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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-30868 | |||||||||
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タイトル | liver ribosome | |||||||||
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生物種 | Ribosome display vector pRDV (その他) | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 18.0 Å | |||||||||
![]() | Zhang JG / Zhang DY / Sun L / Ji G / Huang XJ / Niu TX / Xu JS / Ma CY / Zhu Y / Gao N ...Zhang JG / Zhang DY / Sun L / Ji G / Huang XJ / Niu TX / Xu JS / Ma CY / Zhu Y / Gao N / Xu W / Sun F | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: VHUT-cryo-FIB, a method to fabricate frozen hydrated lamellae from tissue specimens for in situ cryo-electron tomography 著者: Zhang J / Zhang D / Sun L / Ji G / Huang X / Niu T / Xu J / Ma C / Zhu Y / Gao N / Xu W / Sun F | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 4.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 7.5 KB 7.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 237.7 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 326.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 326.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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電子顕微鏡画像生データ | ![]() Data size: 112.1 Data #1: ungaligned multi-frame micrographs of ribosome [micrographs - multiframe]) |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.7 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : liver ribosome
全体 | 名称: liver ribosome |
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要素 |
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-超分子 #1: liver ribosome
超分子 | 名称: liver ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: Ribosome display vector pRDV (その他) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | tissue |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: OTHER |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 3.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
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画像解析
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 18.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用したサブトモグラム数: 13 |
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抽出 | トモグラム数: 13 / 使用した粒子像数: 13 |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |