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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||||||||
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タイトル | in situ cryo-electron tomogram of tgl3,4,5-ko yeast lipid droplet after 4-hour exposure to acute glucose restriction (AGR, 0.001% glucose media) | |||||||||||||||
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生物種 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||||||||
![]() | Rogers S / Gui L / Kovalenko A / Reetz E / Nicastro D / Henne WM | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Liquid-crystalline lipid phase transitions in lipid droplets selectively remodel the LD proteome 著者: Rogers S / Gui L / Kovalenko A / Reetz E / Nicastro D / Henne WM | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 126.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 8.3 KB 8.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 159.9 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 545.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 544.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 5.684 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : lipid droplet of tgl3,4,5 yeast after 4-hour exposure to acute gl...
全体 | 名称: lipid droplet of tgl3,4,5 yeast after 4-hour exposure to acute glucose restriction (AGR, 0.001% glucose media) |
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要素 |
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-超分子 #1: lipid droplet of tgl3,4,5 yeast after 4-hour exposure to acute gl...
超分子 | 名称: lipid droplet of tgl3,4,5 yeast after 4-hour exposure to acute glucose restriction (AGR, 0.001% glucose media) タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
切片作成 | 集束イオンビーム - 装置: OTHER / 集束イオンビーム - イオン: OTHER / 集束イオンビーム - 電圧: 30 kV / 集束イオンビーム - 電流: 0.01 nA / 集束イオンビーム - 時間: 600 sec. / 集束イオンビーム - 温度: 88 K / 集束イオンビーム - Initial thickness: 1000 nm / 集束イオンビーム - 最終 厚さ: 150 nm 集束イオンビーム - 詳細: The value given for _emd_sectioning_focused_ion_beam.instrument is FEI Aquilos. This is not in a list of allowed values {'DB235', 'OTHER'} so OTHER is written into the XML file. |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 1.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 57 |
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