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- EMDB-10654: Structure of the plant mitochondrial ribosome -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-10654
タイトルStructure of the plant mitochondrial ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: The large mitoribosomal subunit of the Plant mitoribosome
    • タンパク質・ペプチド: x 86種
    • RNA: x 3種
キーワードRibosome / Mitochondria / Plant
機能・相同性
機能・相同性情報


embryo sac central cell differentiation / endosperm cellularization / gametophyte development / pollen tube development / endosperm development / polar nucleus fusion / regulation of starch biosynthetic process / pollen germination / double fertilization forming a zygote and endosperm / 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase activity ...embryo sac central cell differentiation / endosperm cellularization / gametophyte development / pollen tube development / endosperm development / polar nucleus fusion / regulation of starch biosynthetic process / pollen germination / double fertilization forming a zygote and endosperm / 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase activity / embryo sac development / nucleus localization / pollen development / karyogamy / regulation of programmed cell death / embryo development ending in seed dormancy / cell communication / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3価のアルコールのエステル加水分解酵素 / vacuole organization / plant-type vacuole / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial ribosome / mitochondrial small ribosomal subunit / mitochondrial membrane organization / mitochondrial translation / plastid / translation elongation factor activity / aminopeptidase activity / cytosolic ribosome / response to cold / chloroplast / trans-Golgi network / regulation of translation / large ribosomal subunit / ribosomal small subunit biogenesis / regulation of gene expression / small ribosomal subunit / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / transcription cis-regulatory region binding / endosome / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / mitochondrial matrix / translation / copper ion binding / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / Golgi apparatus / mitochondrion / RNA binding / nucleus / plasma membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Mitochondrial ribosomal protein S7, plants / Ribosomal protein S3, mitochondrial, plant / : / IMS import disulfide relay-system, CHCH-CHCH-like Cx9C / CHCH-CHCH-like Cx9C, IMS import disulfide relay-system, / : / : / 30S ribosomal protein S31, plant / Ribosomal protein S31e / : ...Mitochondrial ribosomal protein S7, plants / Ribosomal protein S3, mitochondrial, plant / : / IMS import disulfide relay-system, CHCH-CHCH-like Cx9C / CHCH-CHCH-like Cx9C, IMS import disulfide relay-system, / : / : / 30S ribosomal protein S31, plant / Ribosomal protein S31e / : / PPR repeat / Ribosomal protein MRP10, mitochondrial / Eukaryotic mitochondrial regulator protein / Enoyl-CoA hydratase/isomerase, HIBYL-CoA-H type / Small ribosomal subunit protein mS41 SAM domain / PPR repeat family / Enoyl-CoA hydratase/isomerase domain / Enoyl-CoA hydratase/isomerase / IGR protein motif / IGR / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / : / Pentatricopeptide repeat domain / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Ribosomal protein S27/S33, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal subunit S27 / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial, conserved domain / Mitochondrial ribosomal subunit protein / Pentatricopeptide (PPR) repeat profile. / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein S23/S29, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal death-associated protein 3 / Pentatricopeptide repeat / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / : / Mitochondrial ribosomal protein L27 / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / 30S ribosomal protein / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / : / Coiled coil-helix-coiled coil-helix (CHCH) domain profile. / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / ClpP/crotonase-like domain superfamily / Ribosomal protein L11, bacterial-type / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / : / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / RNA recognition motif / RNA recognition motif / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein mL43 / Ribosomal protein S21 family protein / Large ribosomal subunit protein mL101 (rPPR4) / At1g24240/F3I6_17 / At4g22000 / Small ribosomal subunit protein mS80 (rPPR6) / Small ribosomal subunit protein uS19m / Large ribosomal subunit protein uL5m / Small ribosomal subunit protein uS10m ...Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein mL43 / Ribosomal protein S21 family protein / Large ribosomal subunit protein mL101 (rPPR4) / At1g24240/F3I6_17 / At4g22000 / Small ribosomal subunit protein mS80 (rPPR6) / Small ribosomal subunit protein uS19m / Large ribosomal subunit protein uL5m / Small ribosomal subunit protein uS10m / Small ribosomal subunit protein uS12m / Small ribosomal subunit protein uS7m / Large ribosomal subunit protein uL2mz, N-terminal part / Ribosomal protein L31 / IMS import disulfide relay-system CHCH-CHCH-like Cx9C domain-containing protein / Adenylyl cyclase / Small ribosomal subunit protein uS4m / Large ribosomal subunit protein uL22c / At1g64880 / At5g26800 / At1g01640 / Small ribosomal subunit protein mS33 / Small ribosomal subunit protein uS9m / At1g14620/T5E21_15 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Ribosomal protein L35 / 50S ribosomal protein L20 / At5g09770 / At5g27820 / Small ribosomal subunit protein mS47 / Large ribosomal subunit protein uL4m / Small ribosomal subunit protein uS11m / Large ribosomal subunit protein uL2my, C-terminal part / Ribosomal protein / Small ribosomal subunit protein mS29 / Large ribosomal subunit protein uL14mz / Large ribosomal subunit protein mL53 / Large ribosomal subunit protein bL32m / AT5g49210/K21P3_8 / Uncharacterized protein At1g27435/F17L21.30 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Small ribosomal subunit protein uS3m / At1g73940/F2P9_19 / Small ribosomal subunit protein uS13m / 28S ribosomal S34 protein / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain-containing protein / Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein / Small ribosomal subunit protein mL104 (rPPR9) / Small ribosomal subunit protein uS2m / 50S ribosomal protein L10 / AT3g18240 / Small ribosomal subunit protein bS18c / Small ribosomal subunit protein uS15c / Large ribosomal subunit protein uL3m / Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein / 50S ribosomal protein L24 / Small ribosomal subunit protein bS16m/bS16c / At5g40080 / Small ribosomal subunit protein mS75 / Large ribosomal subunit protein bL9c / Small ribosomal subunit protein uS8my / At4g05400 / At3g51010 / Small ribosomal subunit protein bTHXm / Large ribosomal subunit protein uL23m / Small ribosomal subunit protein uS14m / 50S ribosomal protein L33, chloroplastic / AT4g31460/F3L17_30 / At4g35490 / Small ribosomal subunit protein uS17c / Putative ribosomal protein L6 / 50S ribosomal protein L27
類似検索 - 構成要素
生物種Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.86 Å
データ登録者Soufari H / Waltz F / Giege P / Hashem Y
資金援助 フランス, 1件
OrganizationGrant number
French National Research AgencyMITRA, ANR-16-CE11-0024-02 フランス
引用ジャーナル: Nat Plants / : 2020
タイトル: Cryo-EM structure of the RNA-rich plant mitochondrial ribosome.
著者: Florent Waltz / Heddy Soufari / Anthony Bochler / Philippe Giegé / Yaser Hashem /
要旨: The vast majority of eukaryotic cells contain mitochondria, essential powerhouses and metabolic hubs. These organelles have a bacterial origin and were acquired during an early endosymbiosis event. ...The vast majority of eukaryotic cells contain mitochondria, essential powerhouses and metabolic hubs. These organelles have a bacterial origin and were acquired during an early endosymbiosis event. Mitochondria possess specialized gene expression systems composed of various molecular machines, including the mitochondrial ribosomes (mitoribosomes). Mitoribosomes are in charge of translating the few essential mRNAs still encoded by mitochondrial genomes. While chloroplast ribosomes strongly resemble those of bacteria, mitoribosomes have diverged significantly during evolution and present strikingly different structures across eukaryotic species. In contrast to animals and trypanosomatids, plant mitoribosomes have unusually expanded ribosomal RNAs and have conserved the short 5S rRNA, which is usually missing in mitoribosomes. We have previously characterized the composition of the plant mitoribosome, revealing a dozen plant-specific proteins in addition to the common conserved mitoribosomal proteins. In spite of the tremendous recent advances in the field, plant mitoribosomes remained elusive to high-resolution structural investigations and the plant-specific ribosomal features of unknown structures. Here, we present a cryo-electron microscopy study of the plant 78S mitoribosome from cauliflower at near-atomic resolution. We show that most of the plant-specific ribosomal proteins are pentatricopeptide repeat proteins (PPRs) that deeply interact with the plant-specific rRNA expansion segments. These additional rRNA segments and proteins reshape the overall structure of the plant mitochondrial ribosome, and we discuss their involvement in the membrane association and mRNA recruitment prior to translation initiation. Finally, our structure unveils an rRNA-constructive phase of mitoribosome evolution across eukaryotes.
履歴
登録2020年1月31日-
ヘッダ(付随情報) 公開2020年4月15日-
マップ公開2020年4月15日-
更新2024年11月6日-
現状2024年11月6日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図(断面を密度値に従い着色)
  • 表面レベル: 0.035
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-6xyw
  • 表面レベル: 0.035
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_10654.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

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明度
コントラスト
その他
Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.21 Å/pix.
x 400 pix.
= 484. Å
1.21 Å/pix.
x 400 pix.
= 484. Å
1.21 Å/pix.
x 400 pix.
= 484. Å

表面

投影像

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断面 (1/2)

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ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.21 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.035 / ムービー #1: 0.035
最小 - 最大-0.08221578 - 0.19612522
平均 (標準偏差)-0.00001545244 (±0.0109049175)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 484.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.211.211.21
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z484.000484.000484.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ350350350
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS400400400
D min/max/mean-0.0820.196-0.000

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添付データ

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添付マップデータ: emd 10654 additional 1.map

ファイルemd_10654_additional_1.map
投影像・断面図
ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

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添付マップデータ: emd 10654 additional 2.map

ファイルemd_10654_additional_2.map
投影像・断面図
ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

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試料の構成要素

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全体 : The large mitoribosomal subunit of the Plant mitoribosome

全体名称: The large mitoribosomal subunit of the Plant mitoribosome
要素
  • 複合体: The large mitoribosomal subunit of the Plant mitoribosome
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: At1g01640
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein HLP, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L16, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: At5g09770
    • タンパク質・ペプチド: At5g27820
    • タンパク質・ペプチド: At1g24240/F3I6_17
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: AT1G52370 protein
    • タンパク質・ペプチド: Expressed protein
    • タンパク質・ペプチド: At4g39880
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: AT4g31460/F3L17_30
    • タンパク質・ペプチド: At1g07830/F24B9_7
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: At1g26740/T24P13_11
    • タンパク質・ペプチド: At3g06320
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3-2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: At4g05400
    • タンパク質・ペプチド: At5g40080
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L51/S25/CI-B8 family protein
    • タンパク質・ペプチド: At1g14620/T5E21_15
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein
    • タンパク質・ペプチド: At4g22000
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein At1g27435/F17L21.30
    • タンパク質・ペプチド: At1g73940/F2P9_19
    • タンパク質・ペプチド: At3g51010
    • タンパク質・ペプチド: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: rPPR*
    • タンパク質・ペプチド: Pentatricopeptide repeat-containing protein PNM1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: UNK-6
    • RNA: RNA (2842-MER)
    • RNA: RNA (118-MER)
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S7, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein S13, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: At2g34520
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial 28S ribosomal protein S29-like protein
    • タンパク質・ペプチド: 37S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: AT3G18240 protein
    • タンパク質・ペプチド: CX9C domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S31, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g02650, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: UNK-5
    • タンパク質・ペプチド: mS31/mS46
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: At1g64880
    • タンパク質・ペプチド: Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a-5
    • タンパク質・ペプチド: Probable ribosomal protein S11, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: At1g15810/F7H2_23
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16-2, chloroplastic/mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein
    • タンパク質・ペプチド: F10K1.8 protein
    • タンパク質・ペプチド: Putative ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S21 family protein
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: AT5g49210/K21P3_8
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal S34 protein
    • タンパク質・ペプチド: mS38
    • タンパク質・ペプチド: At5g26800
    • タンパク質・ペプチド: Gb|AAC32909.1
    • タンパク質・ペプチド: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: rPPR*
    • タンパク質・ペプチド: rPPR*
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L9/RNase H1
    • タンパク質・ペプチド: Adenylyl cyclase
    • タンパク質・ペプチド: UNK-3
    • タンパク質・ペプチド: UNK-2
    • タンパク質・ペプチド: UNK-4
    • タンパク質・ペプチド: UNK-1
    • RNA: RNA (1743-MER)
    • タンパク質・ペプチド: At5g55140
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: rPPR*
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S12, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: At4g35490

+
超分子 #1: The large mitoribosomal subunit of the Plant mitoribosome

超分子名称: The large mitoribosomal subunit of the Plant mitoribosome
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0
含まれる分子: #1, #10-#19, #2, #20-#29, #3, #30-#39, #4, #40-#49, #5, #50-#59, #6, #60-#69, #7, #70-#79, #8, #80-#89, #9
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)

+
分子 #1: 60S ribosomal protein L2, mitochondrial

分子名称: 60S ribosomal protein L2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 37.982258 KDa
配列文字列: MRPGRARALR QFTLSTGKSA GRNSSGRITV FHRGGGSKRL LRRIDLKRST SSMGIVESIE YDPNRSSQIA PVRWIKGGCQ KKMNTIEKF APPRKILEPT TNTISGLFSF SFLPGKVDKR KVACFSPGLM AAYVVVGLPT GMPPLSSSKS AFASKGAGST K TLVKDVFF ...文字列:
MRPGRARALR QFTLSTGKSA GRNSSGRITV FHRGGGSKRL LRRIDLKRST SSMGIVESIE YDPNRSSQIA PVRWIKGGCQ KKMNTIEKF APPRKILEPT TNTISGLFSF SFLPGKVDKR KVACFSPGLM AAYVVVGLPT GMPPLSSSKS AFASKGAGST K TLVKDVFF SAFSSPKAKR ETASLAFASS FGFPRIAVAG AKPAFFAPRM RQKVRGKSTF SLCEVQKGRT HSILWAHRIK GK AGLSWQS FRRQDTLGLV GAAGHKKSKP KTDQGNLPAK PIGERAKQLK ALRGLRAKDG ACKVDRAPVT YIIASHQLEA GKM VMNCDW SKPSTSSFLQ SAQNDHPKPL FTV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2mz, N-terminal part

+
分子 #2: Expressed protein

分子名称: Expressed protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 22.884924 KDa
配列文字列: MSGLVALCRA RASASSSLFN SVIRPAFRNF STGFADTQNK SLVAQMKEEM LHMDINSMIG SSMPLGMMRI GTIIHNIEMN PGQGAKMVR AAGTNAKILK EPAKGKCLIK LPSGDTKWIN AKCRATIGTV SNPSHGTKKL YKAGQSRWLG IRPKVRGVAM N PCDHPHGG ...文字列:
MSGLVALCRA RASASSSLFN SVIRPAFRNF STGFADTQNK SLVAQMKEEM LHMDINSMIG SSMPLGMMRI GTIIHNIEMN PGQGAKMVR AAGTNAKILK EPAKGKCLIK LPSGDTKWIN AKCRATIGTV SNPSHGTKKL YKAGQSRWLG IRPKVRGVAM N PCDHPHGG GEGKSKSSGS RGRTSVSPWG KPCKGGYKSA SVKKKKKRLA EAAAKM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2my, C-terminal part

+
分子 #3: 50S ribosomal protein L3-2, mitochondrial

分子名称: 50S ribosomal protein L3-2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 35.456988 KDa
配列文字列: MAAVPRGLLS RINQFLSIRS ITPSSSESLP HCSSFFLIRR FSSDTGLMDG GGSDIIGAQT RIIEAKQGEM SSRSKRTGII AVKCGMTAL WDKWGKRIPI SILWVDDNIV SQVKTVEKEG IFALQIGCGQ KKPKHLSKAV VGHFRAQGVP LKRKLREFPV T EDALLPVG ...文字列:
MAAVPRGLLS RINQFLSIRS ITPSSSESLP HCSSFFLIRR FSSDTGLMDG GGSDIIGAQT RIIEAKQGEM SSRSKRTGII AVKCGMTAL WDKWGKRIPI SILWVDDNIV SQVKTVEKEG IFALQIGCGQ KKPKHLSKAV VGHFRAQGVP LKRKLREFPV T EDALLPVG TSLGVRHFVP GQYVDVTGIT RGKGFQGCMK RHGFSGMPAS HGASLSHRSG GSTGQRDAPG KVFKGRKMAG RM GADQRTV KNVWVYKIDP ARNLMWVRGQ VPGAEGNFVF IKDAWCKKPD ISKLPFPTYL APEDEDPSEL EPLVADLGEV DPF MLAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3m

+
分子 #4: Ribosomal protein L35

分子名称: Ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 20.109689 KDa
配列文字列:
MQRFCTKLRS ISLQSNRNLS FYGASPHRLI HHSPSPSRHL TTTTLGFANS TKWSFVPAAG VFPSNVSSMG TTFVPHHFVQ VRNITSKEK MAKWKKKWRP RTPITSKVKK VKIKFYSSFK DRFKPLNDGT IRRWKEGKRH NAHLKSKKSK RRLRQPGLVP P AYAKVMKK LNFCN

UniProtKB: Ribosomal protein L35

+
分子 #5: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 33.315461 KDa
配列文字列: MAASISRRIF RTFGSFSALG RSSSPNLSAN TSGNGLASLT NDLKYGMALL SNRKLSTSIL TPDDSFPSDL LTKKTVLTPD RTIGQYQDL VIPVTNFQNE EKGFMVLAGD VFDVPIRKDI IHNVVRWQLA KRQQGTHSTK TLSEVSGTGR KPWNQKGTGR A RHGTLRGP ...文字列:
MAASISRRIF RTFGSFSALG RSSSPNLSAN TSGNGLASLT NDLKYGMALL SNRKLSTSIL TPDDSFPSDL LTKKTVLTPD RTIGQYQDL VIPVTNFQNE EKGFMVLAGD VFDVPIRKDI IHNVVRWQLA KRQQGTHSTK TLSEVSGTGR KPWNQKGTGR A RHGTLRGP QFRGGCVMHG PKPRSHAIKM NKQVRRLGLK IALTARAAEG KLLVFDDLGL PTHKTKNIVN YYNQMENTKK VL VVEGGPI DEKLKLATQN LHYVNIIPSI GLNVYSILLH DTLLMSRDAV NKIVERMHTP INR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4m

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L5, mitochondrial

分子名称: 60S ribosomal protein L5, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 21.258312 KDa
配列文字列:
MFPLNFHYED VLRQDLLLKL NYANVMEVPG LCEIRVVPKA PYNFIIKNGK LAMEIPCGQK FIQTQRGSTG KSFRSNPFLG SNKDKGYVS DLARQSTLRG HGMSNFLVRI LTVMSLLDFP VEIRKNSIQF SMETEFCEFS PELEDHFEIF EHIRGFNVTI I TSANTQDE TLLLWSGFLQ KDEGETQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5m

+
分子 #7: Putative ribosomal protein L6

分子名称: Putative ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.612772 KDa
配列文字列:
MEAKFFRFLK IVGVGYKARA EEAGRFLYLK LGYSHEVELA VPPAVRVFCF KNNVVCCTGI DKQRVHQFAA TVRSCKPPEP YKGKGIMYT DEVVKKKQGK KSK

UniProtKB: Putative ribosomal protein L6

+
分子 #8: Ribosomal protein L9/RNase H1

分子名称: Ribosomal protein L9/RNase H1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 25.398654 KDa
配列文字列: MAYVGQSRNV IRHVVSRGTA YHKYENAIHH PLLFACQGVR YRKLEVILTT GIEKLGKAGE TVKVAPGYFR NHLMPKLLAV PNIDKYAYL IREQRKMYNH EEVKEEVKVV HKTSEVQTKE YEKAAKRLAN ANLVLRKLVD KEKFKNRSSK DDKPDVQTPI T KEEIVSEV ...文字列:
MAYVGQSRNV IRHVVSRGTA YHKYENAIHH PLLFACQGVR YRKLEVILTT GIEKLGKAGE TVKVAPGYFR NHLMPKLLAV PNIDKYAYL IREQRKMYNH EEVKEEVKVV HKTSEVQTKE YEKAAKRLAN ANLVLRKLVD KEKFKNRSSK DDKPDVQTPI T KEEIVSEV ARQLCVKIDP DNVVLAAPLE TFGEYEVPLK FPKTIPLPQG TVQWILKVKV RGH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9c

+
分子 #9: At4g35490

分子名称: At4g35490 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 16.910752 KDa
配列文字列:
MAAAAKEILR RPVAATIRLT VPAGGARPAP PVGPALGQYR LNLMAFCKDF NARTQKYKPD TPMAVTITAF KDNSFEFTVK SPTVSWYIK KAAGVDKGST RPGHLSVTTL SVRHVYEIAK VKQTDPFCQY MPLESICKSI IGTANSMGIK IVQDLE

UniProtKB: At4g35490

+
分子 #10: At1g01640

分子名称: At1g01640 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 23.42824 KDa
配列文字列: MATQAAAAAS FKGNLKKAVA GIKRINLDGL RWRVFDARGQ VLGRLASQIS TVLQAKDKPT YCPNRDDGDI CIVLNAKEIG FTGRKLTDK FYRWHTGYIG HLKERSLKDQ MAKDPTEVIR KAVWRMLPSN NLRDDRDRKL RIFEGGEHPF GDKPLEPFVM P PRRVREMR ...文字列:
MATQAAAAAS FKGNLKKAVA GIKRINLDGL RWRVFDARGQ VLGRLASQIS TVLQAKDKPT YCPNRDDGDI CIVLNAKEIG FTGRKLTDK FYRWHTGYIG HLKERSLKDQ MAKDPTEVIR KAVWRMLPSN NLRDDRDRKL RIFEGGEHPF GDKPLEPFVM P PRRVREMR PRARRAMIRA QKKAEQAENE GTEVKKGKKR TLSEVPA

UniProtKB: At1g01640

+
分子 #11: 50S ribosomal protein HLP, mitochondrial

分子名称: 50S ribosomal protein HLP, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 18.601754 KDa
配列文字列:
MAAAFASRLT RGGRSLLGGL NNGGSMNSSN GMMNESILSQ QQQRRTFIQM GTVLKVVDNS GAKKVMCIQA LKGKKGARLG DTIVASVKE AMPNGKVKKG AVVYGVVVRA AMQRGRVDGS EVRFDDNAVV LVDSKDKNTK TDRQPIGTRV FGPVPHELRK K KHLKILAL AQHVA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14mz

+
分子 #12: Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein

分子名称: Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 31.262771 KDa
配列文字列: MLRRRLLSII STSLINSSFH QTAKPRFIIS SPLLQCRPSP ISTQIPTSTS RALSFQGIRA YSLLSLNDLR DNVPRKLKTR KGRGIGSGK GKTAGRGHKG QKARGTMKFG FEGGQTPLRR RLPKRGFKNK FKLHFQPVGL GKIAKLINAG KIDSHELITM K TLKDVGAI ...文字列:
MLRRRLLSII STSLINSSFH QTAKPRFIIS SPLLQCRPSP ISTQIPTSTS RALSFQGIRA YSLLSLNDLR DNVPRKLKTR KGRGIGSGK GKTAGRGHKG QKARGTMKFG FEGGQTPLRR RLPKRGFKNK FKLHFQPVGL GKIAKLINAG KIDSHELITM K TLKDVGAI GKQIEDGVRL MGRGADDIKW PLHFEVSRVT VRAKEVVEAA GGSVRRVYYN KLGLRALLKP EWFEKKGRLL PK AARPPPK QQDKVDSIGR LPAPKKPIPF FAAEETKVES PVES

UniProtKB: Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L16, mitochondrial

分子名称: 60S ribosomal protein L16, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 20.132877 KDa
配列文字列:
MYLTIKSIML LWKYLLVTES QVSKCGFHIV KKKGDVLYPK RTKYSKYRKG RCSRGCKPDG TKLGFGRYGI KSCKAGCLSY RAIEAARRA IIGHFHRAMS GQFRRNGKIW VRVFADLPIT GKPTEVRMGR GKGNPTGWIA RVSTGQILFE MDGVSLANAR Q AATLAAHK LCLSTKFVQW S

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16m

+
分子 #14: At5g09770

分子名称: At5g09770 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 18.482443 KDa
配列文字列:
MTKFRKLGRP AGHRMSMLRT MVSQLVKHER IETTVTKAKE VRRLADNMIQ LGKEGSLSAA RRAAGFVRGD DVLHKIFTEL AHRYKDRAG GYTRLLRTRI RVGDAAPMAY IEFIDRENEL RQSKPATPQP PQRVPLDPWE RSRLTRQFAP PKEEKIPDSE L

UniProtKB: At5g09770

+
分子 #15: At5g27820

分子名称: At5g27820 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.762193 KDa
配列文字列:
MVIPPAVRPP RLFDYLKPYV LKMHFTNKFV HAQVIHSPTA TVACSASSQE KALRETMDIT RDVAAASKIG KILGERLLMK DIPAVTIQM KKEQRYHGKV KAVIDSVREA GVKLL

UniProtKB: At5g27820

+
分子 #16: At1g24240/F3I6_17

分子名称: At1g24240/F3I6_17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 25.113316 KDa
配列文字列: MQLIRGSTRL LQRHRFSISN TLPFTSSSCG SWSANESRKL GFDSFPSTRA ATYLISSLKN AGFSSLAVVP KQNFSSRCFS TTGDSVQGS PESDCVVPQR IKFKRLDKTA KHIMQIVDKE AVEEVRTLRE IPEIKPGYIV QLKVEVPENK RRVSIVKGVV I ARRNAGLN ...文字列:
MQLIRGSTRL LQRHRFSISN TLPFTSSSCG SWSANESRKL GFDSFPSTRA ATYLISSLKN AGFSSLAVVP KQNFSSRCFS TTGDSVQGS PESDCVVPQR IKFKRLDKTA KHIMQIVDKE AVEEVRTLRE IPEIKPGYIV QLKVEVPENK RRVSIVKGVV I ARRNAGLN STFRIRRLVA GVGVESMFPL YSPNLRVIKV VDKKKVRRAK LYYLREKVNA LKKH

UniProtKB: At1g24240/F3I6_17

+
分子 #17: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.754178 KDa
配列文字列:
MNKKEIFKLA KGFRGRAKNC IRIARERVEK ALQYSYRDRR NKKREMRGLW IERINAGSRQ HGVNYGNFIH GLMKENIQLN RKVLSELSM HEPYSFKALV DVSRKSFPGN KNVVQASRKV DISSINA

UniProtKB: 50S ribosomal protein L20

+
分子 #18: 50S ribosomal protein L21, mitochondrial

分子名称: 50S ribosomal protein L21, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 30.955697 KDa
配列文字列: MASLRCFREL SRRATTVFSI NQTRSISSFH GIEFSGTSIS HGTVIPNRSL TRNLPWYSHW YRSQDRCFSS NTKDTDEDEE SSEGEDDDE EEGEDFEDSA DMEVEREYSP AEKVEEAEEI GYKVMGPLKP SERLFKPYEP VFAIVQIGSH QFKVSNGDSI F TEKLKFCD ...文字列:
MASLRCFREL SRRATTVFSI NQTRSISSFH GIEFSGTSIS HGTVIPNRSL TRNLPWYSHW YRSQDRCFSS NTKDTDEDEE SSEGEDDDE EEGEDFEDSA DMEVEREYSP AEKVEEAEEI GYKVMGPLKP SERLFKPYEP VFAIVQIGSH QFKVSNGDSI F TEKLKFCD INDKLELTKV LLLGSASQTI IGRPILPDAT VHAVVEEHAL DEKVLIFKKK RRKNYRRTRG HRQELTKLRI TD IQGIEKP EPKIVHKPSK EAVTEQTKAE LVA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21m

+
分子 #19: AT1G52370 protein

分子名称: AT1G52370 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 30.21193 KDa
配列文字列: MAGWQKNLQI VIRQVGKRVK DSHISTANYS STRNLESPFS QGYLQSLLRS TYSSRPLYYH LQQLGISTSR QLQAGEEPVS SPLSSPALL GSGKEEEQKI IPKRQKVQAV LKSIKQSPKK VNLVAALVRG MRVEDALMQL QVTVKRASQT VYRVIHAARA N ATHNHGLD ...文字列:
MAGWQKNLQI VIRQVGKRVK DSHISTANYS STRNLESPFS QGYLQSLLRS TYSSRPLYYH LQQLGISTSR QLQAGEEPVS SPLSSPALL GSGKEEEQKI IPKRQKVQAV LKSIKQSPKK VNLVAALVRG MRVEDALMQL QVTVKRASQT VYRVIHAARA N ATHNHGLD PDRLLVAEAF VGKGLFGKKV AYHAKGRSGI ISIPRCRLTV IVRETTAEEE AEIARLKVHN FKKLNKRQRQ LV PHKLIET SPIWNRRGTK GNHRSSELVP SH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22c

+
分子 #20: At4g39880

分子名称: At4g39880 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 19.894172 KDa
配列文字列:
MGSRLGGRVV HFANLPIKLL MPAKLTNIHE FALKTIPSAS KIEIKRVLES LYGFDVEKVN TLNMDGKKKK RGGLLIAKAD YKKAYVTLR SPLSISRDLF PVKYIEEDRK SKVKGSSFVE EEDDKKSHWL DRKEKREIGG YGKGKGRRGG ERANSPTRGG A AAAGTAKF PWSNMRFVGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23m

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.531445 KDa
配列文字列:
MGWKAAEKLI RHWKILRGDN VMIIRGKDKG ETGTIKRVIR SQNRVIVEGK NLIKKHIKGG PDHEGGIFTV EAPLHASNVQ VVDPVTGRP CKVGVKYLED GTKVRVARGT GTSGSIIPRP EILKIRATPR PTTAGPKDTP MEFVWEQTYD AKTGKGMPDL

UniProtKB: 50S ribosomal protein L24

+
分子 #22: Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding dom...

分子名称: Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 27.376742 KDa
配列文字列: MAKWWRGLRS VTAEVADLPA SSFGRSIRCI HQYQTIQAIP REATGRGVSA RDRTIGRIPA VVFPQSLLDT DASKRGVSRK QLLTADKKQ IKSIIDSVGL PFFCSTTFQL QIRAGQGSST LVESGRVLPL KVHRDEETGK ILNLVFVWAD DGEKLKVDVP V VFKGLDHC ...文字列:
MAKWWRGLRS VTAEVADLPA SSFGRSIRCI HQYQTIQAIP REATGRGVSA RDRTIGRIPA VVFPQSLLDT DASKRGVSRK QLLTADKKQ IKSIIDSVGL PFFCSTTFQL QIRAGQGSST LVESGRVLPL KVHRDEETGK ILNLVFVWAD DGEKLKVDVP V VFKGLDHC PGLQKGGNLR TIRSTLKLLG PAEHIPSKIE VDVSNLDIED KVLLQDVVFH PSLKLLSKNE TMPVCKIVAT SP VKEPEAV QA

UniProtKB: Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain-containing protein

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 16.70926 KDa
配列文字列:
MNFLNSAASI CRRVSLRELI TEVPAYTGSS ISDGSSSGLS LVLKRWATKK TAGSTKNGRD SNPKFLGVKK FGGESVIPGN IIVRQRGTR FHPGDYVGIG KDHTLFALKE GRVRFEKSKI TGRKWIHVDP IGGHVLHPIY TKAAAAKSTK LNTAS

UniProtKB: 50S ribosomal protein L27

+
分子 #24: AT4g31460/F3L17_30

分子名称: AT4g31460/F3L17_30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 24.112625 KDa
配列文字列: MAFRGKEMMK KLVKKVGAEN ITPELKEKLK ACVPDTKVVM GRAKRGLYAG RHIQYGNRVS EDGGNKSRRC WKPNVQEKRL FSYIFDSHI KVKVTTHALR CIDKAGGIDE YLLKTPYQKM DTEMGLYWKT KVEARYAELG QMEVAFFNPE DEAKLEQGFK D LNIAKKDA ...文字列:
MAFRGKEMMK KLVKKVGAEN ITPELKEKLK ACVPDTKVVM GRAKRGLYAG RHIQYGNRVS EDGGNKSRRC WKPNVQEKRL FSYIFDSHI KVKVTTHALR CIDKAGGIDE YLLKTPYQKM DTEMGLYWKT KVEARYAELG QMEVAFFNPE DEAKLEQGFK D LNIAKKDA RREARRTFRK KGGGNKGDEE ASIEGGGGSE SHQEDDNGWL EAKA

UniProtKB: AT4g31460/F3L17_30

+
分子 #25: At1g07830/F24B9_7

分子名称: At1g07830/F24B9_7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 16.913553 KDa
配列文字列:
MFLTRFVGRR FLAAASARSE STTAAAAAST IRTPTNPLEE FFEFDRSQDE DKPVVYGRGW KASELRLKSW DDLQKLWYVL LKEKNMLMT QRQMLQAQNM QFPNPERIPK VRRSMCRIKH VLTERAIEEP DSRRSAEMKR MVNGM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29m

+
分子 #26: Ribosomal protein L31

分子名称: Ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.97231 KDa
配列文字列:
MKKGLHPQMQ WISYVTQSGR LMHVMMTRIH HVGKVYHFGA KRQMAQSIGQ IAKFKRRFNE QEAEAAEENN NENQNK

UniProtKB: Ribosomal protein L31

+
分子 #27: At1g26740/T24P13_11

分子名称: At1g26740/T24P13_11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.82358 KDa
配列文字列:
MALRLTSLKR AAVESCRILE TRSLSHVAAM PSPLNGAFDR PISMPPLVLP EFDQNQPGLI EEKSFGFGLP SFAFNGSMEL MAVPKKKIS KHKRGIRNGP KALKPVPVII RCRSCGRVKL PHFFCCSGER LNPTE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32m

+
分子 #28: At3g06320

分子名称: At3g06320 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 6.975366 KDa
配列文字列:
MGDKRKKTFM FIRLVSAAGT GFFYVKRKST KGLLEKLEFR KYDPRVNRHV LFTEQKMK

UniProtKB: 50S ribosomal protein L33, chloroplastic

+
分子 #29: Ribosomal protein

分子名称: Ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.452438 KDa
配列文字列:
MKVRSSVKKM CEFCKTVKRR GRVYVICSSN PKHKQRQGFS SFAYEGITPS PLFAEPIASQ ELVRLPGQGV SAGLASLLHK RPMPTAYFG WRSGLASILF KQGN

UniProtKB: Ribosomal protein

+
分子 #30: At4g05400

分子名称: At4g05400 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 27.67717 KDa
配列文字列: MIRVTKPKAI IESLSYHLIQ RCSASGTPKG KAKLKTGQPL KRNKLSIKKG GGGGGAPVEG EEAVKGKGRI SDEKQKLYEQ CLNAPCPVR YLTPQEIERE AQREKLGLIS KEKQRDMEIQ KKGGAASMGV TDEPMRIGTP GLDYISLGIF EAEELPKYKL T EEDGERLA ...文字列:
MIRVTKPKAI IESLSYHLIQ RCSASGTPKG KAKLKTGQPL KRNKLSIKKG GGGGGAPVEG EEAVKGKGRI SDEKQKLYEQ CLNAPCPVR YLTPQEIERE AQREKLGLIS KEKQRDMEIQ KKGGAASMGV TDEPMRIGTP GLDYISLGIF EAEELPKYKL T EEDGERLA KEYSKVLMRE HRERRAAETA LLNLKKSAIE ALPENLKKAA LEPDLTPFPA NRGMATLTPP IEGYLEKVMD AA KKSSSKE KLR

UniProtKB: At4g05400

+
分子 #31: At5g40080

分子名称: At5g40080 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 10.478173 KDa
配列文字列:
MTTIGGLLMG IGRSFRRKRA SSLDILSPKR APRDFYKGKN CKPTGFHTRK GGYVVQPDKL PNYVVPDLTG FKLKPYVSQC PLQVNTNES TEASK

UniProtKB: At5g40080

+
分子 #32: Mitochondrial ribosomal protein L51/S25/CI-B8 family protein

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L51/S25/CI-B8 family protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 16.667676 KDa
配列文字列:
MALRGVWQLK KLVVSYCNWG GSSRGIRAFM ESELPALKEK NPQLEVITEL SRGQHPYLKG IYSMYISPLL NTILIQRLLI LAISLAQFI GNRNERVVCV KNMDPEEVLL NATRLRNSLG RKVVKLRTRH VTKHPSVQGT WTTAVKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL43

+
分子 #33: At1g14620/T5E21_15

分子名称: At1g14620/T5E21_15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 27.178295 KDa
配列文字列: MPRSSLRLLA KPLLESRRGF CTSSDKIVAS VLFERLRVVI PKPDPAVYAF QEFKFNWQQQ FRRRYPDEFL DIAKNRAKGE YQMDYVPAP RITEADKNND RKSLYRALDK KLYLLIFGKP FGATSDKPVW HFPEKVYDSE PTLRKCAESA LKSVVGDLTH T YFVGNAPM ...文字列:
MPRSSLRLLA KPLLESRRGF CTSSDKIVAS VLFERLRVVI PKPDPAVYAF QEFKFNWQQQ FRRRYPDEFL DIAKNRAKGE YQMDYVPAP RITEADKNND RKSLYRALDK KLYLLIFGKP FGATSDKPVW HFPEKVYDSE PTLRKCAESA LKSVVGDLTH T YFVGNAPM AHMAIQPTEE MPDLPSYKRF FFKCSVVAAS KYDISNCEDF VWVTKDELLE FFPEQAEFFN KMIIS

UniProtKB: At1g14620/T5E21_15

+
分子 #34: 39S ribosomal protein

分子名称: 39S ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.456548 KDa
配列文字列:
MLKFLSKVRI EFNTLDPRLA SCVEFLAQCN ARKAKESNPN CQVLVKRRTD EQPPQITVTF VNGVEEAFDA AATSAQSIRK MILDKGQYL ETEQMFREAG EQWPVIIPDE ELLQEAPGVK PRKAEDKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL53

+
分子 #35: At4g22000

分子名称: At4g22000 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.492232 KDa
配列文字列:
MAGKAAEAVA KTVTGFQHPW RAKLDKYRTE LTKGVWGYWE MGAWKPLGIS ARRRAMLRKE VLTNGEDWPY DPERKAMRTK RKGHKCDRI SAEKRENTAK LMLKMPQMLL DYKKRRWEKK MKEEEKAKED K

UniProtKB: At4g22000

+
分子 #36: Uncharacterized protein At1g27435/F17L21.30

分子名称: Uncharacterized protein At1g27435/F17L21.30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.780123 KDa
配列文字列:
MGGGMGAFWG TRVMELVKKH DSGGLLWKRI KLTPTRKANA KTRLRRVWQN EAVLRACGES DAPNPPGASN TKSSSNAVKN A

UniProtKB: Uncharacterized protein At1g27435/F17L21.30

+
分子 #37: At1g73940/F2P9_19

分子名称: At1g73940/F2P9_19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.112168 KDa
配列文字列:
MWFAGGGGGL RKLCRASAIF DNEISYNSLL VRYMSRERAV NVRKINPKVP IQEAYAISNS LYDLFKLHGP LSVPNTWLRA QEAGVSGLN SKTHMKLLLK WMRGKKMLKL ICNQVGSSKK FFHTVLPEDP LQEQPAAPIE NKKQAVKKKR SK

UniProtKB: At1g73940/F2P9_19

+
分子 #38: At3g51010

分子名称: At3g51010 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 21.574365 KDa
配列文字列:
MGFGAIRSIL RPLSRTLVSR AVVNYSSAPF NATIPAAKPE LCSFFGGSMT HLRLPWIPMA NHFHSLSLTD TRLPKRRPMT HPKRKRSKL KPPGPYAYVQ YTPGQPISSN NPNEGSVKRR NAKKRIGQRR AFILSEKKKR QALVQEAKRK KRIKQVERKM A AVARDRAW AERLIELQQL EEEKKKSMSS

UniProtKB: At3g51010

+
分子 #39: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770

分子名称: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 55.981285 KDa
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MAMRHLSRSR DVTKRSTKKY IEEPLYNRLF KDGGTEVKVR QQLNQFLKGT KHVFKWEVGD TIKKLRNRGL YYPALKLSEV MEERGMNKT VSDQAIHLDL VAKAREITAG ENYFVDLPET SKTELTYGSL LNCYCKELLT EKAEGLLNKM KELNITPSSM S YNSLMTLY TKTGETEKVP AMIQELKAEN VMPDSYTYNV WMRALAATND ISGVERVIEE MNRDGRVAPD WTTYSNMASI YV DAGLSQK AEKALQELEM KNTQRDFTAY QFLITLYGRL GKLTEVYRIW RSLRLAIPKT SNVAYLNMIQ VLVKLNDLPG AET LFKEWQ ANCSTYDIRI VNVLIGAYAQ EGLIQKANEL KEKAPRRGGK LNAKTWEIFM DYYVKSGDMA RALECMSKAV SIGK GDGGK WLPSPETVRA LMSYFEQKKD VNGAENLLEI LKNGTDNIGA EIFEPLIRTY AAAGKSHPAM RRRLKMENVE VNEAT KKLL DEVSQDV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL101 (rPPR4)

+
分子 #40: rPPR*

分子名称: rPPR* / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 47.569398 KDa
配列文字列: AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA ...文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AA AAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA AAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAA AAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAA AAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAA AAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAA AA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAA

+
分子 #41: Pentatricopeptide repeat-containing protein PNM1, mitochondrial

分子名称: Pentatricopeptide repeat-containing protein PNM1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 59.234504 KDa
配列文字列: MPPSLPSLQL RRLLLRSFIS SSSVNTLQSQ PRIISSKPLF SPLPPSRSSI FSTFPSRFFS SETNAESESL DSNEIALSFS KELTGNPDA ESQTISQRFN LSFSHITPNP DLILQTLNLS PEAGRAALGF NEWLDSNSNF SHTDETVSFF VDYFGRRKDF K GMLEIISK ...文字列:
MPPSLPSLQL RRLLLRSFIS SSSVNTLQSQ PRIISSKPLF SPLPPSRSSI FSTFPSRFFS SETNAESESL DSNEIALSFS KELTGNPDA ESQTISQRFN LSFSHITPNP DLILQTLNLS PEAGRAALGF NEWLDSNSNF SHTDETVSFF VDYFGRRKDF K GMLEIISK YKGIAGGKTL ESAIDRLVRA GRPKQVTDFF EKMENDYGLK RDKESLTLVV KKLCEKGHAS IAEKMVKNTA NE IFPDENI CDLLISGWCI AEKLDEATRL AGEMSRGGFE IGTKAYNMML DCVCKLCRKK DPFKLQPEVE KVLLEMEFRG VPR NTETFN VLINNLCKIR RTEEAMTLFG RMGEWGCQPD AETYLVLIRS LYQAARIGEG DEMIDKMKSA GYGELLNKKE YYGF LKILC GIERLEHAMS VFKSMKANGC KPGIKTYDLL MGKMCANNQL TRANGLYKEA AKKGIAVSPK EYRVDPRFMK KKTKE VDSN VKKRETLPEK TARKKKRLKQ INMSFVKKPH NKMRRRM

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein mL104 (rPPR9)

+
分子 #42: UNK-6

分子名称: UNK-6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 2.079272 KDa
配列文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA

+
分子 #45: Ribosomal protein S3, mitochondrial

分子名称: Ribosomal protein S3, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 64.998555 KDa
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MARKGNPISV RLGKNRSSDS SWFSEYYYGK FVYQDVNLRS YFGSIRPPTR LTFGFRLGRC IILHFPKRTF IHFFLPRRPR RLKRREKTR PGKEKGRWWT TFGKAGPIEC LHSSDDTEEE RNEVRGRGAR KRVESIRLDD RKKQNEIRGW PKKKQRYGYH D RLPSIKKN LSKLLRISGA FKHPKYAGVV NDIAFLIEND DSFKKTKLFK LFFQNKSRSD GPTSYLRTLP AVRPSLNFLV MQ YFFNTKN QINFDPVVVL NHFVAPGAAE PSTMGRANAQ GRSLQKRIRS RIAFFVESLT SEKKCLAEAK NRLTHFIRLA NDL RFAGTT KTTISLFPFF GATFFFLRDG VGVYNNLDAR EQLLNQLRVK CWNLVGKDKI MELIEKLKNL GGIEELIKVI DMMI EIILR KRGIPYRYNS YFYEVKKMRS FLSNRTNTKT LIESVKIKSV YQSASLIAQD ISFQLKNKRR SFHSIFAKIV KEIPK GVEG IRICFSGRLK DAAEKAQTKC YKHRKTSCNV FNHKIDYAPV EVFTRYGILG VKVWISYSQK KGRRAISETY EI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3m

+
分子 #46: Ribosomal protein S7, mitochondrial

分子名称: Ribosomal protein S7, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.235201 KDa
配列文字列:
MGGLDGEQKL LIKKLVNFRM KEGKRTRVRA IVYQTFHRPA RTERDVIKLM VDAVENIKPI CEVAKVGVAG TIYDVPGIVA RDRQQTLAI RWILEAAFKR RISYRISLEK CSFAEILDAY QKRGSARRKR ENLHGLASTN RSFAHFRWW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7m

+
分子 #47: 30S ribosomal protein S9, mitochondrial

分子名称: 30S ribosomal protein S9, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 48.058723 KDa
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MLSRLFLRHS NLRFVTLVSS KSNSQIFSSF IRPLSTNSSG GGGNGDGNGR NRNDVPWSFT GVNDDKSGPF SSDDSFGSSG VAGSGLPGG EGKWPEEPKR WNIKEEEEKV VFDTGGEVGQ GIETSRERRG NEWEETKRWD MKEGEEKVVF GGGGDEVDGF G IRGEVKSN EWDVSKPWNL KEEEEGVVFD TGGEVPFSFE NSLEMAEEER VKKELIEKEE KELLEVIKGP DRAFGDLIAK SG ITDEMLD SLIALKDFQG VEGLPPLTEI ENLRREKSSK KSSRAEIELQ MQEDIAKARV RQVDETGRAY GTGRRKCSIA RVW IQPGEG KFQVNEKEFD VYFPMLDHRA ALLRPLAETK TLGRWDIKCT VKGGGTTGQV GAIQLGISRA LQNWEPDMRT SLRA AGFLT RDSRVVERKK PGKAKARKSF QWVKR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9m

+
分子 #48: 40S ribosomal protein S10, mitochondrial

分子名称: 40S ribosomal protein S10, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 27.135586 KDa
配列文字列: MIAGVLRRSS LPSRQTLSAA LASFNSCISH NLTPATTGAS VSSRFTLASS PNSFGIRARN IHIRSEPSMI VPAGIASQGY ATVTKDRKN EIKKAKIKIS PDNVRPLSRK EIALQKEAAE ESTSKIKGTK ICIAIRSFVN PEKQAWCLPP HTRKVAMPDT R TLYTVLRS ...文字列:
MIAGVLRRSS LPSRQTLSAA LASFNSCISH NLTPATTGAS VSSRFTLASS PNSFGIRARN IHIRSEPSMI VPAGIASQGY ATVTKDRKN EIKKAKIKIS PDNVRPLSRK EIALQKEAAE ESTSKIKGTK ICIAIRSFVN PEKQAWCLPP HTRKVAMPDT R TLYTVLRS PHVDKKSREQ FEMRFKKRFL VIKAQSHELS KKLFWLKRYR ILGAQYELQF HCKTRLDMTQ VLGNINGSTT NA Y

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10m

+
分子 #49: Small ribosomal subunit protein S13, mitochondrial

分子名称: Small ribosomal subunit protein S13, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.311066 KDa
配列文字列:
MLGLRRSATT LFDISQSLLR NVTFHGLRVQ GIRVGNAEVP NNKPLKTGLQ EVYGIGRRKS HQVLCHLGIT NKLARDLTGK ELIDLREEV GQHQHGDELR RRVGSEIQRL VEVDCYRGSR HRHGLPCRGQ RTSTNARTKK GKAVAIAGKK KAPRK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13m

+
分子 #50: At2g34520

分子名称: At2g34520 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 18.778869 KDa
配列文字列:
MASLRRVLLN VTSYCQRSLT QSSYSTSGML SRSVVKHANN LGQIQARHFT TTLMKSGPKH SGTEQGVKRN SADHRRRLLA ARFELRRKL YKAFCKDPDL PSEMRDKNRY KLSKLPRNSA FARIRNRCVF TGRSRSVTEL FRVSRIVFRG LASKGALMGI T KSSW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14m

+
分子 #51: 40S ribosomal protein S19, mitochondrial

分子名称: 40S ribosomal protein S19, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 23.675223 KDa
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MAFCTKLGGH WKQGVNVPVS SMLGSLRYMS TKLYIGGLSP GTDEHSLKDA FSSFNGVTEA RVMTNKVTGR SRGYGFVNFI SEDSANSAI SAMNGQELNG FNISVNVAKD WPSLPLSLDE SIEEAEKKEN KMMSRSVWKD PFVDAFLMKK KNAALNRKIW S RRSTILPE YVDSAVRIYN GKTHVRCKIT EGKVGHKFGE FAFTRKVKKH AKAK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19m

+
分子 #52: Mitochondrial 28S ribosomal protein S29-like protein

分子名称: Mitochondrial 28S ribosomal protein S29-like protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 53.863473 KDa
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MWKYGLRIAA GNAKLNRKSS ILNNTVCHFS PPTSAAVGTL FPSLDHVHRC FSSSKSTKSS ITKTKKSEGK KSKPKGGDPG AAGAEEGEF GAAGGDDLEA GRAKRLADDE KIPSLDVGPN GRPLFTPKDT TLSQLTHKDI GSYFKFDEAA LKAVLPEGLA S GIEDEFNE SWRPALLVRK SYLALRDNFR RIADPPMWPS DSKGVKLQKQ IVLDGPVKCG KSIALAMLVH WARDEGWLVL YA PKGRDWT HGGYFYKNPH TGFWDTPLQA ENILKDFVKF NESRLRELRC KIHDPIVLGE GAGVGYLKGA DAMPIPEDST LYD LVQMGI KSTHAAVNVV VRLRKELSVV KDVPVLIVID QYNSWFTFSE FEEPVTPRSC RPIHARELTT VNAFRSMMHE DMMV GAFSH STAVGKLRKD LPDVPVDARQ QFPRYSLDEA EAVCYYYLRQ RLVRREVFNE ENWKKIYYLA NGNGAEMRWL APFMR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein mS29

+
分子 #53: 37S ribosomal protein S27

分子名称: 37S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.558553 KDa
配列文字列:
MASGSLKSLI SSAVGRGVTE ARARIFGHML NPTGQRSPHK ILRKKLIGDK VAEWYPYDIK NEDPNVLARE EKERISKLEM LKRRDKGPP KKGHGKRAAK RNK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein mS33

+
分子 #54: AT3G18240 protein

分子名称: AT3G18240 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 48.125957 KDa
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MRGALLRNAS LCARRIILSP RITHQISPNV PFLAPIAAPA APKFRFFSSE SGENSTTAPE SSPTDSPEKK DLVVEDVSNK ELKSRIEKY FNEGNEDALP GVIEALLQRR LVDKHAETDD ELLEKIESLP FKDDVKDEDF ESDFEEAHST DEELEDLYNS P EYVAEKMR KNEFFNMDDK KWDHMIREGI QHGCLTDTKE CEEILEDMLK WDQLLPDDLK KKVEAKFNEL GDMCERGEIE AE AAYELFK EFEDEMVIQY GDQMEAEGPP QFGETDASDR NTDLDDPPGK GPILRWQSRI VFAPGGDAWH PKNRKVKMSV TVK ELGLSK HQAKRLRELV GKRYHSGKDE LTITSERFEH REENRKDCLR TLYGLIEEAG KANKIAEDIR TSYVKQRLRA NPAF MQKLQ AKIIRSKESD AINA

UniProtKB: AT3g18240

+
分子 #55: CX9C domain-containing protein

分子名称: CX9C domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 10.53253 KDa
配列文字列:
MSVFRLVERA IMGRKAGNLY INPKKLGNLA KPCMKEMVSF LNCMALNNIK DDKCEKQKQL LSVCMQGQSD HKNKSWGNIN YHLQRLTRG RK

UniProtKB: IMS import disulfide relay-system CHCH-CHCH-like Cx9C domain-containing protein

+
分子 #56: 30S ribosomal protein S31, mitochondrial

分子名称: 30S ribosomal protein S31, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 10.978082 KDa
配列文字列:
MAAMQWCGAM TRRIMMTQRT SAALNCSARY SSLSPACAAP AVSEMDLCGR GDKKTKKGKR FKGSYGNSRG KKQKMIERIK DKLELPRST PWPLPFKLI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bTHXm

+
分子 #57: Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g02650, mitochondrial

分子名称: Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g02650, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 63.912746 KDa
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UniProtKB: Small ribosomal subunit protein mS80 (rPPR6)

+
分子 #58: UNK-5

分子名称: UNK-5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 6.486085 KDa
配列文字列:
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+
分子 #59: mS31/mS46

分子名称: mS31/mS46 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.760567 KDa
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+
分子 #60: Ribosomal protein S2, mitochondrial

分子名称: Ribosomal protein S2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 24.808877 KDa
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MTIHAAVIQK LLNTGAHLGR RAAEHHFKQY AYGTRNGMTI IDSDKTLICL RSAAHFVANL AHMRGNIFFV NTNPLFDEII ELTSRRIQG DSYNHNRAMN LWKMGGFLTN SYSPKKFRSR HKKLCFGPTT MPDCVVVFDS ERKSSVILEA SKLQIPVVAI V DPNVPLEF FEKITYPVPA RDSVKFVYLF CNVITKCFVA EQMKLGIKEG SNEDLMKDLA A

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2m

+
分子 #61: Ribosomal protein S4, mitochondrial

分子名称: Ribosomal protein S4, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 43.47743 KDa
配列文字列: MWLLKKLIQR DIDLSPLRFQ TCRLLSGNVW NRELTIIQRR ILRRLRNRKR SIKKRKIYPK KYLTSYIQLQ TTRKLPFFYG DLPITEMHR GTKRTSYIPF LLNLETRFDV IPLRLYFLET IPQARQLISH RRVCVNKGMV SITHFKLSHG DIISFQENNA I IRGEEIRR ...文字列:
MWLLKKLIQR DIDLSPLRFQ TCRLLSGNVW NRELTIIQRR ILRRLRNRKR SIKKRKIYPK KYLTSYIQLQ TTRKLPFFYG DLPITEMHR GTKRTSYIPF LLNLETRFDV IPLRLYFLET IPQARQLISH RRVCVNKGMV SITHFKLSHG DIISFQENNA I IRGEEIRR SFYKEILVEK IIGKLLHQPL RMWRRSKTEW FHLLKTKRGC RLLLKSRFLQ QLRSSMQEED LERTKKFGSE KV CLGSSFA EHKRMKRNLL KSLFLSKRRK DKNLNLPTRT ISPIVYNSSL SLYSNSTYCF ASPHKLTMKR RIKRIELPTH YLE VNYRTP KAVVFYGPNI GHIPHDIRLK DLNLLLWSRN GRGQNI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4m

+
分子 #62: At1g64880

分子名称: At1g64880 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 60.341039 KDa
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MSLRTRASSW PRLLLRRNPR SSFSRQISTL DSSTSTFPRR ISGYYSSSFF PVNQTPWISS QRYRFFSSST MSPSEADRVV RELIAEVEK EKQREREERQ RQGLDYKDID AEDEEDYLGI EPFIEKLKKQ NLKDDGELNR REESSDSDSE YDEIDLDEER K KEDIFNKK FQRHKELLQT LTKSETLDEA FRWMNKLDKF EEKHFKLRPE YRVIGELMNR LKVAEGKEKF VLQQKLNRAM RL VEWKEAF DPNNPANYGV IERDNVQGGG EEREERLVAD GPKDDNDDDD DEEEFDDMKE RDDILLEKLN AIDKKLEIKL SEL DHTFGK KGKRLEEEIR ELAEDRNALT EKKRQPLYRK GYDVHVIDVK KVCKVTKGGR VERYTALMVC GNYEGIIGYA KAKA ETGQS AMQKAYEKCF QNLHYVERHE EHTIAHAIQT SYKKTKLYLW PAPTTTGMKA GRVVKTILLL AGFKNIKSKV IGSRN SYNT VKAVLKALNA VETPKDVQEK FGRTVVEKYL L

UniProtKB: At1g64880

+
分子 #63: Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein

分子名称: Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.991525 KDa
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MPLYDCMLLF KPIIRKEGLI DLVARIGKHV YSRNGVLTEI KSFGKVELGY GIRKLDGRHY QGQLMQITMM TTPNMNKELH YLNKEDKLL RWLLVKHRDI KIGQSEKEDS LTVPNRLTSG SLYDGSSSDE DDNNILGLSR

UniProtKB: Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein

+
分子 #64: 40S ribosomal protein S15a-5

分子名称: 40S ribosomal protein S15a-5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.941262 KDa
配列文字列:
MGRRILNDAL RTIVNAERRG KASVELKPIS TVMSSFLRIM KEKGYIKNFQ VYDPHRVGRI TVDLQGRVND CKALTYRQDV RAKEIEKYT ERTLPTRQWG YVVITTPDGI LDHEEAIKRN VGGQVLGFFY

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8my

+
分子 #65: Probable ribosomal protein S11, mitochondrial

分子名称: Probable ribosomal protein S11, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 33.977082 KDa
配列文字列: MNGVSRHLRA SSLLSLIRSY GGINSVCRFS SQSDGFSGGR FREQVPVSGE SANNSGLSNT GRIGSSPEPN PSTLRTFGDM KAGLLNRGV NGFSAPNAPP TFKSSLRSRL PNSLPDQFGQ TNPGLPNTGG SGFSAPSLSS YENFTQSSSL LKENSRSGGK S SDLDFVRE ...文字列:
MNGVSRHLRA SSLLSLIRSY GGINSVCRFS SQSDGFSGGR FREQVPVSGE SANNSGLSNT GRIGSSPEPN PSTLRTFGDM KAGLLNRGV NGFSAPNAPP TFKSSLRSRL PNSLPDQFGQ TNPGLPNTGG SGFSAPSLSS YENFTQSSSL LKENSRSGGK S SDLDFVRE VIEDEGRRTA GIFSHFQRPN LETNADIIHI KMLRNNTFVT VTDSKGNVKC KATSGSLPDL KGGRKMTNYT AD ATAENIG RRAKAMGLKS VVVKVNGFTH FGKKKKAIIA FRDGFTNSRS DQNPIVYIED TTRKAHNGCR LPRKRRV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11m

+
分子 #66: At1g15810/F7H2_23

分子名称: At1g15810/F7H2_23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 47.401285 KDa
配列文字列: MALHLARRHQ RLPSNTSLIR FFSNSSSDSP PQFTNAPVEK PSQSPSSPSP SDSSPIFDIK NTLKLKLQNQ QEQGRKPFDR SDAQSQNRG STSFSQNLGK NLAKFQRRST VPPPRDSGGV QPPSYISLAG LYKQSAATNS SDPRNSKAQG FNSNTVSETL K NLRTQINT ...文字列:
MALHLARRHQ RLPSNTSLIR FFSNSSSDSP PQFTNAPVEK PSQSPSSPSP SDSSPIFDIK NTLKLKLQNQ QEQGRKPFDR SDAQSQNRG STSFSQNLGK NLAKFQRRST VPPPRDSGGV QPPSYISLAG LYKQSAATNS SDPRNSKAQG FNSNTVSETL K NLRTQINT SNNMGKRGGV LGSFKSTVGE ALPKYLFETQ MDESKGSEGE TEEAMTEFLM FYNEEELGEK LRTLRPEGEK KE GWFSLEE LNQRLVKLRQ VEEKEAQYRT KNFAQLRNVI SSFKNENSEA SSQQNVAIMG HLGGIPEYKL LPPKEDLVDT YFH PDNMSS AEKMKIELSK VREEFKMSES DCGSARVQVA QLTTKIKHLS SSLHKKDKHS RKGLLGMVQK RKKLLKYLRR TDWD SYCLV LSKLSLRDNP DYKC

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15c

+
分子 #67: 30S ribosomal protein S16-2, chloroplastic/mitochondrial

分子名称: 30S ribosomal protein S16-2, chloroplastic/mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.126385 KDa
配列文字列:
MVVRIRLSRF GCKNRPFFRV MAADSRSPRD GKHLEVLGYF NPLPGQDGGK RMGLKFDRIK YWLSVGAQPS DPVQRLLFRS GLLPPPPMV AMGRKGGARD TRPVDPMTGR YVDAENKTVN ANDNQPKEED TEAKSA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS16m/bS16c

+
分子 #68: Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein

分子名称: Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.58244 KDa
配列文字列:
MKPVIGTVVS NKMQKSVVVA VDRLFHNKIY NRYVKRTSKF MAHDDKDACN IGDRVKLDPS RPLSKNKHWI VAEIIKKARI YSPKAAAAA VSASASASSA STTDSSAQSQ IPPSSTS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17c

+
分子 #69: F10K1.8 protein

分子名称: F10K1.8 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 29.657506 KDa
配列文字列: MSIARFATRS LNNVTFLRPF RPIVSRSLAT NANEDPNQNR SSFDSSDNLD SLFGDYTGND EKSNDFFQHL SKAEKDKRDF NGYNRSGGS RYSGGGSMSK DETFDPSSDG VDGKLKEAAL AYNMDEGDGF KEYSFRPDFN NSWGMNNFPR MQKQMQNPRQ N NSKSEVTT ...文字列:
MSIARFATRS LNNVTFLRPF RPIVSRSLAT NANEDPNQNR SSFDSSDNLD SLFGDYTGND EKSNDFFQHL SKAEKDKRDF NGYNRSGGS RYSGGGSMSK DETFDPSSDG VDGKLKEAAL AYNMDEGDGF KEYSFRPDFN NSWGMNNFPR MQKQMQNPRQ N NSKSEVTT EEVLKNADFR NVRFLANFIT EAGIIIKRKQ TGISAKAQRK IAREIKTARA FGLMPFTTMG TKAFQFGKTM EN RDQDFEY EVLDDDDEFD EGNA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18c

+
分子 #70: Ribosomal protein S21 family protein

分子名称: Ribosomal protein S21 family protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.673912 KDa
配列文字列:
MNTIAKRVTG LVTRPSLNQQ LQQERGIRVK VFSNDLDKAL TILQKKMQSS GMERLIKGTQ THHIKNSEKK VLARKNLERR IKSIDFARK LQSILIKKVR GL

UniProtKB: Ribosomal protein S21 family protein

+
分子 #71: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 22.084541 KDa
配列文字列: MSWMKGDLLS KTRRLVGGLA TREPVWLKAM EASPPPVFPR SNGKIQKIVL PEDPYVRKFA NKHPGTKIDD PAKISAFIPD QARVYGCRV LELKEHGISE GDAMSVANME YLSERKEMKK AYKRLKELAV MQDKDPPPKP YPSAKKGLIT QSKTSAKDRF Q TPSVRRLV ...文字列:
MSWMKGDLLS KTRRLVGGLA TREPVWLKAM EASPPPVFPR SNGKIQKIVL PEDPYVRKFA NKHPGTKIDD PAKISAFIPD QARVYGCRV LELKEHGISE GDAMSVANME YLSERKEMKK AYKRLKELAV MQDKDPPPKP YPSAKKGLIT QSKTSAKDRF Q TPSVRRLV NQLKNEKDVL LQDRTGGSAN QDNWIDE

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #72: AT5g49210/K21P3_8

分子名称: AT5g49210/K21P3_8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 23.553039 KDa
配列文字列: MAFCNKLSRF VRRQSENASM IGSLRSFSAD ATHHRFHQET HNFLEPEYYI GSWEAPSDPK DAERKLAQLR RDYAKKVRVY RKEYIHEIE MLRVEKQRKD EARLLAERAA NEERRLLKAE AAKVRAEERK IADEEFRQTL IKERAEKLEM WKMMGQKREE K IKEREKLL ...文字列:
MAFCNKLSRF VRRQSENASM IGSLRSFSAD ATHHRFHQET HNFLEPEYYI GSWEAPSDPK DAERKLAQLR RDYAKKVRVY RKEYIHEIE MLRVEKQRKD EARLLAERAA NEERRLLKAE AAKVRAEERK IADEEFRQTL IKERAEKLEM WKMMGQKREE K IKEREKLL REQSSLWIEQ KELERKITEA LVDNVVL

UniProtKB: AT5g49210/K21P3_8

+
分子 #73: 28S ribosomal S34 protein

分子名称: 28S ribosomal S34 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.793288 KDa
配列文字列:
MAMTLINRAI SRTETVGAFR LSLNLLRNFS AAPASENPSS DSSKPKRRKK KNLIEVAQFL PNWGIGYHMA KAHWNGISYE ITKINLYKD GRHGKAWGIV HKDGLRAAEA PKKISGVHKR CWKYIPNLSK TAPATTSAHV QAA

UniProtKB: 28S ribosomal S34 protein

+
分子 #74: mS38

分子名称: mS38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.934446 KDa
配列文字列:
MANLMHRFFK NNKSCFNSIQ RLTTTPSLFT YQKPFINNNN IESIIQKPDP VSFANPVITL SGNEFNQPMQ FYPSFSMGLC LNPKMIQGL DLAETASLEE EEDAKENVIY ADSVKKKRKK KMNKHKYRKL RKQLGRKS

+
分子 #75: At5g26800

分子名称: At5g26800 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.624018 KDa
配列文字列:
MAWMRLIQSA RSVLTTAPAS STLNFHRFYS KSAAPYHVKV GIPEFLSGIG GGVETHIAKL ETELGDLPKL LVTRTLRLKK FGIPCKHRK LILKYSHKYR LGLWKPRADA IKA

UniProtKB: At5g26800

+
分子 #76: Gb

分子名称: Gb|AAC32909.1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 48.396664 KDa
配列文字列: MYNLSRIIYR FSSVSLNPST RASGFLLENA SSKILQSATN RAFSAKSGSD GVGGDDNGWN ISTGGSFGGT GSADLDWDNK SMWSTGLTK EHFDGVSVGR QKNAANPSSD NTPSDSGDVM SKLGPKEVAL VNEMNEYDDL LKEIEQDNRQ GRAFVDGIKQ R MMEISVLL ...文字列:
MYNLSRIIYR FSSVSLNPST RASGFLLENA SSKILQSATN RAFSAKSGSD GVGGDDNGWN ISTGGSFGGT GSADLDWDNK SMWSTGLTK EHFDGVSVGR QKNAANPSSD NTPSDSGDVM SKLGPKEVAL VNEMNEYDDL LKEIEQDNRQ GRAFVDGIKQ R MMEISVLL KQVKEPGARG SYLKDSEKTE MYRLHKENPE VYTIERLAKD YRIMRQRVHA ILFLKEDEEE EERKLGRPLD DS VDRLLDE YPEFFISHDR EFHVASLNYK PDFKVMPEGW DGTIKDMDEV HYEISKKEDD MLYEEFVRRF EFNKMKWRGE VMC HKYSRR RSSEGWKITV EKLGAKGKRG AGGGWKFMSL PDGSSRPLNE MEKVYVKRET PLRRRSIIST EVMRYSPANQ KRRS KRKQK RKERRIACLK AGKQT

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein mS75

+
分子 #77: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 2, mitochondrial

分子名称: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3価のアルコールのエステル加水分解酵素
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 45.548742 KDa
配列文字列: MQTVKALRRV SEPLQWVRSV SYGRRFSALP NYSASDADFE DQVLVEGKAK SRAAILNNPS SLNALSAPMV GRLKRLYESW EENPAISFV LMKGSGKTFC SGADVLSLYH SINEGNTEES KLFFENLYKF VYLQGTYLKP NIAIMDGVTM GCGGGISLPG M FRVATDKT ...文字列:
MQTVKALRRV SEPLQWVRSV SYGRRFSALP NYSASDADFE DQVLVEGKAK SRAAILNNPS SLNALSAPMV GRLKRLYESW EENPAISFV LMKGSGKTFC SGADVLSLYH SINEGNTEES KLFFENLYKF VYLQGTYLKP NIAIMDGVTM GCGGGISLPG M FRVATDKT VLAHPEVQIG FHPDAGASYY LSRLPGYLGE YLALTGQKLN GVEMIACGLA THYCLNARLP LIEERIGKLL TD DPAVIED SLAQYGDLVY PDSSSVLHKI ELIDKYFGLD TVEEIIEAME NEAANSCNEW CKKTLKQIKE ASPLSLKITL QSI REGRFQ TLDQCLTHEY RISICGVSKV VSGDFCEGIR ARLVDKDFAP KWDPPRLEDV SKDMVDCYFT PASELDDSDS ELKL PTAQR EPYF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein mS47

+
分子 #78: rPPR*

分子名称: rPPR* / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 18.924742 KDa
配列文字列: AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA ...文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AA AAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA

+
分子 #79: rPPR*

分子名称: rPPR* / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 24.824262 KDa
配列文字列: AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA ...文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AA AAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA AAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA

+
分子 #80: Adenylyl cyclase

分子名称: Adenylyl cyclase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 43.97127 KDa
配列文字列: MQFLQNSRRI ATVLKPIVTT ETNLRFFSSA SQISRSFQWR SQASSSSSVL KGIDSSSHLS SMSLLIPRSS FTSEAEKLAG NPTVTVKDL HDKMLNSVNV KRSMPPNAWL WLLIENCQNQ DDIHLLFDVL QNLRRFRLSN LRIHDNFNCN LCQQVAKTCV R VGAIDSGK ...文字列:
MQFLQNSRRI ATVLKPIVTT ETNLRFFSSA SQISRSFQWR SQASSSSSVL KGIDSSSHLS SMSLLIPRSS FTSEAEKLAG NPTVTVKDL HDKMLNSVNV KRSMPPNAWL WLLIENCQNQ DDIHLLFDVL QNLRRFRLSN LRIHDNFNCN LCQQVAKTCV R VGAIDSGK KALWKHNVHG LTPSVASAHH LMSYALEHKN SELMEEVMQL LKTNDLPLQP GTADLVFRIC HDTDKWDLLA KY SKKFSKA GVKLRKTTFD VWMEFAAKRG DTESLWKVDK QRSETYSQHT LSTAFSCAKG FLLESKPEEA AAVIQIICQA YPD EKKSAI STEFEKLVNE WPVDVIKHQT DEDKKALAAS LKSVIPSMVN TLLSSGLKVS VDLDELNKNE ALLS

UniProtKB: Adenylyl cyclase

+
分子 #81: UNK-3

分子名称: UNK-3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 4.922378 KDa
配列文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA

+
分子 #82: UNK-2

分子名称: UNK-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 5.633154 KDa
配列文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA

+
分子 #83: UNK-4

分子名称: UNK-4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 2.15035 KDa
配列文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA

+
分子 #84: UNK-1

分子名称: UNK-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 84 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 4.566991 KDa
配列文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAA

+
分子 #86: At5g55140

分子名称: At5g55140 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 86 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.381309 KDa
配列文字列:
MSGFRAFKAQ VPIEWSQSLY ITLVRGLPGT RKLHRRTLEA MGLRRCHRTV LHSNNSSIRG MIDQVKRMVV VETEEMYNAR KEAEANHKA LRPPLVVSHS SPATDSSNMS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30m

+
分子 #87: 50S ribosomal protein L10

分子名称: 50S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 87 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 19.125203 KDa
配列文字列:
MASLRRALLV AGKTKINLEN CHFITGINYN GLSVKQLQEL RGILRENTNT KLLVAKNTLV YKALEGTKWE SLKPCMKGMN AWLFVQSED IPAALKTFIN FQKEKKLYDN NLGGAVFEEK LYAPQDYKVI ETMPSRADVY GMMLGSLHWP ALDLVNALQA P PAASENET VVA

UniProtKB: 50S ribosomal protein L10

+
分子 #88: rPPR*

分子名称: rPPR* / タイプ: protein_or_peptide / ID: 88 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 22.47867 KDa
配列文字列: AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA ...文字列:
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA A AAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AA AAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAA

+
分子 #89: Ribosomal protein S12, mitochondrial

分子名称: Ribosomal protein S12, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 89 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.283795 KDa
配列文字列:
MPTFNQLIRH GREEKRRTDR TRALDKCPQK TGVCLRVSTR TPKKPNSALR KIAKVRLSNR HDIFAYIPGE GHNLQEHSTV LIRGGRVKD LPGVKFHCIR GVKDLMGIPG RRRGRSKYGA EKPKSI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12m

+
分子 #43: RNA (2842-MER)

分子名称: RNA (2842-MER) / タイプ: rna / ID: 43 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 918.9575 KDa
配列文字列: GAAUGCAUUG GAUGGAUGCC CGGGCAUUGA GAAGGAAGGA CGCUUUCAGA GGCGAAAGGC CAUGGGGAGA UACCGUCUGU GAUCCAUGG AUCUCCGAUC GGGAAACCGU AUCCAAGCUC CGUGGCUAGU CUGCGCUCUU UGGACUUUGA AAACUUAGCG A ACUGAAAC ...文字列:
GAAUGCAUUG GAUGGAUGCC CGGGCAUUGA GAAGGAAGGA CGCUUUCAGA GGCGAAAGGC CAUGGGGAGA UACCGUCUGU GAUCCAUGG AUCUCCGAUC GGGAAACCGU AUCCAAGCUC CGUGGCUAGU CUGCGCUCUU UGGACUUUGA AAACUUAGCG A ACUGAAAC AUCUAAGUAG CUAAAGGAAG GGAAAUCAAC CGAGACCCCG UUAGUAGCGG CGAGCGAGAG CGGAUUUGGG AU UUUAAGA AAAAGAAAGA CGAAGCACUU CUUUUUCGCC AGGUUUACUG UAAUUGUGAA AAGGUUGGAA GAUCUGGCCA AAG AAGGUG AUAGCCCCGU AGAUUCGUUC CUAUGGUUCG AUCCUUCCCA GUAAAACGCG GCGUGUUCGA AUUCUGAUCG CUUU UACGC GAGAAAGGGG GACCACCCUC UAAGCCUAAG UAUUCCUCAA UGACCGAUAG CGUACAAGUA CCGUGAGGGA AAGGU GAAA AGAACCCUAU GACGGGAGUG CAAUAGAGAA CCUGAGAUCC GAUGCGAACA AUCAGUCGAA GGAGUAGUCA AGCGCA CUC ACUCUAACGG CGUACCUUUU GCAUGAUGGG UCAGCGAGGA AAUGGGAAGA GCGGCUUAAG CCAUUAGGUG UAGGCGC UU UCCAAAGGUG GAAUCUUCUA GUUCUUCCUA UUUGACCCGA AACCGAUCGA UCUAGCCAUG AGCAGGUUGA AGAGAGCU C UAACAGGCCU UGGAGGACCG AACCCACGUA UGUGGCAAAA UACGGGGAUG ACUUGUGGCU AGGGGUGAAA GGCCAACCA AGAUCGGAUA UAGCUGGUUU UCCGCGAAAU CUAUUUCAGU AGAGCGUAUG AUGUCGAUGG CCCGAGGUAG AGCACUCAAU GGGCUAGGG UGGCUUACCA ACCCCAGGGA AACUCCGAAU ACAGGCCGUU CUCGUUUGUA CAGACAGACU UUUGGGGUGC U AAGAUCCA AAGUCGAGAG GGAAACAGCC CAGAUCGUAC GCUAAGGUCC CUAAGCAAUC ACUUAGUGGA AAAGGAAGUG AU CGAGCGA UGACAACCAG GAGGUGGGCU UGGAAGCAGC CAUCCUUUGA AGAAAGCGUA AUAGCUCACU GGUCUAGCUC CAU GGCACC GAAAAUGUAU CAGGGCUCAA GUGAUUCACC GAAGCGACGA GACCUUGAAA GCUGCUUUUU CAAGUGUCAG UAGC GGAAC GUUCUGUCAA UCGGGGAAGG UUUUUGGUGA CAAGACCUGG AGAUAUCAGA AGUGAGAAUG CUGACAUGAG UAACG AUAA AUCCUGUGAA AAACACGAUC GCCUGCCAGU GGAAGGCUUU CUGCGUUCAG UCAAUCUACG CAGAGUGAAU CGGUCC CUA AGGAACCCCC GAAAGGGCUG CCGUCCGAUG GGUACACGAA AGUGACGAAG UUGCUUUGAC UACAAAACCA UGCCUCU CU CUUGGAGCGA AUUGGAUGAU CGGGCCGAGG GCAGCGUAGC GCCUCUUCCC CUCACUCUCC UUUCUCCAAU AUGAACCU U GAGUCAUCAA AGGCGAGUCU GUUUAUAGUC GCGACUCUUG UCAUAGUCAA GAAGGUUGAA ACUUCCAGGA AAAAACUUC GAAUUGGGAG GGCGAUCCUC CCGGUGAACU GACCGUACCC CAAACCGACA CAGGUGAACA AGUAGAGUAU ACUAGGGCGC UUGAGAGAA CCAUGUCGAA GGAACUCGGC AAAAUGACCC CGUAACUUCG GGAGAAGGGG UGCUCUCCUA UCUUUUGAUU A GGAAAGCG GCACAUACCA GGGGGUAGCG ACUGUUUAUU AAAAACACAG GACUCUGCUA AGUGGUAACA CGAUGUAUAG AG UCUGACA CCUGCCCGGU GCUGGAAAGU CAAAAGGAGA AGUGUUAUAA GCUUUGAAUG GAAGCCCCGG UAAACGGCGG CAG UAACUC UAACUGUCCU AAGGUAGCGA AAUUCCUUGU CGCAUAAGUA GCGACCUGCA CGAAUGGUGU AACGACUGCC CCGC UGUCU CCGACAUGGA CCCGGUGAAA UUGAAUUCUC CGUGAAGAUG CGGAGUACCA ACGGCUAGAC GGUAAGACCC CGUGC ACCU UCACUAUAGC UUCGCAGUGA CAACCUUGAU CGAAUGUGUA GGAUAGGUGG GAGGUCGUGA CAUAGAAGGA CCAAUC CUG AAAGACCACU CUUUCGUCUA AGGGUGCCUA ACCGCCGCGG CGGGACACUG CGAGGUGGGU AGUUUAUCUG GGGCGGA UG CCUCCUAAAG AGUAACGGAG GUGUGCGAAG GUAGGCUCAA GCUAAGAUUC UGCUCGUGAG CGUAAUGGUA UAAGCCUG C CUGACUGUGA GACCGACUGG UCGAACAGAG ACGAAAGUCG GCCAUAGUGA UCCGGGAGUC CCGUGUGGAA GGGCUCUCG CUCAACGGAU CAAAGGUACG CCGGGGAUAA CAGGCUGAUG ACUCCCAAGA GCUCUUAUCG ACGGAGUCGU UUGGCACCUC GAUGUCGAC UCAUCACAUC CUGGGGUUGA AGAAGGUCCC AAGGGUUCGG UUGUUCGCCG AUUCAAGUGG UACGUGAGUU G GGUUUAGA ACGUCGUGAG ACAGUUCGGU UCCUAUCUAC CGUUGGUGUU AAAGGGAGAA CUGCGAGGAG CCAACCCUAG UA CGAGAGG ACUGGGUUGG GCCAACCUAU GGUGUACCGG UUGUUAUGCC AAUAGCAGCG CCGGGCAGCU AAGUUGGUAU GGA AGAACU GCUGCUUAGC GGGAAAUCCU UCUCUAUACA AGUUCUCGGA ACAGGUUUUA GAACAGAACU UCGAUAGGCG GGAG GUGGA AGCACCGCGA GGUGUGAAGC CAUCUCGUAC UAAACGA

+
分子 #44: RNA (118-MER)

分子名称: RNA (118-MER) / タイプ: rna / ID: 44 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 37.992594 KDa
配列文字列:
AAACCGGGCA CUACGGUGAG ACGUGAAAAC ACCCGAUCCC AUUCCGACCU CGAUAUGUGG AAUCGUCUUG CGCCAUAUGU ACUGAGAUU GUUCGGGAGA CAUGGUCCAA GCCCGGUGA

+
分子 #85: RNA (1743-MER)

分子名称: RNA (1743-MER) / タイプ: rna / ID: 85 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 564.635188 KDa
配列文字列: UAGUCAAAAG AAGAGUUUGA UUCUGGCUCA GAAGGAACGC UAGCUAUAUG CUUAACACAU GCAAGUCGAA CGUUGUUCUC GGAGCUAGG CAGCUCCUAG CUCCUUGUCU CGGGGAAGAG UUGAGAACAA AGUGGCGAAC GGGUGAGUAA GGCGUGGGAA U CUGCCGAA ...文字列:
UAGUCAAAAG AAGAGUUUGA UUCUGGCUCA GAAGGAACGC UAGCUAUAUG CUUAACACAU GCAAGUCGAA CGUUGUUCUC GGAGCUAGG CAGCUCCUAG CUCCUUGUCU CGGGGAAGAG UUGAGAACAA AGUGGCGAAC GGGUGAGUAA GGCGUGGGAA U CUGCCGAA CAGUUCGGGC CAAAUCCUGA AGAAAGCUAA AAAGCGCUGU UUGAUGAGCC UGCGUAGUAU UAGGUAGUUG GU UAGGUAA AGGCUGACCA AGCCAAUGAU GCUUAGCUGG UCUUUUCGGA UGAUCAGCCA CACUGGGACU GAGACACGGC CCG GACUCC CACGGGGGGC AGCAGUGGGG AAUCUUGGAC AAUGGGCGAA AGCCGAUCCA GCAAUAUCGC GUGAGUGAAG AAAG GCAAU GCCGCUUGUA AAGCUCUUUC GUCGAGUGCG CGAUCAUGAC AGGACUCGAG GAAGAAGCCC CGGCUAACUC CGUGC CAGC AGCCGCGGUA AAACGGGGGG GGCAAGUGUU CUUCGGAAUG ACUGGGCGUA AAGGGCACGU AGGCGGUGAA UCGGGU UGA AAGUGAAAGU CGCCAAAAAG UGGCGGAAUG CUUUCGAAAC CAAUUCACUU GAGUGAGACA GAGGAGAGUG GAAUUUC GU GUGGAGGGGU GAAAUCUACA GAUCUACGAA GGAACGCCAA AAGCGAAGGC AGCUCUCUGG GUCCCUACCG ACGCUGGG G UGCGAAAGCA UGGGGAGCGA ACGGGAUUAG AUACCCUGGU AGUCCAUGCC GUAAACGAUG AGUGUUCGCC CUUGGUCUA CGCAGAUCAG GGGCUCAGCU AACGCGUGAA CACUCCGCCU GGGGAGUACG GUCGCAAGAC CAAAACUCAA AGGAAUUGAC GGGGGCCUG CACAAGCGGU GGAGCAUGUG GUUUAAUUCG AUACAACGCG CAAAACCUUA CCAGCCCUUG ACAUAUGAAC A ACAAAACC UAUCCUUAAC GGGAUGGUAC UCACUUUCAU ACAGGUGCUG CAUGGCUGUC GUCAGCUCGU GUCGUGAGAU GU UUGGUCA AGUCCUAUAA CGAGCGAAAC CCUCGUCUUG UGUUGCUCAG ACAUGCGCCU AAGGAGAAAG GCUUGAAAAC CGA AGUGAG CCAAGGAGCC GAGUGAUGUG CCAGACCUAG CUAGGCCAAC UCGACGUCGC GACGUCGAGU UGGCGGCGGA GAAA GACUC GGCAUUCAGG CGAGCCGCCC GGUGGUGUGG GACGAAGUAA GUGGGUUUAG UACGCCCUGC CAAAACGGCU CCGAA ACAA ACAAAAAGGU GCGUGCCGCA CUCACGAGGG ACUGCCAGUG AUAUACUGGA GGAAGGUGGG GAUGACGUCA AGUCCG CAU GGCCCUUAUG GGCUGGGCCA CACACGUGCU ACAAUGGCAA UUACAAUGGG AAGCAAGGCU GUAAGGCGGA GCGAAUC CG GAAAGAUUGC CUCAGUUCGG AUUGUUCUCU GCAACUCGGG AACAUGAAGU UGGAAUCGCU AGUAAUCGCG GAUCAGCA U GCCGCGGUGA AUAUGUACCC GGGCCCUGUA CACACCGCCC GUCACACCCU GGGAAUUGGU UUCGCCCGAA GCAUCGGAA CAAUGAUCAC CCAUGACUUC UGUGUAACAC UAGUGCCACA AAGGCUUUUG GUGGUCUUAU UGGCGCAUAC CACGGUGGGG UCUUCGACU GGGGUGAAGU CGUAACAAGG UAGCCGUAGG GGAACCUGUG GCUGGAUUGA AUCC

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

濃度2 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TALOS ARCTICA
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
撮影したグリッド数: 1 / 平均露光時間: 1.0 sec. / 平均電子線量: 3.0 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 30.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm
実験機器
モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
最終 再構成使用したクラス数: 4 / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.86 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.7) / 使用した粒子像数: 65280
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.7)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.7)
最終 3次元分類クラス数: 10 / 平均メンバー数/クラス: 15043 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.7)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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