BIRD-PRD_001129: Microcin C7 iso-ASN analog

基本情報

• 登録情報: データベース: 生物学的重要分子辞書 (BIRD) / ID: PRD_001129
• 状態: 状態: REF ONLY
• 名称: Microcin C7 iso-ASN analog

BIRD information

• タイプ: ポリペプチド / 阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition / Family definition

別称

• MccA-N7isoASN (PDB)

Annotation

• 分子機能: Reaction intermediate of MccB / 情報源: PubMed: 19494832

Family

Microcin

Microcin C7 / Microcin J25 / Selenomethionine derivative of Microcin C7 / Microcin C7 iso-ASN analog

Chemical information

組成

組成式: C₂₈H₅₁N₁₂O₁₁S / 化学式量: 763.843

• その他: タイプ: peptide-like

履歴

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NC(C(=O)NC(C(=O)NCC(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)N)CC(=O)O)C)CC(=O)N)C(O)C)CCCNC(=[NH2+])\N)C(N)CCSC
• CACTVS 3.385: CSCC[CH](N)C(=O)N[CH](CCCNC(N)=[NH2+])C(=O)N[CH]([CH](C)O)C(=O)NCC(=O)N[CH](CC(N)=O)C(=O)N[CH](C)C(=O)N[CH](CC(O)=O)C(N)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC(C(C(=O)NCC(=O)NC(CC(=O)N)C(=O)NC(C)C(=O)NC(CC(=O)O)C(=O)N)NC(=O)C(CCCNC(=[NH2+])N)NC(=O)C(CCSC)N)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=[NH2+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(N)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCNC(=[NH2+])N)NC(=O)[C@H](CCSC)N)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C28H50N12O11S/c1-12(23(47)39-16(22(31)46)10-20(44)45)36-26(50)17(9-18(30)42)37-19(43)11-35-27(51)21(13(2)41)40-25(49)15(5-4-7-34-28(32)33)38-24(48)14(29)6-8-52-3/h12-17,21,41H,4-11,29H2,1-3H3,(H2,30,42)(H2,31,46)(H,35,51)(H,36,50)(H,37,43)(H,38,48)(H,39,47)(H,40,49)(H,44,45)(H4,32,33,34)/p+1/t12-,13+,14-,15-,16+,17-,21+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: BNFKGRSSNOJISL-FJHXPREYSA-O

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: L-methionyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-threonylglycyl-L-asparaginyl-L-alanyl-L-alpha-asparagine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [azanyl-[[(4S)-5-[[(2S,3R)-1-[[2-[[(2S)-4-azanyl-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-azanyl-4-oxidanyl-1,4-bis(oxidanylidene)butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]amino]-1,4-bis(oxidanylidene)butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]amino]-3-oxidanyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-[[(2S)-2-azanyl-4-methylsulfanyl-butanoyl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]amino]methylidene]azanium

PDBエントリ

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PDB-3h9g:
Crystal structure of E. coli MccB + MccA-N7isoASN