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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-10459 | |||||||||
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タイトル | Sub-tomogram average of the Sulfolobus islandicus S-layer in situ | |||||||||
![]() | Sub-tomogram average of the Sulfolobus islandicus S-layer in situ | |||||||||
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生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 40.0 Å | |||||||||
![]() | Daum B / Gambelli L | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Architecture and modular assembly of S-layers revealed by electron cryotomography. 著者: Lavinia Gambelli / Benjamin H Meyer / Mathew McLaren / Kelly Sanders / Tessa E F Quax / Vicki A M Gold / Sonja-Verena Albers / Bertram Daum / ![]() ![]() 要旨: Surface protein layers (S-layers) often form the only structural component of the archaeal cell wall and are therefore important for cell survival. S-layers have a plethora of cellular functions ...Surface protein layers (S-layers) often form the only structural component of the archaeal cell wall and are therefore important for cell survival. S-layers have a plethora of cellular functions including maintenance of cell shape, osmotic, and mechanical stability, the formation of a semipermeable protective barrier around the cell, and cell-cell interaction, as well as surface adhesion. Despite the central importance of S-layers for archaeal life, their 3-dimensional (3D) architecture is still poorly understood. Here we present detailed 3D electron cryomicroscopy maps of archaeal S-layers from 3 different strains. We were able to pinpoint the positions and determine the structure of the 2 subunits SlaA and SlaB. We also present a model describing the assembly of the mature S-layer. #1: ![]() タイトル: Architecture and modular assembly of Sulfolobus S-layers revealed by electron cryo-tomography 著者: Gambelli L / Meyer BH / McLaren M / Sanders K / Quax TEF / Gold VAM / Albers SVA / Daum B | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 2.9 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 9.9 KB 9.9 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 112.2 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 225.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 224.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
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注釈 | Sub-tomogram average of the Sulfolobus islandicus S-layer in situ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 7.09 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : SlaA/SlaB array
全体 | 名称: SlaA/SlaB array |
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要素 |
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-超分子 #1: SlaA/SlaB array
超分子 | 名称: SlaA/SlaB array / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | 2D array |
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試料調製
緩衝液 | pH: 3 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI POLARA 300 |
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特殊光学系 | エネルギーフィルター - スリット幅: 40 eV |
撮影 | #0 - Image recording ID: 1 #0 - フィルム・検出器のモデル: GATAN ULTRASCAN 4000 (4k x 4k) #0 - 検出モード: COUNTING / #0 - 平均電子線量: 1.8 e/Å2 / #1 - Image recording ID: 2 #1 - フィルム・検出器のモデル: GATAN ULTRASCAN 4000 (4k x 4k) #1 - 平均電子線量: 1.8 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
試料ステージ | ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company |