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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-20604 | ||||||||||||
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タイトル | BRCA1-BARD1 p53 complex | ||||||||||||
マップデータ | BRCA1-BARD1 p53 complex | ||||||||||||
試料 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 10.8 Å | ||||||||||||
データ登録者 | Kelly DF / Varano AC | ||||||||||||
資金援助 | 米国, 3件
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引用 | ジャーナル: Microsc Microanal / 年: 2018 タイトル: Cryo-EM Reveals a Unique BRCA1 Complex in Metastasis 著者: Varano AC / Alden N / Dearnaley W / Kelly DF | ||||||||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | EMマップ: SurfViewMolmilJmol/JSmol |
添付画像 |
-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_20604.map.gz | 666.3 KB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-20604-v30.xml emd-20604.xml | 7.9 KB 7.9 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
画像 | emd_20604.png | 67.5 KB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-20604 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-20604 | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | emd_20604_validation.pdf.gz | 283.5 KB | 表示 | EMDB検証レポート |
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文書・詳細版 | emd_20604_full_validation.pdf.gz | 283.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | emd_20604_validation.xml.gz | 4.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | emd_20604_validation.cif.gz | 5.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-20604 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-20604 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_20604.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 3.8 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | BRCA1-BARD1 p53 complex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 3.5 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-試料の構成要素
-全体 : BRCA1-BARD1 p53 monomer
全体 | 名称: BRCA1-BARD1 p53 monomer |
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要素 |
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-超分子 #1: BRCA1-BARD1 p53 monomer
超分子 | 名称: BRCA1-BARD1 p53 monomer / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7.2 |
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グリッド | 詳細: unspecified |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TECNAI SPIRIT |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI EAGLE (2k x 2k) / 平均電子線量: 5.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 120 kV / 電子線源: LAB6 |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | モデル: Tecnai Spirit / 画像提供: FEI Company |