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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-12225 | ||||||||||||||||||
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タイトル | tomogram of membrane tubules coated with fungal retromer:Grd19 in the presence of Kex2 cargo. | ||||||||||||||||||
![]() | representative tomogram of fungal retromer:Grd19:Kex2 | ||||||||||||||||||
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生物種 | ![]() | ||||||||||||||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||||||||||||||
![]() | Leneva N / Kovtun O / Morado DR / Briggs JAG / Owen DJ | ||||||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Architecture and mechanism of metazoan retromer:SNX3 tubular coat assembly. 著者: Natalya Leneva / Oleksiy Kovtun / Dustin R Morado / John A G Briggs / David J Owen / ![]() 要旨: Retromer is a master regulator of cargo retrieval from endosomes, which is critical for many cellular processes including signaling, immunity, neuroprotection, and virus infection. The retromer core ...Retromer is a master regulator of cargo retrieval from endosomes, which is critical for many cellular processes including signaling, immunity, neuroprotection, and virus infection. The retromer core (VPS26/VPS29/VPS35) is present on cargo-transporting, tubular carriers along with a range of sorting nexins. Here, we elucidate the structural basis of membrane tubulation and coupled cargo recognition by metazoan and fungal retromer coats assembled with the non-Bin1/Amphiphysin/Rvs (BAR) sorting nexin SNX3 using cryo-electron tomography. The retromer core retains its arched, scaffolding structure but changes its mode of membrane recruitment when assembled with different SNX adaptors, allowing cargo recognition at subunit interfaces. Thus, membrane bending and cargo incorporation can be modulated to allow retromer to traffic cargoes along different cellular transport routes. | ||||||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 323.4 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 8.7 KB 8.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 145 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7blnC ![]() 7bloC ![]() 7blpC ![]() 7blqC ![]() 7blrC C: 同じ文献を引用 ( |
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電子顕微鏡画像生データ | ![]() Data size: 347.7 Data #1: Raw image frames for the fungal retromer:Grd19 coat assembled on the Kex2 cargo-containing membranes [micrographs - multiframe] Data #2: Corrected, aligned and order-sorted tilt series for the membrane-reconstituted fungal retromer:Grd19 complex in the presence of cargo-signal containing C-portion of the Kex2 cargo. [tilt series] Data #3: Corrected, aligned, dose-filtered and order-sorted tilt series for the membrane-reconstituted fungal retromer:Grd19 complex in the presence of cargo-signal containing C-portion of the Kex2 cargo. [tilt series]) |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | representative tomogram of fungal retromer:Grd19:Kex2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 5.516 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : membrane tubules coated with fungal retromer:Grd19 complex.
全体 | 名称: membrane tubules coated with fungal retromer:Grd19 complex. |
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要素 |
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-超分子 #1: membrane tubules coated with fungal retromer:Grd19 complex.
超分子 | 名称: membrane tubules coated with fungal retromer:Grd19 complex. タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#2 詳細: fungal retromer:Grd19 complex assembled on liposomes containing Kex2 cargo. |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | 3D array |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
切片作成 | その他: NO SECTIONING |
位置合わせマーカー | Manufacturer: BBI Solutions / 直径: 10 nm |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k) 平均電子線量: 3.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 41 |
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