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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Global reconstruction for HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab | |||||||||
![]() | Global reconstruction half map B for HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab | |||||||||
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![]() | Virus / glycoprotein / antibody / VIRAL PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å | |||||||||
![]() | Goldsmith JG / McLellan JS | |||||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: HCMV neutralization by broad antibody targeting 著者: Zehner M / Goldsmith JG / McLellan JS / Klein F | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 89.7 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.8 KB 14.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 55.4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 156.9 MB 165.3 MB 165.3 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 872.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 871.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Global reconstruction half map B for HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.94 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: Global reconstruction map for HCMV Trimer in complex...
ファイル | emd_41157_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Global reconstruction map for HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Global reconstruction half map A for HCMV Trimer...
ファイル | emd_41157_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Global reconstruction half map A for HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Global reconstruction sharpened map for HCMV Trimer in...
ファイル | emd_41157_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Global reconstruction sharpened map for HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab
全体 | 名称: HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab |
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要素 |
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-超分子 #1: HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab
超分子 | 名称: HCMV Trimer in complex with CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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-超分子 #2: HCMV Trimer
超分子 | 名称: HCMV Trimer / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-超分子 #3: CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab
超分子 | 名称: CS2it1p2_F7K Fab and CS4tt1p1_E3K Fab / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS GLACIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 49.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.2 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: PDB ENTRY PDBモデル - PDB ID: |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 376687 |
初期 角度割当 | タイプ: RANDOM ASSIGNMENT |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |