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- EMDB-11458: Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State II -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-11458
タイトルStructure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State II
マップデータ
試料
  • 複合体: ABCE1-bound 43S initiation complex
    • タンパク質・ペプチド: x 49種
    • RNA: x 1種
  • リガンド: x 5種
キーワードTranslation / Initiation / Ribosome Recycling / ABC Proteins / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


negative regulation of endoribonuclease activity / CTPase activity / positive regulation of mRNA binding / viral translational termination-reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / cap-dependent translational initiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / IRES-dependent viral translational initiation / translation reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex ...negative regulation of endoribonuclease activity / CTPase activity / positive regulation of mRNA binding / viral translational termination-reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / cap-dependent translational initiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / IRES-dependent viral translational initiation / translation reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 3 complex / OAS antiviral response / formation of cytoplasmic translation initiation complex / cytoplasmic translational initiation / multi-eIF complex / translation factor activity, RNA binding / eukaryotic 43S preinitiation complex / mRNA cap binding / eukaryotic 48S preinitiation complex / oxidized pyrimidine DNA binding / response to TNF agonist / positive regulation of base-excision repair / negative regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response / negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage / positive regulation of respiratory burst involved in inflammatory response / positive regulation of gastrulation / regulation of adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / protein tyrosine kinase inhibitor activity / IRE1-RACK1-PP2A complex / positive regulation of endodeoxyribonuclease activity / nucleolus organization / positive regulation of Golgi to plasma membrane protein transport / translation at postsynapse / ribosome disassembly / TNFR1-mediated ceramide production / ribosomal subunit / negative regulation of DNA repair / negative regulation of RNA splicing / metal-dependent deubiquitinase activity / mammalian oogenesis stage / regulation of translational initiation / supercoiled DNA binding / activation-induced cell death of T cells / neural crest cell differentiation / NF-kappaB complex / oxidized purine DNA binding / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hydrogen peroxide / ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding / regulation of establishment of cell polarity / translation at presynapse / positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / erythrocyte homeostasis / negative regulation of phagocytosis / rRNA modification in the nucleus and cytosol / cytoplasmic side of rough endoplasmic reticulum membrane / laminin receptor activity / protein kinase A binding / negative regulation of ubiquitin protein ligase activity / pigmentation / Ribosomal scanning and start codon recognition / ion channel inhibitor activity / Translation initiation complex formation / positive regulation of mitochondrial depolarization / positive regulation of T cell receptor signaling pathway / positive regulation of activated T cell proliferation / fibroblast growth factor binding / negative regulation of Wnt signaling pathway / monocyte chemotaxis / negative regulation of translational frameshifting / Protein hydroxylation / BH3 domain binding / TOR signaling / SARS-CoV-1 modulates host translation machinery / regulation of cell division / mTORC1-mediated signalling / T cell proliferation involved in immune response / Peptide chain elongation / iron-sulfur cluster binding / positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator / Selenocysteine synthesis / positive regulation of signal transduction by p53 class mediator / Formation of a pool of free 40S subunits / ribosomal small subunit binding / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / ubiquitin ligase inhibitor activity / Eukaryotic Translation Termination / Response of EIF2AK4 (GCN2) to amino acid deficiency / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process / Viral mRNA Translation / negative regulation of respiratory burst involved in inflammatory response / phagocytic cup / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / erythrocyte development / endoribonuclease inhibitor activity
類似検索 - 分子機能
Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J / Eukaryotic translation initiation factor 3-like domain superfamily / Translation initiation factor eIF3 subunit / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 7 (eIF-3) / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H / eIF3h, C-terminal / C-terminal region of eIF3h / RLI, domain 1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F ...Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J / Eukaryotic translation initiation factor 3-like domain superfamily / Translation initiation factor eIF3 subunit / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 7 (eIF-3) / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H / eIF3h, C-terminal / C-terminal region of eIF3h / RLI, domain 1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F / Translation initiation factor 3 complex subunit L / RNA polymerase I-associated factor PAF67 / EIF3I / RLI1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / eIF3 subunit M, C-terminal helix domain / eIF3 subunit 6 N terminal domain / eIF3 subunit M, C-terminal helix / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, C-terminal / RNase L inhibitor RLI-like, possible metal-binding domain / Possible Fer4-like domain in RNase L inhibitor, RLI / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, N-terminal / eIF3 subunit 6 N terminal domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K / Translation initiation factor 3, subunit 12, N-terminal, eukaryotic / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I / Eukaryotic translation initiation factor SUI1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B / eIF3B, RNA recognition motif / Translation initiation factor, beta propellor-like domain / Eukaryotic translation initiation factor eIF2A / SUI1 domain superfamily / Translation initiation factor SUI1 / Translation initiation factor SUI1 family profile. / SUI1 domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M eIF3m/COP9 signalosome complex subunit 7 COPS7 / : / eIF3a, PCI domain, TPR-like region / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, N-terminal domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 8 N-terminus / 4Fe-4S binding domain / CSN8/PSMD8/EIF3K / CSN8/PSMD8/EIF3K family / Rpn11/EIF3F, C-terminal / Maintenance of mitochondrial structure and function / : / motif in proteasome subunits, Int-6, Nip-1 and TRIP-15 / PCI domain / Proteasome component (PCI) domain / PCI domain profile. / 40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ubiquitin-like protein FUBI / JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / : / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S2, eukaryotic / S27a-like superfamily / 40S Ribosomal protein S10 / : / Ribosomal protein S7e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein S27e signature.
類似検索 - ドメイン・相同性
Ribosomal protein S14 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / 40S ribosomal protein S24 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J / Small ribosomal subunit protein eS17 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS5 ...Ribosomal protein S14 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / 40S ribosomal protein S24 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J / Small ribosomal subunit protein eS17 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Small ribosomal subunit protein eS19 / Eukaryotic translation initiation factor 1 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein eS10 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E / Small ribosomal subunit protein uS10 / ATP-binding cassette sub-family E member 1 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Small ribosomal subunit protein eS7 / Small ribosomal subunit protein eS8 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Small ribosomal subunit protein eS4, X isoform / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Small ribosomal subunit protein eS25 / Small ribosomal subunit protein eS26 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS32 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS21 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.8 Å
データ登録者Kratzat H / Mackens-Kiani T
資金援助 ドイツ, フランス, 2件
OrganizationGrant number国
German Research Foundation (DFG) ドイツ
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) フランス
引用ジャーナル: EMBO J / 年: 2021
タイトル: A structural inventory of native ribosomal ABCE1-43S pre-initiation complexes.
著者: Hanna Kratzat / Timur Mackens-Kiani / Michael Ameismeier / Mia Potocnjak / Jingdong Cheng / Estelle Dacheux / Abdelkader Namane / Otto Berninghausen / Franz Herzog / Micheline Fromont-Racine ...著者: Hanna Kratzat / Timur Mackens-Kiani / Michael Ameismeier / Mia Potocnjak / Jingdong Cheng / Estelle Dacheux / Abdelkader Namane / Otto Berninghausen / Franz Herzog / Micheline Fromont-Racine / Thomas Becker / Roland Beckmann /
要旨: In eukaryotic translation, termination and ribosome recycling phases are linked to subsequent initiation of a new round of translation by persistence of several factors at ribosomal sub-complexes. ...In eukaryotic translation, termination and ribosome recycling phases are linked to subsequent initiation of a new round of translation by persistence of several factors at ribosomal sub-complexes. These comprise/include the large eIF3 complex, eIF3j (Hcr1 in yeast) and the ATP-binding cassette protein ABCE1 (Rli1 in yeast). The ATPase is mainly active as a recycling factor, but it can remain bound to the dissociated 40S subunit until formation of the next 43S pre-initiation complexes. However, its functional role and native architectural context remains largely enigmatic. Here, we present an architectural inventory of native yeast and human ABCE1-containing pre-initiation complexes by cryo-EM. We found that ABCE1 was mostly associated with early 43S, but also with later 48S phases of initiation. It adopted a novel hybrid conformation of its nucleotide-binding domains, while interacting with the N-terminus of eIF3j. Further, eIF3j occupied the mRNA entry channel via its ultimate C-terminus providing a structural explanation for its antagonistic role with respect to mRNA binding. Overall, the native human samples provide a near-complete molecular picture of the architecture and sophisticated interaction network of the 43S-bound eIF3 complex and the eIF2 ternary complex containing the initiator tRNA.
履歴
登録2020年7月24日-
ヘッダ(付随情報) 公開2020年10月7日-
マップ公開2020年10月7日-
更新2024年5月1日-
現状2024年5月1日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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ムービー
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  • 原子モデル: PDB-6zvj
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_11458.png

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_11458.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
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軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.06 Å/pix.
x 400 pix.
= 423.6 Å		1.06 Å/pix.
x 400 pix.
= 423.6 Å		1.06 Å/pix.
x 400 pix.
= 423.6 Å

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ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.059 Å
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表面レベル登録者による: 0.015 / ムービー #1: 0.015
最小 - 最大-0.03345038 - 0.086971
平均 (標準偏差)-0.0000085757565 (±0.004475016)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 423.6 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.0591.0591.059
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z423.600423.600423.600
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ162182277
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS400400400
D min/max/mean-0.0330.087-0.000

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添付データ

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追加マップ: post processed and masked map

ファイルemd_11458_additional_1.map
注釈post processed and masked map
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ファイルemd_11458_additional_2.map
注釈local resolution filtered map
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追加マップ: multi body refinement body 1

ファイルemd_11458_additional_3.map
注釈multi body refinement body 1
投影像・断面図
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追加マップ: multi body refinement body 2

ファイルemd_11458_additional_4.map
注釈multi body refinement body 2
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追加マップ: multi body refinement body 3

ファイルemd_11458_additional_5.map
注釈multi body refinement body 3
投影像・断面図
軸ZYX

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密度ヒストグラム

ヒストグラム

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追加マップ: multi body refinement if eIF3 core body 1

ファイルemd_11458_additional_6.map
注釈multi body refinement if eIF3 core body 1
投影像・断面図
軸ZYX

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断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: multi body refinement if eIF3 core body 2

ファイルemd_11458_additional_7.map
注釈multi body refinement if eIF3 core body 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

+
全体 : ABCE1-bound 43S initiation complex

全体名称: ABCE1-bound 43S initiation complex
要素
  • 複合体: ABCE1-bound 43S initiation complex
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein SA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4, X isoform
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L41
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • RNA: 18S ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a
    • タンパク質・ペプチド: Receptor of activated protein C kinase 1
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M
    • タンパク質・ペプチド: ATP-binding cassette sub-family E member 1
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 1
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D
    • タンパク質・ペプチド: RNA recognition motif (unknown)
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

+
超分子 #1: ABCE1-bound 43S initiation complex

超分子名称: ABCE1-bound 43S initiation complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#50
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
分子 #1: 40S ribosomal protein SA

分子名称: 40S ribosomal protein SA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 24.260758 KDa
配列文字列: SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQAAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH ...文字列:
SGALDVLQMK EEDVLKFLAA GTHLGGTNLD FQMEQYIYKR KSDGIYIINL KRTWEKLLLA ARAIVAIENP ADVSVISSRN TGQRAVLKF AAATGATPIA GRFTPGTFTN QIQAAFREPR LLVVTDPRAD HQPLTEASYV NLPTIALCNT DSPLRYVDIA I PCNNKGAH SVGLMWWMLA REVLRMRGTI SREHPWEVMP DLYFYRDPEE IEKEEQAA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #2: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 24.560883 KDa
配列文字列: DPFSKKDWYD VKAPAMFNIR NIGKTLVTRT QGTKIASDGL KGRVFEVSLA DLQNDEVAFR KFKLITEDVQ GKNCLTNFHG MDLTRDKMC SMVKKWQTMI EAHVDVKTTD GYLLRLFCVG FTKKRNNQIR KTSYAQHQQV RQIRKKMMEI MTREVQTNDL K EVVNKLIP ...文字列:
DPFSKKDWYD VKAPAMFNIR NIGKTLVTRT QGTKIASDGL KGRVFEVSLA DLQNDEVAFR KFKLITEDVQ GKNCLTNFHG MDLTRDKMC SMVKKWQTMI EAHVDVKTTD GYLLRLFCVG FTKKRNNQIR KTSYAQHQQV RQIRKKMMEI MTREVQTNDL K EVVNKLIP DSIGKDIEKA CQSIYPLHDV FVRKVKMLKK PKFELGKLME LHG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #3: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.861238 KDa
配列文字列: WMPVTKLGRL VKDMKIKSLE EIYLFSLPIK ESEIIDFFLG ASLKDEVLKI MPVQKQTRAG QRTRFKAFVA IGDYNGHVGL GVKCSKEVA TAIRGAIILA KLSIVPVRRG YWGNKIGKPH TVPCKVTGRC GSVLVRLIPA PRGTGIVSAP VPKKLLMMAG I DDCYTSAR ...文字列:
WMPVTKLGRL VKDMKIKSLE EIYLFSLPIK ESEIIDFFLG ASLKDEVLKI MPVQKQTRAG QRTRFKAFVA IGDYNGHVGL GVKCSKEVA TAIRGAIILA KLSIVPVRRG YWGNKIGKPH TVPCKVTGRC GSVLVRLIPA PRGTGIVSAP VPKKLLMMAG I DDCYTSAR GCTATLGNFA KATFDAISKT YSYLTPDLWK ETVFTKSPYQ EFTDHLVK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #4: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 11.645794 KDa
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCARCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEASVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPPPR FR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS26

+
分子 #5: 40S ribosomal protein S4, X isoform

分子名称: 40S ribosomal protein S4, X isoform / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 28.892998 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIIFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRTDIT YPAGFMDVI SIDKTGENFR LIYDTKGRFA VHRITPEEAK YKLCKVRKIF VGTKGIPHLV THDARTIRYP DPLIKVNDTI Q IDLETGKI TDFIKFDTGN LCMVTGGANL GRIGVITNRE RHPGSFDVVH VKDANGNSFA TRLSNIFVIG KGNKPWISLP RG KGIRLTI AEERDKRL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS4, X isoform

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L41

分子名称: 60S ribosomal protein L41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 3.344271 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS32

+
分子 #7: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 25.612301 KDa
配列文字列: KLNISFPATG CQKLIEVDDE RKLRTFYEKR MATEVAADAL GEEWKGYVVR ISGGNDKQGF PMKQGVLTHG RVRLLLSKGH SCYRPRRTG ERKRKSVRGC IVDANLSVLN LVIVKKGEKD IPGLTDTTVP RRLGPKRASR IRKLFNLSKE DDVRQYVVRK P LNKEGKKP ...文字列:
KLNISFPATG CQKLIEVDDE RKLRTFYEKR MATEVAADAL GEEWKGYVVR ISGGNDKQGF PMKQGVLTHG RVRLLLSKGH SCYRPRRTG ERKRKSVRGC IVDANLSVLN LVIVKKGEKD IPGLTDTTVP RRLGPKRASR IRKLFNLSKE DDVRQYVVRK P LNKEGKKP RTKAPKIQRL VTPRVLQHKR RRIALKKQRT KKNKEEAAEY AKLLAKRMKE AKEK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS6

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 20.788342 KDa
配列文字列:
IVKPNEFESG ISQALLELEM NSDLKAQLRE LNITAAKEIE VGGGRKAIII FVPVPQLKSF QKIQVRLVRE LEKKFSGKHV VFIAQRRIL PKPTRKSRTK NKQKRPRSRT LTAVHDAILE DLVFPSEIVG KRIRVKLDGS RLIKVHLDKA QQNNVEHKVE T FSGVYKKL TGKDVNFEFP EFQ

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS7

+
分子 #9: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.945959 KDa
配列文字列: GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG ...文字列:
GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG KLLACIASRP GQCGRADGYV LEGKELEFYL RKIKARK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS8

+
分子 #10: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 21.279271 KDa
配列文字列:
PVARSWVCRK TYVTPRRPFE KSRLDQELKL IGEYGLRNKR EVWRVKFTLA KIRKAARELL TLDEKDPRRL FEGNALLRRL VRIGVLDEG KMKLDYILGL KIEDFLERRL QTQVFKLGLA KSIHHARVLI RQRHIRVRKQ VVNIPSFIVR LDSQKHIDFS L RSPYGGGR PGRVKRKNAK KG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #11: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 16.913004 KDa
配列文字列:
IQTERAYQKQ PTIFQNKKRV LLGETGKEKL PRYYKNIGLG FKTPKEAIEG TYIDKKCPFT GNVSIRGRIL SGVVTKMKMQ RTIVIRRDY LHYIRKYNRF EKRHKNMSVH LSPCFRDVQI GDIVTVGECR PLSKTVRFNV LKVTK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #12: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 17.057113 KDa
配列文字列:
GRMHAPGKGL SQSALPYRRS VPTWLKLTSD DVKEQIYKLA KKGLTPSQIG VILRDSHGVA QVRFVTGNKI LRILKSKGLA PDLPEDLYH LIKKAVAVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYK TKRVLPPNWK YESSTASALV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #13: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 13.463481 KDa
配列文字列:
NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQRC KELGITALHI KLRATGGNRT KTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRR

UniProtKB: Ribosomal protein S14

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 8.977214 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KN

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS21

+
分子 #15: 40S ribosomal protein S15a

分子名称: 40S ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 14.734357 KDa
配列文字列:
VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFDV QLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #16: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.372082 KDa
配列文字列:
GKCRGLRTAR KLRSHRRDQK WHDKQYKKAH LGTALKANPF GGASHAKGIV LEKVGVEAKQ PNSAIRKCVR VQLIKNGKKI TAFVPNDGC LNFIEENDEV LVAGFGRKGH AVGDIPGVRF KVVKVANVSL LALYKGKKER

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #17: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 14.259944 KDa
配列文字列:
VTIRTRKFMT NRLLQRKQMV IDVLHPGKAT VPKTEIREKL AKMYKTTPDV IFVFGFRTHF GGGKTTGFGM IYDSLDYAKK NEPKHRLAR HGLYEKKKTS RKQRKERKNR MKKVRGTAKA NVG

UniProtKB: 40S ribosomal protein S24

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 9.210843 KDa
配列文字列:
PLAKDLLHPS PEEEKRKHKK KRLVQSPNSY FMDVKCPGCY KITTVFSHAQ TVVLCVGCST VLCQPTGGKA RLTEGCSFRR KQ

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS27

+
分子 #19: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 5.069001 KDa
配列文字列:
ARAGKVRGQT PKVAKQEKKK KKTGRAKRRM QYNRRFVNVG PNAN

UniProtKB: Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein

+
分子 #21: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.036469 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKK AARVIIEKYY TRLGNDFHTN KRVCEEIAII PSKKLRNKIA GYVTHLMKRI QRGPVRGISI KLQEEERERR DNYVPEVSA LDQEIIEVDP DTKEMLKLLD FGSLSNLQVT QPTVGMNFKT P

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #22: 40S ribosomal protein S16

分子名称: 40S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.637354 KDa
配列文字列:
SVQVFGRKKT ATAVAHCKRG NGLIKVNGRP LEMIEPRTLQ YKLLEPVLLL GKERFAGVDI RVRVKGGGHV AQIYAIRQSI SKALVAYYQ KYVDEASKKE IKDILIQYDR TLLVADPRRC ESKKFGGPGA RARYQKSYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #23: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 24.871156 KDa
配列文字列: QISKKRKFVA DGIFKAELNE FLTRELAEDG YSGVEVRVTP TRTEIIILAT RTQNVLGEKG RRIRELTAVV QKRFGFPEGS VELYAEKVA TRGLCAIAQA ESLRYKLLGG LAVRRACYGV LRFIMESGAK GCEVVVSGKL RGQRAKSMKF VDGLMIHSGD P VNYYVDTA ...文字列:
QISKKRKFVA DGIFKAELNE FLTRELAEDG YSGVEVRVTP TRTEIIILAT RTQNVLGEKG RRIRELTAVV QKRFGFPEGS VELYAEKVA TRGLCAIAQA ESLRYKLLGG LAVRRACYGV LRFIMESGAK GCEVVVSGKL RGQRAKSMKF VDGLMIHSGD P VNYYVDTA VRHVLLRQGV LGIKVKIMLP WDPTGKIGPK KPLPDHVSIV EPKDEILPTT PISEQK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #24: 40S ribosomal protein S5

分子名称: 40S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 21.327723 KDa
配列文字列: DIKLFGKWST DDVQINDISL QDYIAVKEKY AKYLPHSAGR YAAKRFRKAQ CPIVERLTNS MMMHGRNNGK KLMTVRIVKH AFEIIHLLT GENPLQVLVN AIINSGPRED STRIGRAGTV RRQAVDVSPL RRVNQAIWLL CTGAREAAFR NIKTIAECLA D ELINAAKG ...文字列:
DIKLFGKWST DDVQINDISL QDYIAVKEKY AKYLPHSAGR YAAKRFRKAQ CPIVERLTNS MMMHGRNNGK KLMTVRIVKH AFEIIHLLT GENPLQVLVN AIINSGPRED STRIGRAGTV RRQAVDVSPL RRVNQAIWLL CTGAREAAFR NIKTIAECLA D ELINAAKG SSNSYAIKKK DELERVAKSN R

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #25: 40S ribosomal protein S10

分子名称: 40S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 11.372488 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS10

+
分子 #26: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 12.945101 KDa
配列文字列:
VNTALQEVLK TALIHDGLAR GIREAAKALD KRQAHLCVLA SNCDEPMYVK LVEALCAEHQ INLIKVDDNK KLGEWVGLCK IDREGKPRK VVGCSCVVVK DYGKESQAKD VIEEYFK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS12

+
分子 #27: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 14.01054 KDa
配列文字列:
FTYRGVDLDQ LLDMSYEQLM QLYSARQRRR LNRGLRRKQH SLLKRLRKAK KEAPPMEKPE VVKTHLRDMI ILPEMVGSMV GVYNGKTFN QVEIKPEMIG HYLGEFSITY KPVKHGRPGI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #28: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 16.496223 KDa
配列文字列:
LVIPEKFQHI LRVLNTNIDG RRKIAFAITA IKGVGRRYAH VVLRKADIDL TKRAGELTED EVERVITIMQ NPRQYKIPDW FLNRQKDVK DGKYSQVLAN GLDNKLREDL ERLKKIRAHR GLRHFWGLRV RGQHTKTTGR R

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #29: 40S ribosomal protein S19

分子名称: 40S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.563858 KDa
配列文字列:
PGVTVKDVNQ QEFVRALAAF LKKSGKLKVP EWVDTVKLAK HKELAPYDEN WFYTRAASTA RHLYLRGGAG VGSMTKIYGG RQRNGVMPS HFSRGSKSVA RRVLQALEGL KMVEKDQDGG RKLTPQGQRD LDRIAGQVAA AN

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS19

+
分子 #30: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 11.186265 KDa
配列文字列:
RIRITLTSRN VKSLEKVCAD LIRGAKEKNL KVKGPVRMPT KTLRITTRKT PCGEGSKTWD RFQMRIHKRL IDLHSPSEIV KQITSISIE PGVEVEVTI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #31: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 7.938426 KDa
配列文字列:
LNNLVLFDKA TYDKLCKEVP NYKLITPAVV SERLKIRGSL ARAALQELLS KGLIKLVSKH RAQVIYTRNT

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS25

+
分子 #32: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 6.87894 KDa
配列文字列:
PIKLARVTKV LGRTGSQGQC TQVRVEFMDD TSRSIIRNVK GPVREGDVLT LLESEREARR L

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #33: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 6.444537 KDa
配列文字列:
GHQQLYWSHP RKFGQGSRSC RVCSNRHGLI RKYGLNMCRQ CFRQYAKDIG FIKL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #34: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a

分子名称: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 7.257627 KDa
配列文字列:
PKKNKHKRKK VKLAVLKYYK VDENGKISRL RRECPSDECG AGVFMASHFD RHYCGKCCLT YC

UniProtKB: Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein

+
分子 #35: Receptor of activated protein C kinase 1

分子名称: Receptor of activated protein C kinase 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 34.224641 KDa
配列文字列: QMTLRGTLKG HNGWVTQIAT TPQFPDMILS ASRDKTIIMW KLTRDETNYG IPQRALRGHS HFVSDVVISS DGQFALSGSW DGTLRLWDL TTGTTTRRFV GHTKDVLSVA FSSDNRQIVS GSRDKTIKLW NTLGVCKYTV QDESHSEWVS CVRFSPNSSN P IIVSCGWD ...文字列:
QMTLRGTLKG HNGWVTQIAT TPQFPDMILS ASRDKTIIMW KLTRDETNYG IPQRALRGHS HFVSDVVISS DGQFALSGSW DGTLRLWDL TTGTTTRRFV GHTKDVLSVA FSSDNRQIVS GSRDKTIKLW NTLGVCKYTV QDESHSEWVS CVRFSPNSSN P IIVSCGWD KLVKVWNLAN CKLKTNHIGH TGYLNTVTVS PDGSLCASGG KDGQAMLWDL NEGKHLYTLD GGDIINALCF SP NRYWLCA ATGPSIKIWD LEGKIIVDEL KQEVISTSSK AEPPQCTSLA WSADGQTLFA GYTDNLVRVW QV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein RACK1

+
分子 #36: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 35.352535 KDa
配列文字列: MKPILLQGHE RSITQIKYNR EGDLLFTVAK DPIVNVWYSV NGERLGTYMG HTGAVWCVDA DWDTKHVLTG SADNSCRLWD CETGKQLAL LKTNSAVRTC GFDFGGNIIM FSTDKQMGYQ CFVSFFDLRD PSQIDNNEPY MKIPCNDSKI TSAVWGPLGE C IIAGHESG ...文字列:
MKPILLQGHE RSITQIKYNR EGDLLFTVAK DPIVNVWYSV NGERLGTYMG HTGAVWCVDA DWDTKHVLTG SADNSCRLWD CETGKQLAL LKTNSAVRTC GFDFGGNIIM FSTDKQMGYQ CFVSFFDLRD PSQIDNNEPY MKIPCNDSKI TSAVWGPLGE C IIAGHESG ELNQYSAKSG EVLVNVKEHS RQINDIQLSR DMTMFVTASK DNTAKLFDST TLEHQKTFRT ERPVNSAALS PN YDHVVLG GGQEAMDVTT TSTRIGKFEA RFFHLAFEEE FGRVKGHFGP INSVAFHPDG KSYSSGGEDG YVRIHYFDP

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I

+
分子 #37: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 65.901969 KDa
配列文字列: ADGIDSVIVV DNVPQVGPDR LEKLKNVIHK IFSKFGKITN DFYPEEDGKT KGYIFLEYAS PAHAVDAVKN ADGYKLDKQH TFRVNLFTD FDKYMTISDE WDIPEKQPFK DLGNLRYWLE EAECRDQYSV IFESGDRTSI FWNDVKDPVS IEERARWTET Y VRWSPKGT ...文字列:
ADGIDSVIVV DNVPQVGPDR LEKLKNVIHK IFSKFGKITN DFYPEEDGKT KGYIFLEYAS PAHAVDAVKN ADGYKLDKQH TFRVNLFTD FDKYMTISDE WDIPEKQPFK DLGNLRYWLE EAECRDQYSV IFESGDRTSI FWNDVKDPVS IEERARWTET Y VRWSPKGT YLATFHQRGI ALWGGEKFKQ IQRFSHQGVQ LIDFSPCERY LVTFSPLMDT QDDPQAIIIW DILTGHKKRG FH CESSAHW PIFKWSHDGK FFARMTLDTL SIYETPSMGL LDKKSLKISG IKDFSWSPGG NIIAFWVPED KDIPARVTLM QLP TRQEIR VRNLFNVVDC KLHWQKNGDY LCVKVDRTPK GTQGVVTNFE IFRMREKQVP VDVVEMKETI IAFAWEPNGS KFAV LHGEA PRISVSFYHV KNNGKIELIK MFDKQQANTI FWSPQGQFVV LAGLRSMNGA LAFVDTSDCT VMNIAEHYMA SDVEW DPTG RYVVTSVSWW SHKVDNAYWL WTFQGRLLQK NNKDRFCQLL WRPRPPTLLS QEQIKQIKKD LKKYSKIFEQ KDRLSQ SKA SKE

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

+
分子 #38: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 85.564188 KDa
配列文字列: YFQRPENALK RANEFLEVGK KQPALDVLYD VMKSKKHRTW QKIHEPIMLK YLELCVDLRK SHLAKEGLYQ YKNICQQVNI KSLEDVVRA YLKMAEEKTE AAKEESQQMV LDIEDLDNIQ TPESVLLSAV SGEDTQDRTD RLLLTPWVKF LWESYRQCLD L LRNNSRVE ...文字列:
YFQRPENALK RANEFLEVGK KQPALDVLYD VMKSKKHRTW QKIHEPIMLK YLELCVDLRK SHLAKEGLYQ YKNICQQVNI KSLEDVVRA YLKMAEEKTE AAKEESQQMV LDIEDLDNIQ TPESVLLSAV SGEDTQDRTD RLLLTPWVKF LWESYRQCLD L LRNNSRVE RLYHDIAQQA FKFCLQYTRK AEFRKLCDNL RMHLSQIQRH HNQSTAINLN NPESQSMHLE TRLVQLDSAI SM ELWQEAF KAVEDIHGLF SLSKKPPKPQ LMANYYNKVS TVFWKSGNAL FHASTLHRLY HLSREMRKNL TQDEMQRMST RVL LATLSI PITPERTDIA RLLDMDGIIV EKQRRLATLL GLQAPPTRIG LINDMVRFNV LQYVVPEVKD LYNWLEVEFN PLKL CERVT KVLNWVREQP EKEPELQQYV PQLQNNTILR LLQQVSQIYQ SIEFSRLTSL VPFVDAFQLE RAIVDAARHC DLQVR IDHT SRTLSFGSDL NYATREDAPI GPHLQSMPSE QIRNQLTAMS SVLAKALEVI KPAHILQEKE EQHQLAVTAY LKNSRK EHQ RILARRQTIE ERKERLESLN IQREKEELEQ REAELQKVRK AEEERLRQEA KEREKERILQ EHEQIKKKTV RERLEQI KK TELGAKAFKD IDIEDLEELD PDFIMAKQVE QLEKEKKELQ ERLKNQEKKI DYFERAKRLE EIPLIKSAYE EQRIKDMD L W

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A

+
分子 #39: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 86.19757 KDa
配列文字列: MSRFFTTGSD SESESSLSGE ELVTKPVGGN YGKQPLLLSE DEEDTKRVVR SAKDKRFEEL TNLIRTIRNA MKIRDVTKCL EEFELLGKA YGKAKSIVDK EGVPRFYIRI LADLEDYLNE LWEDKEGKKK MNKNNAKALS TLRQKIRKYN KGTEITHAVV I KKLNEILQ ...文字列:
MSRFFTTGSD SESESSLSGE ELVTKPVGGN YGKQPLLLSE DEEDTKRVVR SAKDKRFEEL TNLIRTIRNA MKIRDVTKCL EEFELLGKA YGKAKSIVDK EGVPRFYIRI LADLEDYLNE LWEDKEGKKK MNKNNAKALS TLRQKIRKYN KGTEITHAVV I KKLNEILQ ARGKKGTDRA AQIELLQLLV QIAAENNLGE GVIVKIKFNI IASLYDYNPN LATYMKPEMW GKCLDCINEL MD ILFANPN IFVGENILEE SENLHNADQP LRVRGCILTL VERMDEEFTK IMQNTDPHSQ EYVEHLKDEA QVCAIIERVQ RYL EEKGTT EEVCRIYLLR ILHTYYKFDY KAHQRQLTPP EGSSKSEQDQ AENEGEDSAV LMERLCKYIY AKDRTDRIRT CAIL CHIYH HALHSRWYQA RDLMLMSHLQ DNIQHADPPV QILYNRTMVQ LGICAFRQGL TKDAHNALLD IQSSGRAKEL LGQGL LLRS LQERNQEQEK VERRRQVPFH LHINLELLEC VYLVSAMLLE IPYMAAHESD ARRRMISKQF HHQLRVGERQ PLLGPP ESM REHVVAASKA MKMGDWKTCH SFIINEKMNG KVWDLFPEAD KVRTMLVRKI QEESLRTYLF TYSSVYDSIS METLSDM FE LDLPTVHSII SKMIINEELM ASLDQPTQTV VMHRTEPTAQ QNLALQLAEK LGSLVENNER VFDHKQGTYG GYFRDQKD G YRKNEGYMRR GGYRQQQSQT AY

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

+
分子 #40: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 50.43868 KDa
配列文字列: AEYDLTTRIA HFLDRHLVFP LLEFLSVKEI YNEKELLQGK LDLLSDTNMV DFAMDVYKNL YSDDIPHALR EKRTTVVAQL KQLQAETEP IVKMFEDPET TRQMQSTRDG RMLFDYLADK HGFRQEYLDT LYRYAKFQYE CGNYSGAAEY LYFFRVLVPA T DRNALSSL ...文字列:
AEYDLTTRIA HFLDRHLVFP LLEFLSVKEI YNEKELLQGK LDLLSDTNMV DFAMDVYKNL YSDDIPHALR EKRTTVVAQL KQLQAETEP IVKMFEDPET TRQMQSTRDG RMLFDYLADK HGFRQEYLDT LYRYAKFQYE CGNYSGAAEY LYFFRVLVPA T DRNALSSL WGKLASEILM QNWDAAMEDL TRLKETIDNN SVSSPLQSLQ QRTWLIHWSL FVFFNHPKGR DNIIDLFLYQ PQ YLNAIQT MCPHILRYLT TAVITNKDVR KRRQVLKDLV KVIQQESYTY KDPITEFVEC LYVNFDFDGA QKKLRECESV LVN DFFLVA CLEDFIENAR LFIFETFCRI HQCISINMLA DKLNMTPEEA ERWIVNLIRN ARLDAKIDSK LGHVVMGNNA VSPY QQVIE KTKSLSFRSQ MLAMNIEKKL NQNS

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E

+
分子 #41: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ubiquitinyl hydrolase 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.836004 KDa
配列文字列: GRVVRLHPVI LASIVDSYER RNEGAARVIG TLLGTVDKHS VEVTNCFSVP HNESEDEVAV DMEFAKNMYE LHKKVSPNEL ILGWYATGH DITEHSVLIH EYYSREAPNP IHLTVDTSLQ NGRMSIKAYV STLMGVPGRT MGVMFTPLTV KYAYYDTERI G VDLIMKTC ...文字列:
GRVVRLHPVI LASIVDSYER RNEGAARVIG TLLGTVDKHS VEVTNCFSVP HNESEDEVAV DMEFAKNMYE LHKKVSPNEL ILGWYATGH DITEHSVLIH EYYSREAPNP IHLTVDTSLQ NGRMSIKAYV STLMGVPGRT MGVMFTPLTV KYAYYDTERI G VDLIMKTC FSPNRVIGLS SDLQQVGGAS ARIQDALSTV LQYAEDVLSG KVSADNTVGR FLMSLVNQVP KIVPDDFETM LN SNINDLL MVTYLANLTQ SQIALNEKLV NL

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F

+
分子 #42: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 36.960078 KDa
配列文字列: AVKQVQIDGL VVLKIIKHYQ EEGQGTEVVQ GVLLGLVVED RLEITNCFPF PQHTEDDADF DEVQYQMEMM RSLRHVNIDH LHVGWYQST YYGSFVTRAL LDSQFSYQHA IEESVVLIYD PIKTAQGSLS LKAYRLTPKL MEVCKEKDFS PEALKKANIT F EYMFEEVP ...文字列:
AVKQVQIDGL VVLKIIKHYQ EEGQGTEVVQ GVLLGLVVED RLEITNCFPF PQHTEDDADF DEVQYQMEMM RSLRHVNIDH LHVGWYQST YYGSFVTRAL LDSQFSYQHA IEESVVLIYD PIKTAQGSLS LKAYRLTPKL MEVCKEKDFS PEALKKANIT F EYMFEEVP IVIKNSHLIN VLMWELEKKS AVADKHELLS LASSNHLGKN LQLLMDRVDE MSQDIVKYNT YMRNTSKQQQ QK HQYQQRR QQENMQRQSR GEPPLPEEDL SKLFKPPQPP ARMDSLLIAG QINTYCQNIK EFTAQNLGKL FMAQALQEYN N

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H

+
分子 #43: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K
タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 24.952424 KDa
配列文字列: AMFEQMRANV GKLLKGIDRY NPENLATLER YVETQAKENA YDLEANLAVL KLYQFNPAFF QTTVTAQILL KALTNLPHTD FTLCKCMID QAHQEERPIR QILYLGDLLE TCHFQAFWQA LDENMDLLEG ITGFEDSVRK FICHVVGITY QHIDRWLLAE M LGDLSDSQ ...文字列:
AMFEQMRANV GKLLKGIDRY NPENLATLER YVETQAKENA YDLEANLAVL KLYQFNPAFF QTTVTAQILL KALTNLPHTD FTLCKCMID QAHQEERPIR QILYLGDLLE TCHFQAFWQA LDENMDLLEG ITGFEDSVRK FICHVVGITY QHIDRWLLAE M LGDLSDSQ LKVWMSKYGW SADESGQIFI CSQEESIKPK NIVEKIDFDS VSSIMASSQ

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K

+
分子 #44: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 44.172688 KDa
配列文字列: QWLWDIIDEF IYQFQSFSQY RCKTAKKSEE EIDFLRSNPK IWNVHSVLNV LHSLVDKSNI NRQLEVYTSG GDPESVAGEY GRHSLYKML GYFSLVGLLR LHSLLGDYYQ AIKVLENIEL NKKSMYSRVP ECQVTTYYYV GFAYLMMRRY QDAIRVFANI L LYIQRTKS ...文字列:
QWLWDIIDEF IYQFQSFSQY RCKTAKKSEE EIDFLRSNPK IWNVHSVLNV LHSLVDKSNI NRQLEVYTSG GDPESVAGEY GRHSLYKML GYFSLVGLLR LHSLLGDYYQ AIKVLENIEL NKKSMYSRVP ECQVTTYYYV GFAYLMMRRY QDAIRVFANI L LYIQRTKS MFQRTTYKYE MINKQNEQMH ALLAIALTMY PMRIDESIHL QLREKYGDKM LRMQKGDPQV YEELFSYSCP KF LSPVVPN YDNVHPNYHK EPFLQQLKVF SDEVQQQAQL STIRSFLKLY TTMPVAKLAG FLDLTEQEFR IQLLVFKHKM KNL VWTSGI SALDGEFQSA SEVDFYIDKD MIHIADTKVA RRYGDFFIRQ IHKFEE

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L

+
分子 #45: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M
タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 41.278391 KDa
配列文字列: EEDQAAELRA YLKSKGAEIS EENSEGGLHV DLAQIIEACD VCLKEDDKDV ESVMNSVVSL LLILEPDKQE ALIESLCEKL VKFREGERP SLRLQLLSNL FHGMDKNTPV RYTVYCSLIK VAASCGAIQY IPTELDQVRK WISDWNLTTE KKHTLLRLLY E ALVDCKKS ...文字列:
EEDQAAELRA YLKSKGAEIS EENSEGGLHV DLAQIIEACD VCLKEDDKDV ESVMNSVVSL LLILEPDKQE ALIESLCEKL VKFREGERP SLRLQLLSNL FHGMDKNTPV RYTVYCSLIK VAASCGAIQY IPTELDQVRK WISDWNLTTE KKHTLLRLLY E ALVDCKKS DAASKVMVEL LGSYTEDNAS QARVDAHRCI VRALKDPNAF LFDHLLTLKP VKFLEGELIH DLLTIFVSAK LA SYVKFYQ NNKDFIDSLG LLHEQNMAKM RLLTFMGMAV ENKEISFDTM QQELQIGADD VEAFVIDAVR TKMVYCKIDQ TQR KVVVSH STHRTFGKQQ WQQLYDTLNA WKQNLNKVKN SLLSLS

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M

+
分子 #46: ATP-binding cassette sub-family E member 1

分子名称: ATP-binding cassette sub-family E member 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 66.972789 KDa
配列文字列: KLTRIAIVNH DKCKPKKCRQ ECKKSCPVVR MGKLCIEVTP QSKIAWISET LCIGCGICIK KCPFGALSIV NLPSNLEKET THRYCANAF KLHRLPIPRP GEVLGLVGTN GIGKSTALKI LAGKQKPNLG KYDDPPDWQE ILTYFRGSEL QNYFTKILED D LKAIIKPQ ...文字列:
KLTRIAIVNH DKCKPKKCRQ ECKKSCPVVR MGKLCIEVTP QSKIAWISET LCIGCGICIK KCPFGALSIV NLPSNLEKET THRYCANAF KLHRLPIPRP GEVLGLVGTN GIGKSTALKI LAGKQKPNLG KYDDPPDWQE ILTYFRGSEL QNYFTKILED D LKAIIKPQ YVDQIPKAAK GTVGSILDRK DETKTQAIVC QQLDLTHLKE RNVEDLSGGE LQRFACAVVC IQKADIFMFD EP SSYLDVK QRLKAAITIR SLINPDRYII VVEHDLSVLD YLSDFICCLY GVPSAYGVVT MPFSVREGIN IFLDGYVPTE NLR FRDASL VFKVAETANE EEVKKMCMYK YPGMKKKMGE FELAIVAGEF TDSEIMVMLG ENGTGKTTFI RMLAGRLKPD EGGE VPVLN VSYKPQKISP KSTGSVRQLL HEKIRDAYTH PQFVTDVMKP LQIENIIDQE VQTLSGGELQ RVALALCLGK PADVY LIDE PSAYLDSEQR LMAARVVKRF ILHAKKTAFV VEHDFIMATY LADRVIVFDG VPSKNTVANS PQTLLAGMNK FLSQLE ITF RRDPNNYRPR INKLNSIKDV EQKKSGNYFF LD

UniProtKB: ATP-binding cassette sub-family E member 1

+
分子 #47: Eukaryotic translation initiation factor 1

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 10.388935 KDa
配列文字列:
LPAGTEDYIH IRIQQRNGRK TLTTVQGIAD DYDKKKLVKA FKKKFACNGT VIEHPEYGEV IQLQGDQRKN ICQFLVEIGL AKDDQLKVH GF

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 1

+
分子 #48: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D
タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 61.489441 KDa
配列文字列: MAKFMTPVIQ DNPSGWGPCA VPEQFRDMPY QPFSKGDRLG KVADWTGATY QDKRYTNKYS SQFGGGSQYA YFHEEDESSF QLVDTARTQ KTAYQRNRMR FAQRNLRRDK DRRNMLQFNL QILPKSAKQK ERERIRLQKK FQKQFGVRQK WDQKSQKPRD S SVEVRSDW ...文字列:
MAKFMTPVIQ DNPSGWGPCA VPEQFRDMPY QPFSKGDRLG KVADWTGATY QDKRYTNKYS SQFGGGSQYA YFHEEDESSF QLVDTARTQ KTAYQRNRMR FAQRNLRRDK DRRNMLQFNL QILPKSAKQK ERERIRLQKK FQKQFGVRQK WDQKSQKPRD S SVEVRSDW EVKEEMDFPQ LMKMRYLEVS EPQDIECCGA LEYYDKAFDR ITTRSEKPLR SIKRIFHTVT TTDDPVIRKL AK TQGNVFA TDAILATLMS CTRSVYSWDI VVQRVGSKLF FDKRDNSDFD LLTVSETANE PPQDEGNSFN SPRNLAMEAT YIN HNFSQQ CLRMGKERYN FPNPNPFVED DMDKNEIASV AYRYRRWKLG DDIDLIVRCE HDGVMTGANG EVSFINIKTL NEWD SRHCN GVDWRQKLDS QRGAVIATEL KNNSYKLARW TCCALLAGSE YLKLGYVSRY HVKDSSRHVI LGTQQFKPNE FASQI NLSV ENAWGILRCV IDICMKLEEG KYLILKDPNK QVIRVYSLPD GTF

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D

+
分子 #49: RNA recognition motif (unknown)

分子名称: RNA recognition motif (unknown) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 5.562077 KDa
配列文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAA

+
分子 #50: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J
タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.108453 KDa
配列文字列: MAAAAAAAGD SDSWDADAFS VEDPVRKVGG GGTAGGDRWE GEDEDEDVKD NWDDDDDEKK EEAEVKPEVK ISEKKKIAEK IKEKERQQK KRQEEIKKRL EEPEEPKVLT PEEQLADKLR LKKLQEESDL ELAKETFGVN NAVYGIDAMN PSSRDDFTEF G KLLKDKIT ...文字列:
MAAAAAAAGD SDSWDADAFS VEDPVRKVGG GGTAGGDRWE GEDEDEDVKD NWDDDDDEKK EEAEVKPEVK ISEKKKIAEK IKEKERQQK KRQEEIKKRL EEPEEPKVLT PEEQLADKLR LKKLQEESDL ELAKETFGVN NAVYGIDAMN PSSRDDFTEF G KLLKDKIT QYEKSLYYAS FLEVLVRDVC ISLEIDDLKK ITNSLTVLCS EKQKQEKQSK AKKKKKGVVP GGGLKATMKD DL ADYGGYD GGYVQDYEDF M

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J

+
分子 #20: 18S ribosomal RNA

分子名称: 18S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 20 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 555.210688 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GUACUUGGAU AACUGUGGUA AUUCUAGAGC U AAUACAUG ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GUACUUGGAU AACUGUGGUA AUUCUAGAGC U AAUACAUG CCGACGGGCG CUGACCCCCU UCGCGGGGGG GAUGCGUGCA UUUAUCAGUG GUGACUCUAG AUAACCUCGG GC CGAUCGC ACGCCGCGGC GACGACCCAU UCGAACGUCU GCCCUAUCAA CUUUCGAUGG UAGUCGCCGU GCCUACCAUG GUG ACCACG GGUGACGGGG AAUCAGGGUU CGAUUCCGGA GAGGGAGCCU GAGAAACGGC UACCACAUCC AAGGAAGGCA GCAG GCGCG CAAAUUACCC ACUCCCGACC CGGGGAGGUA GUGACGAAAA AUAACAAUAC AGGACUCUUU CGAGGCCCUG UAAUU GGAA UGAGUCCACU UUAAAUCCUU UAACGAGGAU CCAUUGGAGG GCAAGUCUGG UGCCAGCAGC CGCGGUAAUU CCAGCU CCA AUAGCGUAUA UUAAAGUUGC UGCAGUUAAA AAGCUCGUAG UUGGAUCUUG GGAGCGGGCG GGCGGUCCGC CGCGAGG CG AGCCACCGCC CGUCCCCGCC UCUCGGCCGA AGCGUUUACU UUGAAAAAAU UAGAGUGUUC AAAGCAGGCC GCCUGGAU A CCGCAGCUAG GAAUAAUGGA AUAGGACCGC GGUUCUAUUU UGUUGGUUUU CGGAACUGAG GCCAUGAUUA AGAGGGACG GCCGGGGGCA UUCGUAUUGC GCCGCUAGAG GUGAAAUUCU UGGACCGGCG CAAGACGGAC CAGAGCGAAA GCAUUUGCCA AGAAUGUUU UCAUUAAUCA AGAACGAAAG UCGGAGGUUC GAAGACGAUC AGAUACCGUC GUAGUUCCGA CCAUAAACGA U GCCGACCG GCGAUGCGGC GGCGUUAUUC CCAUGACCCG CCGGGCAGCU UCCGGGAAAC CAAAGUCUUU GGGUUCCGGG GG GAGUAUG GUUGCAAAGC UGAAACUUAA AGGAAUUGAC GGAAGGGCAC CACCAGGAGU GGAGCCUGCG GCUUAAUUUG ACU CAACAC GGGAAACCUC ACCCGGCCCG GACACGGACA GGAUUGACAG AUUGAUAGCU CUUUCUCGAU UCCGUGGGUG GUGG UGCAU GGCCGUUCUU AGUUGGUGGA GCGAUUUGUC UGGUUAAUUC CGAUAACGAA CGAGACUCUG GCAUGCUAAC UAGUU ACGC GACCGGUCGG CGUAACUUCU UAGAGGGACA AGUGGCGUUC AGCCACCCGA GAUUGAGCAA UAACAGGUCU GUGAUG CCC UUAGAUGUCC GGGGCUGCAC GCGCGCUACA CUGACUGGCU CAGCGUGUGC CUACCCUACG CCGGCAGGCG CGGGUAA CC CGUUGAACCC CAUUCGUGAU GGGGAUCGGG GAUUGCAAUU AUUCCCCAUG AACGAGGAAU UCCCAGUAAG UGCGGGUC A UAAGCUUGCG UUGAUUAAGU CCCUGCCCUU UGUACACACC GCCCGUCGCU ACUACCGAUU GGAUGGUUUA GUGAGGCCC UCGGAUCGGC CCCGCCGGGG UGCCCUGGCG GAGCGCUGAG AAGACGGUCG AACUUGACUA UCUAGAGGAA GUAAAAGUCG UAACAAGGU UUCCGUAGGU AAACCUGCGG AAGGAUCAUU A

+
分子 #51: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 3 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #52: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 2 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄

+
分子 #53: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 1 / 式: ADP
分子量理論値: 427.201 Da
Chemical component information

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

+
分子 #54: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 2 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #55: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 1 / 式: ATP
分子量理論値: 507.181 Da
Chemical component information

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
平均電子線量: 48.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 5231
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

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お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る