+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Mumps viral factory in a non-stressed HeLa cell in a chronic infection stage | |||||||||
![]() | Tomogram of a viral factory in unstressed HeLa cells chronically infected by mumps virus | |||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | Cryo-ET / cryo-FIB / Helical filament / Nucleocapsid / Protein-RNA complex / Viral factories / Host-virus / VIRUS | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Mahamid J / Zhang X | |||||||||
資金援助 | European Union, 1件
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Molecular mechanisms of stress-induced reactivation in mumps virus condensates. 著者: Xiaojie Zhang / Sindhuja Sridharan / Ievgeniia Zagoriy / Christina Eugster Oegema / Cyan Ching / Tim Pflaesterer / Herman K H Fung / Isabelle Becher / Ina Poser / Christoph W Müller / ...著者: Xiaojie Zhang / Sindhuja Sridharan / Ievgeniia Zagoriy / Christina Eugster Oegema / Cyan Ching / Tim Pflaesterer / Herman K H Fung / Isabelle Becher / Ina Poser / Christoph W Müller / Anthony A Hyman / Mikhail M Savitski / Julia Mahamid / ![]() 要旨: Negative-stranded RNA viruses can establish long-term persistent infection in the form of large intracellular inclusions in the human host and cause chronic diseases. Here, we uncover how cellular ...Negative-stranded RNA viruses can establish long-term persistent infection in the form of large intracellular inclusions in the human host and cause chronic diseases. Here, we uncover how cellular stress disrupts the metastable host-virus equilibrium in persistent infection and induces viral replication in a culture model of mumps virus. Using a combination of cell biology, whole-cell proteomics, and cryo-electron tomography, we show that persistent viral replication factories are dynamic condensates and identify the largely disordered viral phosphoprotein as a driver of their assembly. Upon stress, increased phosphorylation of the phosphoprotein at its interaction interface with the viral polymerase coincides with the formation of a stable replication complex. By obtaining atomic models for the authentic mumps virus nucleocapsid, we elucidate a concomitant conformational change that exposes the viral genome to its replication machinery. These events constitute a stress-mediated switch within viral condensates that provide an environment to support upregulation of viral replication. | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 362.8 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12.3 KB 12.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 291.1 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 821.3 MB | ![]() | |
Filedesc metadata | ![]() | 4.1 KB | ||
その他 | ![]() | 6.9 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 661.3 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 660.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | Tomogram of a viral factory in unstressed HeLa cells chronically infected by mumps virus | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 13.48 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-追加マップ: Tomogram and nucleocapsid tracing of a viral factory...
ファイル | emd_13165_additional_1.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | Tomogram and nucleocapsid tracing of a viral factory in unstressed HeLa cells chronically infected by mumps virus | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-
試料の構成要素
-全体 : A mumps viral factory in the cytoplasm of a HeLa cell at a chroni...
全体 | 名称: A mumps viral factory in the cytoplasm of a HeLa cell at a chronic infection stage |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: A mumps viral factory in the cytoplasm of a HeLa cell at a chroni...
超分子 | 名称: A mumps viral factory in the cytoplasm of a HeLa cell at a chronic infection stage タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | cell |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
---|---|
グリッド | モデル: Quantifoil / 材質: GOLD / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / 装置: LEICA EM GP |
切片作成 | 集束イオンビーム - 装置: OTHER / 集束イオンビーム - イオン: OTHER / 集束イオンビーム - 電圧: 30 / 集束イオンビーム - 電流: 0.05 / 集束イオンビーム - 時間: 600 / 集束イオンビーム - 温度: 100 K / 集束イオンビーム - Initial thickness: 1000 / 集束イオンビーム - 最終 厚さ: 150 集束イオンビーム - 詳細: Rough milling was done with currents of 1 nA, gradually reduced to lower currents, down to 50 pA for the final polishing step. The value given for _em_focused_ion_ ...集束イオンビーム - 詳細: Rough milling was done with currents of 1 nA, gradually reduced to lower currents, down to 50 pA for the final polishing step. The value given for _em_focused_ion_beam.instrument is Aquilos Cryo-FIB. This is not in a list of allowed values {'DB235', 'OTHER'} so OTHER is written into the XML file. |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
特殊光学系 | 位相板: VOLTA PHASE PLATE / エネルギーフィルター - 名称: GIF Quantum LS / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / デジタル化 - サイズ - 横: 3708 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 3838 pixel / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-8 / 実像数: 58 / 平均露光時間: 1.6 sec. / 平均電子線量: 2.2 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最小 デフォーカス(公称値): 3.5 µm / 倍率(公称値): 42000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
最終 再構成 | アルゴリズム: BACK PROJECTION / ソフトウェア - 名称: ![]() |
---|