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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Conformation 1 peripheral arm) | |||||||||
![]() | Focused map | |||||||||
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![]() | Plant / Mitochondria / Complex / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.34 Å | |||||||||
![]() | Klusch N / Kuehlbrandt W | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM structure of the respiratory I + III2 supercomplex from Arabidopsis thaliana at 2 A resolution 著者: Klusch N / Dreimann M / Senkler J / Rugen N / Kuehlbrandt W / Braun HP | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 80.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.6 KB 13.6 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 26.5 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 149.5 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 1.3 GB 1.3 GB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 884.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 883.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 33.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 45.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | Focused map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.573 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: Focused half map
ファイル | emd_16158_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Focused half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Focused half map
ファイル | emd_16158_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Focused half map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Conformat...
全体 | 名称: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Conformation 1 peripheral arm). |
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要素 |
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-超分子 #1: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Conformat...
超分子 | 名称: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Conformation 1 peripheral arm). タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 0.18 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 7.4 |
グリッド | モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 400 / 支持フィルム - #0 - Film type ID: 1 / 支持フィルム - #0 - 材質: CARBON / 支持フィルム - #0 - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - #1 - Film type ID: 2 / 支持フィルム - #1 - 材質: GRAPHENE / 支持フィルム - #1 - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 15 sec. |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 70 % / チャンバー内温度: 283.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm / 倍率(公称値): 215000 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |