ChemComp-YPP: Hydrolyzed piperacillin

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: YPP
• 名称: 名称: Hydrolyzed piperacillin; 別称: (2R,4S)-2-[(R)-carboxy{[(2R)-2-{[(4-ethyl-2,3-dioxopiperazin-1-yl)carbonyl]amino}-2-phenylacetyl]amino}methyl]-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidine-4-carboxylic acid

Chemical information

組成

組成式: C₂₃H₂₉N₅O₈S / 原子数: 66 / 化学式量: 535.57 / 形式電荷: 0

その他

3q07

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: YPP / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3Q07

履歴

作成	2011年1月6日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月13日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NC(C(=O)O)C1SC(C(N1)C(=O)O)(C)C)C(c2ccccc2)NC(=O)N3C(=O)C(=O)N(CC)CC3
• CACTVS 3.370: CCN1CCN(C(=O)N[CH](C(=O)N[CH]([CH]2N[CH](C(O)=O)C(C)(C)S2)C(O)=O)c3ccccc3)C(=O)C1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CCN1CCN(C(=O)C1=O)C(=O)NC(c2ccccc2)C(=O)NC(C3NC(C(S3)(C)C)C(=O)O)C(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CCN1CCN(C(=O)N[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H]2N[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S2)C(O)=O)c3ccccc3)C(=O)C1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CCN1CCN(C(=O)C1=O)C(=O)N[C@H](c2ccccc2)C(=O)N[C@@H]([C@@H]3N[C@H](C(S3)(C)C)C(=O)O)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C23H29N5O8S/c1-4-27-10-11-28(19(31)18(27)30)22(36)25-13(12-8-6-5-7-9-12)16(29)24-14(20(32)33)17-26-15(21(34)35)23(2,3)37-17/h5-9,13-15,17,26H,4,10-11H2,1-3H3,(H,24,29)(H,25,36)(H,32,33)(H,34,35)/t13-,14+,15+,17-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: OKSUEATVFIVTFV-WBTNSWJXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R,4S)-2-[(R)-carboxy{[(2R)-2-{[(4-ethyl-2,3-dioxopiperazin-1-yl)carbonyl]amino}-2-phenylacetyl]amino}methyl]-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidine-4-carboxylic acid
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: (2R,4S)-2-[(1R)-1-[[(2R)-2-[(4-ethyl-2,3-dioxo-piperazin-1-yl)carbonylamino]-2-phenyl-ethanoyl]amino]-2-hydroxy-2-oxo-ethyl]-5,5-dimethyl-1,3-thiazolidine-4-carboxylic acid

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-3q07:
CTX-M-9 S70G in complex with piperacillin

PDB-3q1f:
CTX-M-9 S70G in complex with hydrolyzed piperacillin

PDB-7o4a:
Crystal structure of Penicillin-Binding Protein 1 (PBP1) from Staphylococcus aureus in complex with piperacillin

PDB-9g80:
CTX-M-14 mixed with piperacillin at 3s delay time - serial crystallography temperature series; 20C, 293K

PDB-9g81:
CTX-M-14 mixed with piperacillin at 3s delay time - serial crystallography temperature series; 30C, 303K

PDB-9g82:
CTX-M-14 mixed with piperacillin at 3s delay time - serial crystallography temperature series; 37C, 310K