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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | A CBg-ParM filament with GTP or GDPPi | ||||||||||||
![]() | Alp20 with GTP or GDPPi | ||||||||||||
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![]() | ParM actin-like plasmid segregation / CELL CYCLE | ||||||||||||
機能・相同性 | : ![]() | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 6.5 Å | ||||||||||||
![]() | Koh A / Ali S / Robinson R / Narita A | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: A new actin-like filament from Clostridium botulinum exhibits a new system of filament turn over 著者: Koh A / Ali S / Popp D / Tanaka K / Kitaoku Y / Miyazaki N / Iwasaki K / Mitsuoka K / Robert R / Narita A | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 9 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 11.6 KB 11.6 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 13.7 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 40.1 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.4 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 442.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 441.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 16.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Alp20 with GTP or GDPPi | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.87 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : CBg-ParM filament with GTP or GDPPi
全体 | 名称: CBg-ParM filament with GTP or GDPPi |
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要素 |
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-超分子 #1: CBg-ParM filament with GTP or GDPPi
超分子 | 名称: CBg-ParM filament with GTP or GDPPi / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: ParM/StbA family protein
分子 | 名称: ParM/StbA family protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 32.545352 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MKITVVDLGN INVKYVGENK GRFSSKITND YQSYEEGFQR VEYNGIKTYI GVGELSREFN KADRDYMAQL LYSLAKANTA DTKEINLTL LLPIIQMKNK TRLIETLKGE NFKFKFNGID REIKINDLMV LPEGYASYYS LDIENKKGDV CILDLGSRTI N ICVLENAK ...文字列: MKITVVDLGN INVKYVGENK GRFSSKITND YQSYEEGFQR VEYNGIKTYI GVGELSREFN KADRDYMAQL LYSLAKANTA DTKEINLTL LLPIIQMKNK TRLIETLKGE NFKFKFNGID REIKINDLMV LPEGYASYYS LDIENKKGDV CILDLGSRTI N ICVLENAK IVKTNTIKLG SFDFYSKIKS LENAKGEDYI EEDIQRLIDN GLIKVDSKQY IEFLSDILNA VKPYVNLKTY NT IFTGGTS LMLKEYIEKL PLNKFKVHPN ALTSNVDGAM EASKKVWN UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6B3ZKE5 |
-分子 #2: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子 | 名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 2 / コピー数: 5 / 式: GTP |
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分子量 | 理論値: 523.18 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-GTP: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | らせん対称体再構成法 |
試料の集合状態 | filament |
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試料調製
濃度 | 0.7 mg/mL | ||||||||||||
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緩衝液 | pH: 7.5 構成要素:
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 90 % / チャンバー内温度: 298 K / 装置: LEICA EM GP |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k) 平均電子線量: 45.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |