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- EMDB-4345: Mouse mitochondrial complex I in the active state -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4345
タイトルMouse mitochondrial complex I in the active state
マップデータMouse mitochondrial complex I in the active state
試料
  • 複合体: Mitochondrial complex I from mouse in the active state
    • タンパク質・ペプチド: x 44種
  • リガンド: x 10種
機能・相同性
機能・相同性情報


Mitochondrial protein import / response to injury involved in regulation of muscle adaptation / reproductive system development / Protein lipoylation / Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / Complex I biogenesis / RHOG GTPase cycle / Respiratory electron transport / protein insertion into mitochondrial inner membrane / blastocyst hatching ...Mitochondrial protein import / response to injury involved in regulation of muscle adaptation / reproductive system development / Protein lipoylation / Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / Complex I biogenesis / RHOG GTPase cycle / Respiratory electron transport / protein insertion into mitochondrial inner membrane / blastocyst hatching / circulatory system development / respiratory system process / psychomotor behavior / ubiquinone-6 biosynthetic process / Mitochondrial protein degradation / response to light intensity / cellular response to oxygen levels / iron-sulfur cluster assembly complex / : / mitochondrial large ribosomal subunit binding / gliogenesis / negative regulation of non-canonical NF-kappaB signal transduction / cellular response to glucocorticoid stimulus / neural precursor cell proliferation / cardiac muscle tissue development / [2Fe-2S] cluster assembly / oxygen sensor activity / adult walking behavior / positive regulation of mitochondrial membrane potential / response to hydroperoxide / : / ubiquinone binding / iron-sulfur cluster assembly / positive regulation of ATP biosynthetic process / adult behavior / dopamine metabolic process / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / positive regulation of execution phase of apoptosis / proton motive force-driven mitochondrial ATP synthesis / NADH dehydrogenase activity / apoptotic mitochondrial changes / mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport / respiratory chain complex I / : / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / electron transport coupled proton transport / neuron development / acyl binding / acyl carrier activity / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / cellular response to interferon-beta / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway / ATP synthesis coupled electron transport / quinone binding / cellular response to retinoic acid / negative regulation of reactive oxygen species biosynthetic process / extrinsic apoptotic signaling pathway / muscle contraction / ionotropic glutamate receptor binding / tricarboxylic acid cycle / Neutrophil degranulation / visual perception / aerobic respiration / response to hormone / neurogenesis / respiratory electron transport chain / cerebellum development / reactive oxygen species metabolic process / kidney development / regulation of mitochondrial membrane potential / response to cocaine / synaptic membrane / fatty acid metabolic process / mitochondrion organization / response to nicotine / mitochondrial membrane / sensory perception of sound / electron transport chain / brain development / regulation of protein phosphorylation / response to hydrogen peroxide / negative regulation of cell growth / multicellular organism growth / response to organic cyclic compound / mitochondrial intermembrane space / cognition / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / circadian rhythm / positive regulation of protein catabolic process / NAD binding / FMN binding / myelin sheath / nervous system development / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / protease binding / in utero embryonic development / neuron apoptotic process / response to ethanol / response to oxidative stress
類似検索 - 分子機能
NmrA-like domain / NmrA-like family / Complex1_LYR-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NDUFB4 / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 ...NmrA-like domain / NmrA-like family / Complex1_LYR-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NDUFB4 / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase B15 subunit (NDUFB4) / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, NDUC2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit b14.5b (NDUFC2) / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB6/B17 subunit / : / NADH:ubiquinone oxidoreductase chain 4, N-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus / NADH dehydrogenase subunit 2 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a (Complex I-B14.5a) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex subunit 3 / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / GRIM-19 / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / Deoxynucleoside kinase domain / Deoxynucleoside kinase / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / NADH-quinone oxidoreductase subunit 3, ferredoxin-like domain / SLBB domain / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / Complex 1 LYR protein domain / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / Complex 1 protein (LYR family) / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / :
類似検索 - ドメイン・相同性
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 ...NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / Acyl carrier protein, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
類似検索 - 構成要素
生物種Mus musculus (ハツカネズミ) / Mouse (ネズミ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å
データ登録者Agip ANA / Blaza JN / Bridges HR / Viscomi C / Rawson S / Muench SP / Hirst J
資金援助 英国, 3件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_U105663141 英国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_UU_00015/2 英国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_UU_00015/5 英国
引用ジャーナル: Nat Struct Mol Biol / 年: 2018
タイトル: Cryo-EM structures of complex I from mouse heart mitochondria in two biochemically defined states.
著者: Ahmed-Noor A Agip / James N Blaza / Hannah R Bridges / Carlo Viscomi / Shaun Rawson / Stephen P Muench / Judy Hirst /
要旨: Complex I (NADH:ubiquinone oxidoreductase) uses the reducing potential of NADH to drive protons across the energy-transducing inner membrane and power oxidative phosphorylation in mammalian ...Complex I (NADH:ubiquinone oxidoreductase) uses the reducing potential of NADH to drive protons across the energy-transducing inner membrane and power oxidative phosphorylation in mammalian mitochondria. Recent cryo-EM analyses have produced near-complete models of all 45 subunits in the bovine, ovine and porcine complexes and have identified two states relevant to complex I in ischemia-reperfusion injury. Here, we describe the 3.3-Å structure of complex I from mouse heart mitochondria, a biomedically relevant model system, in the 'active' state. We reveal a nucleotide bound in subunit NDUFA10, a nucleoside kinase homolog, and define mechanistically critical elements in the mammalian enzyme. By comparisons with a 3.9-Å structure of the 'deactive' state and with known bacterial structures, we identify differences in helical geometry in the membrane domain that occur upon activation or that alter the positions of catalytically important charged residues. Our results demonstrate the capability of cryo-EM analyses to challenge and develop mechanistic models for mammalian complex I.
履歴
登録2018年3月23日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年4月25日-
マップ公開2018年6月6日-
更新2021年6月2日-
現状2021年6月2日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.075
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.075
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6g2j
  • 表面レベル: 0.075
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4345.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4345.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 347.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Mouse mitochondrial complex I in the active state
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.05 Å/pix.
x 450 pix.
= 472.5 Å		1.05 Å/pix.
x 450 pix.
= 472.5 Å		1.05 Å/pix.
x 450 pix.
= 472.5 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.05 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.075 / ムービー #1: 0.075
最小 - 最大-0.15626569 - 0.44951007
平均 (標準偏差)-4.5899822e-05 (±0.0132195875)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ450450450
Spacing450450450
セルA=B=C: 472.49997 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.051.051.05
M x/y/z450450450
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z472.500472.500472.500
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS450450450
D min/max/mean-0.1560.450-0.000

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添付データ

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ハーフマップ: half-2

ファイルemd_4345_half_map_1.map
注釈half-2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: half-1

ファイルemd_4345_half_map_2.map
注釈half-1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Mitochondrial complex I from mouse in the active state

全体名称: Mitochondrial complex I from mouse in the active state
要素
  • 複合体: Mitochondrial complex I from mouse in the active state
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: MCG5603
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate

+
超分子 #1: Mitochondrial complex I from mouse in the active state

超分子名称: Mitochondrial complex I from mouse in the active state
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#44
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ) / 株: C57BL/6 / 器官: Heart
分子量理論値: 1.0 MDa

+
分子 #1: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 13.251785 KDa
配列文字列:
(FME)NLYTVIFIN ILLSLTLILV AFWLPQMNLY SEKANPYECG FDPTSSARLP FSMKFFLVAI TFLLFDLEIA LLLPLP WAI QTIKTSTMMI MAFILVTILS LGLAYEWTQK GLEWTE

+
分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 24.715912 KDa
配列文字列: MAALAAPGLL SVRILGLRTA QVQLRRVHQS VATEGPSPSP SPSLSSTQSA VSKAGAGAVV PKLSHLPRSR AEYVVTKLDD LINWARRSS LWPMTFGLAC CAVEMMHMAA PRYDMDRFGV VFRASPRQAD VMIVAGTLTN KMAPALRKVY DQMPEPRYVV S MGSCANGG ...文字列:
MAALAAPGLL SVRILGLRTA QVQLRRVHQS VATEGPSPSP SPSLSSTQSA VSKAGAGAVV PKLSHLPRSR AEYVVTKLDD LINWARRSS LWPMTFGLAC CAVEMMHMAA PRYDMDRFGV VFRASPRQAD VMIVAGTLTN KMAPALRKVY DQMPEPRYVV S MGSCANGG GYYHYSYSVV RGCDRIVPVD IYVPGCPPTA EALLYGILQL QRKIKREQKL KIWYRR

+
分子 #3: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 30.191307 KDa
配列文字列: MAAAAARVWC RGLLGAASVG RGAGRPSVLW QHVRRESAAA DKRPTVRPRS DVTHKQLSAF GEYVAEILPK YVQQVQVSCL DELEICIHP DGVIPTLTFL RDHTNAQFKS LADLTAVDVP TRQNRFEIVY NLLSLRFNSR IRVKTYADEL TPIDSIVSVH I AANWYERE ...文字列:
MAAAAARVWC RGLLGAASVG RGAGRPSVLW QHVRRESAAA DKRPTVRPRS DVTHKQLSAF GEYVAEILPK YVQQVQVSCL DELEICIHP DGVIPTLTFL RDHTNAQFKS LADLTAVDVP TRQNRFEIVY NLLSLRFNSR IRVKTYADEL TPIDSIVSVH I AANWYERE VWDMFGVFFF NHPDLRRILT DYGFEGHPFR KDFPLTGYVE LRYDDEVKRV VAEPVELAQE FRKFDLNSPW EA FPAYRQP PESLKLEAGD KKPETK

+
分子 #4: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 52.720602 KDa
配列文字列: MAALRALRCL RGVGAPVLRP GSGIRLPSQP SRGARQWQPD IEWAEQFSGA VMYPSKETAH WKPPPWNDVD ILKEKAVTNM TLNFGPQHP AAHGVLRLVL ELSGEMVRKC DPHIGLLH(2MR)G TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSIAVE KL ...文字列:
MAALRALRCL RGVGAPVLRP GSGIRLPSQP SRGARQWQPD IEWAEQFSGA VMYPSKETAH WKPPPWNDVD ILKEKAVTNM TLNFGPQHP AAHGVLRLVL ELSGEMVRKC DPHIGLLH(2MR)G TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSIAVE KL LNIQPPPRAQ WIRVLFGEIT RILNHIMAVT THALDIGAMT PFFWMFEERE KMFEFYERVS GARMHAAYIR PGGVHQDL P LGLLDDIYEF SKNFSLRIDE VEEMLTNNRI WRNRTVDIGV VTAEDALNYG FSGVMLRGSG IQWDLRKTQP YDVYDQVEF DVPIGSRGDC YDRYLCRVEE MRQSLRIIEQ CLNKMPPGEI KVDDAKVSPP KRAEMKTSME SLIHHFKLYT EGYQVPPGAT YTAIEAPKG EFGVYLVSDG SSRPYRCKIK APGFAHLAGL DKMSKGHMLA DVVAIIGTQD IVFGEIDR

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分子 #5: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 27.318336 KDa
配列文字列: MFSLALRARA TGLAAQWGRH ARNLHKTAVH NGAGGALFVH RDTPENNPDT PFDFTPENYK RIEAIVKNYP EGHQAAAVLP VLDLAQRQN GWLPISAMNK VAEVLQVPPM RVYEVATFYT MYNRKPVGKY HIQVCTTTPC MLRDSDSILE TLQRKLGIKV G ETTPDKLF ...文字列:
MFSLALRARA TGLAAQWGRH ARNLHKTAVH NGAGGALFVH RDTPENNPDT PFDFTPENYK RIEAIVKNYP EGHQAAAVLP VLDLAQRQN GWLPISAMNK VAEVLQVPPM RVYEVATFYT MYNRKPVGKY HIQVCTTTPC MLRDSDSILE TLQRKLGIKV G ETTPDKLF TLIEVECLGA CVNAPMVQIN DNYYEDLTPK DIEEIIDELK AGKVPKPGPR SGRFCCEPAG GLTSLTEPPK GP GFGVQAG L

+
分子 #6: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 47.060621 KDa
配列文字列: TSFGSLKDED RIFTNLYGRH DWRLKGALRR GDWYKTKEIL LKGPDWILGE MKTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNAD EGEPGTCKDR EIMRHDPHKL VEGCLVGGRA MGARAAYIYI RGEFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG S DYDFDVFV ...文字列:
TSFGSLKDED RIFTNLYGRH DWRLKGALRR GDWYKTKEIL LKGPDWILGE MKTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNAD EGEPGTCKDR EIMRHDPHKL VEGCLVGGRA MGARAAYIYI RGEFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG S DYDFDVFV VRGAGAYICG EETALIESIE GKQGKPRLKP PFPADVGVFG CPTTVANVET VAVSPTICRR GGTWFAGFGR ER NSGTKLF NISGHVNHPC TVEEEMSVPL KELIEKHAGG VTGGWDNLLA VIPGGSSTPL IPKSVCETVL MDFDALVQAQ TGL GTAAVI VMDRSTDIVK AIARLIEFYK HESCGQCTPC REGVDWMNKV MARFVKGDAR PAEIDSLWEI SKQIEGHTIC ALGD GAAWP VQGLIRHFRP ELEDRMQRFA QQH

+
分子 #7: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 79.866688 KDa
配列文字列: MLRIPIKRAL IGLSNSPKGY VRTTGTAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKS KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL ...文字列:
MLRIPIKRAL IGLSNSPKGY VRTTGTAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKS KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL VKTIMTRCIQ CTRCIRFASE IAGVDDLGTT GRGNDMQVGT YIEKMFMSEL SGNVIDICPV GALTSKPYAF TA RPWETRK TESIDVMDAV GSNIVVSTRT GEVMRILPRM HEDINEEWIS DKTRFAYDGL KRQRLTEPMV RNEKGLLTYT SWE DALSRV AGMLQNFEGN AVAAIAGGLV DAEALVALKD LLNKVDSDNL CTEEIFPTEG AGTDLRSNYL LNTTIAGVEE ADVV LLVGT NPRFEAPLFN ARIRKSWLHN DLKVALIGSP VDLTYRYDHL GDSPKILQDI ASGRHSFCEV LKDAKKPMVV LGSSA LQRD DGAAILVAVS NMVQKIRVTT GVAAEWKVMN ILHRIASQVA ALDLGYKPGV EAIRKNPPKM LFLLGADGGC ITRQDL PKD CFIVYQGHHG DVGAPMADVI LPGAAYTEKS ATYVNTEGRA QQTKVAVTPP GLAREDWKII RALSEIAGIT LPYDTLD QV RNRLEEVSPN LVRYDDIEET NYFQQASELA KLVNQEVLAD PLVPPQLTIK DFYMTDSISR ASQTMAKCVK AVTEGAQA V EEPSIC

+
分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 36.105027 KDa
配列文字列: (FME)FFINILTLL VPILIAMAFL TLVERKILGY MQLRKGPNIV GPYGILQPFA DAMKLFMKEP MRPLTTSMSL FIIAPT LSL TLALSLWVPL PMPHPLINLN LGILFILATS SLSVYSILWS GWASNSKYSL FGALRAVAQT ISYEVTMAII LLSVLLM NG ...文字列:
(FME)FFINILTLL VPILIAMAFL TLVERKILGY MQLRKGPNIV GPYGILQPFA DAMKLFMKEP MRPLTTSMSL FIIAPT LSL TLALSLWVPL PMPHPLINLN LGILFILATS SLSVYSILWS GWASNSKYSL FGALRAVAQT ISYEVTMAII LLSVLLM NG SYSLQTLITT QEHMWLLLPA WPMAMMWFIS TLAETNRAPF DLTEGESELV SGFNVEYAAG PFALFFMAEY TNIILMNA L TTIIFLGPLY YINLPELYST NFMMEALLLS STFLWIRASY PRFRYDQLMH LLWKNFLPLT LALCMWHISL PIFTAGVPP YM

+
分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 24.068355 KDa
配列文字列: MYRLSSSMLP RALAQAMRTG HLNGQSLHSS AVAATYKYVN KKEQESEVDM KSATDNAARI LMWTELIRGL GMTLSYLFRE PATINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAICPAQAIT IEAEPRADGS RRTTRYDIDM TKCIYCGFCQ E ACPVDAIV ...文字列:
MYRLSSSMLP RALAQAMRTG HLNGQSLHSS AVAATYKYVN KKEQESEVDM KSATDNAARI LMWTELIRGL GMTLSYLFRE PATINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAICPAQAIT IEAEPRADGS RRTTRYDIDM TKCIYCGFCQ E ACPVDAIV EGPNFEFSTE THEELLYNKE KLLNNGDKWE AEIAANIQAD YLYR

+
分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 18.6561 KDa
配列文字列:
(FME)NNYIFVLSS LFLVGCLGLA LKPSPIYGGL GLIVSGFVGC LMVLGFGGSF LGLMVFLIYL GGMLVVFGYT TAMATE EYP ETWGSNWLIL GFLVLGVIME VFLICVLNYY DEVGVINLDG LGDWLMYEVD DVGVMLEGGI GVAAMYSCAT WMMVVAG WS LFAGIFIIIE ITRD

+
分子 #11: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 10.637629 KDa
配列文字列:
(FME)PSTFFNLTM AFSLSLLGTL MFRSHLMSTL LCLEGMVLSL FIMTSVTSLN SNSMSSMPIP ITILVFAACE AAVGLA LLV KVSNTYGTDY VQNLNLLQC

+
分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 68.547297 KDa
配列文字列: (FME)NIFTTSILL IFILLLSPIL ISMSNLIKHI NFPLYTTTSI KFSFIISLLP LLMFFHNNME YMITTWHWVT MNSMEL KMS FKTDFFSILF TSVALFVTWS IMQFSSWYMH SDPNINRFIK YLTLFLITML ILTSANNMFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW ...文字列:
(FME)NIFTTSILL IFILLLSPIL ISMSNLIKHI NFPLYTTTSI KFSFIISLLP LLMFFHNNME YMITTWHWVT MNSMEL KMS FKTDFFSILF TSVALFVTWS IMQFSSWYMH SDPNINRFIK YLTLFLITML ILTSANNMFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW YGRTDANTAA LQAILYNRIG DIGFILAMVW FSLNMNSWEL QQIMFSNNND NLIPLMGLLI AATGKSAQFG LHPWLPSA M EGPTPVSALL HSSTMVVAGI FLLVRFHPLT TNNNFILTTM LCLGALTTLF TAICALTQND IKKIIAFSTS SQLGLMMVT LGMNQPHLAF LHICTHAFFK AMLFMCSGSI IHSLADEQDI RKMGNITKIM PFTSSCLVIG SLALTGMPFL TGFYSKDLII EAINTCNTN AWALLITLIA TSMTAMYSMR IIYFVTMTKP RFPPLISINE NDPDLMNPIK RLAFGSIFAG FVISYNIPPT S IPVLTMPW FLKTTALIIS VLGFLIALEL NNLTMKLSMN KANPYSSFST LLGFFPSIIH RITPMKSLNL SLKTSLTLLD LI WLEKTIP KSTSTLHTNM TTLTTNQKGL IKLYFMSFLI NIILIIILYS INLE

+
分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 51.943547 KDa
配列文字列: (FME)LKIILPSLM LLPLTWLSSP KKTWTNVTSY SFLISLTSLT LLWQTDENYK NFSNMFSSDP LSTPLIILTA WLLPLM LMA SQNHLKKDNN VLQKLYISML ISLQILLIMT FSATELIMFY ILFEATLIPT LIIITRWGNQ TERLNAGIYF LFYTLIG SI ...文字列:
(FME)LKIILPSLM LLPLTWLSSP KKTWTNVTSY SFLISLTSLT LLWQTDENYK NFSNMFSSDP LSTPLIILTA WLLPLM LMA SQNHLKKDNN VLQKLYISML ISLQILLIMT FSATELIMFY ILFEATLIPT LIIITRWGNQ TERLNAGIYF LFYTLIG SI PLLIALILIQ NHVGTLNLMI LSFTTHTLDA SWSNNLLWLA CMMAFLIKMP LYGVHLWLPK AHVEAPIAGS MILAAILL K LGSYGMIRIS IILDPLTKYM AYPFILLSLW GMIMTSSICL RQTDLKSLIA YSSVSHMALV IASIMIQTPW SFMGATMLM IAHGLTSSLL FCLANSNYER IHSRTMIMAR GLQMVFPLMA TWWLMASLAN LALPPSINLM GELFITMSLF SWSNFTIILM GINIIITGM YSMYMIITTQ RGKLTNHMIN LQPSHTRELT LMALHMIPLI LLTTSPKLIT GLTM

+
分子 #14: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 38.80023 KDa
配列文字列: (FME)NPITLAIIY FTIFLGPVIT MSSTNLMLMW VGLEFSLLAI IPMLINKKNP RSTEAATKYF VTQATASMII LLAIVL NYK QLGTWMFQQQ TNGLILNMTL MALSMKLGLA PFHFWLPEVT QGIPLHMGLI LLTWQKIAPL SILIQIYPLL NSTIILM LA ...文字列:
(FME)NPITLAIIY FTIFLGPVIT MSSTNLMLMW VGLEFSLLAI IPMLINKKNP RSTEAATKYF VTQATASMII LLAIVL NYK QLGTWMFQQQ TNGLILNMTL MALSMKLGLA PFHFWLPEVT QGIPLHMGLI LLTWQKIAPL SILIQIYPLL NSTIILM LA ITSIFMGAWG GLNQTQMRKI MAYSSIAHMG WMLAILPYNP SLTLLNLMIY IILTAPMFMA LMLNNSMTIN SISLLWNK T PAMLTMISLM LLSLGGLPPL TGFLPKWIII TELMKNNCLI MATLMAMMAL LNLFFYTRLI YSTSLTMFPT NNNSKMMTH QTKTKPNLMF STLAIMSTMT LPLAPQLIT

+
分子 #15: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mi...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 40.657375 KDa
配列文字列: MALRLLRLVP ASAPARGLAA GAQRVGRIHT SVHCKLRYGL LAAILGDKTT KKLHEYSRVI TVDGNICSGK NKLAKEIAQQ LGMKHYPEA GIQYSSTTTG DGRPLDIEFS GSCSLEKFYD DPKSNDGNSY RLQSWLYASR LLQYADALEH LLSTGQGVVL E RSIYSDFV ...文字列:
MALRLLRLVP ASAPARGLAA GAQRVGRIHT SVHCKLRYGL LAAILGDKTT KKLHEYSRVI TVDGNICSGK NKLAKEIAQQ LGMKHYPEA GIQYSSTTTG DGRPLDIEFS GSCSLEKFYD DPKSNDGNSY RLQSWLYASR LLQYADALEH LLSTGQGVVL E RSIYSDFV FLEAMYNQGY IRKQCVDHYN EIKRLTLPEY LPPHAVIYID VPVPEVQSRI QKKGDPHEMK VTSAYLQDIE NA YKKTFLP KMSEMCEVLV YDSWEAEDPT KVVEDIEYLK YNKGPWLKQD DWTFHYLRML VQDKTEVLNY TTIPVYLPEI TIG AHQGSR IYNSFRELPG RKYAPGYNAE VGDKWIWLK

+
分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 42.588129 KDa
配列文字列: MAAAVRFRVV RALPMSRPAI TAAATSVFCG SSHRQLHHAV IPHGKGGRSS VSGVVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IIPYRCDVY DIMHLRLMGD LGQLTFLEWD ARDKDSIRKA VQHSNVVINL IGREWETRNF DFEDVFVNIP RAIAQASKEA G VERFIHVS ...文字列:
MAAAVRFRVV RALPMSRPAI TAAATSVFCG SSHRQLHHAV IPHGKGGRSS VSGVVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IIPYRCDVY DIMHLRLMGD LGQLTFLEWD ARDKDSIRKA VQHSNVVINL IGREWETRNF DFEDVFVNIP RAIAQASKEA G VERFIHVS HLNASMKSSS KSLRSKAVGE KEVRSVFPEA IIIRPSDIFG REDRFLNHFA NYRWFLAVPL VSLGFKTVKQ PV YVADVSK GIVNATKDPD AVGKTFAFTG PNRYLLFHLV KYIFGMTHRT FIPYPLPLFV YSWIGKLFGL SPFEPWTTKD KVE RIHISD VMPTDLPGLE DLGVQPTPLE LKSIEVLRRH RTYRWLSSEI EETKPAKTVN Y

+
分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 19.814725 KDa
配列文字列:
MAAVSISVSL RQAMLGRRAM ATAAVSVCRV PSRLLSTSTW KLADNQTRDT QLITVDEKLD ITTLTGVPEE HIKTRKVRIF VPARNNMQS GVNNTKKWKM EFDTRERWEN PLMGWASTAD PLSNMVLTFS AKEDAIAFAE KNGWSYDVEE KKVPKPKSKS Y GANFSWNK RTRVSTK

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 13.041828 KDa
配列文字列:
MAAVLTFRRL LTLPRAARGF GVQVSPSGEK ITHTGQVYDE KDYRRVRFVD RQKEVNENFA IDLIAQQPVN EVEHRIIACD GGGGALGHP KVYINLDKET KTGTCGYCGL QFKQHHH

+
分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 10.932675 KDa
配列文字列:
MAAAAASRAV GAKLGLREIR VHLCQRSPGS QGVRDFIVQR YVELKKAHPN LPILIRECSE VQPKLWARYA FGQEKTVSLN NLSADEVTR AMQNVLSGKA

+
分子 #20: Acyl carrier protein, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 17.390289 KDa
配列文字列:
MASRVLCACV RRLPAAFAPL PRLPTLALAR PLSTTLCPEG IRRRPGALQS ALALAQVPGT VTHLCRQYSD APPLTLDGIK DRVLYVLKL YDKIDPEKLS VNSHFMKDLG LDSLDQVEII MAMEDEFGFE IPDIDAEKLM CPQEIVDYIA DKKDVYE

+
分子 #21: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 13.380719 KDa
配列文字列:
MAGLLKKTTG LVGLAVCDTP HERLTILYTK TLDILKHFPK HAAYRKYTEQ ITNEKLDMVK AEPDVKKLEA LLQGGEVEEV ILQAEKELS LARKMLKWKP WEPLVEEPPA NQWKWPI

+
分子 #22: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 15.311858 KDa
配列文字列:
MAAAATGLRQ AAAAAASTSV KPIFSRDLNE AKRRVRELYR AWYREVPNTV HLMQLDITVK QGRDKVREMF MKNAHVTDPR VVDLLVIKG KMELQETIKV WKQRTHVMRF FHETETPRPK DFLSKFYMGH DP

+
分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 20.025127 KDa
配列文字列:
MPGIVELPTL EELKVEEVKV SSAVLKAAAH HYGAQCDKTN KEFMLCRWEE KDPRRCLKEG KLVNGCALNF FRQIKSHCAE PFTEYWTCL DYSNMQLFRH CRQQQAKFDQ CVLDKLGWVR PDLGQLSKVT KVKTDRPLPE NPYHSRARPE PNPVIEGDLK P AKHGTRFF FWTV

+
分子 #24: MCG5603

分子名称: MCG5603 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 15.130416 KDa
配列文字列:
MAMVKRFFES YHEVPDGTQC HRKTYITTAL GGICGIIGSA YSVSLNPADS TLEAVARVGR YTFTAAAIGA MFGLTTCVSA QVREKPDDP LNYFIGGCAG GLTLGARTHS YGTAAMGCVY MGTAAALFKI GKLEGWELFP TPKV

+
分子 #25: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 16.881588 KDa
配列文字列:
MAASKVKQDM PPPGGYGPID YKRNLPRRGL SGYSMFAVGI GALIFGYWRM MRWNQERRRL LIEDLEARIA LMPLFQAEKD RRTLQILRE NLEEEAIIMK DVPNWKVGES VFHTTRWVPP LIGEMYGLRT KEEMSNANFG FTWYT

+
分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 7.807176 KDa
配列文字列:
MWFEILPGLA IMGVCLVIPG VSTAYIHKFT NGGKEKRVAR VQYQWYLMER DRRISGVNRY YVSKGLE

+
分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 9.380904 KDa
配列文字列:
M(AYA)GRISAFLK NAWAKEPVLV VSFSVWGLAI IMPMISPYTK YASMINKATP YNYPVPVRDD GNMPDVPSHP QDPLGP SLD WLKNL

+
分子 #28: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 8.636023 KDa
配列文字列:
MAPSVVLRSF SRLLAPARLP SCSSTRSKFY VREPVNAKPN WLAVGLSVGA SVFMWIYLIQ THNEDVLEYK RRNGLE

+
分子 #29: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 14.185692 KDa
配列文字列:
MMNGRPGHEP LKFLPDEARS LPPPKLNDPR LVYMGLLGYC TGLMDNMLRM RPVMRAGLHR QLLFVTSFVF AGYFYLKRQN YLYAVKDHD MFGYIKLHPE DFPEKEKKTY AEILEPFHPV R

+
分子 #30: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 12.675772 KDa
配列文字列:
MPFLDIQKKL GISLDRHFMF LSAEQPYKNA ARCHAFEKEW IECAHGIGGT RAKKECKIEF DDFEECLLRY KTMRRMHDIK KQREKLMKE GKYTPPPHHS GREEPRP

+
分子 #31: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 6.965109 KDa
配列文字列:
MTLFQLLREH WVHILVPAGF VFGCYLDRKD DEKLTAFRNK SMLFQRELRP NEEVTWK

+
分子 #32: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 17.463727 KDa
配列文字列:
MAARLLSLYG RCLSAAGAMR GLPAARVRWE SSRAVIAPSG VEKKRQREPT MQWQEDPEPE DENVYAKNPD FHGYDSDPVV DVWNMRAVF FFGFSIVLVF GTTFVAYVPD YRMQEWARRE AERLVKYREV NGLPIMESNY FDPSKIQLPE DD

+
分子 #33: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 21.742197 KDa
配列文字列: MAAMSLLQRA SVSALTALSC RRAGPRLGVG SFLTRSFPKT VAPVRHSGDH GKRLFVVKPS LYYDARFLRL MKFYLMLTGI PVIIGITLV NIFIGEAELA EIPEGYIPEH WEYYKHPISR WIARNFYDGP EKNYEKTLAI LQIESEKAEL RLKEQEVRRL M RARGDGPW ...文字列:
MAAMSLLQRA SVSALTALSC RRAGPRLGVG SFLTRSFPKT VAPVRHSGDH GKRLFVVKPS LYYDARFLRL MKFYLMLTGI PVIIGITLV NIFIGEAELA EIPEGYIPEH WEYYKHPISR WIARNFYDGP EKNYEKTLAI LQIESEKAEL RLKEQEVRRL M RARGDGPW YQFPTPEKEF IDHSPKATPD N

+
分子 #34: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 15.582122 KDa
配列文字列:
M(SAC)GYTPDEKL RLQQLRELRR RWLKDQELSP REPVLPPRRM WPLERFWDNF LRDGAVWKNM VFKAYRSSLF AVSHVL IPM WFVHYYVKYH MATKPYTIVS SKPRIFPGDT ILETGEVIPP MRDFPDQHH

+
分子 #35: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 11.982437 KDa
配列文字列:
MSALTRLVPF GRVGGRLLRG CRARAAGDSG VRHAGGGVHI QPRYREFPQL TRSQVIQGEF LSSLMWFWIL WRFWHDSDAV LGHFSYPDP SQWTDEELGI PPDDED

+
分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 11.71424 KDa
配列文字列:
MAAGHGHEHG HEHGHGHGKM ELPDYRQWKI EGTPLETVQK KLAARGLRDP WARNEAWRYM GGFAGNITFP SVILKGFKWG FAAFVVALG AEYFLDSQNG DKKHH

+
分子 #37: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 21.903828 KDa
配列文字列:
MAAARAAALG VRWLQRTTRG VVPLEARRAF HMTKDMLPGS YPRTPEERAA AAKKYNMRVE DYEPYPDDGM GYGDYPMLPN RSQHERDPW YQWDHSELRM NWGEPIHWDL DMYIRNRVDT SPTPVSWDVM CKHLFGFVAF MVFMFWVGHV FPSYQPVGPK Q YPYNNLYL ERGGDPTKEP EPVVHYDI

+
分子 #38: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 15.105287 KDa
配列文字列:
MSGSKYKPAP LATLPSTLDP AEYDVSPETR RAQVERLSIR ARLKREYLLQ YNDPKRVSHI EDPALIRWTY ARSANIYPNF RPTPKNSLL GAVAGFGPLI FWYYVFKTDR DRKERLIQEG KLDRKFNISY

+
分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 22.020123 KDa
配列文字列:
MAFCAPPAYL THQQKVLRLY KRALRHLESW CIHRDKYRYF ACLMRARFEE HKNEKDMMRA TQLLREAEEE FWQNQHPQPY IFPDSPGGT SFERYECYKV PEWCLDYWHP SEKAMYPDYF SKREQWKKLR MESWDREVKQ LQEETSPDGI MTEALPPARR E GDLPPLWW HIVTRPRERP T

+
分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 16.360804 KDa
配列文字列:
MGAHLTRRYL WDASVEPDPE KIPSFPPDLG FPERKERVMV ATQQEMMDAQ LTLQQRDYCA HYLIRLLKCK RDSFPNFLAC KHEQHDWDY CEHLDYVKRM KEFERERRLL QRKKRRALKE ARVAQGQGEG EVGPEVAL

+
分子 #41: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 21.054832 KDa
配列文字列:
MPDSWDKDVY PEPPSRTPAP SPQTSLPNPI TYLTKAYDLV VDWPVTLVRE FIERQHAKNR TYYYHRQYRR VPDITECKEG DVLCIYEAE MQWRRDFKVD QEIMNIIQER LKACQQREGE NYQQNCAKEL EQFTKVTKAY QDRYLDLGAY YSARKCLAKQ K QRMLEERK AARQEAAA

+
分子 #42: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 17.154453 KDa
配列文字列:
(AME)ELVEVLKRG VQQVTGHGGL RGLLRVFFRA NDIRIGTLVG EDKYGNKYYE DNKQFFGRHR WVIYTTEMNG KNTFWD VDG SMVPPEWHRW LHCMTDDPPT TNPPTARKFI WTNHKFNVSA TPEQYVPYST TRKKIHEWVP PSTPYK

+
分子 #43: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 12.637629 KDa
配列文字列:
M(AYA)SATRVIQK LRNWASGQDL QAKLQLRYQE IAKRTQPPPK LPVGPSHKLS NNYYCTRDGR REVVPPSIIM SSQKAL VSG KAAESSAMAA TEKKAVTPAP PMKRWELSKD QPYL

+
分子 #44: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse (ネズミ) / 器官: Heart
分子量理論値: 11.833504 KDa
配列文字列:
MAVSLLLRGG RIRALKAVLL EARVFPGELV SVVRLSTESE KSAKEKELHP KTQSVLKEPE PTDTTTYKNL QHHDYNTYTF LDLNLDLSK FRLPQPSSGR ESPRH

+
分子 #45: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 12 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da

+
分子 #46: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄

+
分子 #47: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #48: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN

+
分子 #49: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 4 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM

+
分子 #50: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 4 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

+
分子 #51: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 1 / 式: ADP
分子量理論値: 427.201 Da
Chemical component information

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

+
分子 #52: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH

+
分子 #53: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #54: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butan...

分子名称: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 2 / 式: EHZ
分子量理論値: 584.703 Da
Chemical component information

ChemComp-EHZ:
~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度5 mg/mL
緩衝液pH: 7.14
構成要素:
濃度式名称
150.0 mMNaClSodium chloride
20.0 mMTris
0.05 %DDM
グリッドモデル: Quantifoil UltrAuFoil / 材質: GOLD / メッシュ: 300
詳細: Gold was PEGylated prior to use in anaerobic ethanol in 5mM SPT-11P6 (Sensopath Technologies) for two days 0.6/1 holes
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 詳細: 8-16s blotting..
詳細Peak fraction from a gel filtration column- monodisperse and not concentrated

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
特殊光学系エネルギーフィルター - 名称: GIF Quantum LS
エネルギーフィルター - エネルギー下限: 0 eV
エネルギーフィルター - エネルギー上限: 20 eV
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-12 / 撮影したグリッド数: 1 / 平均露光時間: 10.0 sec. / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系倍率（補正後）: 47600 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.1 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 60851
CTF補正ソフトウェア - 名称: Gctf (ver. 1.06)
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

2676

最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / アルゴリズム: FOURIER SPACE / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1) / ソフトウェア - 詳細: patch b1 / 使用した粒子像数: 20370
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1) / ソフトウェア - 詳細: patch b1
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1) / ソフトウェア - 詳細: patch b1
最終 3次元分類クラス数: 5 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1) / ソフトウェア - 詳細: patch b1
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

詳細Used default paramteres in phenix.real_space_refine
精密化空間: REAL / プロトコル: FLEXIBLE FIT
得られたモデル

PDB-6g2j:
Mouse mitochondrial complex I in the active state

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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