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データを開く
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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | CryoEM structure of PP7 virus-like particle from a multi-species dataset | |||||||||
![]() | Final sharpened map | |||||||||
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![]() | PP7 VLP / icosahedral cage / multi-species / VIRUS LIKE PARTICLE | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.36 Å | |||||||||
![]() | Kopylov M / Bobe D / Eng ET | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: CryoEM structure of PP7 virus-like particle from a multi-species dataset 著者: Kopylov M / Bobe D / Eng ET | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 398.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12.3 KB 12.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 15.8 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 183.4 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 421.9 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 3.8 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 392.1 MB 392.1 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 25.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 33.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Final sharpened map | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.096 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half B
ファイル | emd_41917_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half B | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half A
ファイル | emd_41917_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half A | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Pseudomonas phage PP7
全体 | 名称: ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Pseudomonas phage PP7
超分子 | 名称: Pseudomonas phage PP7 / タイプ: virus / ID: 1 / 親要素: 0 / 詳細: Virus-like particles / NCBI-ID: 12023 / 生物種: Pseudomonas phage PP7 / ウイルスタイプ: VIRUS-LIKE PARTICLE / ウイルス・単離状態: SPECIES / ウイルス・エンベロープ: No / ウイルス・中空状態: Yes |
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分子量 | 理論値: 2.5 MDa |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 1 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 7.5 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 70.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.5 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |