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万見
- EMDB-36475: cryo-EM structure of NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2 -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-36475
タイトルcryo-EM structure of NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2
マップデータ
試料
  • 複合体: NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2
    • タンパク質・ペプチド: NTS(8-13)
    • タンパク質・ペプチド: Neurotensin receptor type 1
    • タンパク質・ペプチド: Beta-adrenergic receptor kinase 1
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha
  • リガンド: 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol
  • リガンド: STAUROSPORINE
  • リガンド: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: TETRAFLUOROALUMINATE ION
キーワードBiased signaling / SIGNALING PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


Calmodulin induced events / negative regulation of the force of heart contraction by chemical signal / negative regulation of relaxation of smooth muscle / beta-adrenergic-receptor kinase / Activation of SMO / beta-adrenergic receptor kinase activity / G protein-coupled neurotensin receptor activity / G protein-coupled receptor kinase activity / Edg-2 lysophosphatidic acid receptor binding / alpha-2A adrenergic receptor binding ...Calmodulin induced events / negative regulation of the force of heart contraction by chemical signal / negative regulation of relaxation of smooth muscle / beta-adrenergic-receptor kinase / Activation of SMO / beta-adrenergic receptor kinase activity / G protein-coupled neurotensin receptor activity / G protein-coupled receptor kinase activity / Edg-2 lysophosphatidic acid receptor binding / alpha-2A adrenergic receptor binding / inositol phosphate catabolic process / tachykinin receptor signaling pathway / symmetric synapse / Fatty Acids bound to GPR40 (FFAR1) regulate insulin secretion / Acetylcholine regulates insulin secretion / phospholipase C-activating G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway / negative regulation of striated muscle contraction / D-aspartate import across plasma membrane / positive regulation of gamma-aminobutyric acid secretion / positive regulation of protein localization to cilium / Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis / phospholipase C-activating serotonin receptor signaling pathway / PLC beta mediated events / desensitization of G protein-coupled receptor signaling pathway / regulation of membrane depolarization / cytoplasmic side of mitochondrial outer membrane / entrainment of circadian clock / regulation of platelet activation / positive regulation of arachidonate secretion / regulation of the force of heart contraction / L-glutamate import across plasma membrane / regulation of respiratory gaseous exchange / positive regulation of inhibitory postsynaptic potential / positive regulation of smoothened signaling pathway / G protein-coupled receptor internalization / negative regulation of systemic arterial blood pressure / positive regulation of glutamate secretion / negative regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol / regulation of canonical Wnt signaling pathway / G alpha (s) signalling events / glutamate receptor signaling pathway / G alpha (q) signalling events / positive regulation of inositol phosphate biosynthetic process / response to lipid / temperature homeostasis / detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain / phototransduction, visible light / postsynaptic cytosol / photoreceptor outer segment / neuropeptide signaling pathway / regulation of signal transduction / cardiac muscle contraction / enzyme regulator activity / response to prostaglandin E / GTPase activator activity / viral genome replication / positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol / dendritic shaft / Peptide ligand-binding receptors / adult locomotory behavior / learning / Turbulent (oscillatory, disturbed) flow shear stress activates signaling by PIEZO1 and integrins in endothelial cells / negative regulation of protein kinase activity / cell projection / intracellular protein transport / G protein-coupled receptor binding / terminal bouton / G protein-coupled receptor activity / G-protein beta/gamma-subunit complex binding / cytoplasmic side of plasma membrane / Thromboxane signalling through TP receptor / G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway / adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / G-protein activation / blood coagulation / ADP signalling through P2Y purinoceptor 1 / Cooperation of PDCL (PhLP1) and TRiC/CCT in G-protein beta folding / heterotrimeric G-protein complex / presynapse / Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs) / peptidyl-serine phosphorylation / G protein activity / heart development / High laminar flow shear stress activates signaling by PIEZO1 and PECAM1:CDH5:KDR in endothelial cells / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / chemical synaptic transmission / nuclear membrane / G alpha (q) signalling events / dendritic spine / perikaryon / postsynapse / protein kinase activity / protein stabilization / protein phosphorylation / G protein-coupled receptor signaling pathway / positive regulation of apoptotic process / membrane raft / symbiont entry into host cell / lysosomal membrane
類似検索 - 分子機能
Neurotensin receptor / Neurotensin type 1 receptor / GPCR kinase / G-protein alpha subunit, group Q / Regulator of G protein signaling domain / RGS domain / RGS domain profile. / Regulator of G protein signalling domain / RGS, subdomain 2 / RGS domain superfamily ...Neurotensin receptor / Neurotensin type 1 receptor / GPCR kinase / G-protein alpha subunit, group Q / Regulator of G protein signaling domain / RGS domain / RGS domain profile. / Regulator of G protein signalling domain / RGS, subdomain 2 / RGS domain superfamily / Extension to Ser/Thr-type protein kinases / AGC-kinase, C-terminal / AGC-kinase C-terminal domain profile. / PH domain / PH domain profile. / Pleckstrin homology domain. / Pleckstrin homology domain / Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit / G protein alpha subunit, helical insertion / G-protein alpha subunit / G-alpha domain profile. / G protein alpha subunit / G-protein coupled receptors family 1 signature. / G protein-coupled receptor, rhodopsin-like / GPCR, rhodopsin-like, 7TM / G-protein coupled receptors family 1 profile. / 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) / PH-like domain superfamily / Serine/threonine-protein kinase, active site / Serine/Threonine protein kinases active-site signature. / Protein kinase domain / Serine/Threonine protein kinases, catalytic domain / Protein kinase, ATP binding site / Protein kinases ATP-binding region signature. / Protein kinase domain profile. / Protein kinase domain / Protein kinase-like domain superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
類似検索 - ドメイン・相同性
Beta-adrenergic receptor kinase 1 / Neurotensin receptor type 1 / Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / synthetic construct (人工物) / Bos taurus (ウシ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.07 Å
データ登録者Duan J / Liu H / Zhao F / Yuan Q / Ji Y / Xu HE
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number国
National Natural Science Foundation of China (NSFC) 中国
引用ジャーナル: Nature / 年: 2023
タイトル: GPCR activation and GRK2 assembly by a biased intracellular agonist.
著者: Jia Duan / Heng Liu / Fenghui Zhao / Qingning Yuan / Yujie Ji / Xiaoqing Cai / Xinheng He / Xinzhu Li / Junrui Li / Kai Wu / Tianyu Gao / Shengnan Zhu / Shi Lin / Ming-Wei Wang / Xi Cheng / ...著者: Jia Duan / Heng Liu / Fenghui Zhao / Qingning Yuan / Yujie Ji / Xiaoqing Cai / Xinheng He / Xinzhu Li / Junrui Li / Kai Wu / Tianyu Gao / Shengnan Zhu / Shi Lin / Ming-Wei Wang / Xi Cheng / Wanchao Yin / Yi Jiang / Dehua Yang / H Eric Xu /
要旨: Phosphorylation of G-protein-coupled receptors (GPCRs) by GPCR kinases (GRKs) desensitizes G-protein signalling and promotes arrestin signalling, which is also modulated by biased ligands. The ...Phosphorylation of G-protein-coupled receptors (GPCRs) by GPCR kinases (GRKs) desensitizes G-protein signalling and promotes arrestin signalling, which is also modulated by biased ligands. The molecular assembly of GRKs on GPCRs and the basis of GRK-mediated biased signalling remain largely unknown owing to the weak GPCR-GRK interactions. Here we report the complex structure of neurotensin receptor 1 (NTSR1) bound to GRK2, Gα and the arrestin-biased ligand SBI-553. The density map reveals the arrangement of the intact GRK2 with the receptor, with the N-terminal helix of GRK2 docking into the open cytoplasmic pocket formed by the outward movement of the receptor transmembrane helix 6, analogous to the binding of the G protein to the receptor. SBI-553 binds at the interface between GRK2 and NTSR1 to enhance GRK2 binding. The binding mode of SBI-553 is compatible with arrestin binding but clashes with the binding of Gα protein, thus providing a mechanism for its arrestin-biased signalling capability. In sum, our structure provides a rational model for understanding the details of GPCR-GRK interactions and GRK2-mediated biased signalling.
履歴
登録2023年6月11日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年8月9日-
マップ公開2023年8月9日-
更新2024年11月6日-
現状2024年11月6日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_36475.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_36475.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.82 Å/pix.
x 320 pix.
= 263.68 Å		0.82 Å/pix.
x 320 pix.
= 263.68 Å		0.82 Å/pix.
x 320 pix.
= 263.68 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.824 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.3
最小 - 最大-1.8564255 - 2.712978
平均 (標準偏差)0.0026337244 (±0.05564686)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ320320320
Spacing320320320
セルA=B=C: 263.68 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_36475_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_36475_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #2

ファイルemd_36475_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2

全体名称: NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2
要素
  • 複合体: NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2
    • タンパク質・ペプチド: NTS(8-13)
    • タンパク質・ペプチド: Neurotensin receptor type 1
    • タンパク質・ペプチド: Beta-adrenergic receptor kinase 1
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha
  • リガンド: 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol
  • リガンド: STAUROSPORINE
  • リガンド: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: TETRAFLUOROALUMINATE ION

+
超分子 #1: NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2

超分子名称: NTSR1-GRK2-Galpha(q) complexes 2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#4
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
分子 #1: NTS(8-13)

分子名称: NTS(8-13) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: synthetic construct (人工物)
分子量理論値: 819.007 Da
配列文字列:
RRPYIL

+
分子 #2: Neurotensin receptor type 1

分子名称: Neurotensin receptor type 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 46.307594 KDa
組換発現生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
配列文字列: MRLNSSAPGT PGTPAADPFQ RAQAGLEEAL LAPGFGNASG NASERVLAAP SSELDVNTDI YSKVLVTAVY LALFVVGTVG NTVTAFTLA RKKSLQSLQS TVHYHLGSLA LSDLLTLLLA MPVELYNFIW VHHPWAFGDA GCRGYYFLRD ACTYATALNV A SLSVERYL ...文字列:
MRLNSSAPGT PGTPAADPFQ RAQAGLEEAL LAPGFGNASG NASERVLAAP SSELDVNTDI YSKVLVTAVY LALFVVGTVG NTVTAFTLA RKKSLQSLQS TVHYHLGSLA LSDLLTLLLA MPVELYNFIW VHHPWAFGDA GCRGYYFLRD ACTYATALNV A SLSVERYL AICHPFKAKT LMSRSRTKKF ISAIWLASAL LAVPMLFTMG EQNRSADGQH AGGLVCTPTI HTATVKVVIQ VN TFMSFIF PMVVISVLNT IIANKLTVMV RQAAEQGQVC TVGGEHSTFS MAIEPGRVQA LRHGVRVLRA VVIAFVVCWL PYH VRRLMF CYISDEQWTP FLYDFYHYFY MVTNALFYVS STINPILYNL VSANFRHIFL ATLACLCPVW RRRRKRPAFS RKAD SVSSN HTLSSNATRE TLY

UniProtKB: Neurotensin receptor type 1

+
分子 #3: Beta-adrenergic receptor kinase 1

分子名称: Beta-adrenergic receptor kinase 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: beta-adrenergic-receptor kinase
由来(天然)生物種: Bos taurus (ウシ)
分子量理論値: 79.644727 KDa
組換発現生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
配列文字列: ADLEAVLADV SYLMAMEKSK ATPAARASKK ILLPEPSIRS VMQKYLEDRG EVTFEKIFSQ KLGYLLFRDF CLKHLEEAKP LVEFYEEIK KYEKLETEEE RLVCSREIFD TYIMKELLAC SHPFSKSAIE HVQGHLVKKQ VPPDLFQPYI EEICQNLRGD V FQKFIESD ...文字列:
ADLEAVLADV SYLMAMEKSK ATPAARASKK ILLPEPSIRS VMQKYLEDRG EVTFEKIFSQ KLGYLLFRDF CLKHLEEAKP LVEFYEEIK KYEKLETEEE RLVCSREIFD TYIMKELLAC SHPFSKSAIE HVQGHLVKKQ VPPDLFQPYI EEICQNLRGD V FQKFIESD KFTRFCQWKN VELNIHLTMN DFSVHRIIGR GGFGEVYGCR KADTGKMYAM KCLDKKRIKM KQGETLALNE RI MLSLVST GDCPFIVCMS YAFHTPDKLS FILDLMNGGD LHYHLSQHGV FSEPDMIFYA AEIILGLEHM HNRFVVYRDL KPA NILLDE HGHVRISDLG LACDFSKKKP HASVGTHGYM APEVLQKGVA YDSSADWFSL GCMLFKLLRG HSPFRQHKTK DKHE IDRMT LTMAVELPDS FSPELRSLLE GLLQRDVNRR LGCLGRGAQE VKESPFFRDL DWQMVFLQKY PPPLIPPRGE VNAAD AFDI GSFDEEDTKG IKLLDSDQEL YRNFPLTISE RWQQEVAETV FDTINAETDR LEARKKTKNK QLGHEEDYAL GKDCIM HGY MSKMGNPFLT QWQRRYFYLF PNRLEWRGEG EAPQSLLTME EIQSVEETQI KERKCLLLKI RGGKQFVLQC DSDPELV QW KKELRDAYRE AQQLVQRVPK MKNKPRSPVV ELSKVPLIQR GSANGL

UniProtKB: Beta-adrenergic receptor kinase 1

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分子 #4: Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 41.282895 KDa
組換発現生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
配列文字列: MGCTLSAEDK AAVERSKMID RNLREDGERS RRELKLLLLG TGESGKSTFI KQMRIIHGSG YSDEDKRGFT KLVYQNIFTA MQAMIRAMD TLKIPYKYEH NKAHAQLVRE VDVEKVSAFE NPYVDAIKSL WNDPGIQECY DRRREYQLSD STKYYLNDLD R VADPAYLP ...文字列:
MGCTLSAEDK AAVERSKMID RNLREDGERS RRELKLLLLG TGESGKSTFI KQMRIIHGSG YSDEDKRGFT KLVYQNIFTA MQAMIRAMD TLKIPYKYEH NKAHAQLVRE VDVEKVSAFE NPYVDAIKSL WNDPGIQECY DRRREYQLSD STKYYLNDLD R VADPAYLP TQQDVLRVRV PTTGIIEYPF DLQSVIFRMV DVGGQRSERR KWIHCFENVT SIMFLVALSE YDQVLVESDN EN RMEESKA LFRTIITYPW FQNSSVILFL NKKDLLEEKI MYSHLVDYFP EYDGPQRDAQ AAREFILKMF VDLNPDSDKI IYS HFTCAT DTENIRFVFA AVKDTILQLN LKEYNLV

UniProtKB: Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha

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分子 #5: 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]...

分子名称: 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol
タイプ: ligand / ID: 5 / コピー数: 1 / 式: SRW
分子量理論値: 450.548 Da
Chemical component information

ChemComp-SRW:
2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol

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分子 #6: STAUROSPORINE

分子名称: STAUROSPORINE / タイプ: ligand / ID: 6 / コピー数: 1 / 式: STU
分子量理論値: 466.531 Da
Chemical component information

ChemComp-STO:
STAUROSPORINE / 抗がん剤, 抗真菌剤, 抗生剤, alkaloid*YM

+
分子 #7: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 7 / コピー数: 1 / 式: GDP
分子量理論値: 443.201 Da
Chemical component information

ChemComp-GDP:
GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / GDP, エネルギー貯蔵分子*YM

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分子 #8: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 8 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #9: TETRAFLUOROALUMINATE ION

分子名称: TETRAFLUOROALUMINATE ION / タイプ: ligand / ID: 9 / コピー数: 1 / 式: ALF
分子量理論値: 102.975 Da
Chemical component information

ChemComp-ALF:
TETRAFLUOROALUMINATE ION / テトラフルオロアルミナ-ト

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: DARK FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.2 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.2 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.07 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 233943
初期 角度割当タイプ: RANDOM ASSIGNMENT
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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