BIRD-PRD_000967: macrocyclic peptidomimetic

基本情報

• 登録情報: データベース: 生物学的重要分子辞書 (BIRD) / ID: PRD_000967
• 状態: 状態: REF ONLY
• 名称: macrocyclic peptidomimetic

BIRD information

• タイプ: ペプチド様 / 阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition / Family definition

別称

• macrocyclic peptidomimetic (MCP-1), 34 (PDB)

Annotation

• 分子機能: inhibitor of Menin binding to an essential oncogenic cofactor for mixed lineage leukemia 1 (MLL1) / 情報源: PubMed: 23244744

由来

• synthetic (人工物), :

External info

• PubChem: 70789289

Family

aliphatic amine containing macrocyclic peptidomimetic inhibitor

macrocyclic peptidomimetic

Chemical information

組成

組成式: C₅₆H₈₄N₁₆O₉ / 化学式量: 1125.368

• その他: タイプ: peptide-like

履歴

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NC(C(=O)NC(C(=O)NC1C(=O)NC(C(=O)N3C(C(=O)NC(C(=O)NC(C(=O)N2C(C(=O)NCCCCCCC1)CCC2)CCCNC(=[NH2+])\N)C)CCC3)Cc4ccccc4)Cc6c5ccccc5nc6)CCCNC(=[NH2+])/N)C
• CACTVS 3.370: C[CH]1NC(=O)[CH]2CCCN2C(=O)[CH](Cc3ccccc3)NC(=O)[CH](CCCCCCCNC(=O)[CH]4CCCN4C(=O)[CH](CCCNC(N)=[NH2+])NC1=O)NC(=O)[CH](Cc5c[nH]c6ccccc56)NC(=O)[CH](CCCNC(N)=[NH2+])NC(C)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC1C(=O)NC(C(=O)N2CCCC2C(=O)NCCCCCCCC(C(=O)NC(C(=O)N3CCCC3C(=O)N1)Cc4ccccc4)NC(=O)C(Cc5c[nH]c6c5cccc6)NC(=O)C(CCCNC(=[NH2+])N)NC(=O)C)CCCNC(=[NH2+])N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: C[C@@H]1NC(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@H](Cc3ccccc3)NC(=O)[C@H](CCCCCCCNC(=O)[C@@H]4CCCN4C(=O)[C@H](CCCNC(N)=[NH2+])NC1=O)NC(=O)[C@H](Cc5c[nH]c6ccccc56)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=[NH2+])NC(C)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C[C@H]1C(=O)N[C@H](C(=O)N2CCC[C@H]2C(=O)NCCCCCCC[C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N3CCC[C@H]3C(=O)N1)Cc4ccccc4)NC(=O)[C@H](Cc5c[nH]c6c5cccc6)NC(=O)[C@H](CCCNC(=[NH2+])N)NC(=O)C)CCCNC(=[NH2+])N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C56H82N16O9/c1-34-47(74)68-42(23-14-28-63-56(59)60)53(80)71-29-15-24-45(71)51(78)61-26-12-5-3-4-9-21-41(49(76)70-44(31-36-17-7-6-8-18-36)54(81)72-30-16-25-46(72)52(79)65-34)67-50(77)43(32-37-33-64-39-20-11-10-19-38(37)39)69-48(75)40(66-35(2)73)22-13-27-62-55(57)58/h6-8,10-11,17-20,33-34,40-46,64H,3-5,9,12-16,21-32H2,1-2H3,(H,61,78)(H,65,79)(H,66,73)(H,67,77)(H,68,74)(H,69,75)(H,70,76)(H4,57,58,62)(H4,59,60,63)/p+2

InChIKey

• InChI 1.03: MEYYIZALDRYBJG-UHFFFAOYSA-P

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N~2~-acetyl-N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-N-[(6R,9S,18aR,24S,27R,29aR)-24-(3-{[amino(iminio)methyl]amino}propyl)-6-benzyl-27-methyl-5,8,18,23,26,29-hexaoxooctacosahydro-1H-dipyrrolo[2,1-c:2',1'-l][1,4,7,10,13,16]hexaazacyclopentacosin-9-yl]-L-tryptophanamide #

PDBエントリ

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PDB-4i80:
Crystal structure of human menin in complex with a high-affinity macrocyclic peptidomimetics