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- EMDB-38424: The cryo-EM structure of Orf2971-FtsHi motor complex -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-38424
タイトルThe cryo-EM structure of Orf2971-FtsHi motor complex
マップデータ
試料
  • 複合体: The complex of Orf2971-FtsHi motor
    • タンパク質・ペプチド: x 19種
  • リガンド: x 6種
キーワードChlamydomonas reinhardtii / protein transportation / chloroplast / lipid synthesis / Enzyme / PROTEIN TRANSPORT
機能・相同性
機能・相同性情報


fatty acid transmembrane transporter activity / protein import into chloroplast stroma / chloroplast inner membrane / phytochromobilin biosynthetic process / oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, iron-sulfur protein as acceptor / poly(ADP-ribose) glycohydrolase / cobalt ion binding / ATP-dependent peptidase activity / acyl carrier activity / fatty acid transport ...fatty acid transmembrane transporter activity / protein import into chloroplast stroma / chloroplast inner membrane / phytochromobilin biosynthetic process / oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, iron-sulfur protein as acceptor / poly(ADP-ribose) glycohydrolase / cobalt ion binding / ATP-dependent peptidase activity / acyl carrier activity / fatty acid transport / chloroplast / metalloendopeptidase activity / protein transport / oxidoreductase activity / hydrolase activity / ATP hydrolysis activity / proteolysis / ATP binding / membrane
類似検索 - 分子機能
Tic22-like / Tic22-like family / Fatty acid desaturase / Acyl carrier protein, chloroplastic / Ferredoxin-dependent bilin reductase / Ferredoxin-dependent bilin reductase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 / ADP-ribosylglycohydrolase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 superfamily / : ...Tic22-like / Tic22-like family / Fatty acid desaturase / Acyl carrier protein, chloroplastic / Ferredoxin-dependent bilin reductase / Ferredoxin-dependent bilin reductase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 / ADP-ribosylglycohydrolase / ADP-ribosylation/Crystallin J1 superfamily / : / Peptidase M41 / Peptidase M41-like / Peptidase family M41 / : / Acyl carrier protein (ACP) / AAA ATPase, AAA+ lid domain / AAA+ lid domain / ATPase, AAA-type, conserved site / AAA-protein family signature. / Phosphopantetheine attachment site / ACP-like superfamily / Carrier protein (CP) domain profile. / Phosphopantetheine binding ACP domain / ATPase family associated with various cellular activities (AAA) / ATPase, AAA-type, core / ATPases associated with a variety of cellular activities / AAA+ ATPase domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
類似検索 - ドメイン・相同性
Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein / Flagellar associated protein / AAA+ ATPase domain-containing protein / ADP-ribosylhydrolase ARH3 / Uncharacterized protein / Fatty acid desaturase domain-containing protein / Uncharacterized protein ...Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein / Flagellar associated protein / AAA+ ATPase domain-containing protein / ADP-ribosylhydrolase ARH3 / Uncharacterized protein / Fatty acid desaturase domain-containing protein / Uncharacterized protein / AAA+ ATPase domain-containing protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized 341.7 kDa protein in psbD-psbC intergenic region / Acyl carrier protein
類似検索 - 構成要素
生物種Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å
データ登録者Wang N / Li M
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number国
National Natural Science Foundation of China (NSFC) 中国
引用ジャーナル: Mol Plant / 年: 2024
タイトル: Architecture of the ATP-driven motor for protein import into chloroplasts.
著者: Ning Wang / Jiale Xing / Xiaodong Su / Junting Pan / Hui Chen / Lifang Shi / Long Si / Wenqiang Yang / Mei Li /
要旨: Thousands of nuclear-encoded proteins are transported into chloroplasts through the TOC-TIC translocon that spans the chloroplast envelope membranes. A motor complex pulls the translocated proteins ...Thousands of nuclear-encoded proteins are transported into chloroplasts through the TOC-TIC translocon that spans the chloroplast envelope membranes. A motor complex pulls the translocated proteins out of the TOC-TIC complex into the chloroplast stroma by hydrolyzing ATP. The Orf2971-FtsHi complex has been suggested to serve as the ATP-hydrolyzing motor in Chlamydomonas reinhardtii, but little is known about its architecture and assembly. Here, we report the 3.2-Å resolution structure of the Chlamydomonas Orf2971-FtsHi complex. The 20-subunit complex spans the chloroplast inner envelope, with two bulky modules protruding into the intermembrane space and stromal matrix. Six subunits form a hetero-hexamer that potentially provides the pulling force through ATP hydrolysis. The remaining subunits, including potential enzymes/chaperones, likely facilitate the complex assembly and regulate its proper function. Taken together, our results provide the structural foundation for a mechanistic understanding of chloroplast protein translocation.
履歴
登録2023年12月24日-
ヘッダ(付随情報) 公開2024年12月4日-
マップ公開2024年12月4日-
更新2024年12月4日-
現状2024年12月4日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_38424.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_38424.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 282.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.04 Å/pix.
x 420 pix.
= 436.8 Å		1.04 Å/pix.
x 420 pix.
= 436.8 Å		1.04 Å/pix.
x 420 pix.
= 436.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.04 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.00943
最小 - 最大-0.0 - 0.09903348
平均 (標準偏差)0.00021641939 (±0.0018428217)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ420420420
Spacing420420420
セルA=B=C: 436.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : The complex of Orf2971-FtsHi motor

全体名称: The complex of Orf2971-FtsHi motor
要素
  • 複合体: The complex of Orf2971-FtsHi motor
    • タンパク質・ペプチド: Ctap1
    • タンパク質・ペプチド: Fhl2
    • タンパク質・ペプチド: 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: AAA+ ATPase domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized 341.7 kDa protein in psbD-psbC intergenic region
    • タンパク質・ペプチド: AAA+ ATPase domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Flagellar associated protein
    • タンパク質・ペプチド: Tic22
    • タンパク質・ペプチド: FaxL
    • タンパク質・ペプチド: Fatty acid desaturase domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Moc25
    • タンパク質・ペプチド: Moc29
    • タンパク質・ペプチド: Moc34
    • タンパク質・ペプチド: Moc45
    • タンパク質・ペプチド: PcyA1
    • タンパク質・ペプチド: ADP-ribosylglycohydrolase
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: Moc13
    • タンパク質・ペプチド: Moc31
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: DIACYL GLYCEROL
  • リガンド: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
  • リガンド: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
  • リガンド: ARACHIDONIC ACID
  • リガンド: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL

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超分子 #1: The complex of Orf2971-FtsHi motor

超分子名称: The complex of Orf2971-FtsHi motor / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#19
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)

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分子 #1: Ctap1

分子名称: Ctap1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 107.778039 KDa
配列文字列: MRSAELGRPP RLAQSRLRNV SSHHVTNSCL WLRPPGCRRL VASCAASKES SSASLTAERF ITDAKELNAT GSGLPIIDGP DWEEQHWAA LKAMSAGRPV ALPTPHAKFG PEDLQRIAAS GPRLEDLTLE HAERLAGPGQ LPTAPDGVAL AFRYIPRSVL G DFRQEVEP ...文字列:
MRSAELGRPP RLAQSRLRNV SSHHVTNSCL WLRPPGCRRL VASCAASKES SSASLTAERF ITDAKELNAT GSGLPIIDGP DWEEQHWAA LKAMSAGRPV ALPTPHAKFG PEDLQRIAAS GPRLEDLTLE HAERLAGPGQ LPTAPDGVAL AFRYIPRSVL G DFRQEVEP DWRSLPAMSP AELYAGLRAR NWTSAHYDPA AEPWRLQVFS CDYKHTGVTG WPGYRVVVTS RGGRRRWVDL AE EGELVQL TEQAPPASPA DIGYSHVFAQ LYQAYEPRYS PEALAALYGS SSSKGKAAAA AAAQHDTPAL RHLDVSYHGT GSA VAPGSG TAFLMQPSWD AVTGAIRWGL ERSGLPELRA LRDSLLPEWR PPALELNRSN NNLGVVYFAV CLTLGIVIPA LRRS RILDI RTLEEDPGAA MEFARSKSEA RKEGLTGVEF RDVAGLGPIL NEVVEVVEFL KDPGTFSKLG ARPPKGILLE GDPGT GKTL LAKALAGEAM VPFYQMSGTE FTEGIVGLGA ARVRDLFKRA RATAPCVIFV DEIDALGLRR AENDSAKTNE EREQTL NQL LTEMDGFTPD TGVVFLGATN RADLLDPALM RPGRFDRKIR MPKPDTEGRL EILKLHLRNK QVAPDVDLLQ LARDLPG LV GADLANIVNE AAMTAVRSGR QQLTARDIYA GVDRFTQGEV RPSLPTAHKL PVLCFAAKEI GIALVAGELR DRYGRVEL V ERVSIQPKGR AYSRTMFQRG TDEEYQLMTR GRLLDRIRLA LAGGFAVRTA LGEETNFTAA DIKRATRMAK KYVFYYGFS EAGGAGITTW ANQPYSGDFV IGQQRARKVV STDAMDAFAD WPTVSEDFRF DAPSPSDVTW HRYTDEVRRV LKGCSEDVLG ILAERQEAM WAGIKALSDR KELLGSELRD IFDAHPAATS RDRDARAELA AAKLDMTIFT EGANSRWPYG IEWLDDAYPK P YWVQQQEA EAAEAQAKQP AAAL

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分子 #2: Fhl2

分子名称: Fhl2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 109.355469 KDa
配列文字列: MKATGLPSLP ARALGAAGCS TSPRPAALGW SSRGCASGRR RACARVHVAD AEAVASGVAA TEAAAAVPAL PARATAVVAP LPEKNYGSL RGGRWPFLYD NVYGLPVVRQ VASYGEVLEG IRTGRISQVL WFQAPRAVTA SAAAPPPGLG GPQQPQPPPL A SPDGRCLV ...文字列:
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分子 #3: 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein

分子名称: 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 50.682551 KDa
配列文字列: MGQFYSREFD GDPYVDLMRS LPERELVWWA QKVIWLAEGF TFVDHFARTY PRLLQHKCQR CKGAGVMTCP ACLGDARVSG GARRRAALA GLGGVAEGRS AHDHDHEAGA DGGCRVCGTA CAWDAESEWM ERWGEWESRL AYYDKATGPL MDEWYEDVLN A GNLEEDTP ...文字列:
MGQFYSREFD GDPYVDLMRS LPERELVWWA QKVIWLAEGF TFVDHFARTY PRLLQHKCQR CKGAGVMTCP ACLGDARVSG GARRRAALA GLGGVAEGRS AHDHDHEAGA DGGCRVCGTA CAWDAESEWM ERWGEWESRL AYYDKATGPL MDEWYEDVLN A GNLEEDTP PVEDDPPGPE VTGRWAEHDR ALHKDKKRMA ALMRRWGHPY DADANLGYQI VDPTASMGEN VWNMAQVYNS LP PELNPLR TQHLADRGGG NTQAAVEAAR SAFDAQVVME AALLQNLEAA AQDLPKPHRL PPTAGTVACN ECGGAAWGYS FFP NTAVMF GLERPFWGDT LARLSKYWNP TQVADPARTG QLLPYGEGGL RRLLAAGGGG EDEEGGALEA VVGKAPATTG RYRR DLELL LAHPELRDGA LRVPGGWGPE GGLQTYLRGQ QEEQARMQRR RDLAAEASPL ELAPAGK

UniProtKB: 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein

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分子 #4: AAA+ ATPase domain-containing protein

分子名称: AAA+ ATPase domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 128.535375 KDa
配列文字列: MHAQRPAGPP CSSAPSTSYP VAPSPVSSRS RGLHARRGVA EQRSLGCRST GSSDQHSNTN DGASGPSRPE QGPELDWSGL PRRQLAAMA MSPFAALSLP LVNDPAWQQS FETYGGKLRE VLLGQQEAAK NVAKQLDEGV TYMDWTYRST GVDLSAVWDP E LWIRFREA ...文字列:
MHAQRPAGPP CSSAPSTSYP VAPSPVSSRS RGLHARRGVA EQRSLGCRST GSSDQHSNTN DGASGPSRPE QGPELDWSGL PRRQLAAMA MSPFAALSLP LVNDPAWQQS FETYGGKLRE VLLGQQEAAK NVAKQLDEGV TYMDWTYRST GVDLSAVWDP E LWIRFREA VAQNEPAIFW NKLLDRVQYK ENLPQAGLVG DMRISYAKFL ELLKDQRVKR LVVYGDMRTA VVEVPHPWSA SV LGHPATH PFYEDSAHNR VSMLRPNPAA PEDVTQWFCA EMPEWDMEKY RFYVDLPGDF WESGVLQRHL AAQRAEGAVW DPA SGQYIL PYRAQKKVFQ VSTEVQLLDP QESWDFLGWL LAPGRLEFYE KAACVAIALR VLGIVIAIST GSPLFKLVNV GWGK LRGKG KKNATKDPKK MSKQEKKESQ WERLTSSRAR EFMTKDEKTG KMRDTGVRFE DIAGMEFLVT EMREIVRMLK GDEAY KRVG AKCPKGIIFQ GPPGTGKTYL ARAIAGEAEV PFFSSVGSEF VEMFAGVAAA RVNSLFYNAR KKAPAIIFID EIDAIG RAR STLGGDPGSM ERESALLAML VQMDGIANKT EQVLTIGATN LAQELDAALL RPGRFEVVYE VPQPGPSARM AILRYHA KG KPLEGDGQRL LLKTAEATQG WSAAALANLM NEAAILTVRR NVPAISLPMV LELVEGLNWG EQAPRIPDSE AKDRLALI T AAKAVAFALT PGLEPIKSVT MWSGRRGLGP SVDFIAMEDK AAMDMHPEET ELMGWRTNFK TNAAVVGDEP LGEFAHVAG LLVPLYAGRA AEVALFGKDG ASLATAQPLA DCFEIAYYCV RNSQVHPRFK SLPPLHTTMW LGRDDAGRWR RDPLAIGFDE ELGYHKLTL TLLKASWRRA LRLVAQRRSA ITKVAAEMLA APEEKITGAR LVEIIESTPL DDLGGEGLDG AAAAAVVEEA G NEFLPLLK EVLGQVPGII LTGESLAQTD DQGRPLPPSS ASTSSADAAA SDAAASAGPA TELRLDDATL AAVSRTLMGR LD VVDLIGR NTAVEAAERV RDALLHPETR ERLLAMRRWV EGGPGAPEFP PSPLSPEQTA AMSPSGPLYG NLALNLDWWR RRQ DNVISW SAMEILMSRR QVDLYKQDAD MTEGAIAKLG TPPAAPAAAI GSSSKSSSGQ SS

UniProtKB: AAA+ ATPase domain-containing protein

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分子 #5: Uncharacterized 341.7 kDa protein in psbD-psbC intergenic region

分子名称: Uncharacterized 341.7 kDa protein in psbD-psbC intergenic region
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 342.11675 KDa
配列文字列: MTFLNHYTYL FSIPEKQADK VSGILRLAQA RPIETLQNER INKQLNAFLK TYKFEKLITN YKKMQSFIPN NSLNGNKTNS STNKLYATS LNVFPENPPL MVRKAVSDEA DKFSKFTYSK VQVVTNNLNN GMNSKEFIKA NNLKPSLRAA ESLVLNHLTY N KFKENLYF ...文字列:
MTFLNHYTYL FSIPEKQADK VSGILRLAQA RPIETLQNER INKQLNAFLK TYKFEKLITN YKKMQSFIPN NSLNGNKTNS STNKLYATS LNVFPENPPL MVRKAVSDEA DKFSKFTYSK VQVVTNNLNN GMNSKEFIKA NNLKPSLRAA ESLVLNHLTY N KFKENLYF KTNNIQPTKS KSTSLFFLNI LSNSKPRTCS DFLSSPKIRK TWFRNTAWSL QTQQHRSSNG INLSLQLPYA LG PSVPAGA SGQNMYELPV AQSSSRFGTY YFLQKLLSKY LDVWNASADN GSVLSNSENI KLNFSMVSLL DSKMAIQTPN SLY FVFTQL NQKTFLSYWL LPVAGLALLT PTLLTLTGQS VSVQKFNSFI NKKTDMMVLS NTEMPSKSFG TPTLFGTSVE IYLP NSYMP KGEGESGINR VNSSINAVKK NTVTANLVLD SESQEVATSF QNDLISIKYC FNNLYNYISN KTALSTKNLF LFSAI KSNA TKHKRTQSFF SVENTTTLGN NSNFVKGHFK SSINAFSSYL PSTNVHSMIP LTSLPYLKAI SPLYSKFMID HSLKFI TPK TTLKLLQHKL NKSPKQMYTK TQNFTGLRDL RALNSFSFGQ VNFRTNHFLH SNSRPLNHYN QALKLINGYE QYKNNLQ IN CNKTLDLNTK NKLVYQVHKS HLFNQKCSQI VYKQSLYNRD LCTIRGTGTK VVDYFSHGDK LSNKNGIVLD YFVYSNLL F DNKTNTIINK DGKQNITKLK LNLTKTTVPF KTLIKKYTSI NSLVANEQTR NNLNLGLIHF NGHLSVVSNA NLLTGRPVK FIYYKFDKRL NSYLIYVNQN LKKFIQLNNN FLKPKPLSHQ KNKPVEDFNQ YATNNSSPPK TNVFEKSFVE DSSLRKPLTS LRGSKQFLN SLTILFKHQK MFKKKTLKAH KWHSDTQGIF RKHTNSSFGS ANFSNGPEES SLSTRLHIQK KRKAKKQRLE T RRQKKRTR FFPRPVWLRS RMFLNFLTER NKYYLNSTIT KQGFSLPSKD VVTTKLDWLK EDMRPSSLGA YQYKSLLTQK AG NKFQRQS FTEVVSTMEY INGIHKALNN SIFNKIVRKS LLSSSQNPLK LRLVANYSKM QFMHRVKLPF YRTLKHSEGT KNL ANKKQN LRDIKIKANY NNFKSQKANN QPQQNDKDKD KDTMFRDFWV WSYNNTQTNA FNQNLWWLLP NLTTKQSNLE FLTS TYPTA KETQRAKEEI HGNSIPTASK NQIALIRLNW ALNKTNINTF TDYSKRNNLW TTQKLRNQSK NNKTKSLEKQ FITNW EKFF LNKNLNIFSK KIISKVKQKK QKLNYMTSYL NVQSEHNVKI FHNSWWTHLN IKNLVNNQDM VIPVREGYFS VGNFNS EFI NSAIIKSINN KTLVENYVYS PSSEKETMQL LLMSSSILLH LCAIISLVSI SQVRCFVKFH LILLYKLSNV YNAILNQ LS NKLQKNLPIY NNINKLNSRY FYMNHQKSQI KQRKKLLTYF SLTLLKKQFV TVKPLQIRNF ASIKNQSSNN SNLTYTDM L PLSLRANKFR GSKYDISIRE EEGQSAHIKP SKSMYAKLNI LSLKTIFLKQ LLMNKKPSAL PSNVGLKSNR ETQKSQLIQ RIKTKELQIS LKKNIIGFSK VTKNHILKIL FNVIEVFQTA VRNISSFFEK PAEFTTTWIA YGFLVEWSSD FITIIPENVD IYIWNVFSK IYRTIPLSFI STTLGPASTV FDPVTNSTIP IQMGNFNYQK MVAFPILLSL SHLLHRRILY LFDTLFSTIT Q PDTDLIAR QEKGTLFWDI WADFLVTAAD YYNVNVAALS TIKAEQNSLI ENISNDFDNL TMSSKKPFFM PNKGVSNIKN IF WIKKLKE PQLPESIVQN REVFVRERKR TLKGLFNIYA PQEETLWNNP TSPKNLSDEK ISFKLFNQLN LQLFAEKNKI KPY FEAYFS TTQQKTNIMQ SAFPEANLNR WSVNQFITYQ SWHSHNGSNN SNGDLFIDYH PPKTFSHIPA LKYNSILQQP IGSL VCQIY SGLFNKQISK NILLVNPKTT SNNLVDYNVL LIQALAGETE MKIITDNAQR YALVNRGFAI GIKLLREVFD AIALN TPCI FLLEDIHAIG ERRPMLISDF GGGMSDDNGS FKEDFFGSQR DEVHEKNQVV YQLTRHAITH YKKPFKGDYS LAIPTN LYV TDLFLKLPTQ SISNLTNVEN HNLSIKNKIQ HNGTQSLTET KRNLGGDINK NSYLQLTQFT KTLAPPSTSP FSVLLLK EE KRLKPNKIVE ELPWTSLPGE QLATKPRTSY SVRAKVAMLA ELSLSNLSAK LDMITDLLVI IDSVRSNKGF VVFATTDI P HVLDPALRRP GRLDETICLP NIHTSNILNF TKNYEIFKSA KDTSNFGKKI ILNEMQNLTT TSTQRDMYLS CLPTNNQTH KTKREGVLTM NLKDYNILLN QVYFAEGTGG ILNSQMHKDS LQKSLNFALI SHSKKLKELN VSKLIGSNGT VSQGNVDQLG VFAGQIVNK QKKSLQQHLP NSKKSFKKKY KDKAIIYYEV GKFVLNYFLN NQLTQSSIID KPVSVTNKQT NDITIFGNDF L NLKTINYL SLYNSKNKIL LQLMLIFGGK ISQLLSSKNL VKSLKQASIN SYMVEEESGS ISSAGMPLGQ THLLPKALSV LA KPMIFSD GYNNQNLKTA TTLLLSFIHK RYLYRKNLIV PKLLSFADGN ILDEPPSPPF SSLLIPAKRF ENYKRFFRDT LTG DKMGQR KSQITLLEKL QYHMQLRSIK QLNATFSSQE NLDFQSNAAL TSQKLDTLMS LSTNNLLQNP TNINWYYQNR ILKR HGQYL TNQWWNGQLS EHNAETVFLS DIDWRSSFIK NKNINITKSK NLYRLTQQKN NTDGLDVLLD FPDTDQYYNP KRRRW LLNN GSWNFWFNFD KLYSEEIVTT WILESLIQTY KYLHKNTELL DFVTNKFITL GYIAPENANL QNISGFPSQS ELLSTK EII LTNSFKRF

UniProtKB: Uncharacterized 341.7 kDa protein in psbD-psbC intergenic region

+
分子 #6: AAA+ ATPase domain-containing protein

分子名称: AAA+ ATPase domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 114.826094 KDa
配列文字列: MQRRWSRAAN VRTLATSRGE QPQDSGPSTS GRAELPLDSG IGKLISTTAK AIGLVGLMAV AVLSGPTRAA HARDRLSAQP AAEALIHHQ QPYQQPHHHQ QQHRSAGAVA NPVLSDLAAA PATLEPATLE PATSTTSALT PVEAAYSAYL RRIAEAYLAE H PQMAAPEH ...文字列:
MQRRWSRAAN VRTLATSRGE QPQDSGPSTS GRAELPLDSG IGKLISTTAK AIGLVGLMAV AVLSGPTRAA HARDRLSAQP AAEALIHHQ QPYQQPHHHQ QQHRSAGAVA NPVLSDLAAA PATLEPATLE PATSTTSALT PVEAAYSAYL RRIAEAYLAE H PQMAAPEH AAHVARVVRS RALGTPLSFD ELMRSAVPAP GEVPNRNSRG QVAEQVRAIL DQYDREDFDL GIKQFMLEAK VK AKLEAAS RGTSRDRAAP KDYEEALAAE LFAAEEGAAP KEKAKTEDMV DDAFTTEVVE EAMALFGDAN SVKTAWRTQE VLR ELSYTQ LWALVGEGHV ARVRFYGPEK NKVMATTRAS APGGERLCKV VLPPDPELLD HLVSNGVVVD TGVTEDDRLR ASLL VQMLR YTVPFMVISG LFWMIHTWIL DPLPNKFRRQ EFIRYRREML HVASKLNFRT PAREVRIDTG SPDFIKWDDI NGIDE VKKE INEIIEYLRN PALLRSRGVA RIGGVLLAGA PGTGKTLLAK AIAAEGGVRM FTCSGTDFYD VYSGVGARRV RETFDR LRN AAPAILFIDE FDAMGAARGA QASGDESASI INELLVQMDG FEDNRGIVVL GATNRPGAID SALIRPGRFD RIIYMPL PD ALGRAKIMQV HARNKAVDPN INWYEVARAM AGFTGADVMG LMARAARMAA RQGRHAITED DIYAAMENKT MEATLEAS T AGDGGGLVGG EGVEGSPDPI PPQLRRAVSV YEAGKALLAY ITPDYEEIAR VSVCPLNVLT GFTLFVEDED KNVNAILTR SELEGRMVVH LAGRCAEKLV MGEGQMTGMG SPDLFHANLI AREMIMSMGM GRRTGPIDLL RVAATSEAAS GADTLRAGPA AADGDPFYY HTTDMSTEQA RVALAEVVEL LDAAEAKAMY GLAINWRALQ ALTQALLDRG TITGKEVAHI LESNGVIHFP D PYTTGFGW DPDGSLRYPF KPDTPPEGGS GGGGAAAEGS APQTPDLSGA RGKTWFAGTA YDAPRNADGT FKHGWHWNMP FS VKTELPD WYKKEVERYS Y

UniProtKB: AAA+ ATPase domain-containing protein

+
分子 #7: Flagellar associated protein

分子名称: Flagellar associated protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 71.675305 KDa
配列文字列: MATTSAPTSE PWTFDLVGQL RQKFGLGPEN WDRFKGQAAE VPGADVPPSG AHVTLKDLSR PAESLPARAD EAAVQAALAD DGGWVGTPD PSKYAAGTTQ LSARELQEEV AKGNVMTWKD FKQQVSGLQG PEREALLALV AQRVAAERMF FTLEDGSKVS L WDLQQYVD ...文字列:
MATTSAPTSE PWTFDLVGQL RQKFGLGPEN WDRFKGQAAE VPGADVPPSG AHVTLKDLSR PAESLPARAD EAAVQAALAD DGGWVGTPD PSKYAAGTTQ LSARELQEEV AKGNVMTWKD FKQQVSGLQG PEREALLALV AQRVAAERMF FTLEDGSKVS L WDLQQYVD NNPELAALAA SVRRIAVADP EDPAGRPLPG GGASGLDRSR GLTGAAHMSG QEAEELELDW GQVGRGALWR RR PTRWLLG GLDGVKDWEL EAYAHEPLAN QLLGAKYGGR DPRAVVADPA YAADVLRAGP LLGMTFVLRA ARDLPLQEVA SSW RGLLGN YLQRQAPLSL PKAVRPAHLD PTDLNGVAWP ALLSRPAAAA HAAAEAEAAG AVPDDEMGVA WRVQSGKEAA ASVA AAQQL LQSLPDALCP GPSPAAWPLT GTKLVDEGGR NWRRGGSVWV TLQPEGGVLV QAQTGGVVGE QESYLLTHVQ GQEAL AGAV MSAFMGPQPL DPELAAAARS VLLVPANGFT AANKERDPNH PLYPSFTGVR PGRAPRDVAA YTLAGGRTPL LAAGGP GEA KLASELRTVM EAALAAAARA EAEALADAAT SPSSTSSRAA PAAALAEAEA AEARRARGRA AAAAVMAEGL RRLGPDA VA MLERTAAEAE APQGGGAVVV AGAGSASGEK GVGLTSSDIF SLARTLEQE

UniProtKB: Flagellar associated protein

+
分子 #8: Tic22

分子名称: Tic22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 36.869215 KDa
配列文字列: MREGVTRWLE RTPLAQIIRN AQEGVATQQR QRDQGPWAPM LASIAMSGAG PRPQPVMDLA MAKDEVKARL APVPVYTVAN PKNEFVLVA GENNTQLGFF FFRKEDAEAL IEKIREENPR LARDSKILRV PMDNVYEVFT TPREQTGLQG IHFRFMPDMK Q VAHALQLY ...文字列:
MREGVTRWLE RTPLAQIIRN AQEGVATQQR QRDQGPWAPM LASIAMSGAG PRPQPVMDLA MAKDEVKARL APVPVYTVAN PKNEFVLVA GENNTQLGFF FFRKEDAEAL IEKIREENPR LARDSKILRV PMDNVYEVFT TPREQTGLQG IHFRFMPDMK Q VAHALQLY KDAGVPTRQF IGVPVFQAEG LTVTTRDMQY VPLFLCKEDL DIAVQSAYVQ RNAAQIKLYK DKADKYQADY DQ IASQLEA AANGRERGGL ESRLAKARVK LEAARDKVES VERAPLPKVE VGSFEEVVMR MTASAGNELA AWSQVMFVAP ELL RDSAGA GGKK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #9: FaxL

分子名称: FaxL / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 39.091016 KDa
配列文字列: MSPGALYQLA PEQLRASSRR SAAATIFRRD RIRLLRCSAA AQPGEPGEAA GPSTSGSDNS NWWASINRKT GIRGPDPAPA EEHTNGPAR DIIGDRMSRR LEDINKAERQ RVWDAMRVAA AHRYAAGQMP AWFDPEWLQQ EEAPLNAMDR MRGEQRRIDE Q QQQGEASS ...文字列:
MSPGALYQLA PEQLRASSRR SAAATIFRRD RIRLLRCSAA AQPGEPGEAA GPSTSGSDNS NWWASINRKT GIRGPDPAPA EEHTNGPAR DIIGDRMSRR LEDINKAERQ RVWDAMRVAA AHRYAAGQMP AWFDPEWLQQ EEAPLNAMDR MRGEQRRIDE Q QQQGEASS SDKLAMEGGG GDSGAGAGGW SGGGGGGGWW REDDPYWPLR DWGDHPMRWW TLAFAAIMAA GGLATSVATG YV EPVQAGL GAGSLLALAG AAMSDARCVP GALGVKLAWA VCALIVLKEV SVGWQHKRKR RLAASAPRLE LTGLAAAALC AGY MLTDMS GLGEVALPPN PGAVFKSPDV AYRASVWQKW GYGQVQMRV

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #10: Fatty acid desaturase domain-containing protein

分子名称: Fatty acid desaturase domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 70.334234 KDa
配列文字列: MNTTRQMAAS TSCSSFTSLV APGTRLRTTV RAPAMQLRNG QRESGAAGTA ASASSSSCWR LAATALGQAQ LHSGARVSCM GGVIRSPAV LLRAGVPTRL PQSAHASPLA AVQPVTSTSG SVGELGAASR RTSSGAACSS SSSGSRSAVC TSGPVRGLGR P LPSAGLRR ...文字列:
MNTTRQMAAS TSCSSFTSLV APGTRLRTTV RAPAMQLRNG QRESGAAGTA ASASSSSCWR LAATALGQAQ LHSGARVSCM GGVIRSPAV LLRAGVPTRL PQSAHASPLA AVQPVTSTSG SVGELGAASR RTSSGAACSS SSSGSRSAVC TSGPVRGLGR P LPSAGLRR RRGASPIAAV GTPAVGSGSG VADSGANGST GSGNGADAAA AATAAAAPSN HHPPGSSNGD NGSSAAASAS TS SATAASA SDPAPEPEPA AASTSLDGLP ETQKYVYADE WGFSRVGADF PPGSHPSLFS QLLPQALFAF DARAAVAAVA VPL AAMAAG YGWLWYMHSI APVWQQALCA ALIGTGYAGL FKVAHECAMM RFIPQMPGLQ AALGTLLMAP ALYSLPSWRL HHLH HLLHT NMLWQDVWGW HPLTKVELAD EMVRSGGSGG AAMAAARLVL TTPIKLFASV GHWLRSWDGL DLRHFHPASY VEVLS GWAA PLAFAGLVLP AVVSAGGLSG FVSCYLAPWL VFHFWLSVLS LTAHTAPHIP WRAEGDGWDA GRAAVAGTVT LRLPRP LEV LLNNANYMLP QAVAPGLPMW SAPAAYAVLA ARLGPYLTEA SMSLKLLTNH VTRWQIYDEE AHTYRPMEEV VDEIEAD LQ QLAAAAQQAQ QQLAAQDQEA RAQQVEGREE GSGGGVPAVA

UniProtKB: Fatty acid desaturase domain-containing protein

+
分子 #11: Moc25

分子名称: Moc25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 29.084951 KDa
配列文字列: MRPCPAVHRR VPPGPVAGHK QLLPLQRSCR GAPLVCRTAA PMAPSWAETR SAAASAPILE PDMLPSTSAP FISPMTPYVP EEEPTRTPP SIKDTGTLRP ASEWYPQWMQ YRRREDNYVF WQDKFMRCST DIPWAEKRWT LFSTVWYLVQ QLRFVGTPPA L RYVAFLGW ...文字列:
MRPCPAVHRR VPPGPVAGHK QLLPLQRSCR GAPLVCRTAA PMAPSWAETR SAAASAPILE PDMLPSTSAP FISPMTPYVP EEEPTRTPP SIKDTGTLRP ASEWYPQWMQ YRRREDNYVF WQDKFMRCST DIPWAEKRWT LFSTVWYLVQ QLRFVGTPPA L RYVAFLGW RALMFQVYAA HKALVLWQCK LDAGLARIGS GGATATFSKT MALRRLHWRN SPLAEALYAL NLYKTGRVHL LP PVAKPIP RPTFFWLF

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #12: Moc29

分子名称: Moc29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 34.185254 KDa
配列文字列: MQSAARGCHA PAGLSSSLLR SRTYVPPCAP SSSGRVVGSR HITARAAGGK GGGKDDKAKE KADFSALWAL RIKNFFSSRR KYLQQAEQV GDDDKEKAFK AEIAKEERSI RELKDELVAI SMEEIEEQEK QGDPRPALAA TDIAQARMDL QTSPLTRAVL A VVRVRELL ...文字列:
MQSAARGCHA PAGLSSSLLR SRTYVPPCAP SSSGRVVGSR HITARAAGGK GGGKDDKAKE KADFSALWAL RIKNFFSSRR KYLQQAEQV GDDDKEKAFK AEIAKEERSI RELKDELVAI SMEEIEEQEK QGDPRPALAA TDIAQARMDL QTSPLTRAVL A VVRVRELL RALLLLPFSA VGGAVAAWQG LFNSQRYENF LMSEGERIWA WRNRSENERW FWEVFAWDRL IFPILVIVAW EY LVPNHLV WAVLAPLALL TWMSGRLPTP ATPEFWMLAY FGFYRKVWPD AAAWLQGYVV PLMGFA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #13: Moc34

分子名称: Moc34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 34.163977 KDa
配列文字列: MVHVPFFGID LPEPRLAAVM PDAVYALVQG THKLGEYAHD LVFPPTPEDL RKLEQQVNAT IPREFDRVRQ RYAEGKIAND EQLSSELED ASFNWYRRQL RTSVVGATDE ELEDVAVRKL RLEPPALQAS LQERALAAAV TAAGGVDLAA EVADAAALAA L AEQEAETR ...文字列:
MVHVPFFGID LPEPRLAAVM PDAVYALVQG THKLGEYAHD LVFPPTPEDL RKLEQQVNAT IPREFDRVRQ RYAEGKIAND EQLSSELED ASFNWYRRQL RTSVVGATDE ELEDVAVRKL RLEPPALQAS LQERALAAAV TAAGGVDLAA EVADAAALAA L AEQEAETR RLLAARQARL ADLRKQLRPA HRQAIGTITN ASAGMLVGVL VVKSVLTLVR RLFRKKRPAG AKAPAGAAAR RQ GSVQSSA AQLQSLAAPA ARQQQQSAAA ALASAQQAAM RPQAGASASA AAAASGKAAA SKEQPKAGAA AAAADAGAKK TRI VKKR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #14: Moc45

分子名称: Moc45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 48.618184 KDa
配列文字列: MQSSIAHRSL AACPVQRNRF VPARCKLASN RIGPKLLSAA IAGTPEQPAT STSTPSSEAG TKDAAVVVGP ALVAKEVVST SGHSDAVPD PNFPELPLST NRAAGTQYLA IGAAYAVAAG AVAVAALQGP QLLLASPAAA DPWSSVLLGC VAATYLRAAG V FLQLKAAS ...文字列:
MQSSIAHRSL AACPVQRNRF VPARCKLASN RIGPKLLSAA IAGTPEQPAT STSTPSSEAG TKDAAVVVGP ALVAKEVVST SGHSDAVPD PNFPELPLST NRAAGTQYLA IGAAYAVAAG AVAVAALQGP QLLLASPAAA DPWSSVLLGC VAATYLRAAG V FLQLKAAS DAAELLCWRH QRLALTAAAY GMVAVLTQAA GLASPQLLGL QLLLSVASAA VVANVARSAW AVRPFVSSLT EG RSPGGVL AAVAGAMTGS VSTVAGLLLT TTIVVSLYGL FAAVFAPAPA LPVAVGAWPG TAAAAAVMDG SAAGLRRLAA GGL LLTAAA SHGLFDFAGS VKQQGPIDVA QAVKKMVVMD MAAPRIRTLK YFLPNPTIYS LLNLGFVAAA VLQSYFLYIA PAWG VNVNW DTALWGPMYG TAFLGLVYGL VALTKFDWSS VVDAVLRVAC WFAELTMWFW DTFVWKFSWS EKTRRA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #15: PcyA1

分子名称: PcyA1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 61.329266 KDa
配列文字列: MMSSIPKSIG AQRSAASTRA HALARPVVLA PAASIPARSQ GVTSTSGRCL APPPRAAAGA GAPGTAGPTN AGAAAHEVEV DAVESPLSP EDIMRLVQQH EDVAAAAESE QLVAQFRDDP QGLYEYVNRA YAEGPRRVTT PISLLQEEIT GAVTESYPAA V ANDIIGMG ...文字列:
MMSSIPKSIG AQRSAASTRA HALARPVVLA PAASIPARSQ GVTSTSGRCL APPPRAAAGA GAPGTAGPTN AGAAAHEVEV DAVESPLSP EDIMRLVQQH EDVAAAAESE QLVAQFRDDP QGLYEYVNRA YAEGPRRVTT PISLLQEEIT GAVTESYPAA V ANDIIGMG SWRLKDDVDP VIEFLVARLE GCWREILDTD LCLYPREKWK EQGWDLVDSM DPHQELEGFS YADIPDPAKG EA GYPRLQL ENRVYCSKVF RKLHVEVGLR QDGLQVLHVV VYPRYSYDMP IFGMDIVMVD GRVTLAVVDC CPVRADLKLQ PHY METMAL LQRTFLEGTD PALRRIPEWG SKIFSPLALC ITPSGPEELA AFAKYAVALH RAYLTMSLNA VPVVAGPGDR REAA RLQEI QDGQKRFCDN QLVNKKTRRV LEVAMGVEWT EAYMSQLMFD FDPKYEPPYF DASFEKLYTY FDENPSFGEM ADEAM ELER GAEAERANET MAAALSGRSV SREKLAMAMG FLFQNDATFR AAVQTLSGGQ VDGNIEERLT DDLMQLLERS E

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #16: ADP-ribosylglycohydrolase

分子名称: ADP-ribosylglycohydrolase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 51.410547 KDa
配列文字列: MRQSVRSPGT RASLQSGRAA SSCLPVTPLC PLVASTTSAP ATSISSSDAL LRSTAVASTS TSSPATVPIA ARRRHQPRSR SVAAATPAA APSPAAAAAP AWRGPGEVGD EDKAVGCLLG AAVGNVLAAP YQGDRHFEVI RLRRNGVTDF WKYDIGAQPV Q YGQYTGDF ...文字列:
MRQSVRSPGT RASLQSGRAA SSCLPVTPLC PLVASTTSAP ATSISSSDAL LRSTAVASTS TSSPATVPIA ARRRHQPRSR SVAAATPAA APSPAAAAAP AWRGPGEVGD EDKAVGCLLG AAVGNVLAAP YQGDRHFEVI RLRRNGVTDF WKYDIGAQPV Q YGQYTGDF ANLLAVATSL SASRGVEPAH LLGALTRAYA EGGSSVEVED ASGGSSSGFL PARRYSPYDR LVMDAVLAGT DP LKVPELA ERYLAETTRR HASSSSDRPD REPHGPSDLG AAARAAPIGL AYRRAGGERL LAAVRRSLEF SHPTPLGLDA AHV VAAAAA WCGRQQPGDA VGATPAALLS HLLNDVAVTA EQCGKLRLLR DNLFQLDEVT DWRAFYAGPQ WARLTALFSR LSFH GLATA GSEFASVVLL ALLSSWGRPE QAVIVAASLG GHAPATAQTV GALAGTLYGQ SWVPERWWRG LGEGVEGEAG REAVV QAGR ALAAVELADG L

UniProtKB: ADP-ribosylhydrolase ARH3

+
分子 #17: Acyl carrier protein

分子名称: Acyl carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 12.519384 KDa
配列文字列:
MALSMIRKSA AAPVRRAAAA PVVVRGRRVI TFAAVDKAKV LEDVRSIIST QLGTELEKVA PEAKFVDLGA D(SEP)LDTV EIM MALEEKFEIA LEEEGAEKIA TVQDAADMIA AQIAAKGN

UniProtKB: Acyl carrier protein

+
分子 #18: Moc13

分子名称: Moc13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 15.265472 KDa
配列文字列:
MGGELAERKA SSASAGPRVV QMRREAIPAE LLLVKEDPSK LPAGVLQTRE QLKQAQRDIN WAGKREQVFA AVAAGWHLAS FALNLAFWG VEGMPPDRYW PTSPRIRLQI RPGRYGNMDG GQRVYMDYLA RSEGVPLN

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #19: Moc31

分子名称: Moc31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 31.085385 KDa
配列文字列: MASTARRKPV PEAMSEDSVE QEFGGDYSEA SLEYIRALGP KKGAPFAEVD PAEQAAALPP SQAECEAAKA VLENYKRDID ALKTYRPSE QERAAIDARR ALALEATPEE LTWLKMREYY ATQRAAAADG AASTSAPGAG DAASAAADND VAALRAEMLR V AMEALGSA ...文字列:
MASTARRKPV PEAMSEDSVE QEFGGDYSEA SLEYIRALGP KKGAPFAEVD PAEQAAALPP SQAECEAAKA VLENYKRDID ALKTYRPSE QERAAIDARR ALALEATPEE LTWLKMREYY ATQRAAAADG AASTSAPGAG DAASAAADND VAALRAEMLR V AMEALGSA TETEELEARA RSHLAASSAG RQWSRGVAGG AGAAASGEAS AAVLAAAADA AVASVMVGTG ARYRDDYLEE ER LTRQVAK QRGQRSQAFA LSLAAAVGVS VARWWLRRGR GGAGAGGGSG GPSRSRSTQQ MQ

+
分子 #20: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 20 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #21: DIACYL GLYCEROL

分子名称: DIACYL GLYCEROL / タイプ: ligand / ID: 21 / コピー数: 1 / 式: DGA
分子量理論値: 625.018 Da
Chemical component information

ChemComp-DGA:
DIACYL GLYCEROL

+
分子 #22: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

分子名称: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) / タイプ: ligand / ID: 22 / コピー数: 2 / 式: DGD
分子量理論値: 949.299 Da
Chemical component information

ChemComp-DGD:
DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

+
分子 #23: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

分子名称: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE / タイプ: ligand / ID: 23 / コピー数: 2 / 式: LMG
分子量理論値: 787.158 Da
Chemical component information

ChemComp-LMG:
1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

+
分子 #24: ARACHIDONIC ACID

分子名称: ARACHIDONIC ACID / タイプ: ligand / ID: 24 / コピー数: 1 / 式: ACD
分子量理論値: 304.467 Da
Chemical component information

ChemComp-ACD:
ARACHIDONIC ACID

+
分子 #25: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL

分子名称: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
タイプ: ligand / ID: 25 / コピー数: 1 / 式: SQD
分子量理論値: 795.116 Da
Chemical component information

ChemComp-SQD:
1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度1.2 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: GOLD / メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: DIFFRACTION / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.2 µm
試料ステージホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 127613
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

-
原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: BACKBONE TRACE
得られたモデル

PDB-8xks:
The cryo-EM structure of Orf2971-FtsHi motor complex

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る