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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-electron tomogram of ATG2A and small unilamellar vesicles | |||||||||
![]() | Cryo-electron tomogram of ATG2A and small unilamellar vesicles (denoised using IsoNet) | |||||||||
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![]() | autophagy / intracellular trafficking / membranes / vesicles / LIPID TRANSPORT | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Dahmane S / Wang N / Stjepanovic G / Carlson LA | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis for lipid transfer by the ATG2A-ATG9A complex 著者: Wang N / Dahmane S / Ti R / Mai X / Zhu L / Carlson LA / Stjepanovic G | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 212.7 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 9.4 KB 9.4 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 191.1 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.5 KB | ||
その他 | ![]() | 217.8 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 329.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 329 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Cryo-electron tomogram of ATG2A and small unilamellar vesicles (denoised using IsoNet) | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 11.12 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: un-denoised map
ファイル | emd_50658_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | un-denoised map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : ATG2A and small unilamellar vesicles
全体 | 名称: ATG2A and small unilamellar vesicles |
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要素 |
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-超分子 #1: ATG2A and small unilamellar vesicles
超分子 | 名称: ATG2A and small unilamellar vesicles / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 詳細: Purified human protein mixed with vesicles (SUVs). |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE |
切片作成 | その他: NO SECTIONING |
位置合わせマーカー | Manufacturer: CMC-Utrecht / 直径: 10 nm |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 2.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 4.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 3.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 41 |
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