ジャーナル: Science / 年: 2014 タイトル: Marine tubeworm metamorphosis induced by arrays of bacterial phage tail-like structures. 著者: Nicholas J Shikuma / Martin Pilhofer / Gregor L Weiss / Michael G Hadfield / Grant J Jensen / Dianne K Newman / 要旨: Many benthic marine animal populations are established and maintained by free-swimming larvae that recognize cues from surface-bound bacteria to settle and metamorphose. Larvae of the tubeworm ...Many benthic marine animal populations are established and maintained by free-swimming larvae that recognize cues from surface-bound bacteria to settle and metamorphose. Larvae of the tubeworm Hydroides elegans, an important biofouling agent, require contact with surface-bound bacteria to undergo metamorphosis; however, the mechanisms that underpin this microbially mediated developmental transition have been enigmatic. Here, we show that a marine bacterium, Pseudoalteromonas luteoviolacea, produces arrays of phage tail-like structures that trigger metamorphosis of H. elegans. These arrays comprise about 100 contractile structures with outward-facing baseplates, linked by tail fibers and a dynamic hexagonal net. Not only do these arrays suggest a novel form of bacterium-animal interaction, they provide an entry point to understanding how marine biofilms can trigger animal development.
ダウンロード / ファイル: emd_2543.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈
Subtomogram average of an extended contractile structure in a MAC array
ボクセルのサイズ
X=Y=Z: 16.8 Å
密度
表面レベル
登録者による: 114.0 / ムービー #1: 114
最小 - 最大
57.931991580000002 - 176.02999878
平均 (標準偏差)
98.893997189999993 (±8.88727379)
対称性
空間群: 1
詳細
EMDB XML:
マップ形状
Axis order
X
Y
Z
Origin
0
0
0
サイズ
65
65
65
Spacing
65
65
65
セル
A=B=C: 1092.0 Å α=β=γ: 90.0 °
CCP4マップ ヘッダ情報:
mode
Image stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z
16.8
16.8
16.8
M x/y/z
65
65
65
origin x/y/z
0.000
0.000
0.000
length x/y/z
1092.000
1092.000
1092.000
α/β/γ
90.000
90.000
90.000
start NX/NY/NZ
-207
-207
-206
NX/NY/NZ
414
414
414
MAP C/R/S
1
2
3
start NC/NR/NS
0
0
0
NC/NR/NS
65
65
65
D min/max/mean
57.932
176.030
98.894
-
添付データ
-
試料の構成要素
-
全体 : Culture of Pseudoalteromonas violacea cells
全体
名称: Culture of Pseudoalteromonas violacea cells
要素
試料: Culture of Pseudoalteromonas violacea cells
細胞器官・細胞要素: Extended contractile structure in a MAC array
-
超分子 #1000: Culture of Pseudoalteromonas violacea cells
超分子
名称: Culture of Pseudoalteromonas violacea cells / タイプ: sample / ID: 1000 / Number unique components: 1
-
超分子 #1: Extended contractile structure in a MAC array
超分子
名称: Extended contractile structure in a MAC array / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 集合状態: Structure is part of a MAC array / 組換発現: No / データベース: NCBI
由来(天然)
生物種: Pseudoalteromonas luteoviolacea (バクテリア) Organelle: MAC array / 細胞中の位置: cytoplasmic and extracellular
-
実験情報
-
構造解析
手法
クライオ電子顕微鏡法
解析
サブトモグラム平均法
試料の集合状態
cell
-
試料調製
グリッド
詳細: Quantifoil
凍結
凍結剤: ETHANE-PROPANE MIXTURE / チャンバー内湿度: 100 % / 装置: FEI VITROBOT MARK III
-
電子顕微鏡法
顕微鏡
FEI POLARA 300
特殊光学系
エネルギーフィルター - 名称: GIF
日付
2013年7月12日
撮影
カテゴリ: CCD / フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 (4k x 4k)
電子線
加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系
照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
試料ステージ
試料ホルダーモデル: OTHER
実験機器
モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company
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画像解析
詳細
PEET
最終 再構成
アルゴリズム: OTHER / ソフトウェア - 名称: ETOMO / 使用したサブトモグラム数: 20