNYNTVF ALGSYLDVNM ITVILICFLV ASMAKSAQLG LHSWLLLA M EGPTPVSSLL HAACLVIAGV FLLMRSSPLL EYTPIVLLLI LWLGGLSTLI SGLIAMVSND IKKIIALSTM SQVGIMMIA IGVSCYNLAL FHLICHSFFK ALLFMSAGSV IHSIISEYQD IRMYGGFRQF IPLAYTCIFI ASLSLMAIPG LTGFYSKDII IESMYGEYT FSGFIIYWFA LISATCTSLY SIRLIYYTFL NNPNSPKYIY INLKENDIVL ITPMIILTIL SIFGGYLLRD I YLGMGSPF NELFIHPNNL SLIETEFSLP SILKVLPLIT GLGGGLILLL IYEFNYSLFL VYNNKNLSKL YSFFNQKIMF DQ LLNNLIL RSGLNIGWLL NVHIDRGILQ LFGPLGLWKL STFISSKLNK LVFLNIGFIL EIIVLSWLLI VFKVSLLKYI LLL IIFIIL

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

+
分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 54.784211 KDa
配列文字列: (FME)LVQNLIIFN IIGIVLLVLL NNNNNGILNK KSLLTIKNEL KLKQIGLIIS IINILIIIEN WIGFNSNYYG FQNIER FLN IYWGIDGISL LLVLLTLILG PIAILSNWKN LKGYYTYYVI SINMLVILMA LNFICLDLVS FYILFESTLA PLFLLIG IY ...文字列:
(FME)LVQNLIIFN IIGIVLLVLL NNNNNGILNK KSLLTIKNEL KLKQIGLIIS IINILIIIEN WIGFNSNYYG FQNIER FLN IYWGIDGISL LLVLLTLILG PIAILSNWKN LKGYYTYYVI SINMLVILMA LNFICLDLVS FYILFESTLA PLFLLIG IY GANNKNKAAY YVLIYTLASS LFMLLSIVIY YIIINSTDYI YINNIILSIN LQSLLFIGII IGIAVKTPLM PVHTWLPT V HSESPLGGSI LLAGVILKLA IYGVIRLLLP NLSEISMMFT PIIYIISILT LIYSSLITLK QTDLKVIIAY SSISHLAVC MIGIFANNLI GINGSLILCL AHGFVSPALF ILVGGILYDR YHNRLINYYQ GLSTFMPIFS IYLVVFSFCN TGTPLSGNFV GEFLSITGA VIRHPIIGSL TAASVLLSAC YQMKLTNRLT GSVFSQYLHI TNDVTNREIF LLNWLLIPTI IIGIYPSFVT N ILNLASST LIYSVLI

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

+
分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 59.097926 KDa
配列文字列: (FME)LFTSLLLII VYGSLVNKSH LLTKLINRLG LIIIIYTLLI HLNINTLENL SIGINMFNNL LLINSFNNTI IELILI ICI LYVLLISFNI TGLSIIDNLN YSKRTFIVIV LFNIIGLTLL PLVNDIMILF IIIELQSYSL YLLTAIFNES HNSTKSA LY ...文字列:
(FME)LFTSLLLII VYGSLVNKSH LLTKLINRLG LIIIIYTLLI HLNINTLENL SIGINMFNNL LLINSFNNTI IELILI ICI LYVLLISFNI TGLSIIDNLN YSKRTFIVIV LFNIIGLTLL PLVNDIMILF IIIELQSYSL YLLTAIFNES HNSTKSA LY YFIVGSIASF IILDATVSIY DDLGLTNIQY ILMYIDKLEI FDLLCLLFGL FIKIGLAPFY SYSITIYSLS PTIITNYI S LMPKLSILTL IYIIMHYINI VNNTDLNYVI SFLILISMFI GSFGGLNVIR IKTLLAYSSL LNVSYMLLAI LSNSNESII AYIYYIIQYS LTHINIFSII LVISIYLPIM NNNITSNTVD NKYSNNGGNM LNVMITKYSP IEYINQLKNL FINNIFIAIA LCISIFSLI GIPPLTGFYG KYLVLISGLN NGYVLLSIVL IIASSISTVY YATILKVLSF DTLSFKDIIS NNLIINTSPE N NNNEIKPE ISNVISYVIS SLTLIILLII IQYENIVKGA YLVLLYNWV

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

+
分子 #14: NUXM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Com...

分子名称: NUXM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 22.263098 KDa
配列文字列: (ACE)METYELIDS DPKFSRVVRY FRPSDYLTWA LGTIGAPGLM VLFEKIEPAK GNTFKMPPPS IMRIATTIGF FGGFYY AYT SSTKRFWGYS ENAKEVAKDR YEVKKALSEK KSPYGSSLLN PYQQDMSARN STNSQLLLAI FPWFNVANHQ SHGIDLR KY ...文字列:
(ACE)METYELIDS DPKFSRVVRY FRPSDYLTWA LGTIGAPGLM VLFEKIEPAK GNTFKMPPPS IMRIATTIGF FGGFYY AYT SSTKRFWGYS ENAKEVAKDR YEVKKALSEK KSPYGSSLLN PYQQDMSARN STNSQLLLAI FPWFNVANHQ SHGIDLR KY YEVRDGEENW NFTLPPLDQV KDLDVAQYKE YSNYP

UniProtKB: NUXM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #15: NUEM (39 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreduc...

分子名称: NUEM (39 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 43.349988 KDa
配列文字列: MFRQARFVST FPLKSDINIT KSGKTLLSVG QGGRSSRTGF TATVFGGTGF LGRVVVSKLA KHGTNVVVPF RNDRARRQLK VNGDLGVVN FVEFDIRNLK SIEDSVKYSD IVINLIGTEH FSKNFSIEDV NIGAAERIAK AAKEAGVSRL IHVSSYNANP S SSSDFYAT ...文字列:
MFRQARFVST FPLKSDINIT KSGKTLLSVG QGGRSSRTGF TATVFGGTGF LGRVVVSKLA KHGTNVVVPF RNDRARRQLK VNGDLGVVN FVEFDIRNLK SIEDSVKYSD IVINLIGTEH FSKNFSIEDV NIGAAERIAK AAKEAGVSRL IHVSSYNANP S SSSDFYAT KGIGEQVVRD NFGPDATIVR PAPMYFRNSP FLNELLQIKA LGGNVIFKKE VYPVHALQVG EAIERIAFDD AT AGQTYEL FGKERYSKKE LREMIKHIIH IGQRGYYPYS AGFYLPAPEP FLYAFALIRQ YISSQPRFNV DQLKRSHINQ EID QSAKTF TDLGMVPDEL SEYLYRYVKP HISYTSQTQN RTVYSKEDIE KLRDYVNTPN DSFNLFNV

UniProtKB: NUEM (39 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 18.241705 KDa
配列文字列:
MLRSLLKVQV RGFSCGRVVS AAKNTNITPA INEGHTDLAK ELVSGAPKEL ITERVARIYQ EAKAATQSGQ HNTETWKIDW DILNKGNRW ENDLMGYQSS SDYMQGTILK FDTREGAIRF AKGQGWDYYI QEPKVRRFVK KDYSANFYHS KGPLKHIRTK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

+
分子 #17: NUMM (13 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreduc...

分子名称: NUMM (13 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 15.717822 KDa
配列文字列:
MLRLTRASIR RISTKELTTA RIKDISKPDE NNLQQQAPNR ISPWSKSQKP RAEAQDNVRF AVKDLAKQPR PYAAIDLIYK QPIRYIEHD NVAVCDGNGG AQGHPKVYIN LDQNKAIPCG YCGLRFAQAA FKEDIESSQN

UniProtKB: NUMM (13 kDa) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #18: NI8M (B8) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase...

分子名称: NI8M (B8) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 9.858478 KDa
配列文字列:
(ACE)SSKFVFPKV VKELRFFLSQ TGEASVPLRS FLTKTYPAIK KANPTLPILI REAYGIPPSV TARLEKGHEV KTNLEG FSA DQIAKTLQSI A

UniProtKB: NI8M (B8) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #19: Acyl carrier protein

分子名称: Acyl carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 15.507594 KDa
配列文字列:
MLRNVSRQLL RSSKVYLPQV AVVRTQTPAF VSPSIISKRF NITQSASTLT KEDVLTRSVS VLRGFEVKTK DIDLQTTFVQ DLGMDSLDL NDALVALEEE FDVVFDDKTA NEIKTVGEVV DFVLANYLPT EQSINHTIR

UniProtKB: Acyl carrier protein

+
分子 #20: Acyl carrier protein

分子名称: Acyl carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 14.780592 KDa
配列文字列:
MNRFNHPILR TAFSKSKWNL SKYTSPLFRP SYARTMIPLR TYSSTPSLTK EIIYDRIVEI LESYDNVKQG STISPAASFS KDLGLDSLD TVEVLLELEN EFSILIPDNE ADEIKTVQQA VDYIAAQEDS I

UniProtKB: Acyl carrier protein

+
分子 #21: NUFM (B13) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductas...

分子名称: NUFM (B13) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 15.590797 KDa
配列文字列:
MRAFTYLRQA QEILIKANKG NPTGLTGLFQ HPSPRPTLIT LYKATLKNLE EKIPKESVYR TAVEAFTKER LSIVENNEII EDIEKKIGS GLVEELIVQA NEEYDLIDKM AEWKAWEELE EKPLDDQWTY FGKKL

UniProtKB: NUFM (B13) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #22: BA75_04796T0

分子名称: BA75_04796T0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 14.783013 KDa
配列文字列:
MTNPTAFAQT TRYVKDSTEM RTLVLNLYRR YLRHSRGFVN NYNLDIPASQ VRTKIRQEFE RQRFVKDLPL KNVLYMKAQM EFQELVNFW KQQCHVMQYF ESIDHQNKIK GDSFVQKFLK GAQ

UniProtKB: BA75_04796T0

+
分子 #23: NADH-ubiquinone oxidoreductase

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 20.718482 KDa
配列文字列:
(ACE)SSTHTNDSL NSSNYVDKLK DTHFVFENDK LPSEIPDVEE VGATTAPLLS AAYFIGAKCQ DYNDDFMLCQ KEAKGN GPI DCLKEGRRVT RCASGVLKDL NTHCSDEFRL HWQCLSFSNL EYKNCRKAES LLNKCVFEKM NLVKKIPGIP EDRQIHL KQ NPVLKPVALH QDSEVAFKKA QNENSI

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase

+
分子 #24: NUJM (B14.7) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreduct...

分子名称: NUJM (B14.7) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 23.507607 KDa
配列文字列: MSETTAEQTV VEQFHLPQPF WPTTKTKEGE YVPKDSIREA SKVFIGSGVL LGGMHFRRLM QYKKGSARPG LAKYLNLFSL SKSQLIGFP VALGAFSFLS HSFANLQEGQ TATGEFAASS IASLIGLSIF RTKKPLSSNV AIAVGMGSLF GFLTWAGNFN L GDNSYRAA ...文字列:
MSETTAEQTV VEQFHLPQPF WPTTKTKEGE YVPKDSIREA SKVFIGSGVL LGGMHFRRLM QYKKGSARPG LAKYLNLFSL SKSQLIGFP VALGAFSFLS HSFANLQEGQ TATGEFAASS IASLIGLSIF RTKKPLSSNV AIAVGMGSLF GFLTWAGNFN L GDNSYRAA LEAGNGNEGG FDNKVIKTER QGFWEGVYRR PLSQTVEDLG EGRGIITQ

UniProtKB: NUJM (B14.7) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #25: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 17.243695 KDa
配列文字列:
(ACE)ATQDLPPIS GYAPIQWKRN LPSRGFRPVI WFLGLCTATG YGFYQISLAN REKIELKREK LWARAHLMPL LQAEQD RNV VRRTFAYYKR EGEIMKDVPW WEVKSTYSNK DIFHPPQTVL FGKHIDRDSG LMYANSRNRF GPDEEETK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

+
分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 17.446691 KDa
配列文字列:
MIPFEALIPY AIMFAGFCLG GGVMNSAITA DITKRARGPN QEIKRNVGED EGPRNYTKPR YNTDQWDKYF AVRDLRLTGS LRGQSDNAV AEESFKTNSI QPYSNTRRPW VLRRHIIMKN SPTKWARKYS SRRDEREQEI KDDYIRGMGE H

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

+
分子 #27: NI9M (B9) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase...

分子名称: NI9M (B9) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 9.181521 KDa
配列文字列:
MAIGDYPVYY KQPIRWLSYH AHTRPHVFYA IAVAALGPVF MMATPLRRKF LYDDHEPLPA NGYPLPNRSR DKTLTGYDD

UniProtKB: NI9M (B9) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #28: BA75_00589T0

分子名称: BA75_00589T0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 20.110992 KDa
配列文字列:
(ACE)SGGPVPVFK KYTTGSKGIW EKIRQLLTLV PNRSTGNPLV KNYRVPPPGS QTLKYKDPVT IPAGDIVKNQ YYDRDH RRN YPRLVAFDQT KVSGLLTLGS AQNPRISVGE KGQKELAVFD QSVSLSSTLA TIDPKVVKSE LLAEGGSPVV APSLNKK MK FRLTEESEHG MYPEDYPIRI FAQN

UniProtKB: BA75_00589T0

+
分子 #29: Pichia pastoris NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit NEBM

分子名称: Pichia pastoris NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit NEBM
タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 9.050411 KDa
配列文字列:
MIASLAGWGL FGVTVRAYQQ GIRKVPFSYY PLGYVYSALG WVAFGYGFNL WTERNDKLLE KRVEKLKESR NLRLSKDD

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #30: BA75_05084T0

分子名称: BA75_05084T0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 12.251016 KDa
配列文字列:
MAPLQQVGRH GGPNKCFGEF QRVVECMTNA KHDSYEPCNN LKNDYLECRK HKVERYKAFL MQKHAEELGK DPEEIGAPFV RKRRFLTSK TLGLVDGDDY EIGVEKI

UniProtKB: BA75_05084T0

+
分子 #31: NUTM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Com...

分子名称: NUTM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 9.86431 KDa
配列文字列:
MPYLVAFRPA VLVFFFIRQP IGAGLLAGGF LFWQADRHFN FGIRDNIHNF KQTILGFPTQ ASKWETFKQV DAQKRAQLVS GPSEEH

UniProtKB: NUTM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #32: NESM (ESSS) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreducta...

分子名称: NESM (ESSS) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 27.250256 KDa
配列文字列: MYPVIQSAAR RLGVRCFSGT TSVRAFNLQL EKEIRSKIDS LPKLNNIFQN ANGSVRQPSD TELQTIAELN SLVTNRKLSL TDYLFQNAA NQALYVDNEA DLKELDISSR QVVDKVPFKD AKTGEIKWKV VRENENEGWE KIMYVGFVPT MILIFAIVLF K DDKSIDEW ...文字列:
MYPVIQSAAR RLGVRCFSGT TSVRAFNLQL EKEIRSKIDS LPKLNNIFQN ANGSVRQPSD TELQTIAELN SLVTNRKLSL TDYLFQNAA NQALYVDNEA DLKELDISSR QVVDKVPFKD AKTGEIKWKV VRENENEGWE KIMYVGFVPT MILIFAIVLF K DDKSIDEW AMDELLLRLK EKNLSDVELI DELDKLSKSH VGKIGASEIN KRDAVIIERI LNGEYDQLSG LKKKELPIID L

UniProtKB: NESM (ESSS) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #33: NUSM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Com...

分子名称: NUSM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 21.224576 KDa
配列文字列:
MLTRRSVGLL QSTRISPVLT NFSSSRFYSA HHESDKKHDD HHEEHHDEHH DDHHTPLGPA ENIFNKWNVT PFVWLFATVG IFQWDKSHR ESHDGKGILD FLGEIKVKES LDTYFKEYQT KVASTADLYG LISFTPKRDI HHYVIRVDEV PGKHFPTNTT G NFGNTVDF ENLEPRRKPI NPYL

UniProtKB: NUSM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #34: NUUM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Com...

分子名称: NUUM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 8.335509 KDa
配列文字列:
MSGHHIHTPS YIKPPTGGWN FTPANWKQNT VLVLVGFTAC CVGLYKLGEA GSYNPKLKYK EEELSRWNQS AKKN

UniProtKB: NUUM subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #35: Subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

分子名称: Subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 7.071344 KDa
配列文字列:
MSAHHAFKYV RGAIVPKPKV HPGYVITSKF LGGLMWFWIF YRAKQDYPVW FGLKHPWEH

UniProtKB: Subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #36: NB2M (B12) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductas...

分子名称: NB2M (B12) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 7.141992 KDa
配列文字列:
MAGNPWKRRD AWRSQGAFTR ANRFRGALPG FFWGLGAFGV YCVYEKVFLT NDHHGHHEEH H

UniProtKB: NB2M (B12) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #37: NIAM (ASHI) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreducta...

分子名称: NIAM (ASHI) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 17.944211 KDa
配列文字列:
MLRQAYRLAG KTNSITSSSV FIRNKSFLPH FIPKNYSYGD YPRLKPENLQ KRDPYLKYDD QANKRNFNEP LHPQQDDLDM WAPDHFDFV QDSIALKWFG TFFGVLAVFS SVIYIGGLYP EKPANPRNYP FSGLAKDLGA SSEEDTLLYA AKIDKSI

UniProtKB: NIAM (ASHI) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #38: NB5M (B15) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductas...

分子名称: NB5M (B15) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 9.437788 KDa
配列文字列:
MAGHGPHLLR EDASFQRYGQ LRDNLATYWK FNRKAARNVF IFLVAVPAGL GYLAYNYEGK TPFVGKRRTE PIFEQDYVPR K

UniProtKB: NB5M (B15) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 12.845718 KDa
配列文字列:
MSSIARKAVV PFSEANKKYV SSLYRKSLRT AHDWINKTEF YRVKASEIRS RFDANKHIND PNELKVIFKE TEALLEDYAH PDPIIPPCR PGGSKFERNI PPRVEARIPI DV

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

+
分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 10.473039 KDa
配列文字列:
MGVSELPELL SHEEMKQNKI PLAYRDRCAR LLVPLNKCRK EGWYMPWNCV QERHDYEQCQ YLDFKRRVKE LEEIKKQRDA ADASADL

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

+
分子 #41: NIDM (PDSW) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreducta...

分子名称: NIDM (PDSW) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 10.787037 KDa
配列文字列:
MVDHVRSPNV SFDDIDYNNS QDLHNAQESL LREQWIRVSA LKVCRKALES CYKTSGPNHY EDCREIAEKY LNMLPDHRIQ GFLGYQKND PSK

UniProtKB: NIDM (PDSW) subunit of mitochondrial NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I)

+
分子 #42: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Komagataella pastoris (菌類)
分子量理論値: 16.331366 KDa
配列文字列:
(ACE)SSSIQRTLR NLWKNGFKKS FKQLQGYNDI KSGRLVGTDS FGNKFYEVDD PVEIHMRTRF VEYTGFWRQD MSEVEP GWH YWLAYGTDVP PNQLKPEEKS VRAYPVKKHV PNLTYTDGAY VPYNTARPKC ATWDPKVTER P

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit

+
分子 #43: DIUNDECYL PHOSPHATIDYL CHOLINE

分子名称: DIUNDECYL PHOSPHATIDYL CHOLINE / タイプ: ligand / ID: 43 / コピー数: 21 / 式: PLC
分子量理論値: 622.834 Da
Chemical component information

ChemComp-PLC:
DIUNDECYL PHOSPHATIDYL CHOLINE / リン脂質*YM

+
分子 #44: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 44 / コピー数: 5 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER

+
分子 #45: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 1 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #46: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 1 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #47: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine

分子名称: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 21 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da
Chemical component information

ChemComp-3PE:
1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / リン脂質*YM

+
分子 #48: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 5 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

+
分子 #49: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

+
分子 #50: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #51: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butan...

分子名称: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 2 / 式: EHZ
分子量理論値: 584.703 Da
Chemical component information

ChemComp-EHZ:
~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.7 mg/mL
緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度名称式
10.0 mMMOPS
50.0 mMpotassium chlorideKCl

詳細: 10 mM MOPS, 50 mM KCl, pH 7.5 at 4 degrees celsius.
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 180 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR / 前処理 - 気圧: 0.039 kPa
詳細: glow discharged for 2X 90s, flipping the grid in between
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK III / 詳細: 2s blot time and -10 blot force.
詳細LMNG-solubilised Pichia Pastoris CI reconstituted in to nanodiscs (8:1:1 ratio of DOPC:DOPE:CDL [0.5 mg total] and 20 nM final Q10)

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
特殊光学系エネルギーフィルター - 名称: TFS Selectris X / エネルギーフィルター - スリット幅: 10 eV
撮影フィルム・検出器のモデル: TFS FALCON 4i (4k x 4k)
デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 7574 / 平均露光時間: 5.85 sec. / 平均電子線量: 47.79 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 50.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 1.8 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.6 µm / 倍率（公称値）: 130000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 1350752
CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING ONLY
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
In silico モデル: Initial model generated from 3D initial model job in CryoSPARC v3.3.2
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 61256
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 3次元分類クラス数: 4 / 平均メンバー数/クラス: 40000
詳細: Not an even split in final numbers for the classes: class 1 53,716; class 2 61,256; class 3 25,125; class 4 18,608. Final classification used focused maps to target the compositionally heterogenous regions.
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

9ihr


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model / 詳細: State 1 from same data
詳細The initial model was made for state 1 and then subunits removed to match this state. This was manually inspected in Coot and final refinements with ligand restraints imposed performed in PHENIX v.1.21_5207
精密化空間: REAL
得られたモデル

PDB-9ihq:
Closed state with NUQM and without flavoprotein (classification state 2) of Pichia pastoris mitochondrial complex I in cMSP26 nanodiscs

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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