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- EMDB-13595: Helical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited Do... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-13595
タイトルHelical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited Domains) filaments.
マップデータHelical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited Domains) filaments.
試料
  • 複合体: TORC1 Organized in Inhibited Domains (TOROID)
    • タンパク質・ペプチド: Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1
    • タンパク質・ペプチド: Serine/threonine-protein kinase TOR2
    • タンパク質・ペプチド: Target of rapamycin complex subunit LST8
生物種Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
手法らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 9.1 Å
データ登録者Felix J / Prouteau M / Bourgoint C / Bonnadei L / Desfosses A / Gabus C / Sadian Y / Savvides SN / Gutsche I / Loewith R
資金援助 スイス, フランス, 4件
OrganizationGrant number国
European Research Council (ERC)834394 スイス
Swiss National Science Foundation179517 スイス
H2020 Marie Curie Actions of the European Commission789385 フランス
European Research Council (ERC)64778 フランス
引用ジャーナル: Nat Struct Mol Biol / 年: 2023
タイトル: EGOC inhibits TOROID polymerization by structurally activating TORC1.
著者: Manoël Prouteau / Clélia Bourgoint / Jan Felix / Lenny Bonadei / Yashar Sadian / Caroline Gabus / Savvas N Savvides / Irina Gutsche / Ambroise Desfosses / Robbie Loewith /
要旨: Target of rapamycin complex 1 (TORC1) is a protein kinase controlling cell homeostasis and growth in response to nutrients and stresses. In Saccharomyces cerevisiae, glucose depletion triggers a ...Target of rapamycin complex 1 (TORC1) is a protein kinase controlling cell homeostasis and growth in response to nutrients and stresses. In Saccharomyces cerevisiae, glucose depletion triggers a redistribution of TORC1 from a dispersed localization over the vacuole surface into a large, inactive condensate called TOROID (TORC1 organized in inhibited domains). However, the mechanisms governing this transition have been unclear. Here, we show that acute depletion and repletion of EGO complex (EGOC) activity is sufficient to control TOROID distribution, independently of other nutrient-signaling pathways. The 3.9-Å-resolution structure of TORC1 from TOROID cryo-EM data together with interrogation of key interactions in vivo provide structural insights into TORC1-TORC1' and TORC1-EGOC interaction interfaces. These data support a model in which glucose-dependent activation of EGOC triggers binding to TORC1 at an interface required for TOROID assembly, preventing TORC1 polymerization and promoting release of active TORC1.
履歴
登録2021年9月17日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年1月18日-
マップ公開2023年1月18日-
更新2023年3月29日-
現状2023年3月29日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_13595.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_13595.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 103 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Helical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited Domains) filaments.
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
2.7 Å/pix.
x 300 pix.
= 810. Å		2.7 Å/pix.
x 300 pix.
= 810. Å		2.7 Å/pix.
x 300 pix.
= 810. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 2.7 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.028
最小 - 最大-0.040822297 - 0.086129285
平均 (標準偏差)0.0020309312 (±0.0068145893)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ300300300
Spacing300300300
セルA=B=C: 810.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: Helical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited...

ファイルemd_13595_half_map_1.map
注釈Helical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited Domains) filaments, half map 1.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Helical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited...

ファイルemd_13595_half_map_2.map
注釈Helical reconstruction of TOROID (TORC1 Organized in Inhibited Domains) filaments, half map 2.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : TORC1 Organized in Inhibited Domains (TOROID)

全体名称: TORC1 Organized in Inhibited Domains (TOROID)
要素
  • 複合体: TORC1 Organized in Inhibited Domains (TOROID)
    • タンパク質・ペプチド: Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1
    • タンパク質・ペプチド: Serine/threonine-protein kinase TOR2
    • タンパク質・ペプチド: Target of rapamycin complex subunit LST8

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超分子 #1: TORC1 Organized in Inhibited Domains (TOROID)

超分子名称: TORC1 Organized in Inhibited Domains (TOROID) / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

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分子 #1: Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1

分子名称: Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1
詳細: S. cerevisiae TOROIDs (TORC1 Organized in Inhibited Domains) in the sample are composed of Kog1 (P38873), Lst8 (P41318) and Tor2 (P32600).
光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: MPEIYGPQPL KPLNTVMRHG FEEQYQSDQL LQSLANDFIF YFDDKRHKTN GNPIPEEDKQ RDVNRYYQP ITDWKIMKDR QKTVSAALLL CLNLGVDPPD VMKTHPCARV EAWVDPLNFQ D SKKAIEQI GKNLQAQYET LSLRTRYKQS LDPCVEDVKR FCNSLRRTSK ...文字列:
MPEIYGPQPL KPLNTVMRHG FEEQYQSDQL LQSLANDFIF YFDDKRHKTN GNPIPEEDKQ RDVNRYYQP ITDWKIMKDR QKTVSAALLL CLNLGVDPPD VMKTHPCARV EAWVDPLNFQ D SKKAIEQI GKNLQAQYET LSLRTRYKQS LDPCVEDVKR FCNSLRRTSK EDRILFHYNG HG VPKPTKS GEIWVFNRGY TQYIPVSLYD LQTWLGAPCI FVYDCNSAEN ILINFQKFVQ KRI KDDEEG NHDVAAPSPT SAYQDCFQLA SCTSDELLLM SPELPADLFS CCLTCPIEIS IRIF LMQSP LKDSKYKIFF ENSTSNQPFG DSKNSFKSKI PNVNIPGMLS DRRTPLGELN WIFTA ITDT IAWTSLPRPL FKKLFRHDLM IAALFRNFLL AKRIMPWYNC HPVSDPELPD SITTHP MWK SWDLAMDEVL TKIVIDLKNA PPATALESQM ILQQQETLQN GGSSKSNAQD TKAGSIQ TQ SRFAVANLST MSLVNNPALQ SRKSISLQSS QQQLQQQQQQ QQQFTGFFEQ NLTAFELW L KYASNVRHPP EQLPIVLQVL LSQVHRIRAL VLLSRFLDLG PWAVYLSLSI GIFPYVLKL LQSPAPELKP ILVFIWARIM SIDYKNTQSE LIKEKGYMYF VTVLVPDWGV NGMSATNGSA MINSGNPLT MTASQNINGP SSRYYERQQG NRTSNLGHNN LPFYHSNDTT DEQKAMAVFV L ASFVRNFP LGQKNCFSLE LVNKLCFYID NSEIPLLRQW CVILLGLLFA DNPLNRFVCM NT GAVEILL KSLKDPVPEV RTASIFALKH FISGFQDAEV ILRLQQEFEE QYQQLHSQLQ HLQ NQSHLQ QQQSQQQQQH LEQQQMKIEK QIRHCQVMQN QLEVIDLRKL KRQEIGNLIS ILPL INDGS SLVRKELVVY FSHIVSRYSN FFIVVVFNDL LEEIKLLEKS DINTRNTSDK YSVSQ GSIF YTVWKSLLIL AEDPFLENKE LSKQVIDYIL LELSAHKELG GPFAVMEKFL LKRSSK AHQ TGKFGFNSSQ VQFVKSSLRS FSPNERVDNN AFKKEQQQHD PKISHPMRTS LAKLFQS LG FSESNSDSDT QSSNTSMKSH TSKKGPSGLY LLNGNNNIYP TAETPRFRKH TEPLQLPL N SSFLDYSREY FQEPQMKKQE ADEPGSVEYN ARLWRRNRNE TIIQETQGEK KLSIYGNWS KKLISLNNKS QPKLMKFAQF EDQLITADDR STITVFDWEK GKTLSKFSNG TPFGTKVTDL KLINEDDSA LLLTGSSDGV IKIYRDYQDV DTFKIVSAWR GLTDMLLTPR STGLLTEWLQ I RGSLLTTG DVKVIRVWDA HTETVEVDIP AKTSSLITSL TADQLAGNIF VAGFADGSLR VY DRRLDPR DSMIRRWRAG NDKQGVWINN VHLQRGGYRE LVSGATNGVV ELWDIRSEDP VES FVDQNV TSQYGSQQKP TTMTCMQVHE HAPIIATGTK QIKIWTTSGD LLNSFKNSHN NGVT STLAA TGIPKSLSYS STSDAFLSSM AFHPHRMMIA ATNSHDSIVN IYKCEDERID YF

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分子 #2: Serine/threonine-protein kinase TOR2

分子名称: Serine/threonine-protein kinase TOR2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2
詳細: S. cerevisiae TOROIDs (TORC1 Organized in Inhibited Domains) in the sample are composed of Kog1 (P38873), Lst8 (P41318) and Tor2 (P32600).
光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: MNKYINKYTT PPNLLSLRQR AEGKHRTRKK LTHKSHSHDD EMSTTSNTDS NHNGPNDSGR VITGSAGHI GKISFVDSEL DTTFSTLNLI FDKLKSDVPQ ERASGANELS TTLTSLAREV S AEQFQRFS NSLNNKIFEL IHGFTSSEKI GGILAVDTLI SFYLSTEELP ...文字列:
MNKYINKYTT PPNLLSLRQR AEGKHRTRKK LTHKSHSHDD EMSTTSNTDS NHNGPNDSGR VITGSAGHI GKISFVDSEL DTTFSTLNLI FDKLKSDVPQ ERASGANELS TTLTSLAREV S AEQFQRFS NSLNNKIFEL IHGFTSSEKI GGILAVDTLI SFYLSTEELP NQTSRLANYL RV LIPSSDI EVMRLAANTL GRLTVPGGTL TSDFVEFEVR TCIDWLTLTA DNNSSSSKLE YRR HAALLI IKALADNSPY LLYPYVNSIL DNIWVPLRDA KLIIRLDAAV ALGKCLTIIQ DRDP ALGKQ WFQRLFQGCT HGLSLNTNDS VHATLLVFRE LLSLKAPYLR DKYDDIYKST MKYKE YKFD VIRREVYAIL PLLAAFDPAI FTKKYLDRIM VHYLRYLKNI DMNAANNSDK PFILVS IGD IAFEVGSSIS PYMTLILDNI REGLRTKFKV RKQFEKDLFY CIGKLACALG PAFAKHL NK DLLNLMLNCP MSDHMQETLM ILNEKIPSLE STVNSRILNL LSISLSGEKF IQSNQYDF N NQFSIEKARK SRNQSFMKKT GESNDDITDA QILIQCFKML QLIHHQYSLT EFVRLITIS YIEHEDSSVR KLAALTSCDL FIKDDICKQT SVHALHSVSE VLSKLLMIAI TDPVAEIRLE ILQHLGSNF DPQLAQPDNL RLLFMALNDE IFGIQLEAIK IIGRLSSVNP AYVVPSLRKT L LELLTQLK FSNMPKKKEE SATLLCTLIN SSDEVAKPYI DPILDVILPK CQDASSAVAS TA LKVLGEL SVVGGKEMTR YLKELMPLII NTFQDQSNSF KRDAALTTLG QLAASSGYVV GPL LDYPEL LGILINILKT ENNPHIRRGT VRLIGILGAL DPYKHREIEV TSNSKSSVEQ NAPS IDIAL LMQGVSPSND EYYPTVVIHN LMKILNDPSL SIHHTAAIQA IMHIFQNLGL RCVSF LDQI IPGIILVMRS CPPSQLDFYF QQLGSLISIV KQHIRPHVEK IYGVIREFFP IIKLQI TII SVIESISKAL EGEFKRFVPE TLTFFLDILE NDQSNKRIVP IRILKSLVTF GPNLEDY SH LIMPIVVRMT EYSAGSLKKI SIITLGRLAK NINLSEMSSR IVQALVRILN NGDRELTK A TMNTLSLLLL QLGTDFVVFV PVINKALLRN RIQHSVYDQL VNKLLNNECL PTNIIFDKE NEVPERKNYE DEMQVTKLPV NQNILKNAWY CSQQKTKEDW QEWIRRLSIQ LLKESPSACL RSCSSLVSV YYPLARELFN ASFSSCWVEL QTSYQEDLIQ ALCKALSSSE NPPEIYQMLL N LVEFMEHD DKPLPIPIHT LGKYAQKCHA FAKALHYKEV EFLEEPKNST IEALISINNQ LH QTDSAIG ILKHAQQHNE LQLKETWYEK LQRWEDALAA YNEKEAAGED SVEVMMGKLR SLY ALGEWE ELSKLASEKW GTAKPEVKKA MAPLAAGAAW GLEQWDEIAQ YTSVMKSQSP DKEF YDAIL CLHRNNFKKA EVHIFNARDL LVTELSALVN ESYNRAYNVV VRAQIIAELE EIIKY KKLP QNSDKRLTMR ETWNTRLLGC QKNIDVWQRI LRVRSLVIKP KEDAQVRIKF ANLCRK SGR MALAKKVLNT LLEETDDPDH PNTAKASPPV VYAQLKYLWA TGLQDEALKQ LINFTSR MA HDLGLDPNNM IAQSVPQQSK RVPRHVEDYT KLLARCFLKQ GEWRVCLQPK WRLSNPDS I LGSYLLATHF DNTWYKAWHN WALANFEVIS MLTSVSKKKQ EGSDASSVTD INEFDNGMI GVNTFDAKEV HYSSNLIHRH VIPAIKGFFH SISLSESSSL QDALRLLTLW FTFGGIPEAT QAMHEGFNL IQIGTWLEVL PQLISRIHQP NQIVSRSLLS LLSDLGKAHP QALVYPLMVA I KSESLSRQ KAALSIIEKM RIHSPVLVDQ AELVSHELIR MAVLWHEQWY EGLDDASRQF FG EHNTEKM FAALEPLYEM LKRGPETLRE ISFQNSFGRD LNDAYEWLMN YKKSKDVSNL NQA WDIYYN VFRKIGKQLP QLQTLELQHV SPKLLSAHDL ELAVPGTRAS GGKPIVKISK FEPV FSVIS SKQRPRKFCI KGSDGKDYKY VLKGHEDIRQ DSLVMQLFGL VNTLLQNDAE CFRRH LDIQ QYPAIPLSPK SGLLGWVPNS DTFHVLIREH REAKKIPLNI EHWVMLQMAP DYDNLT LLQ KVEVFTYALN NTEGQDLYKV LWLKSRSSET WLERRTTYTR SLAVMSMTGY ILGLGDR HP SNLMLDRITG KVIHIDFGDC FEAAILREKF PEKVPFRLTR MLTYAMEVSG IEGSFRIT C ENVMKVLRDN KGSLMAILEA FAFDPLINWG FDLPTKKIEE ETGIQLPVMN ANELLSNGA ITEEEVQRVE NEHKNAIRNA RAMLVLKRIT DKLTGNDIRR FNDLDVPEQV DKLIQQATSV ENLCQHYIG WCPFW

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分子 #3: Target of rapamycin complex subunit LST8

分子名称: Target of rapamycin complex subunit LST8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3
詳細: S. cerevisiae TOROIDs (TORC1 Organized in Inhibited Domains) in the sample are composed of Kog1 (P38873), Lst8 (P41318) and Tor2 (P32600).
光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: MSVILVSAGY DHTIRFWEAL TGVCSRTIQH SDSQVNRLEI TNDKKLLATA GHQNVRLYDI RTTNPNPVA SFEGHRGNVT SVSFQQDNRW MVTSSEDGTI KVWDVRSPSI PRNYKHNAPV N EVVIHPNQ GELISCDRDG NIRIWDLGEN QCTHQLTPED DTSLQSLSMA ...文字列:
MSVILVSAGY DHTIRFWEAL TGVCSRTIQH SDSQVNRLEI TNDKKLLATA GHQNVRLYDI RTTNPNPVA SFEGHRGNVT SVSFQQDNRW MVTSSEDGTI KVWDVRSPSI PRNYKHNAPV N EVVIHPNQ GELISCDRDG NIRIWDLGEN QCTHQLTPED DTSLQSLSMA SDGSMLAAAN TK GNCYVWE MPNHTDASHL KPVTKFRAHS TYITRILLSS DVKHLATCSA DHTARVWSID DDF KLETTL DGHQRWVWDC AFSADSAYLV TASSDHYVRL WDLSTREIVR QYGGHHKGAV CVAL NDV

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析らせん対称体再構成法
試料の集合状態filament

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試料調製

濃度0.02 mg/mL
緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度式名称
50.0 mMMES-NaOH2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid-sodium hydroxide
5.0 mMCHAPS3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfonate
600.0 mMNaClsodium chloride
0.5 mMDTTDithiothreitol
Phosphatase Inhibitor Mix
1.0 1 tablet/50 mlComplete Protease Inhibitor Cocktail
1.0 mMPMSFphenylmethylsulfonyl fluoride

詳細: 50 mM MES-NaOH pH 6.0, 5 mM CHAPS, 600 mM KCl, 0,5 mM DTT, Phosphatase Inhibitor Mix, Complete Protease Inhibitor Cocktail (Roche; 1 tablet/ 50 ml) and 1 mM PMSF)
グリッドモデル: PELCO Ultrathin Carbon with Lacey Carbon / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE / 装置: HOMEMADE PLUNGER

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 2-16 / 実像数: 4901 / 平均露光時間: 8.0 sec. / 平均電子線量: 20.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: OTHER / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.8 µm / 倍率（公称値）: 37000
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

詳細Motion correction and dose weighting of the recorded movies were performed using MotionCor2, discarding the first frame.
最終 再構成想定した対称性 - らせんパラメータ - Δz: 26.7 Å
想定した対称性 - らせんパラメータ - ΔΦ: 47.32 °
想定した対称性 - らせんパラメータ - 軸対称性: D1 (2回x1回 2面回転対称)
解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 9.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.0) / ソフトウェア - 詳細: Helical reconstruction / 使用した粒子像数: 219455
Segment selection選択した数: 219455 / ソフトウェア - 名称: EMAN2 / ソフトウェア - 詳細: e2helixboxer module
詳細: A total of 219,455 particles (filaments) were extracted in RELION 2.0 using the --helix option, with an extract size of 600 pixels (810 Angstrom), an outer diameter of 620 Angstrom, and a ...詳細: A total of 219,455 particles (filaments) were extracted in RELION 2.0 using the --helix option, with an extract size of 600 pixels (810 Angstrom), an outer diameter of 620 Angstrom, and a helical rise of 26.75 Angstrom.
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

3814


詳細: Map was low-pass filtered to 30 Angstrom.
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.0) / ソフトウェア - 詳細: Helical reconstruction
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

精密化プロトコル: RIGID BODY FIT

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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