ChemComp-VPU: [[(3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(pentanoylamino...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: VPU
• 名称: 名称: [[(3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(pentanoylamino)oxan-2-ylidene]amino] N-phenylcarbamate; 別称: N-Valeryl-PUGNAc; 日化辞名称: 2-(バレリルアミノ)-1-(フェニルカルバモイルオキシイミノ)-1,2-ジデオキシ-α-D-グルコピラノ-ス

Chemical information

組成

組成式: C₁₈H₂₅N₃O₇ / 原子数: 53 / 化学式量: 395.407 / 形式電荷: 0

その他

3gsm

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: VPU / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3GSM

履歴

作成	2009年4月15日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / DrugBank / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O\N=C1/OC(CO)C(O)C(O)C1NC(=O)CCCC)Nc2ccccc2
• CACTVS 3.341: CCCCC(=O)N[CH]1[CH](O)[CH](O)[CH](CO)OC1=NOC(=O)Nc2ccccc2
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CCCCC(=O)NC1C(C(C(OC1=NOC(=O)Nc2ccccc2)CO)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CCCCC(=O)N[C@@H]\1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)OC\1=N\OC(=O)Nc2ccccc2
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CCCCC(=O)N[C@@H]\1[C@H]([C@@H]([C@H](O/C1=N\OC(=O)Nc2ccccc2)CO)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C18H25N3O7/c1-2-3-9-13(23)20-14-16(25)15(24)12(10-22)27-17(14)21-28-18(26)19-11-7-5-4-6-8-11/h4-8,12,14-16,22,24-25H,2-3,9-10H2,1H3,(H,19,26)(H,20,23)/b21-17-/t12-,14-,15-,16-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: NUNQIQQEEPOGDJ-JDOAOKHLSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: N-[(2Z,3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-2-{[(phenylcarbamoyl)oxy]imino}tetrahydro-2H-pyran-3-yl]pentanamide (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [[(3R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(pentanoylamino)oxan-2-ylidene]amino] N-phenylcarbamate

PDBエントリ

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PDB-3gsm:
Vibrio cholerae family 3 glycoside hydrolase (NagZ) bound to N-Valeryl-PUGNAc