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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | In situ structure of peripheral stalk of mitochondrial ATP synthase from Chlamydomonas reinhardtii, consensus subtomogram average | |||||||||
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![]() | ATP synthase / Chlamydomonas reinhardtii / in situ / mitochondria / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 5.1 Å | |||||||||
![]() | Obr M / Zhang X / Kelley R / Khavnekar S / Waltz F / Righetto RD / Engel B / Kotecha A | |||||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Towards community-driven visual proteomics with large-scale cryo-electron tomography of Chlamydomonas reinhardtii 著者: Obr M / Zhang X / Kelley R / Waltz F / Khavnekar S / Righetto RD / Engel B / Kotecha A | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 40 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.2 KB 15.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 8 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 49.8 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 42.9 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 4.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 33.1 MB 33.1 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.92 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_51802_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_51802_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Chlamydomonas reinhardtii
全体 | 名称: ![]() ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Chlamydomonas reinhardtii
超分子 | 名称: Chlamydomonas reinhardtii / タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() 株: CC-3994 mat3-4 mt+ |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: NITROGEN |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / 平均電子線量: 3.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 4.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.5 µm / 倍率(公称値): 64000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |