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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | 180 A SynPspA rod after incubation with ATP | |||||||||
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![]() | Nucleotide binding / Helical assembly / ESCRT-III fold / Membrane remodeling / LIPID BINDING PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | PspA/IM30 / PspA/IM30 family / Chloroplast membrane-associated 30 kD protein![]() | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.1 Å | |||||||||
![]() | Junglas B / Hudina E / Schoennenbeck P / Ritter I / Santiago-Schuebel B / Huesgen P / Sachse C | |||||||||
資金援助 | European Union, 1件
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![]() | ![]() タイトル: Non-canonical ATPase activity drives PspA membrane constriction 著者: Junglas B / Hudina E / Schoennenbeck P / Ritter I / Santiago-Schuebel B / Huesgen P / Sachse C | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 7.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 16.1 KB 16.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 13.2 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 60 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 244.1 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 5.6 KB | ||
その他 | ![]() ![]() ![]() | 8.5 MB 226.3 MB 226.3 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8akqMC ![]() 8akrC ![]() 8aksC ![]() 8aktC ![]() 8akuC ![]() 8akvC ![]() 8akwC ![]() 8akxC ![]() 8akyC ![]() 8akzC ![]() 8al0C M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.362 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Locally filterd map
ファイル | emd_15489_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Locally filterd map | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_15489_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_15489_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Helical assembly of SynPspA after incubation with ATP
全体 | 名称: Helical assembly of SynPspA after incubation with ATP |
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要素 |
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-超分子 #1: Helical assembly of SynPspA after incubation with ATP
超分子 | 名称: Helical assembly of SynPspA after incubation with ATP タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 88.0 kDa/nm |
-分子 #1: Chloroplast membrane-associated 30 kD protein
分子 | 名称: Chloroplast membrane-associated 30 kD protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 60 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 28.097758 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MGSSHHHHHH SSSAALEVLF QGPMELFNRV GRVLKSQLTH WQQQQEAPED LLERLLGEME LELIELRRAL AQTIATFKST ERQRDAQQL IAQRWYEKAQ AALDRGNEQL AREALGQRQS YQSHTEALGK SLGEQRALVE QVRGQLQKLE RKYLELKSQK N LYLARLKS ...文字列: MGSSHHHHHH SSSAALEVLF QGPMELFNRV GRVLKSQLTH WQQQQEAPED LLERLLGEME LELIELRRAL AQTIATFKST ERQRDAQQL IAQRWYEKAQ AALDRGNEQL AREALGQRQS YQSHTEALGK SLGEQRALVE QVRGQLQKLE RKYLELKSQK N LYLARLKS AIAAQKIEEI AGNLDNASAS SLFERIETKI LELEAERELL NPPPSPLDKK FEQWEEQQAV EATLAAMKAR RS LPPPSS UniProtKB: Chloroplast membrane-associated 30 kD protein |
-分子 #2: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子 | 名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 2 / コピー数: 60 / 式: ADP |
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分子量 | 理論値: 427.201 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-ADP: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | らせん対称体再構成法 |
試料の集合状態 | helical array |
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試料調製
濃度 | 7 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 8 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TALOS ARCTICA |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 58.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 4.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company |