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- EMDB-12078: the 96-nm axonemal repeat from horse sperm flagella (whole population) -
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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-12078 | |||||||||
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タイトル | the 96-nm axonemal repeat from horse sperm flagella (whole population) | |||||||||
![]() | subtomogram average of the 96-nm axonemal repeat from horse sperm flagella (whole population) | |||||||||
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生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 40.0 Å | |||||||||
![]() | Leung MR / Zeev-Ben-Mordehai T | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: The multi-scale architecture of mammalian sperm flagella and implications for ciliary motility. 著者: Miguel Ricardo Leung / Marc C Roelofs / Ravi Teja Ravi / Paula Maitan / Heiko Henning / Min Zhang / Elizabeth G Bromfield / Stuart C Howes / Bart M Gadella / Hermes Bloomfield-Gadêlha / ...著者: Miguel Ricardo Leung / Marc C Roelofs / Ravi Teja Ravi / Paula Maitan / Heiko Henning / Min Zhang / Elizabeth G Bromfield / Stuart C Howes / Bart M Gadella / Hermes Bloomfield-Gadêlha / Tzviya Zeev-Ben-Mordehai / ![]() ![]() ![]() ![]() 要旨: Motile cilia are molecular machines used by a myriad of eukaryotic cells to swim through fluid environments. However, available molecular structures represent only a handful of cell types, limiting ...Motile cilia are molecular machines used by a myriad of eukaryotic cells to swim through fluid environments. However, available molecular structures represent only a handful of cell types, limiting our understanding of how cilia are modified to support motility in diverse media. Here, we use cryo-focused ion beam milling-enabled cryo-electron tomography to image sperm flagella from three mammalian species. We resolve in-cell structures of centrioles, axonemal doublets, central pair apparatus, and endpiece singlets, revealing novel protofilament-bridging microtubule inner proteins throughout the flagellum. We present native structures of the flagellar base, which is crucial for shaping the flagellar beat. We show that outer dense fibers are directly coupled to microtubule doublets in the principal piece but not in the midpiece. Thus, mammalian sperm flagella are ornamented across scales, from protofilament-bracing structures reinforcing microtubules at the nano-scale to accessory structures that impose micron-scale asymmetries on the entire assembly. Our structures provide vital foundations for linking molecular structure to ciliary motility and evolution. #1: ![]() タイトル: The multi-scale architecture of mammalian sperm flagella and implications for ciliary motility 著者: Leung MR / Roelofs MC / Ravi RT / Maitan P / Zhang M / Henning H / Bromfield EG / Howes SC / Gadella BM / Bloomfield-Gadelha H / Zeev-Ben-Mordehai T | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 3.5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 10.1 KB 10.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 157.2 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 277.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 276.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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マップ
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注釈 | subtomogram average of the 96-nm axonemal repeat from horse sperm flagella (whole population) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 11.32 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : subtomogram average of the 96-nm axonemal repeat from horse sperm...
全体 | 名称: subtomogram average of the 96-nm axonemal repeat from horse sperm flagella (whole population) |
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要素 |
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-超分子 #1: subtomogram average of the 96-nm axonemal repeat from horse sperm...
超分子 | 名称: subtomogram average of the 96-nm axonemal repeat from horse sperm flagella (whole population) タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | cell |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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グリッド | モデル: Quantifoil / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE |
凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TALOS ARCTICA |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 1.67 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 40.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.5 CUT-OFF / 使用したサブトモグラム数: 634 |
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抽出 | トモグラム数: 16 / 使用した粒子像数: 634 / ソフトウェア - 名称: PEET (ver. 1.13.0) |
CTF補正 | ソフトウェア - 名称: PEET (ver. 1.13.0) |
最終 角度割当 | タイプ: OTHER |