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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | Structure of a human adenosine A3 receptor complex bound to the covalent antagonist LUF7602 | ||||||||||||
![]() | Composite map | ||||||||||||
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![]() | G protein-coupled receptor / adenosine binding / seven transmembrane protein / MEMBRANE PROTEIN / SIGNALING PROTEIN | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of norepinephrine secretion / Adenosine P1 receptors / G protein-coupled adenosine receptor activity / G protein-coupled adenosine receptor signaling pathway / negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity / regulation of heart contraction / activation of adenylate cyclase activity / presynaptic modulation of chemical synaptic transmission / negative regulation of cell migration / response to wounding ...regulation of norepinephrine secretion / Adenosine P1 receptors / G protein-coupled adenosine receptor activity / G protein-coupled adenosine receptor signaling pathway / negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity / regulation of heart contraction / activation of adenylate cyclase activity / presynaptic modulation of chemical synaptic transmission / negative regulation of cell migration / response to wounding / Schaffer collateral - CA1 synapse / presynaptic membrane / G alpha (i) signalling events / inflammatory response / negative regulation of cell population proliferation / synapse / dendrite / signal transduction / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() | ||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å | ||||||||||||
![]() | Zhang L / Mobbs JI / Glukhova A / Thal DM | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Molecular basis of ligand binding and receptor activation at the human A3 adenosine receptor 著者: Zhang L / Mobbs JI / Bennetts FM / Venugopal H / Nguyen AT / Christopoulos A / van der Es D / Heitman LH / May LT / Glukhova A / Thal DM | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 251.4 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 16.1 KB 16.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 50.5 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 6.2 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 335.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 334.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 9ehsMC ![]() 9ebhC ![]() 9ebiC C: 同じ文献を引用 ( M: このマップから作成された原子モデル |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | Composite map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.65 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Human A3AR-S97R-BRIL-Bag2-Nb complex
全体 | 名称: Human A3AR-S97R-BRIL-Bag2-Nb complex |
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要素 |
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-超分子 #1: Human A3AR-S97R-BRIL-Bag2-Nb complex
超分子 | 名称: Human A3AR-S97R-BRIL-Bag2-Nb complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#4 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: BAG2 Anti-BRIL Fab Heavy Chain
分子 | 名称: BAG2 Anti-BRIL Fab Heavy Chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 24.539314 KDa |
組換発現 | 生物種: synthetic construct (人工物) |
配列 | 文字列: EISEVQLVES GGGLVQPGGS LRLSCAASGF NVVDFSLHWV RQAPGKGLEW VAYISSSSGS TSYADSVKGR FTISADTSKN TAYLQMNSL RAEDTAVYYC ARWGYWPGEP WWKAFDYWGQ GTLVTVSSAS TKGPSVFPLA PSSKSTSGGT AALGCLVKDY F PEPVTVSW ...文字列: EISEVQLVES GGGLVQPGGS LRLSCAASGF NVVDFSLHWV RQAPGKGLEW VAYISSSSGS TSYADSVKGR FTISADTSKN TAYLQMNSL RAEDTAVYYC ARWGYWPGEP WWKAFDYWGQ GTLVTVSSAS TKGPSVFPLA PSSKSTSGGT AALGCLVKDY F PEPVTVSW NSGALTSGVH TFPAVLQSSG LYSLSSVVTV PSSSLGTQTY ICNVNHKPSN TKVDKKVEPK SCD |
-分子 #2: elbow nanobody
分子 | 名称: elbow nanobody / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 15.071431 KDa |
組換発現 | 生物種: synthetic construct (人工物) |
配列 | 文字列: HHHHHHGENL YFQGSQVQLQ ESGGGLVQPG GSLRLSCAAS GRTISRYAMS WFRQAPGKER EFVAVARRSG DGAFYADSVQ GRFTVSRDD AKNTVYLQMN SLKPEDTAVY YCAIDSDTFY SGSYDYWGQG TQVTVSS |
-分子 #3: BAG2 Anti-BRIL Fab Light Chain
分子 | 名称: BAG2 Anti-BRIL Fab Light Chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: synthetic construct (人工物) |
分子量 | 理論値: 23.499129 KDa |
組換発現 | 生物種: synthetic construct (人工物) |
配列 | 文字列: DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQSVS SAVAWYQQKP GKAPKLLIYS ASSLYSGVPS RFSGSRSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQ QYLYYSLVTF GQGTKVEIKR TVAAPSVFIF PPSDSQLKSG TASVVCLLNN FYPREAKVQW KVDNALQSGN S QESVTEQD ...文字列: DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQSVS SAVAWYQQKP GKAPKLLIYS ASSLYSGVPS RFSGSRSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQ QYLYYSLVTF GQGTKVEIKR TVAAPSVFIF PPSDSQLKSG TASVVCLLNN FYPREAKVQW KVDNALQSGN S QESVTEQD SKDSTYSLSS TLTLSKADYE KHKVYACEVT HQGLSSPVTK SFNRGEC |
-分子 #4: Adenosine receptor A3,adenosine A3 receptor fused to BRIL
分子 | 名称: Adenosine receptor A3,adenosine A3 receptor fused to BRIL タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 53.11823 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: DYKDDDDAMG ANFTPVNGSS GNQSVRLVTS SSLEVLFQGP STALSLANVT YITMEIFIGL CAIVGNVLVI CVVKLNPSLQ TTTFYFIVS LALADIAVGV LVMPLAIVVS LGITIHFYSC LFMTCLLLIF THARIMSLLA IAVDRYLRVK LTVRYKRVTT H RRIWLALG ...文字列: DYKDDDDAMG ANFTPVNGSS GNQSVRLVTS SSLEVLFQGP STALSLANVT YITMEIFIGL CAIVGNVLVI CVVKLNPSLQ TTTFYFIVS LALADIAVGV LVMPLAIVVS LGITIHFYSC LFMTCLLLIF THARIMSLLA IAVDRYLRVK LTVRYKRVTT H RRIWLALG LCWLVSFLVG LTPMFGWNMK LTSEYHRAVT FLSCQFVSVM RMDYMVYFSF LTWIFIPLVV MCAIYLDIFY II RNKLADL EDNWETLNDN LKVIEKADNA AQVKDALTKM RAAALDAQKA TPPKLEDKSP DSPEMKDFRH GFDILVGQID DAL KLANEG KVKEAQAAAE QLKTTRNAYI QKYLERARST LQREFKTAKS LFLVLFLFAL SWLPLSIINC IIYFNGEVPQ LVLY MGILL SHANSMMNPI VYAYKIKKFK ETYLLILKAC VVCHPLEVLF QGPSDSLDTS IEKNSEHHHH HHHH UniProtKB: Adenosine receptor A3 |
-分子 #5: LUF7602
分子 | 名称: LUF7602 / タイプ: ligand / ID: 5 / コピー数: 1 / 式: A1BII |
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分子量 | 理論値: 517.53 Da |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |