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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-4952 | ||||||||||||
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タイトル | Electron cryotomogram of septal region from FIB milled Anabaena sp. PCC7120 SepJ mutant filament | ||||||||||||
![]() | Electron cryotomogram of septal region from FIB milled Anabaena sp. PCC7120 SepJ mutant filament | ||||||||||||
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生物種 | ![]() | ||||||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | ||||||||||||
![]() | Weiss GL / Kieninger A / Maldener I / Forchhammer K / Pilhofer M | ||||||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure and Function of a Bacterial Gap Junction Analog. 著者: Gregor L Weiss / Ann-Katrin Kieninger / Iris Maldener / Karl Forchhammer / Martin Pilhofer / ![]() ![]() 要旨: Multicellular lifestyle requires cell-cell connections. In multicellular cyanobacteria, septal junctions enable molecular exchange between sister cells and are required for cellular differentiation. ...Multicellular lifestyle requires cell-cell connections. In multicellular cyanobacteria, septal junctions enable molecular exchange between sister cells and are required for cellular differentiation. The structure of septal junctions is poorly understood, and it is unknown whether they are capable of controlling intercellular communication. Here, we resolved the in situ architecture of septal junctions by electron cryotomography of cryo-focused ion beam-milled cyanobacterial filaments. Septal junctions consisted of a tube traversing the septal peptidoglycan. Each tube end comprised a FraD-containing plug, which was covered by a cytoplasmic cap. Fluorescence recovery after photobleaching showed that intercellular communication was blocked upon stress. Gating was accompanied by a reversible conformational change of the septal junction cap. We provide the mechanistic framework for a cell junction that predates eukaryotic gap junctions by a billion years. The conservation of a gated dynamic mechanism across different domains of life emphasizes the importance of controlling molecular exchange in multicellular organisms. | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 116.5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 8.9 KB 8.9 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 133.8 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 202.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 201.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 4949C ![]() 4950C ![]() 4951C ![]() 4953C ![]() 4954C ![]() 4955C ![]() 4956C ![]() 4957C ![]() 4961C ![]() 4962C ![]() 4963C ![]() 4964C ![]() 4965C ![]() 4966C ![]() 4967C ![]() 4968C ![]() 4969C C: 同じ文献を引用 ( |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
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注釈 | Electron cryotomogram of septal region from FIB milled Anabaena sp. PCC7120 SepJ mutant filament | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 13.51 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Electron cryotomogram of septal region from FIB milled Anabaena s...
全体 | 名称: Electron cryotomogram of septal region from FIB milled Anabaena sp. PCC7120 SepJ mutant filament |
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要素 |
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-超分子 #1: Electron cryotomogram of septal region from FIB milled Anabaena s...
超分子 | 名称: Electron cryotomogram of septal region from FIB milled Anabaena sp. PCC7120 SepJ mutant filament タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE |
切片作成 | 集束イオンビーム - 装置: OTHER / 集束イオンビーム - イオン: OTHER / 集束イオンビーム - 電圧: 30 kV / 集束イオンビーム - 電流: 18 nA / 集束イオンビーム - 時間: 1 sec. / 集束イオンビーム - 温度: 128 K / 集束イオンビーム - Initial thickness: 3000 nm / 集束イオンビーム - 最終 厚さ: 200 nm 集束イオンビーム - 詳細: The value given for _emd_sectioning_focused_ion_beam.instrument is FEI Helios NanoLab 600i. This is not in a list of allowed values set(['DB235', 'OTHER']) so OTHER ...集束イオンビーム - 詳細: The value given for _emd_sectioning_focused_ion_beam.instrument is FEI Helios NanoLab 600i. This is not in a list of allowed values set(['DB235', 'OTHER']) so OTHER is written into the XML file. |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k) 平均電子線量: 2.3 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 61 |
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