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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-15338 | |||||||||
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タイトル | Complex III2 from Yarrowia lipolytica, oxidised with ferricyanide, Rieske domains in the int-position | |||||||||
マップデータ | ||||||||||
試料 |
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キーワード | oxidoreductase (酸化還元酵素) / electron transport chain (電子伝達系) / MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) | |||||||||
生物種 | Yarrowia lipolytica (酵母) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å | |||||||||
データ登録者 | Wieferig J / Kuehlbrandt W | |||||||||
資金援助 | ドイツ, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Complex III2 from Yarrowia lipolytica, oxidised with ferricyanide, Rieske domains in the int-position 著者: Wieferig J / Kuehlbrandt W | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_15338.map.gz | 166.7 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-15338-v30.xml emd-15338.xml | 13.5 KB 13.5 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_15338_fsc.xml | 12.8 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_15338.png | 67.5 KB | ||
その他 | emd_15338_half_map_1.map.gz emd_15338_half_map_2.map.gz | 139.4 MB 139 MB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-15338 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-15338 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ |
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-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_15338.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 178 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.837 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_15338_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_15338_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-試料の構成要素
-全体 : Complex III2, oxidised with ferricyanide, symmetric dimer with bo...
全体 | 名称: Complex III2, oxidised with ferricyanide, symmetric dimer with both Rieske domains in int-position |
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要素 |
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-超分子 #1: Complex III2, oxidised with ferricyanide, symmetric dimer with bo...
超分子 | 名称: Complex III2, oxidised with ferricyanide, symmetric dimer with both Rieske domains in int-position タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#10 |
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由来(天然) | 生物種: Yarrowia lipolytica (酵母) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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グリッド | モデル: UltrAuFoil R1.2/1.3 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm |
試料ステージ | ホルダー冷却材: NITROGEN |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 55.0 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |